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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第6期43卷 25-31页

作者：黄金思奚晓桐丁晓磊叶建仁南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】运用SNP标记研究中国广东省松材线虫虫株SNP位点多样性,从分子角度探讨广东省不同地区松材线虫种群的亲缘关系,为松材线虫病的疫源追溯提供基础。【方法】收集来自于广东省各地区松材线虫虫株共30株,提取DNA并进行基因组重测序... 详细信息

【目的】运用SNP标记研究中国广东省松材线虫虫株SNP位点多样性,从分子角度探讨广东省不同地区松材线虫种群的亲缘关系,为松材线虫病的疫源追溯提供基础。【方法】收集来自于广东省各地区松材线虫虫株共30株,提取DNA并进行基因组重测序;利用生物信息学软件分析广东省松材线虫的SNPs位点信息及基因型类型,依据以上信息进行种群聚类分析。【结果】对30株松材线虫虫株SNPs数据进行统计分析,发现GD01、GD09、GD12、GD20、GD22、GD24、GD25这7株虫株的SNP数量、纯合子数量都明显少于其余23株虫株;对基因型类型进行统计分析发现,以上7株虫株出现频率较高的基因型为A->G、C->G、G->C、T->C;其余23株虫株则是A->G、C->T、G->A、T->C这4种基因型出现的频率较高。而通过主成分和聚类分析可将这30株虫株分为3类。【结论】广东省松材线虫种群遗传多样性较高,聚类分析表明其具有不同的传播来源。

关键词：松材线虫高通量测序 SNP 聚类分析广东省

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基于分水岭优化思想的单木信息分割算法

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林业工程学报 2020年第5期5卷 109-116页

作者：刘方舟刘浩云挺南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037

基于机载激光雷达(LiDAR)技术和单木分割算法提取单株树木信息对于单木结构研究、理解树木生长、森林可持续管理具有重要的意义。本研究以分水岭算法为基础,使用可变窗口的局部最大值算法,并采用分层级的区域增长算法及由高度差和梯度... 详细信息

基于机载激光雷达(LiDAR)技术和单木分割算法提取单株树木信息对于单木结构研究、理解树木生长、森林可持续管理具有重要的意义。本研究以分水岭算法为基础,使用可变窗口的局部最大值算法,并采用分层级的区域增长算法及由高度差和梯度构建的能量函数来分割树冠边界,从而优化树顶提取和相邻树冠的分割结果。以中国南方亚热带森林为研究区,测试了针对不同密度(低、中、高密度)、不同树种(白皮松和桉树)以传统分水岭算法和优化算法对于树顶提取及树冠分割的效果。为检验结果的准确性,在实验中对LiDAR数据和人工测量数据的分割结果进行了对比和验证,结果表明:对树冠顶点探测率而言,优化算法平均探测效果(树冠探测率r=0.90、树冠准确率p=0.84、总体准确率f=0.86)优于传统分水岭算法(r=0.62、p=0.81、f=0.78);对树冠边界探测精度而言,优化算法平均探测效果(R 2=0.80、R MSE=0.22 m、R RMSE=12.03%)优于传统分水岭算法(R 2=0.68、R MSE=0.28 m、R RMSE=17.45%)。在树冠探测上,桉树的准确率略低于白皮松,但是与白皮松的探测率相差较小,这表明白皮松对于优化的算法具有较好的鲁棒性,受密度等因素影响较小;在冠幅探测上,桉树和白皮松的精确度随着林分密度的增加而增加,且均有良好的表现。本研究是一种在传统分水岭算法基础上优化的算法,可以较好地提高单木信息分割的效果,这对于了解亚热带森林中林木经营管理、树木竞争及资源监测具有重要意义。

关键词：机载激光雷达单木分割算法区域增长边界控制能量函数

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四种气候变化情景下中国樱桃的潜在适生区预测

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南京林业大学学报（自然科学版） 2024年第4期48卷 235-242页

作者：付陈龙李蒙田昌芬宋炎峰伊贤贵王贤荣南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

【目的】中国樱桃(Prunus pseudocerasus)是我国古老的栽培果树之一。分析当前和未来气候变化情景下中国樱桃潜在适生区的变化趋势,为深入认识中国樱桃生长习性以及合理栽培和资源保护提供参考。【方法】基于中国樱桃现实地理分布数据... 详细信息

【目的】中国樱桃(Prunus pseudocerasus)是我国古老的栽培果树之一。分析当前和未来气候变化情景下中国樱桃潜在适生区的变化趋势,为深入认识中国樱桃生长习性以及合理栽培和资源保护提供参考。【方法】基于中国樱桃现实地理分布数据和环境气候因子数据,使用MaxEnt模型模拟中国樱桃当前、未来2050年代和2070年代4种气候变化情景(SSP126、SSP245、SSP370和SSP585)下的潜在适生区分布,评估影响中国樱桃适生区分布的重要环境气候因子并分析其潜在适生区的变化趋势。【结果】采用ROC曲线法检验预测结果精度为0.936,说明预测结果可信度高。影响中国樱桃潜在适生区范围的关键因子为最冷月最低温、年降水量和最热季平均气温,土壤因子对中国樱桃适生区的限制不明显;现代气候条件下中国樱桃的潜在地理分布区主要集中于华东、华中以及西南地区,其中高适生区主要位于山东中东部和陕西南部;未来气候变化条件下,中国樱桃原本适生区范围收缩,西藏中部、吉林东部出现新的适生区。【结论】未来气候变化情景下,中国樱桃的潜在适生区将持续缩小,呈零星化、碎片化分布,并逐渐向高纬度、高海拔地区移动,这一结果可为中国樱桃种质资源的保护和产业规划提供理论依据。

关键词：中国樱桃潜在适生区种质资源保护 MaxEnt模型

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北美鹅掌楸NAC基因的克隆与表达分析

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植物资源与环境学报 2015年第3期24卷 1-9页

作者：杨颖李火根南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

基于鹅掌楸〔Liriodendron chinense（Hemsl.）Sarg.〕转录组信息,对北美鹅掌楸（*** Linn.）NAC（NAM、ATAF1/2及CUC2）家族基因的结构和功能进行研究。采用RACE技术从北美鹅掌楸叶片中克隆出16个Lt NAC基因的开放阅读框（ORF）,编号为... 详细信息

基于鹅掌楸〔Liriodendron chinense（Hemsl.）Sarg.〕转录组信息,对北美鹅掌楸（*** Linn.）NAC（NAM、ATAF1/2及CUC2）家族基因的结构和功能进行研究。采用RACE技术从北美鹅掌楸叶片中克隆出16个Lt NAC基因的开放阅读框（ORF）,编号为Lt NAC01至Lt NAC16。16个Lt NAC基因的ORF长度为561~1 830 bp,编码187~610个氨基酸。根据理论等电点（p I）,在Lt NAC基因编码的16个Lt NAC蛋白中,9个为碱性蛋白质,7个为酸性蛋白质。根据蛋白质疏水性（GRAVY）,16个Lt NAC蛋白中,13个为亲水蛋白质,3个为两性蛋白质。蛋白质二级结构预测结果显示：16个Lt NAC蛋白均以无规则卷曲为主要构成元件,α螺旋、延伸链和β转角则散布于整个蛋白质中。系统进化分析结果表明：北美鹅掌楸16个Lt NAC基因可能并不参与细胞壁的生物合成,其中,Lt NAC02、Lt NAC03和Lt NAC04基因可能参与北美鹅掌楸的胁迫响应。Lt NAC03、Lt NAC07、Lt NAC08、Lt NAC09、Lt NAC11、Lt NAC12、Lt NAC14、Lt NAC15和Lt NAC16基因的相对表达量与北美鹅掌楸叶片衰老程度呈现相关性,推测该9个Lt NAC基因可能参与调控叶片衰老。

关键词：北美鹅掌楸 LtNAC基因叶片衰老 qRT-PCR

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智慧林业发展现状与展望

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南京林业大学学报（自然科学版） 2022年第6期46卷 83-95页

作者：曹林周凯申鑫杨晓明曹福亮汪贵斌南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

信息技术是人类文明发展的重要推动力,也是当今世界发展最快、影响最大的高新技术之一。随着现代信息技术在林业领域的广泛应用,智慧林业成为了现代林业发展的必由之路。智慧林业是物联网、大数据、云计算、人工智能、移动互联网等新一... 详细信息

信息技术是人类文明发展的重要推动力,也是当今世界发展最快、影响最大的高新技术之一。随着现代信息技术在林业领域的广泛应用,智慧林业成为了现代林业发展的必由之路。智慧林业是物联网、大数据、云计算、人工智能、移动互联网等新一代信息技术与3S技术、智能装备及林木育种、森林培育、森林经营、森林保护等林业生产和管理业务深入融合新模式。我国智慧林业的发展,在现代林业发展中具有重要的里程碑意义。笔者首先介绍了智慧林业产生的背景、内涵、特征、理论基础和研究方法,以及针对智慧林业发展所进行的顶层设计、项目部署实施、科研平台建设及人才培养概况;然后系统介绍了林业智能感知、空间信息技术、大数据及云计算、虚拟现实和智能装备技术等智慧林业关键核心技术的研究现状;进一步介绍了智慧林业在林木遗传育种、森林精准培育、森林资源监测与经营决策、林火监测预测及病虫害防治、野生动植物保护方向上的应用进展;最后,分析了未来智慧林业的发展目标,展望了智慧林业技术体系的主要发展方向。笔者认为,智慧林业的发展需要进一步推进智能算法及硬件的研发和应用,并加强智慧林业理论基础研究;同时,还需在精准多源数据获取的基础上,将现代数据挖掘、模型模拟、智能分析技术融入林业生产的业务流程中,服务林业生产的全产业链,引领林业高质量发展。

关键词：智慧林业林业信息化人工智能林木表型森林培育与监测森林经营决策森林保护与灾害防治

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枫杨秋季扦插繁殖技术的研究

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中南林业科技大学学报 2019年第6期39卷 60-65,83页

作者：李柠陈军曹福亮汪贵斌钱龙梁南京林业大学南方现代林业协同创新中心

为了研究秋季不同的处理方法对枫杨硬枝和嫩枝扦插生根的影响以及扦插生根与插穗内营养物质含量之间的关系,分别以枫杨的硬枝和嫩枝为实验材料,从3种不同种类的外源生长调节剂及浓度等方面研究了不同处理分别对硬枝和嫩枝生根的影响,同... 详细信息

为了研究秋季不同的处理方法对枫杨硬枝和嫩枝扦插生根的影响以及扦插生根与插穗内营养物质含量之间的关系,分别以枫杨的硬枝和嫩枝为实验材料,从3种不同种类的外源生长调节剂及浓度等方面研究了不同处理分别对硬枝和嫩枝生根的影响,同时测定了枫杨扦插不同时期的可溶性糖和可溶性蛋白质的含量。结果表明:枫杨硬枝的扦插成活率高于嫩枝,其中最适合硬枝扦插的外源生长调节剂为IBA+ABT2000mg/L,生根率高达94.22%,生根效果指数为15.11;最适合嫩枝扦插的外源生长调节剂为GGR1000mg/L,生根率为48.20%,生根效果指数为2.81。枫杨硬枝和嫩枝扦插都是以皮部生根为主。生根过程中插穗基部的可溶性糖含量先急剧下降后缓慢升高,蛋白质含量变化趋势总体呈下降—升高。

关键词：枫杨硬枝嫩枝插穗营养物质

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5个南方型杨树无性系苗木耐盐性盆栽试验

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林业科学研究 2019年第3期32卷 105-112页

作者：程方赵小军倪云黄开栋张康唐罗忠南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

[目的]研究盐胁迫对杨树生长及生理指标的影响,开展不同杨树无性系耐盐性比较及评价。[方法]以895杨(Populus×euramericana ‘Nanlin895’)、1388杨(P.×euramericana ‘Nanlin1388’)、3804杨(*** ‘Nanlin3804’)、110杨(***×***.‘110’)和328杨(P.×euramericanacl.‘328’)5个杨树无性系为材料,采用室内盆栽方法,以无盐处理为对照,对其在不同盐(NaCl)浓度处理(1‰、2‰、3‰、4‰、5‰)土壤下的成活率、生长量、叶片细胞质膜透性、丙二醛含量、光合速率等13项指标进行测定和分析,采用隶属函数法对其耐盐性进行了综合评价。[结果]在土壤盐胁迫下5个杨树无性系的苗高、地径和生物量生长均受到了抑制;苗木成活率、叶片光合速率和叶绿素含量均随盐处理浓度的提高而降低;叶片细胞质膜透性和丙二醛含量随着盐处理浓度的提高而提高。[结论]5个杨树无性系耐盐性存在差异,其顺序为:110杨>328杨>3804杨>895杨>1388杨。110杨能耐受3‰左右的土壤含盐量,其它无性系只能耐受2‰左右。

关键词：杨树盆栽耐盐性隶属函数法综合评价

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淹水处理下杨树不同无性系苗木根系形态变化

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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第5期43卷 1-8页

作者：赵小军程方张康黄开栋倪云孟晓唐罗忠南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】了解淹水处理下不同杨树无性系苗木根系的形态变化规律,揭示杨树对淹水胁迫的根系适应策略,为筛选耐水的杨树无性系提供依据。【方法】选用3804杨、1388杨、895杨、110杨和328杨5个杨树无性系,设置对照、渍水和淹水3种处理,测... 详细信息

【目的】了解淹水处理下不同杨树无性系苗木根系的形态变化规律,揭示杨树对淹水胁迫的根系适应策略,为筛选耐水的杨树无性系提供依据。【方法】选用3804杨、1388杨、895杨、110杨和328杨5个杨树无性系,设置对照、渍水和淹水3种处理,测定苗木根系的生物量、长度、数量、表面积、体积等指标。【结果】①渍水处理下杨树根生物量与对照无显著差异,但淹水处理下的根生物量却显著小于对照。②渍水和淹水处理下的多数杨树无性系苗木一级根数量与对照之间没有显著差异,但总根长、总根投影面积、总根表面积和总根体积却大于对照。③与对照相比,渍水和淹水处理下的杨树苗木根系平均直径有所减小,但根尖数、分叉数和交叉数却增大。④主成分分析提取出的2个主成分累积贡献率为88.58%,可较好地反映杨树苗木根系形态特征。【结论】隶属函数法分析表明,在渍水处理下5个杨树无性系根系形态表现的优劣顺序是1388杨>895杨>3804杨>110杨>328杨;在淹水处理下的优劣顺序是1388杨>895杨>110杨>328杨>3804杨。所以,从根系形态表现看,1388杨和895杨的耐水性较强。

关键词：杨树无性系渍水处理淹水处理根系形态综合评价

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高温干旱复合胁迫对构树幼苗抗氧化酶活性和活性氧代谢的影响

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生态学报 2016年第2期36卷 403-410页

作者：吴永波叶波南京林业大学江苏省南方现代林业协同创新中心南京210037

近年来,全球气温不断升高,亚热带部分地区夏季高温和临时性干旱现象日益显著,高温与干旱严重威胁着植物的生存与生长。采用盆栽和人工气候室方式模拟不同的温度和土壤水分梯度,研究了高温与干旱复合胁迫对构树幼苗超氧化物歧化酶(SOD)... 详细信息

近年来,全球气温不断升高,亚热带部分地区夏季高温和临时性干旱现象日益显著,高温与干旱严重威胁着植物的生存与生长。采用盆栽和人工气候室方式模拟不同的温度和土壤水分梯度,研究了高温与干旱复合胁迫对构树幼苗超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)与过氧化氢酶(CAT)活性、活性氧代谢和丙二醛(MDA)含量的影响。结果表明:(1)高温或干旱单一胁迫下,构树幼苗SOD、POD、CAT活性增加,复合胁迫下,SOD和POD酶活性高于单一胁迫,且随着复合胁迫时间延长而升高。SOD活性受温度和土壤水分双因素影响极其显著,复合胁迫对SOD活性有一定程度的叠加效应;(2)复合胁迫下,活性氧代谢物与MDA含量均显著高于单一胁迫,表明复合胁迫加剧对植物的伤害。通过改变抗氧化酶活性以减轻膜脂过氧化的伤害作用是有限的。

关键词：高温干旱抗氧化酶活性活性氧代谢构树幼苗

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拟松材线虫个体发育研究（英文）

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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第6期43卷 11-17页

作者：尚征周立峰冯玥瑶刘费樱陈凤毛南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】探索拟松材线虫(Bursaphelenchus mucronatus)的繁殖能力,并对其胚胎发育过程中经历的重要阶段和卵的形态变化进行研究,了解胚胎发育和完成整个生活史所需时间,为进一步研究其生长发育并进行有效防控提供参考。【方法】分别挑取... 详细信息

【目的】探索拟松材线虫(Bursaphelenchus mucronatus)的繁殖能力,并对其胚胎发育过程中经历的重要阶段和卵的形态变化进行研究,了解胚胎发育和完成整个生活史所需时间,为进一步研究其生长发育并进行有效防控提供参考。【方法】分别挑取3组180条拟松材线虫雌成虫,观察记录雌虫在25℃条件下的产卵情况,每隔2 h统计每组线虫的累积产卵量,直至卵的数量基本不再增加。挑取尚未产卵的拟松材线虫雌虫于载玻片上,待其产卵后,将卵置于蔡司体视显微镜下观察。连续观察胚胎的发育过程并使用照片记录不同发育阶段胚胎的形态变化,记录卵发育至不同阶段所需时间。挑取约200个刚产下的拟松材线虫卵,在25℃条件下发育24 h后每隔4 h统计其总孵化率,直至孵化数不再增加,设置3组重复。将刚孵化的2龄幼虫接种于灰葡萄孢(Botrytis cinerea)上,分为3组,每组设置3个重复,分别在接种1、2、3 d后使用贝尔曼漏斗法收集线虫,计算混合龄线虫中每龄期线虫所占比例,计算拟松材线虫胚后发育及完成整个生活史所需时间。【结果】①在拟松材线虫产卵能力方面,0~10 h拟松材线虫产卵总量增长较快,16 h后产卵量逐渐趋于稳定,28 h内雌虫平均累积产卵12粒/条。②拟松材线虫的胚胎发育过程主要经历以下几个关键阶段:单胞期、双胞期、3胞期、4胞期、5胞期、8胞期、16胞期、囊胚期、利马豆期、蝌蚪期、蠕虫期、1龄幼虫(J1),至孵化为2龄幼虫(J2)时结束。③在胚胎发育前期,第1次卵裂发生的位置存在两种情况,即卵的1/2和1/3处。双胞发育至5胞时也存在两种不同的发育方式,一种是双胞不移动直接分裂成3胞并列排列,另外一种是细胞进行移动,3胞呈三角形排列。通过观察30个卵的第1次卵裂和100个卵双胞的发育过程发现,这些不同的发育方式均是普遍存在的。④在25℃条件下,拟松材线虫卵的累积孵化率随时间增加而增加,在32 h时达到最高(93.31%),随后逐渐趋于稳定。⑤在25℃条件下记录了拟松材线虫卵从单胞发育至各个阶段的时间,完成整个胚胎发育过程需要约28 h。2龄幼虫接种于灰葡萄孢3 d后即可获得新的2龄幼虫,因此拟松材线虫完成整个生活史只需要3 d。【结论】对拟松材线虫卵从单胞阶段直至孵化的整个胚胎发育过程进行观察发现,拟松材线虫完成胚胎发育大约需要28 h,完成整个生活史需要3 d。对拟松材线虫产卵能力和卵的孵化率进行统计,收集拟松材线虫卵和2龄幼虫的最佳时间分别为16 h和36 h。拟松材线虫胚胎发育前期,在第1次卵裂期以及由双胞期发育至5胞期的两个过程中均存在两种与同属线虫不同的发育方式。这种现象还有待进一步研究。

关键词：拟松材线虫产卵能力胚胎个体发育

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