检索结果-内蒙古大学图书馆

生物医学工程学杂志 2025年第1期42卷 1-8页

作者：高鸿祥蔡志鹏李建清刘澄玉东南大学仪器科学与工程学院南京210096 东南大学数字医学工程国家重点实验室南京210096 南京医科大学生物医学工程与信息学院南京211166

心血管疾病和心理障碍已成为威胁人类身心健康的两大主要问题。尽管基于心电图信号的研究为解决这些问题提供了重要契机,但在心电特征的理解以及跨任务知识迁移方面,现有方法仍面临性能瓶颈和适用性不足等挑战。为此,本文设计了一种基... 详细信息

心血管疾病和心理障碍已成为威胁人类身心健康的两大主要问题。尽管基于心电图信号的研究为解决这些问题提供了重要契机,但在心电特征的理解以及跨任务知识迁移方面,现有方法仍面临性能瓶颈和适用性不足等挑战。为此,本文设计了一种基于残差网络的多分辨率特征编码网络,能够有效提取心电信号的局部形态特征与全局节律特征,增强特征表达能力。此外,提出的基于模型压缩的持续学习方法通过将简单任务中的结构化知识逐步传递到复杂任务,可有效提升下游任务性能。多分辨率学习模型在心电QRS波群检测、心律失常分类和情绪分类等五个数据库上取得了超越或与当前先进算法相当的性能。持续学习方法在跨领域、跨任务和数据增量的场景下都取得了相较于常规训练方法的显著提升,证明了所提出方法对于心电跨任务知识迁移的能力,为心电多任务学习提供了新路径。

关键词：身心健康心电图信号多分辨率持续学习

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基于胎盘体素内不相干运动MRI和胎儿脑体积预测生长受限胎儿中的极低出生体重儿

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南京医科大学学报(自然科学版) 2025年第3期45卷 360-366页

作者：孔令男黄世杰张璇季亮宇周欣吴飞云赵萌南京医科大学第一附属医院放射科江苏南京210029 上海科技大学生物医学工程学院先进医疗材料和设备国家重点实验室上海201210 南京医科大学第一附属医院产科江苏南京210029

目的:探讨胎盘体素内不相干运动(intravoxel incoherent motion,IVIM)MRI参数和胎儿脑体积对FGR中VLBWI的预测价值。方法:回顾性纳入23例FGR孕妇,依据胎儿出生体重分为VLBWI组(8例)和非极低出生体重儿(non-VLBWI)组(15例)。比较两组胎... 详细信息

目的:探讨胎盘体素内不相干运动(intravoxel incoherent motion,IVIM)MRI参数和胎儿脑体积对FGR中VLBWI的预测价值。方法:回顾性纳入23例FGR孕妇,依据胎儿出生体重分为VLBWI组(8例)和非极低出生体重儿(non-VLBWI)组(15例)。比较两组胎儿侧脑室占颅内体积百分比以及胎盘IVIM参数[真扩散系数(D)、伪扩散系数(D^(*))、血流灌注分数(f)及胎盘面积]。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析各参数对VLBWI的预测效能。结果:VLBWI组胎盘D值小于non-VLBWI组[(1.38±0.04)×10^(-3)mm^(2)/s vs.(1.44±0.07)×10^(-3)mm^(2)/s,t=-2.109,P=0.047],胎盘面积小于non-VLBWI组[(155.84±34.69)cm^(2)vs.(200.41±47.95)cm^(2),t=-2.315,P=0.031],胎儿侧脑室占颅内体积百分比大于non-VLBWI组[(3.00±0.55)%vs.(2.53±0.33)%,t=2.591,P=0.017]。胎盘D值、胎盘面积和侧脑室占颅内体积百分比的ROC曲线下面积分别为0.767、0.783和0.792。联合胎儿侧脑室占颅内体积百分比、胎盘D值和胎盘面积可将ROC曲线下面积提高至0.892。结论:胎盘IVIM参数和胎儿脑体积可能是帮助预测FGR中VLBWI的潜在有效影像标志物。

关键词：胎儿生长受限极低出生体重儿胎儿脑体积体素内不相干运动

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肠道降脂药物新靶点SOAT2介导脂质摄取抑制和降脂作用

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科学通报 2023年第16期68卷 2124-2132页

作者：梁静佳邵文涛顾爱华南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京211166

目前,已发现的靶向抑制肠道脂质摄取的降脂药物作用大多局限于胆固醇,达不到预期的降脂效果,且具有一定的副作用.因此,寻找能同时有效抑制肠道脂肪酸和胆固醇摄取的新药物及新靶点是可行的新策略.为了寻找和筛选对肠道脂质摄取具有抑制... 详细信息

目前,已发现的靶向抑制肠道脂质摄取的降脂药物作用大多局限于胆固醇,达不到预期的降脂效果,且具有一定的副作用.因此,寻找能同时有效抑制肠道脂肪酸和胆固醇摄取的新药物及新靶点是可行的新策略.为了寻找和筛选对肠道脂质摄取具有抑制效应的天然化合物,本文构建了基于脂质摄取和转化的荧光高通量体外双评价体系.经过对104个天然化合物的筛选发现,盐酸小檗碱(BBR)的效应最为明显,且对肠道胆固醇和脂肪酸摄取的双重抑制作用均呈现时间-剂量依赖性.此外,随着剂量和处理时间的增加,BBR可以显著抑制酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶2(SOAT2)的表达.进一步通过SOAT2干扰实验证实,SOAT2特异性介导了BBR对脂质摄取的抑制作用,并发现SOAT2可能是同时调控胆固醇与脂肪酸摄取的关键靶点.因此,本研究通过利用高通量筛选体系,为降脂药物筛选提供了新策略,并提出肠道SOAT2可能是一种潜在的降脂新靶点,可用于筛选和寻找更安全有效的治疗药物,同时也为BBR的临床应用提供了新的证据支持.

关键词：肠道降脂药筛选模型酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶2(SOAT2) 肠道脂质摄取盐酸小檗碱

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精子发生障碍的遗传学研究进展

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遗传 2021年第5期43卷 473-486页

作者：张星雨祝天喻张清荣郭雪江王铖靳光付胡志斌南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京211166

育龄人群中约15%的夫妻被不孕不育困扰,其中男方因素导致的不孕不育约占50%。男性不育通常由精子发生障碍导致,呈现为少、弱、畸形精子症,最严重的是无精子症。本文以精子发生障碍为主线,重点综述了非梗阻性无精子症和畸形精子症的遗传... 详细信息

育龄人群中约15%的夫妻被不孕不育困扰,其中男方因素导致的不孕不育约占50%。男性不育通常由精子发生障碍导致,呈现为少、弱、畸形精子症,最严重的是无精子症。本文以精子发生障碍为主线,重点综述了非梗阻性无精子症和畸形精子症的遗传学病因研究。近年来,随着高通量芯片和测序技术的快速发展,无精子症和畸形精子症的遗传学因素得以深入的揭示与解析。围绕无精子症,全基因组关联研究与高通量测序研究揭示了一批非梗阻性无精子症的风险位点和致病基因;围绕畸形精子症,全外显子测序等研究鉴定了一系列致病基因,极大地丰富了精子鞭毛多发性形态异常等精子畸形的遗传学病因。大量致病基因的发现,促进了男性不育病理机制的阐明。全面而深入地了解精子发生障碍中的遗传因素,对男性不育的诊断、临床治疗和遗传咨询具有重要的意义。

关键词：精子发生遗传因素非梗阻性无精子症精子畸形鞭毛多发性形态异常

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Hsp60C是果蝇精子分化与成熟所必需的线粒体分子伴侣蛋白

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中国科学：生命科学 2023年第1期53卷 82-93页

作者：肖天衡程丽萍徐宇君南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京211166

HSP60家族是从原核生物到真核生物均保守的分子伴侣蛋白家族,在蛋白稳态与细胞应激中发挥重要功能. HSP60在生物生殖发育中起着重要的作用,但在果蝇生殖发育过程中的调控机制与表达定位尚不明确.本研究通过RT-qPCR, Western blot和免疫... 详细信息

HSP60家族是从原核生物到真核生物均保守的分子伴侣蛋白家族,在蛋白稳态与细胞应激中发挥重要功能. HSP60在生物生殖发育中起着重要的作用,但在果蝇生殖发育过程中的调控机制与表达定位尚不明确.本研究通过RT-qPCR, Western blot和免疫荧光染色技术,发现果蝇Hsp60C为睾丸特异性表达,定位于各级生精细胞的线粒体衍生聚合体(Nebenkern)中.敲除hsp60C后,果蝇呈现出雄性不育,但在精子发生早期的减数分裂和精子变形均为正常,果蝇的存活及雌蝇育性也显示正常;hsp60C敲除果蝇的精子发生个体化阶段存在缺陷以致无法产生成熟精子,但睾丸过表达Hsp60C可以挽救敲除雄蝇的育性.深入研究不育果蝇的精子发生缺陷,发现hsp60C敲除的精子个体化阶段后线粒体存在形态结构异常.与w1118野生型对照相比, hsp60C敲除后睾丸中线粒体能量代谢相关基因转录本水平发生改变,并且伴有AMPK通路和JNK通路的激活.综上所示, Hsp60C作为线粒体分子伴侣蛋白在精子发生过程中起着重要作用.

关键词： Hsp60C 精子发生线粒体精子个体化分子伴侣 Nebenkern 蛋白稳态

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精子发生过程中翻译后修饰的蛋白质组学研究进展

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生理学报 2020年第1期72卷 75-83页

作者：祝天喻李妍刘小飞齐雅玲郭雪江南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京医科大学附属逸夫医院病理与临床检验中心南京211166

精子发生由一系列多阶段、复杂的生物学事件所组成,受到多因素的调控。精子发生过程存在翻译延迟的现象,因此转录和蛋白表达水平变化不完全一致。蛋白质的翻译后修饰作为蛋白质功能的重要调控方式,在精子发生过程中起着重要调控作用。... 详细信息

精子发生由一系列多阶段、复杂的生物学事件所组成,受到多因素的调控。精子发生过程存在翻译延迟的现象,因此转录和蛋白表达水平变化不完全一致。蛋白质的翻译后修饰作为蛋白质功能的重要调控方式,在精子发生过程中起着重要调控作用。近年来,蛋白质组学(proteomics)的发展促进了蛋白质翻译后修饰的解析和功能研究。本文综述了精子发生过程中多种翻译后修饰的蛋白质组学研究进展,并讨论了它们在精子发生、精子功能和男性生育能力中的作用以及它们在未来临床诊疗中的价值。

关键词：精子发生翻译后修饰蛋白质组学

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妊娠早期自然流产组织染色体异常情况及其相关因素分析

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中华妇产科杂志 2019年第12期54卷 797-802页

作者：沈鉴东孙方西瞿殿云谢佳孜高莉仇茜高超吴畏吴春香汪道武刁飞杨刘嘉茵南京医科大学第一附属医院生殖医学中心生殖医学国家重点实验室 210029

目的分析早孕期自然流产组织的染色体异常情况及其相关因素。方法收集2015年6月至2018年8月在南京医科大学第一附属医院生殖医学中心就诊的早孕期自然流产患者的流产绒毛或胎儿组织831例,通过二代测序技术(NGS)行染色体拷贝数分析,通过... 详细信息

目的分析早孕期自然流产组织的染色体异常情况及其相关因素。方法收集2015年6月至2018年8月在南京医科大学第一附属医院生殖医学中心就诊的早孕期自然流产患者的流产绒毛或胎儿组织831例,通过二代测序技术(NGS)行染色体拷贝数分析,通过统计学方法分析染色体异常与女方年龄、是否体外受精-胚胎移植(IVF-ET)妊娠、既往自然流产次数、既往有无活产分娩史之间的关系。结果在831例早孕期自然流产组织样本中,发现染色体异常461例(55.5%,461/831)。其中女方年龄(OR=1.107,95%CI为1.070~1.145)和活产分娩史(OR=1.909,95%CI为1.182~3.083)是早孕期自然流产组织染色体异常的正相关因素,既往自然流产次数(OR=0.807,95%CI为0.702~0.928)和IVF-ET妊娠(OR=0.554,95%CI为0.404~0.760)是早孕期自然流产组织染色体异常的负相关因素。结论胚胎染色体异常是早孕期自然流产的重要病因。女方年龄增加、有活产分娩史者染色体异常率增加,而既往自然流产次数增加、IVF-ET妊娠者染色体异常率下降。

关键词：染色体异常早孕期生殖医学中心活产早期自然流产分娩史胎儿组织流产次数

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RNA结合蛋白的CLIP-seq数据的生物信息学分析流程建立及初步应用

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中国科学：生命科学 2021年第4期51卷 450-461页

作者：谢正尧臧敏李鑫徐宇君南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京211166

近年来,紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(UV cross-linking immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing, CLIP-seq)成为鉴定RNA结合蛋白(RNA-binding proteins, RBP)的靶标序列和结合位点的新技术,为研究RNA结合蛋白功能、解析其分子机制提供了强有力的工具.尽管国际上已有应用CLIP技术的报道,但是实验方法周期长、技术性强,尤其是后续的数据处理和生物信息学分析令没有计算机基础和专职生物信息分析人员的实验室望而却步.基于2016年Van Nostrand等人优化的CLIP方法,本团队建立并完成了多个RBP在组织和细胞中的CLIP测序及数据的生物信息学分析流程,并验证了其可行性.本研究整合了多家实验室已公开发表的分析软件和脚本,对人前列腺癌DU145细胞系中的PUMILIO1(PUM1)蛋白CLIP-seq数据进行分析,总结出对于蛋白功能分析更有效的命令和参数,并建立了完整的生物信息学分析流程.运用该流程寻找PUM1蛋白在人前列腺癌发展中的潜在机制,本团队识别出PUM1在DU145细胞系中的1189个靶标,并发现PUM1主要结合其靶标mRNA的3′非翻译区(untranslated region, UTR)和转录终止位点(transcription termination sites, TTS)区域, UGUAHAUA(H代表A/U/C)基序(motif)为PUM1蛋白识别的特征性序列. PUM1可能通过结合靶标mRNA的3′UTR对靶标进行转录后调控,参与癌细胞的生长、分化等过程以及相关的癌症通路中.本团队还发现, PUM1在人前列腺癌细胞系中能够与其他物种或组织中类似的靶标结合,并且结合方式高度一致,这与该家族蛋白在RNA结合功能域和功能上的高度保守性相符合.因此,本文报道的技术方法和生物信息学分析流程可以为有兴趣开展RBP的靶标鉴定的研究人员提供一个一站式的方法学服务平台,也有助于推动转录后调控在疾病和发育中的机制研究和RBP的RNA调控等新兴领域的发展.

关键词： RNA结合蛋白紫外交联免疫沉淀高通量测序生物信息学 PUM1 前列腺癌 3′UTR

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睾丸优势表达的Boule蛋白影响果蝇发育

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中国科学：生命科学 2020年第4期50卷 438-445页

作者：夏文娟肖天衡黄娟徐宇君南京医科大学生殖医学国家重点实验室南京211166

boule基因是屈指可数的高度保守、横跨后生动物的调控多个物种精子发生所不可或缺的基因.在果蝇中,boule基因突变体bol1可导致雄性不育,而boule基因的大片段缺失突变体boule40却表现了致死表型,提示boule可能在胚胎发育过程中也起到一... 详细信息

boule基因是屈指可数的高度保守、横跨后生动物的调控多个物种精子发生所不可或缺的基因.在果蝇中,boule基因突变体bol1可导致雄性不育,而boule基因的大片段缺失突变体boule40却表现了致死表型,提示boule可能在胚胎发育过程中也起到一定的作用.为了验证这一假设,首先,本团队利用RT-PCR检测了boule基因在不同组织中的表达情况,并构建了GFP敲入突变体检测Boule蛋白在不同组织中的分布,结果表明boule mRNA及Boule蛋白在发育过程及成蝇的头、胸、腹中均存在.其次,构建了boule基因完全缺失突变体,发现在不同发育阶段均有致死发生.为了探寻这种影响是来自boule基因产生的蛋白还是非编码RNA或是内含子产生的未发现的基因,本团队又构建了boule基因单碱基缺失的移码突变体,发现同样有致死现象.最后,全身性过表达Boule蛋白也可导致果蝇发育过程中的逐渐死亡.以上结果都说明,果蝇体细胞中的Boule蛋白在发育过程中起重要作用,并需要进行精确调控.这一睾丸以外的作用目前只在昆虫中发现.

关键词： boule 果蝇睾丸精子发生体细胞发育

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m6A识别蛋白Ythdf3在精子发生中的作用研究

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南京医科大学学报（自然科学版） 2019年第6期39卷 846-850页

作者：宋小玲刘媛媛王仿竹沈彬南京医科大学生殖医学国家重点实验室

目的:通过基因敲除模型研究N6-甲基腺嘌呤(m6A)识别蛋白Ythdf3在小鼠精子发生过程的调控作用。方法:利用CRISPR/Cas9技术构建Ythdf3基因敲除小鼠,通过免疫荧光和HE染色对敲除小鼠进行表型分析,研究Ythdf3在调控小鼠精子发生过程中的作... 详细信息

目的:通过基因敲除模型研究N6-甲基腺嘌呤(m6A)识别蛋白Ythdf3在小鼠精子发生过程的调控作用。方法:利用CRISPR/Cas9技术构建Ythdf3基因敲除小鼠,通过免疫荧光和HE染色对敲除小鼠进行表型分析,研究Ythdf3在调控小鼠精子发生过程中的作用。结果:免疫组化染色显示Ythdf3在精原及各级生精细胞核中均有表达;成功构建Ythdf3基因敲除小鼠模型;HE染色显示Ythdf3敲除小鼠睾丸各级生精时相及附睾尾精子与对照相比无明显异常。结论:在正常生理条件下,敲除Ythdf3不影响雄性小鼠精子发生。

关键词： CRISPR/Cas9 Ythdf3 精子发生

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