检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2019年第4期46卷 406-414页

作者：王琪丁砚书耿宝宝聂玉敏南京医科大学生物医学工程与信息学院生物信息学系南京210029

染色质互作是真核生物基因组组装的基础,并且在调控真核基因细胞特异性表达中发挥重要作用.染色质互作的发生与特定的蛋白质有关,目前已经发现CTCF (CCCTC binding facor,转录阻抑物)和黏连蛋白与染色质互作相关,然而并不清楚是否还有... 详细信息

染色质互作是真核生物基因组组装的基础,并且在调控真核基因细胞特异性表达中发挥重要作用.染色质互作的发生与特定的蛋白质有关,目前已经发现CTCF (CCCTC binding facor,转录阻抑物)和黏连蛋白与染色质互作相关,然而并不清楚是否还有其他蛋白质参与染色质互作.我们将整合高通量染色体构象捕获(Hi-C)和染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)数据,在GM12878和K562细胞系中挖掘与染色质互作相关的转录因子,并对发现的转录因子做功能分析.我们在频繁发生互作的染色质位点中发现RUNX3、SPI1等转录因子也可能参与染色质互作.另外,通过FP-growth的数据挖掘方法还发现多个转录因子可能协同作用参与染色质互作.研究结果将为染色质互作相关实验的开展提供先验知识.

关键词：染色质互作转录因子 FP-growth Hi-C

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流动质子NMR信号强度与梯度回波中翻转角间的关系

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中国生物医学工程学报 2002年第6期21卷 543-547页

作者：汪家旺罗立民南京医科大学第一附属医院南京210029 东南大学生物医学工程系南京210096

梯度回波脉冲序列对血流分布和血管结构极其敏感。当脉冲序列中的参数发生变化时 ,血流的NMR(NuclearMagneticResonance)信号也发生改变。本文阐述了流动质子NMR信号强度与FLASH(fastlowangleshot)序列中的射频翻转角间的关系。并通过... 详细信息

梯度回波脉冲序列对血流分布和血管结构极其敏感。当脉冲序列中的参数发生变化时 ,血流的NMR(NuclearMagneticResonance)信号也发生改变。本文阐述了流动质子NMR信号强度与FLASH(fastlowangleshot)序列中的射频翻转角间的关系。并通过模拟实验验证了此关系的有效性。这种关系对在临床应用NMR血管成像时选取梯度回波脉冲序列有一定的指导意义。

关键词：流动质子梯度回波脉冲序列 NMR信号强度射频翻转角 FLASH序列

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基于神经网络的环孢素血药浓度预测

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中国生物医学工程学报 2009年第6期28卷 939-943页

作者：成刚吴小玲夏杰张炯肖富男崔燕南周荃刘永康李珊南京医科大学生物医学工程系南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室南京210029

通过研究肾移植病人环孢素A血药浓度的不同影响因子,分别采用广义神经网络、Elman网络、BP神经网络等模型,对环孢素A血药浓度进行预测。结果显示三种网络模型都达到了较好的预测结果,其中BP网络的预测结果最好,平均相对误差为19.94%,El... 详细信息

通过研究肾移植病人环孢素A血药浓度的不同影响因子,分别采用广义神经网络、Elman网络、BP神经网络等模型,对环孢素A血药浓度进行预测。结果显示三种网络模型都达到了较好的预测结果,其中BP网络的预测结果最好,平均相对误差为19.94%,Elman网络的平均相对误差为21.39%,广义神经网络的平均相对误差为25.93%。说明将神经网络应用于预测CsA血药浓度是可行的,其结果可以作为临床CsA的个体化给药的参考。

关键词：神经网络肾移植环孢菌素A

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腰椎间盘分子量级的超微结构形态学研究

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中华外科杂志 1996年第12期34卷 754-757页

作者：朱同银周士枋沈家维童明庆吕翔张继宁顾宁顾建华尚忠党陆祖宏韦钰南京医科大学第一附属医院东南大学生物医学工程系

为探讨腰椎间盘实出患者之髓核分子量级超微结构的形态，作者经对手术证实３例腰椎间盘突出症患者的髓核和１例鲜尸体的髓核应用原子力显微镜，进行了超微结构研究。结果表明两者髓核中的胶原束，胶原纤维和原胶原纤维呈不同排列，蛋白... 详细信息

为探讨腰椎间盘实出患者之髓核分子量级超微结构的形态，作者经对手术证实３例腰椎间盘突出症患者的髓核和１例鲜尸体的髓核应用原子力显微镜，进行了超微结构研究。结果表明两者髓核中的胶原束，胶原纤维和原胶原纤维呈不同排列，蛋白多糖的颗粒分子形态与正常亦不一，胶原纤维形成原胶原纤维网孔附着蛋白分子及蛋白多糖，ＤＮＡ吸附在纤维细胞核ＲＮＡ单链上，呈双链、多链三维螺旋结构形态。原胶原纤维呈带状结构（ＢａｎｄｅｄＳｔｒｕｃｔｕｒｅ）６４～７８ｎｍ，退变髓核胶原纤维化合并钙化，其含量明显高于正常（Ｐ＜０．０５）。提示腰椎间盘受到长时间的伤害，使胶原纤维损害断裂导致出现扭结现象，失去正常抗阻力。

关键词：椎间盘突出腰椎椎间盘分子量级超微结构

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牙科复合树脂增韧用单壁碳纳米管的表面改性和微结构

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生物医学工程学杂志 2006年第6期23卷 1279-1283页

作者：夏阳章非敏徐丽娜顾宁南京医科大学口腔医学院南京210029 东南大学生物医学工程系南京210096

为了使单壁碳纳米管(SWNTs)在牙科复合树脂中获得良好的单分散和牢固的界面结合,将其回流、氧化处理后,用APTE处理,然后用溶胶-凝胶法在其外侧壁包裹一层纳米SiO2颗粒,用硅烷偶联剂对包裹后的SWNTs进行化学改性,用红外光谱和透射电镜检... 详细信息

为了使单壁碳纳米管(SWNTs)在牙科复合树脂中获得良好的单分散和牢固的界面结合,将其回流、氧化处理后,用APTE处理,然后用溶胶-凝胶法在其外侧壁包裹一层纳米SiO2颗粒,用硅烷偶联剂对包裹后的SWNTs进行化学改性,用红外光谱和透射电镜检测改性结果,发现透射电镜照片显示在SWNTs外壁上包裹了一层纳米级颗粒;红外光谱上出现SiO2的特征吸收峰;制备纳米复合树脂试件,用透射电镜观察,发现SWNTs镶嵌在树脂基质内的其他填料之间。

关键词：牙科复合树脂碳纳米管 SiO2 硅烷偶联剂

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基于深度学习的手术机器人单目视觉患者头部姿态估计

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中国生物医学工程学报 2022年第5期41卷 537-546页

作者：冯朋飞李亮丁辉王广志清华大学医学院生物医学工程系北京100084 南京医科大学生物医学工程与信息学院南京211100

患者头部姿态估计技术是神经外科手术机器人自主化与智能化感知的关键技术之一。本研究利用基于数据驱动的深度学习方法帮助神经外科手术机器人估算患者头部姿态,为神经外科手术的智能化打下基础。首先,建立患者头部姿态估计任务的基本... 详细信息

患者头部姿态估计技术是神经外科手术机器人自主化与智能化感知的关键技术之一。本研究利用基于数据驱动的深度学习方法帮助神经外科手术机器人估算患者头部姿态,为神经外科手术的智能化打下基础。首先,建立患者头部姿态估计任务的基本数学关系;其次,给出一种高效、鲁棒的头部姿态标注方法,解决面部特征缺失情况下的2D头部图像姿态标注问题;之后,通过采集机器人视角下神经外科手术场景照片,构建共包含79个手术场景、合计4301张照片的患者头部姿态估计数据集;最后,研究HopeNet深度神经网络在患者头部姿态估计问题上的适用性,并通过分布式标签、头部区域自适应裁剪、旋转数据增强以及新提出的旋转速率损失函数等方法提高模型性能。进行网络训练和评价,在包含10个手术场景、386张照片的同源测试集1上,基于单视角的姿态估计在偏航角、滚动角、俯仰角等3个方向平均可以达到±12.76°的预测误差;在8个手术场景、229张照片的异源测试集2上,在上述3个方向平均可以达到±13.41°的预测误差。结果表明,提出的模型能准确估计患者头部姿态,且提出的优化方法可以有效提升算法精度,并提高模型的泛化能力。

关键词：手术机器人头部姿态估计数据标注

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FGF信号通路在内耳发育调控和毛细胞再生中的作用

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遗传 2018年第7期40卷 515-524页

作者：杨志姚俊曹新南京医科大学第一临床医学院南京211166 南京医科大学生物技术系南京211166

内耳是感受听觉和平衡觉的复杂器官。在内耳发育过程中,成纤维生长因子(fibroblast growth factor,FGF)信号通路参与了听基板的诱导、螺旋神经节(statoacoustic ganglion,SAG)的发育以及Corti器感觉上皮的分化。FGF信号开启了内耳早期... 详细信息

内耳是感受听觉和平衡觉的复杂器官。在内耳发育过程中,成纤维生长因子(fibroblast growth factor,FGF)信号通路参与了听基板的诱导、螺旋神经节(statoacoustic ganglion,SAG)的发育以及Corti器感觉上皮的分化。FGF信号开启了内耳早期发育的基因调控网络,诱导前基板区域以及听基板的形成。正常表达的FGF信号分子可促进听囊腹侧成神经细胞的特化,但成熟SAG神经元释放的过量FGF5可抑制此过程,形成负反馈环路使SAG在稳定状态下发育。FGF20在Notch信号通路的调控下参与了前感觉上皮区域向毛细胞和支持细胞的分化过程,而内毛细胞分泌的FGF8可调控局部支持细胞分化为柱细胞。人类FGF信号通路异常可导致多种耳聋相关遗传病。此外,FGF信号通路在低等脊椎动物毛细胞自发再生以及干细胞向内耳毛细胞诱导过程中都起到了关键作用。本文综述了FGF信号通路在内耳发育调控以及毛细胞再生中的作用及其相关研究进展,以期为毛细胞再生中FGF信号通路调控机制的阐明奠定理论基础。

关键词： FGF信号通路内耳发育毛细胞再生

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多重并行中介分析方法的比较研究

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中华流行病学杂志 2022年第5期43卷 739-746页

作者：于洋仇沁晓尤东方赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室/肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的介绍4种多重并行中介模型的分析方法,包括纯回归法、逆概率加权法、扩展的自然效应模型和基于权重的填补法,并对其进行探讨和比较。方法针对多重并行中介模型,通过3种情境的模拟试验比较不同方法在不同情境下估计直接效应和间接效... 详细信息

目的介绍4种多重并行中介模型的分析方法,包括纯回归法、逆概率加权法、扩展的自然效应模型和基于权重的填补法,并对其进行探讨和比较。方法针对多重并行中介模型,通过3种情境的模拟试验比较不同方法在不同情境下估计直接效应和间接效应的表现,并应用英国生物样本库的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果显示纯回归法和逆概率加权法对各效应的估计偏倚较小,扩展的自然效应模型次之,基于权重的填补法与另外3种的估计结果差异较大。结论不同的多重并行中介分析方法有不同的适用情境以及各自的优缺点,纯回归法更适用于连续中介的情形,逆概率加权法更适用于二分类中介的情形,扩展的自然效应模型在用于两个并行中介的残差呈正相关且相关程度较小时更佳,而基于权重的填补法可能并不适用于并行中介的情形,因而实际应用时应根据具体情境选择合适的方法。

关键词：多重并行中介分析并行中介效应逆概率加权法

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存在时依性混杂时的G方法

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中华疾病控制杂志 2021年第6期25卷 625-631页

作者：仇沁晓尤东方赵杨南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学生物医学大数据重点实验室肿瘤个体化医学协同创新中心南京211166

目的介绍处理时依性混杂的G方法,并对不同G方法进行探讨和比较。方法通过4个情境的模拟试验验证不同G方法在不同情境下对时依性混杂的处理效果,并应用英国生物样本库(UK Biobank)的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果均显... 详细信息

目的介绍处理时依性混杂的G方法,并对不同G方法进行探讨和比较。方法通过4个情境的模拟试验验证不同G方法在不同情境下对时依性混杂的处理效果,并应用英国生物样本库(UK Biobank)的数据集进行实例分析。结果模拟试验和实例分析结果均显示G方法能有效处理时依性混杂。模拟试验显示3种方法效果类似,G-computation易受G-null paradox的影响。随着时依性混杂因素数量增加,相比于G-computation和G-estimation,逆概率加权法(inverse probability of treatment weighting,IPTW)的效果波动较大。结论不同G方法都能适当地处理时依性混杂,降低统计分析过程中的偏倚大小。

关键词：时依性混杂碰撞偏倚 G方法

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基于声音传感器阵列的空间定位系统

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科技导报 2010年第19期28卷 46-49页

作者：崔燕南刘永康李开良朱松盛王伟南京医科大学生物医学工程系南京210029

声源定位技术在视频会议、语音识别、目标定位和助听装置等领域有着重要的应用。声音传感器阵列相比单个声音传感器来说,除了可以提高信噪比外,还能够实现声源的定位和跟踪。本文采用TIMSP430F149单片机为声音传感器阵列空间定位系统的... 详细信息

声源定位技术在视频会议、语音识别、目标定位和助听装置等领域有着重要的应用。声音传感器阵列相比单个声音传感器来说,除了可以提高信噪比外,还能够实现声源的定位和跟踪。本文采用TIMSP430F149单片机为声音传感器阵列空间定位系统的控制核心,选择蜂鸣器为声源,空间坐标系上的各接收器对采集到的声音信号进行放大和滤波处理,单片机控制器根据各接收器处理后的信号,运用基于时延的定位理论形成空间坐标系定位算法,定位声源。

关键词：空间定位信号捕获声音信号处理 MSP430F149

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