检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2025年第4期23卷 1132-1139页

作者：吴雅琼张春红杨海燕闾连飞李维林吴文龙江苏省中国科学院植物研究所果树研究中心南京210014 南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心南京210037

黑莓(Rubus spp.)是蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus)重要经济林小浆果树种,其果实含有丰富的营养物质,具有重要的经济和药用价值。本研究以黑莓‘Chester’果实为试验材料获得转录组序列数据,基于转录组数据分析简单重复序列(SSR)位点... 详细信息

黑莓(Rubus spp.)是蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus)重要经济林小浆果树种,其果实含有丰富的营养物质,具有重要的经济和药用价值。本研究以黑莓‘Chester’果实为试验材料获得转录组序列数据,基于转录组数据分析简单重复序列(SSR)位点信息、序列特征和分布特点,以期为黑莓SSR分子标记的筛选与开发、种质资源遗传改良和遗传多样性研究提供理论基础。运用MicroSAtellite(MISA)软件对全部unigenes序列的SSR位点进行检索和特征分析,结果表明,SSR位点总数为11486,SSR发生频率为13.3%。SSR基元类型中以二、三核苷酸重复最多,分别占转录组总SSR重复数量的46.54%和39.81%,其中AG/CT(30.58%)是出现频率最高的重复基元,其次为AT/AT(11.81%)和AAG/CTT(10.84%)基元类型。不同重复基元类型间SSR序列的长度也存在差异,平均长度范围为18.07~26.26 bp,总平均长度为19.11 bp。黑莓转录组SSR长度大多集中于12~16 bp和>30 bp,占SSR总数量均超过10%,而SSR序列长度>20 bp,占比32.13%。黑莓转录组SSR位点发生频率较高,平均距离较短,重复基元类型较丰富,可为悬钩子属乃至蔷薇科的遗传多样性研究、品种鉴定和分子标记辅助育种提供新思路。

关键词：黑莓转录组 SSR位点

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于机载LiDAR数据的桉树人工林生物量估测模型

引用

中南林业科技大学学报 2025年第5期45卷 19-29页

作者：余彪薛冬冬温小荣汪求来叶金盛南京林业大学林草学院水土保持学院广东省岭南院勘察设计有限公司南方现代林业协同创新中心广东省林业调查规划院

【目的】探索生物量模型中建模变量的选取及个数对最终拟合精度的影响，为生物量模型的建立提供方法参考。【方法】以桉树人工林为研究对象，利用无人机机载激光雷达点云数据构建冠层高度模型（CHM），应用高斯低通滤波和增强Frost滤波... 详细信息

【目的】探索生物量模型中建模变量的选取及个数对最终拟合精度的影响，为生物量模型的建立提供方法参考。【方法】以桉树人工林为研究对象，利用无人机机载激光雷达点云数据构建冠层高度模型（CHM），应用高斯低通滤波和增强Frost滤波计算样地算术平均高。使用变量投影重要性法和VSURF包筛选变量，比较多元回归模型和机器学习模型对生物量拟合效果的差异，筛选出最优模型。【结果】1)增强Frost滤波和高斯低通滤波后的样地算术平均高的相对误差比直接在CHM上提取的样地算术平均高要低，其中增强Frost滤波的提取效果略优于高斯低通滤波。2)多元回归模型的拟合精度随变量的增加而增加，非线性模型普遍优于线性模型，机器学习中随机森林模型表现最佳，决定系数为0.88，均方根误差为16.15 t/hm2，平均绝对误差为12.17 t/hm2，且拟合效果优于多元回归模型。3)利用VSURF包筛选后的变量相比直接使用全部变量建模效果更好，经过变量筛选后，发现点云的高度特征变量相比密度变量和强度变量对生物量的重要性更高，说明高度变量对森林生物量解释能力更强。【结论】利用机载激光雷达点云数据，通过增强Frost滤波平滑图像可显著降低提取树高的误差，且提取效果略优于高斯低通滤波。利用VSURF包筛选变量可以提高模型精度，随机森林模型在桉树人工林生物量估测模型中表现最佳。

关键词：地上生物量增强Frost滤波机器学习机载激光雷达变量筛选

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

美国白蛾内参基因的鉴定及筛选

引用

林业科学 2019年第9期55卷 111-120页

作者：陶蓉李慧孙宇航于晓航朱晗郝德君南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】为筛选美国白蛾在不同温度处理、不同发育阶段、幼虫不同组织中稳定的内参基因,为美国白蛾相关的基因定量研究奠定基础。【方法】在美国白蛾转录组测序结果中筛选出8个候选内参基因GAPDH、ACT、RPL12、RPL18a、RPS16、EF1α、EF... 详细信息

【目的】为筛选美国白蛾在不同温度处理、不同发育阶段、幼虫不同组织中稳定的内参基因,为美国白蛾相关的基因定量研究奠定基础。【方法】在美国白蛾转录组测序结果中筛选出8个候选内参基因GAPDH、ACT、RPL12、RPL18a、RPS16、EF1α、EF1β、18S rRNA,获得碱基序列。将以上序列进行克隆、测序、比对最终证明其为美国白蛾的基因且碱基序列正确,之后将其上传到NCBI获得登录号。设计以上8个候选内参基因的实时荧光定量PCR(qRT?PCR)引物,利用qRT?PCR技术测定8个候选内参基因在美国白蛾不同发育阶段(幼虫1~6龄)、不同温度处理下(-10、-5、0、25、35、40、45℃处理2 h)、幼虫的不同组织(头、肠道、脂肪体、马氏管、表皮)中的表达量,记录Ct值;然后通过ΔCt法、GeNorm、NormFinder和BestKeeper共4种方法对8个候选内参基因在不同条件下的Ct值进行统计分析,最后综合RelFinder选出最稳定的内参基因。通过GeNorm计算Vn/(n+1)最合适内参基因的数目。【结果】Ct分析表明,在不同发育阶段和在不同温度处理下表达最稳定的是RPL12;在幼虫不同组织中,最稳定的是RPS16。GeNorm分析结果与ΔCt分析结果相同。NormFinder分析表明,在不同的发育阶段和不同温度处理下最稳定的候选内参基因分别是RPL18a和EF1α;在幼虫组织中,最稳定的是ACT。BestKeeper分析认为,不同发育阶段,ACT、GAPDH不适合作为内参基因;不同温度处理下,ACT、RPL18a、RPL12、RPS16、EF1β不适合作为内参基因;在不同幼虫组织中,RPL18a、EF1α、EF1β、18S rRNA不适合作为内参基因。最后RelFinder综合评价显示,在不同的发育阶段最稳定的内参基因组合是RPL12和EF1β,最不稳定的是ACT;在不同的温度处理下,最稳定的内参基因组合是EF1α和GAPDH,最不稳定的是ACT;在不同组织中,最稳定的组合是ACT和RPS16,最不稳定的是RPL18a。经GeNorm软件计算,最合适的内参基因数目应该是2个。【结论】在美国白蛾不同发育阶段的基因定量研究中,建议以RPL12和EF1β作为内参基因;在不同温度处理的基因定量研究中,建议以EF1α和GAPDH作为内参基因;在幼虫不同组织的基因定量研究中,建议以ACT和RPS16作为内参基因。此外,亦初步说明了昆虫内参基因在不同试验条件下的不稳定性。

关键词：内参基因基因筛选 qRT-PCR

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007吲哚-3-乙酰胺IAA合成功能及其依赖途径鉴定

引用

林业科学 2019年第9期55卷 121-129页

作者：刘婉慧陈飞飞叶建仁王朝恩康熠付欢欢南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】探索吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007(Burkholderia pyrrocinia JK-SH007)合成生长素吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)的能力,并阐明*** JK-SH007存在色氨酸依赖型的吲哚-3-乙酰胺(indole-3-acetamide, IAM)IAA合成途径。【方法】使用Salkowski比色法和酶联免疫吸附法(ELISA)进行L-色氨酸对*** JK-SH007合成IAA能力影响的检测;以*** JK-SH007全基因组为模板,设计特异性引物克隆iaaM和iaaH基因,并使用生物信息学方法对其蛋白质和亲缘关系进行分析;通过实时荧光定量PCR方法分析*** JK-SH007中的iaaM和iaaH基因在L-色氨酸处理下的差异表达。【结果】*** JK-SH007菌株能够合成15.663μg·mL-1的IAA,在以L-色氨酸为前体的条件下其合成IAA的量显著增加,达到了44.404μg·mL-1。iaaM和iaaH基因均含有一个完整的开放阅读框,其中iaaM基因全长1 782 bp,编码593个氨基酸,属于Aminooxidase super family家族;iaaH基因全长1 368 bp,编码455个氨基酸,属于Amidase super family家族。在L-色氨酸的处理下,*** JK-SH007中的iaaM和iaaH基因的表达量均显著增加。【结论】*** JK-SH007具有合成IAA的能力,L-色氨酸对其合成IAA具有显著促进作用,且克隆得到了iaaM和iaaH基因,其在进化上具有一定的保守性,证明*** JK-SH007中存在吲哚-3-乙酰胺IAA合成途径。

关键词：吡咯伯克霍尔德氏菌吲哚-3-乙酸吲哚-3-乙酰胺途径色氨酸2-单加氧酶基因吲哚乙酰胺水解酶基因

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

仁扇舟蛾化学感受蛋白cDNA的克隆、序列分析及时空表达

引用

林业科学 2018年第4期54卷 67-75页

作者：李慧顾天滋陈昌宇黄开茹田朔赵旭东郝德君南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院南京210037

【目的】通过克隆仁扇舟蛾化学感受蛋白(Chemosensory proteins,CSPs)覆盖编码区的cDNA序列全长并研究其特征以及在不同发育阶段、不同日龄、不同组织的表达情况,为研究该蛋白在仁扇舟蛾化学感受系统中的作用奠定基础。【方法】利用转... 详细信息

【目的】通过克隆仁扇舟蛾化学感受蛋白(Chemosensory proteins,CSPs)覆盖编码区的cDNA序列全长并研究其特征以及在不同发育阶段、不同日龄、不同组织的表达情况,为研究该蛋白在仁扇舟蛾化学感受系统中的作用奠定基础。【方法】利用转录组测序和RACE技术克隆CresCSP3的覆盖编码区的全长cDNA序列,使用在线工具预测其信号肽、等电点、分子质量和三维结构。利用Blast进行同源性对比,并用MEGA 6.0软件Neighbor-joining法构建进化树,进而分析其与鳞翅目其他12种昆虫化学感受蛋白的亲缘关系。应用qRT-PCR技术对CresCSP3在不同发育阶段,羽化后1~6日龄雌雄成虫触角以及在雌雄成虫头(不含触角)、触角、足、翅不同组织的表达情况进行分析。【结果】克隆获得仁扇舟蛾1条化学感受蛋白基因的cDNA序列全长,命名为CresCSP3。cDNA全长为545 bp,包括61 bp的5'非翻译区,100 bp的3'非翻译区以及384 bp的开放阅读框,编码127个氨基酸残基,成熟蛋白分子质量14.34 kD,等电点5.75,预测N末端含有18个氨基酸组成的信号肽。CresCSP3的三维结构由6个α-螺旋组成,形成1个疏水性的结合腔,具有化学感受蛋白家族的典型特征。氨基酸序列比较显示仁扇舟蛾化学感受蛋白氨基酸序列与棉铃虫、烟青虫及双委夜蛾比较相近,与亚洲玉米螟和小菜蛾也较为相近,与小菜蛾的CSP相似性最高,氨基酸序列相似性达到61%,而与茶尺蠖的EObl CSP2氨基酸序列的相似性只有27%。系统进化树分析表明,CresCSP3并没有与其他种类聚为一支。qRT-PCR结果表明:CresCSP3在不同发育阶段均有表达,卵期及蛹期表达量较低,并在4龄时达到高峰。CresCSP3在雌雄成虫触角均有分布,但表达情况有差异,雄虫前4天CresCSP3的表达量高于雌虫,3~4天出现高峰,而雌虫于羽化后4、5天出现表达高峰;CresCSP3在触角、头、足和翅中均有分布,相对表达量触角中均为最高,且在雄虫触角中高于雌虫触角。【结论】明确了仁扇舟蛾化学感受蛋白基因仁扇舟蛾化学感受蛋白CresCSP3的结构特征。CresCSP3与其他12种鳞翅目昆虫的CSP亲缘关系较远,表明化学感受蛋白家族的多样性。不同发育阶段CresCSP3的表达方式表明该基因参与仁扇舟蛾在幼虫取食过程中的寄主定位。不同日龄雌、雄虫触角中CresCSP3的表达量特性表明CSP3参与雄虫交配行为和配偶定位,也可能参与雌虫产卵过程中的寄主定位。CresCSP3在雌、雄成虫的触角中表达量最高,可能是因为昆虫主要通过触角感受外界挥发性气味分子,而翅、足、头部一定程度上也会参与对外界环境的感知,CresCSP3的广泛分布表明其对仁扇舟蛾识别环境中复杂的化学信号的从而使机体做出准确的反应起到重要作用。

关键词：仁扇舟蛾化学感受蛋白分子克隆序列分析时空表达

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

芳樟醇、桉叶油素取食胁迫下香樟齿喙象(鞘翅目:象甲科)幼虫的生长发育及抗性基因的转录表达

引用

林业科学 2023年第5期59卷 109-120页

作者：王璟廷李寿银左壮徐文轩郝德君南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学林学院南京210037

【目的】探究香樟齿喙象与香樟互作中的寄主选择和适应机制,明确香樟齿喙象幼虫对芳樟醇、桉叶油素胁迫生境下的生长发育适应性及其解毒代谢方式,以阐明香樟齿喙象专性为害香樟的潜在机制。【方法】采用人工饲料混药法,测定香樟齿喙象... 详细信息

【目的】探究香樟齿喙象与香樟互作中的寄主选择和适应机制,明确香樟齿喙象幼虫对芳樟醇、桉叶油素胁迫生境下的生长发育适应性及其解毒代谢方式,以阐明香樟齿喙象专性为害香樟的潜在机制。【方法】采用人工饲料混药法,测定香樟齿喙象初孵幼虫取食不同质量分数芳樟醇和桉叶油素3天后的死亡率,明确香樟齿喙象幼虫对2种萜类物质的敏感性。分别设定10.0、19.7 mg·g^(-1)的芳樟醇及5.0、15.2 mg·g^(-1)的桉叶油素进行长期取食处理,测定香樟齿喙象幼虫阶段的存活曲线、发育历期、体重等生长发育指标,明确香樟齿喙象幼虫对2种萜类物质的生物学响应。利用qRT-PCR技术,测定香樟齿喙象4龄幼虫取食芳樟醇和桉叶油素后的解毒酶基因(细胞色素P450酶、羧酸酯酶、UDP-葡萄糖醛酸转移酶、谷胱甘肽-S-转移酶和ABC转运蛋白)和表皮蛋白基因的相对表达量变化。【结果】芳樟醇和桉叶油素在2种处理质量分数条件长期胁迫下,对香樟齿喙象幼虫的生长发育产生显著的抑制作用,并且抑制作用随质量分数增加而增强,即发育历期延长、体重降低以及死亡率提高。此外,还表现出幼虫在蜕皮期前后出现高频死亡的特征。相较于桉叶油素,香樟齿喙象幼虫对芳樟醇表现出更强的耐受性。qRT-PCR结果显示,芳樟醇胁迫能够显著地诱导香樟齿喙象幼虫体内细胞色素P450酶和表皮蛋白的基因表达,而桉叶油素取食胁迫下仅有1条UDP-葡萄糖醛酸转移酶的基因表达量显著上调。【结论】香樟齿喙象幼虫对2种寄主植物次生物质的取食胁迫产生不同生理适应性。同时,其幼虫的解毒酶相关基因和表皮蛋白基因对2种萜类物质胁迫的表达响应模式存在差异性。香樟齿喙象幼虫能够有目的地调控不同生理适应机制,以克服不同的寄主次生物质防御,以实现寄主定殖和种群暴发。

关键词：香樟齿喙象寄主次生物质解毒酶表皮蛋白生理适应性

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土固碳潜力的影响

引用

林业科学 2024年第2期60卷 32-41页

作者：史文竹孙禧邵旭升热由索姆王艮梅张焕朝项剑南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学林学院南京210037

【目的】研究外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土过程中土壤CO_(2)排放和土壤碳库的影响,以期为滨海盐碱土的改良利用与固碳潜力提升提供理论依据。【方法】采用室内培养试验,在施用玉米秸秆生物炭+鸡粪(BM)以及水稻秸秆+鸡粪(SM)的基... 详细信息

【目的】研究外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土过程中土壤CO_(2)排放和土壤碳库的影响,以期为滨海盐碱土的改良利用与固碳潜力提升提供理论依据。【方法】采用室内培养试验,在施用玉米秸秆生物炭+鸡粪(BM)以及水稻秸秆+鸡粪(SM)的基础上,以氢氧化钙和硅酸钙作为钙源,按照等钙量原则,分别设置了6种处理:不施用硅酸钙和氢氧化钙(CK)、施用12.4 g·kg^(-1)硅酸钙(Ca1)、施用24.8 g·kg^(-1)硅酸钙(Ca2)、施用7.9 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca3)、施用15.8 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca4)以及施用12.4 g·kg^(-1)硅酸钙+7.9 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca5),进行1个月的培养试验。【结果】培养期间外源钙的添加能显著降低CO_(2)累积排放;有机物料的施用会导致土壤有机碳(SOC)的损失,外源钙的添加不会显著影响SOC矿化但会导致土壤无机碳(SIC)含量显著增加,从而弥补SOC的损失,增加土壤的总碳量,实现土壤固碳的目的,适当增加氢氧化钙的添加量对固碳量有促进作用;外源钙添加导致的减排作用主要是通过增加吸收矿化产生的CO_(2),并转化为碳酸钙的形式而固定。【结论】在改良盐碱土的过程中,有机物料配施硅酸钙和氢氧化钙的改良措施能实现土壤固碳减排。

关键词：滨海盐碱土二氧化碳土壤固碳土壤无机碳

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

广东省与江苏省松材线虫种群遗传结构差异分析

引用

林业科学 2022年第8期58卷 1-9页

作者：丁晓磊汪青桐林司曦赵瑞文张悦叶建仁南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院南京210037

【目的】研究广东省和江苏省松材线虫的遗传变异,为我国松材线虫病的疫源追溯研究奠定基础,并为松材线虫病防控工作提供有力支持。【方法】使用Illumina全基因组重测序的方法,对所有松材线虫样本进行测序深度>40×的高通量测序... 详细信息

【目的】研究广东省和江苏省松材线虫的遗传变异,为我国松材线虫病的疫源追溯研究奠定基础,并为松材线虫病防控工作提供有力支持。【方法】使用Illumina全基因组重测序的方法,对所有松材线虫样本进行测序深度>40×的高通量测序。测序结果经过FastQC质量检测后,利用Cutaadpt软件去除接头序列。利用BWA软件将重测序结果与松材线虫基因组进行比对,使用Samtools和Picard将比对结果进行排序和去冗余,利用Freebayes进行SNP位点挖掘。而后使用VCFtools筛选统计松材线虫SNP位点信息以及突变基因型种类,并用SNPRelate构建所有虫株的系统发育树,最后进行焦磷酸测序验证。【结果】在广东省和江苏省疫木中共分离得到24株松材线虫,两省各12株。在所有松材线虫样本中共发现15100281个SNP位点,其中广东省虫株共发现12990503个SNP位点,江苏省虫株共发现2109778个SNP位点。对所有SNP位点统计分析后发现,广东省虫株的SNP数量和纯合子数量比江苏省虫株多,且差异性显著。此外,广东省大部分虫株出现频率最高的突变基因型为A→G、C→T、G→A、T→C,而所有江苏省虫株与2株广东省虫株GD09和GD12的高频基因型则为A→G、C→G、G→C、T→C。通过聚类分析发现,江苏省虫株和广东省大部分虫株之间遗传分化明显,除GD09和GD12与江苏省虫株聚为一类之外,其他虫株按省份不同分别聚为两类,推测其可能是从江苏有通过人为活动远距离传播至广东省。后续焦磷酸测序试验也验证了测序分析结果的准确性,支持了上述研究结果。【结论】广东省虫株之间存在明显的遗传分化现象,结合我国各地松材线虫病发生时间,推测广东省大部分地区和江苏省的松材线虫具有不同的传播来源,而广东省韶关市和汕头市松材线虫虫株和江苏省虫株具相同的传播来源。

关键词：松材线虫 SNP 遗传多样性种群分化

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

拟蕈状芽孢杆菌JYZ-SD5与菌根真菌互作对水杉生长和耐盐性的影响

引用

林业科学 2023年第1期59卷 99-109页

作者：李振倩吴小芹孔维亮南方现代林业协同创新中心、南京林业大学林学院南京210037

【目的】研究盐胁迫下拟蕈状芽孢杆菌(JYZ-SD5)和裂褶菌(Be)互作对水杉生长和耐盐性的影响,以探究其作用机制,为利用有益微生物提高木本植物耐盐性以及盐碱地生物修复利用提供参考依据。【方法】盐胁迫下采用盆栽试验探讨拟蕈状芽孢杆菌... 详细信息

【目的】研究盐胁迫下拟蕈状芽孢杆菌(JYZ-SD5)和裂褶菌(Be)互作对水杉生长和耐盐性的影响,以探究其作用机制,为利用有益微生物提高木本植物耐盐性以及盐碱地生物修复利用提供参考依据。【方法】盐胁迫下采用盆栽试验探讨拟蕈状芽孢杆菌JYZ-SD5和裂褶菌Be对水杉相关生理代谢指标和耐盐性的影响。【结果】1)与对照相比,各接菌处理均提高了水杉的生物量和根系生长参数,其中双接种JYZ-SD5+Be效果优于单接种,双接种处理的水杉幼苗株高和地径分别提高65.47%和63.46%,根长、根表面积、根体积、总根尖数和分枝数分别显著提高1.05、1.51、2.2、1.88和2.31倍(P<0.05)。2)在盐胁迫下,与未接种对照相比,各接菌处理均有效缓解了盐胁迫对水杉叶片的损害,盐害症状减轻;单接种JYZ-SD5分别显著提高了水杉可溶性糖、可溶性蛋白和脯氨酸12.4%、62.58%和38.99%(P<0.05),单接种Be以及双接种处理分别显著提高水杉脯氨酸122%和35.64%(P<0.05)。3)盐胁迫下,与未接种对照相比,各接菌处理均有效降低水杉H2O2含量、O_(2)·-产生速率、丙二醛含量和电解质渗漏,其中单接种JYZ-SD5分别显著降低26.58%、9%、15.85%和18.76%(P<0.05),单接种Be分别降低8.91%、7.77%、8.54%和22.09%,双接种JYZ-SD5+Be分别显著降低15.58%、26.38%、53.66%和30.39%(P<0.05);同时各接菌处理均显著降低了水杉的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)和谷胱甘肽还原酶(GR)活性。4)盐胁迫下,与未接种对照相比,各接菌处理提高了水杉茎和叶中的K+含量,降低了Na^(+)含量,从而降低了Na^(+)/K^(+)比,尤以单接种Be效果最好,分别显著降低水杉茎和叶Na^(+)/K^(+)比23.84%和26.58%(P<0.05)。【结论】根际促生细菌JYZ-SD5与外生菌根真菌Be可促进水杉生长,并可通过提高水杉植株水分吸收、渗透调节物质积累、维持细胞膜稳定性、降低膜脂质过氧化水平、活性氧积累及抗氧化酶活以及降低Na+/K+比来缓解盐胁迫对水杉的损伤,提高水杉对盐胁迫的耐受性。

关键词：拟蕈状芽孢杆菌JYZ-SD5 裂褶菌Be 水杉盐胁迫耐盐性

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

等温扩增技术快速检测棕榈疫霉

引用

林业科学 2016年第10期52卷 161-166页

作者：戴婷婷吴小芹南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院南京210037

【目的】棕榈疫霉是农林业生产上的一种危害严重的病原菌,建立棕榈疫霉的快速分子检测技术对于预测疫病发生情况、及时采取有效的防治方法控制疫病的传播和流行、减少经济损失具有重要意义。【方法】采用环介导等温核酸扩增技术(loop-me... 详细信息

【目的】棕榈疫霉是农林业生产上的一种危害严重的病原菌,建立棕榈疫霉的快速分子检测技术对于预测疫病发生情况、及时采取有效的防治方法控制疫病的传播和流行、减少经济损失具有重要意义。【方法】采用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),建立了以基因间隔区(intergenic spacer,IGS)为靶标的快速、简单、特异和灵敏的棕榈疫霉菌的检测方法。以IGS基因为靶序列,利用环介导等温核酸扩增技术,设计了多组LAMP引物,同时建立并优化了LAMP反应体系与条件,最终筛选出1组扩增反应结果较好的LAMP引物,采用该组引物进行特异性、灵敏度和实际应用的验证。在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为反应指示剂,根据HNB的颜色变化判定反应结果。【结果】整个检测过程在等温64℃条件下仅需80 min即可通过肉眼直接目测试验结果。在特异性试验中,通过HNB显色只有在棕榈疫霉菌株中能观察到天蓝色的阳性反应,而在其他疫霉、腐霉和真菌的供试菌株仍为紫色的阴性反应;在灵敏度试验中,PpIGS-LAMP技术检测灵敏度达到10fg.μL^(-1)目标菌纯DNA;在实际应用中,PpIGS-LAMP技术能够快速检测出采自田间的木薯根部土壤中目标菌和人工接种发病木薯组织样品的目标菌。【结论】本研究在国内外首次采用环介导等温扩增技术检测棕榈疫霉,建立了1种快速、高灵敏度、高特异性、可视化的棕榈疫霉的LAMP检测方法。建立的棕榈疫霉菌的LAMP检测方法在80 min内可完成待检样品的检测过程,显著缩短检测时间,降低基层部门的检测成本,为棕榈疫霉引起疫病的检疫和所致病害的快速诊断提供了新的检测技术。

关键词：棕榈疫霉环介导等温扩增 PpIGS 羟基萘酚蓝

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：