检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2022年

作者：潘志良张金鹏柏胜军郦芝汀童春发南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心

插入或缺失多态性（insertion or deletion polymorphisms， InDel）是生物体中一种常见且具有重要功能的序列多态性类型。InDel在基因组中分布广泛，并且具有多等位性和共显性的特点。InDel不仅弥补了SSR数量少的缺点，而且比SNP更容... 详细信息

插入或缺失多态性（insertion or deletion polymorphisms， InDel）是生物体中一种常见且具有重要功能的序列多态性类型。InDel在基因组中分布广泛，并且具有多等位性和共显性的特点。InDel不仅弥补了SSR数量少的缺点，而且比SNP更容易通过凝胶电泳进行检验，同时它对蛋白质的结构和功能会产生更大的影响。随着二代测序技术的进步，能够快速、经济、准确地识别群体中大量个体的InDel基因型，使得构建高密度InDel遗传连锁图谱成为可能。本研究以美洲黑杨和小叶杨的杂交F;代群体中的两个亲本和140个子代为材料，构建了两个亲本的InDel遗传连锁图谱。以毛果杨基因组为参考序列，在两个亲本中共鉴定出129 167个InDel，其中来自母本美洲黑杨的有65 997个，来自父本小叶杨的有73 002个，两个亲本共有9 832个。经卡方检验，共获得1 620个符合孟德尔分离比的InDel标记，用于构建遗传连锁图谱。母本遗传图谱包含777个InDel标记和19个连锁群，图谱的总长度为2 867.76 cM，相邻标记间的平均距离为3.78 cM。父本的遗传图谱由669个InDel标记和19个连锁群组成，总长度为3 423.56 cM，平均标记间距为5.27 cM。结果显示两个亲本的连锁图谱与毛果杨参考基因组之间具有很高的共线性。本研究首次构建了杨树的InDel遗传连锁图谱，为研究杨树重要的经济和生态性状的遗传变异提供了不可或缺的遗传资源。

关键词：杨树插入或缺失多态性遗传连锁图谱二代测序技术

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杉木人工林林分叶面积动态变化规律

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生态学报 2024年第13期44卷 5609-5620页

作者：屈彦成江怡航陈涵玥张建国张雄清中国林业科学研究院林业研究所林木资源高效生产全国重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037

叶面积与树木生长密切相关,是量化树木潜在生产能力的重要因子,其动态变化直接驱动林木生长的变化,但目前学者们对于林分叶面积动态变化规律却持有不同的观点。以亚热带不同气候区杉木人工林为研究对象,基于54个样地,共144株解析木的数... 详细信息

叶面积与树木生长密切相关,是量化树木潜在生产能力的重要因子,其动态变化直接驱动林木生长的变化,但目前学者们对于林分叶面积动态变化规律却持有不同的观点。以亚热带不同气候区杉木人工林为研究对象,基于54个样地,共144株解析木的数据,采用6种生长方程通过非线性混合效应模型分别构建杉木单木叶面积模型和林分密度模型,将二者相乘得到林分叶面积动态变化模型,进而探究其动态变化规律。结果表明,以样地作为随机效应因子,考虑Logistic方程a参数上的随机效应,同时不考虑异方差结构的混合模型(样地水平)作为单木叶面积的最优模型;以地区作为随机效应因子,考虑Logistic方程a参数上的随机效应,同时不考虑异方差结构的混合模型(总体平均水平)作为林分密度的最优模型;林分叶面积动态变化呈单峰形式,幼龄阶段增长较快,达到峰值后迅速下降,之后下降幅度减少。本研究在考虑林分自然稀疏的前提下从生长模型的角度证明了杉木林分叶面积动态变化呈单峰型,而非达到顶峰后保持不变,同时也表明林分叶面积达到顶峰后下降是由于林分密度的降低引起的。研究结果对于合理经营不同气候梯度的杉木人工林具有重要意义。

关键词：杉木林分叶面积动态变化单峰自然稀疏

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基于文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge.)基因组SSR标记的开发及初步验证

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分子植物育种 2023年第9期21卷 2971-2979页

作者：乐琳琳杨晓明郁万文蔡金峰汪贵斌李守科赵祥树曹福亮南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 山东沃奇农业开发有限公司潍坊262100

本研究基于文冠果全基因组信息,开展SSR分子标记鉴定与分析研究。结果表明,文冠果全基因组全长477586502 bp,共存在253336个SSR位点,平均每1870 bp出现一个SSR位点,GC含量为34.96%;不同染色体上的SSR位点数量不同,其中,SSR位点数量最多... 详细信息

本研究基于文冠果全基因组信息,开展SSR分子标记鉴定与分析研究。结果表明,文冠果全基因组全长477586502 bp,共存在253336个SSR位点,平均每1870 bp出现一个SSR位点,GC含量为34.96%;不同染色体上的SSR位点数量不同,其中,SSR位点数量最多的是1号染色体,SSR位点数量最少的是15号染色体。SSR位点的平均长度为18.92 bp,且重复单元中单核苷酸到六核苷酸的数量呈下降趋势。SSR位点的重复次数主要集中在4~13次重复范围内,且同一重复类型,重复次数越多,SSR位点出现的频率越低。文冠果基因组中共存在268种SSR重复类别,重复基元种类随重复次数增加而增加。单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸的重复单元中,出现最多的分别是A/T、AT/AT、AAG/TTC、AAAT/TTTA、AAAAT/TTTTA和AAAACG/TTTTCG,显示出明显的A/T偏好性。虽然不同的SSR重复单元的序列长度有所不同,但其均显示出SSR重复单元的序列长度的增加,而SSR位点数减少的趋势。进一步利用6份不同种源的文冠果对待测引物进行多样性分析,得到30对条带清晰、多态性好的SSR引物。本研究将为今后文冠果种质资源鉴定和遗传图谱的构建奠定重要基础。

关键词：文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge.) 基因组 SSR 标记开发

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杉木生长性状的空间与竞争效应及其对遗传参数估计的影响

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林业科学 2022年第5期58卷 75-84页

作者：史月冬郑宏叶代全施季森边黎明南京林业大学林木遗传与生物技术教育部重点实验室南京210037 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 福建省洋口国有林场南平353000

【目的】探讨整合空间与竞争效应的模型对不同林龄阶段杉木生长性状遗传参数评估的影响,为提高育种值预测和优良单株选择的准确性提供理论依据。【方法】以40年生杉木自由授粉子代测定林为研究对象,以幼林龄阶段、中林龄阶段和过成熟林... 详细信息

【目的】探讨整合空间与竞争效应的模型对不同林龄阶段杉木生长性状遗传参数评估的影响,为提高育种值预测和优良单株选择的准确性提供理论依据。【方法】以40年生杉木自由授粉子代测定林为研究对象,以幼林龄阶段、中林龄阶段和过成熟林阶段的胸径和树高为目标性状,基于最佳线性无偏估计的混合线性模型方法,分别拟合试验设计效应、空间效应、竞争效应、空间-竞争效应,利用赤池信息准则评价模型,对比不同模型估计的遗传参数和育种值。【结果】1)拟合空间-竞争效应平均提高生长性状狭义遗传力估计值的39.72%。针对不同林龄阶段胸径性状的遗传参数,拟合空间-竞争混合模型的加性遗传方差相比标准混合线性模型、空间模型和竞争模型分别提高4.46%、26.95%和35.87%,残差分别降低21.95%、26.81%和20.19%;树高性状空间-竞争模型的加性遗传方差1991和2020年相比基本模型提高10.73%和1.22%,残差降低12.75%和33.83%。2)竞争强度与林分个体间的距离有关,杉木生长性状受到相同行列个体的竞争效应要显著高于对角线方向个体。3)生长性状存在竞争效应,且径生长大于高生长。同一性状的加性-竞争效应相关表明,杉木生长性状在不同林龄均表现出竞争效应,幼林龄阶段径生长受到的竞争效应大于高生长;中林龄阶段生长性状表现出强烈的竞争相关,结合残差相关结果发现,杉木在中林龄表现出强烈的竞争效应。个体间胸径的竞争影响大于树高间的竞争影响,胸径比树高更能感受到竞争的敏感程度。4)在5%入选率下,育种值平均预测准确性为0.559。4种模型分别选出23个个体,其中78.3%的入选单株重复。基本模型、空间模型、竞争模型和空间-竞争模型的入选单株胸径均值分别为37.3、37.2、37.3和37.3 cm,遗传增益分别为12.73%、13.86%和13.32%、14.37%。【结论】采用竞争-空间模型拟合参数可增加加性遗传方差并降低残差方差的估计值;林分内目标单株受对角线方向的竞争性弱于行、列方向单株的竞争。中林龄阶段生长性状所受竞争效应最大,径生长对竞争的敏感性大于高生长。

关键词：竞争效应空间效应混合线性模型遗传参数杉木

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‘渤丰3号’杨叶片高效原生质体提取体系的建立与优化

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林业科学研究 2025年第2期38卷 116-126页

作者：钟姗辰张伟溪张冰玉苏晓华唐芳中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种全国重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

[目的]建立欧美杨‘渤丰3号’叶片高效的原生质体提取体系,为基因功能研究和基因编辑分子育种提供技术支撑。[方法]利用两种组分的酶解液和不同的预处理方法检测‘渤丰3号’杨叶片原生质体提取的效率和质量,优化原生质体纯化条件,以建... 详细信息

[目的]建立欧美杨‘渤丰3号’叶片高效的原生质体提取体系,为基因功能研究和基因编辑分子育种提供技术支撑。[方法]利用两种组分的酶解液和不同的预处理方法检测‘渤丰3号’杨叶片原生质体提取的效率和质量,优化原生质体纯化条件,以建立最适合‘渤丰3号’杨叶片高效的原生质体提取方法。[结果]结果表明,酶解液1(1.5%纤维素酶+0.75%离析酶+20 mmol·L^(-1)MES+10 mmol·L^(-1)KCl+0.6 mol·L^(-1)甘露醇+10 mmol·L^(-1)CaCl_(2)+1%BSA)酶解原生质体的效果优于酶解液2(0.8%纤维素酶+0.2%离析酶+5 mmol·L^(-1)MES+0.6 mol·L^(-1)甘露醇),酶解液1酶解得到的原生质体数量较多,且细胞较为完整,杂质少。酶解前的抽真空处理能略微提高原生质体的数量,但得到的原生质体与未抽真空处理的相比,细胞易碎、杂质更多;而换用更小空隙细胞筛对原生质体过滤的效果提升不明显。采用W5溶液直接洗涤可以获得最多的原生质体但有少许的杂质,在样品量有限的情况下可以使用该纯化方式。0.5 mol·L^(-1)蔗糖溶液纯化后的原生质体中杂质最少,但会损失较多的原生质体细胞;而0.75 mol·L^(-1)蔗糖溶液的纯化效果最好,既能减少杂质,又能获得较多的原生质体,适用于对原生质体纯度要求较高的情况。[结论]通过优化酶解条件、预处理步骤和纯化方法,本研究建立了欧美杨‘渤丰3号’叶片高效的原生质体提取体系。这一体系能够显著提高原生质体的提取效率和纯度,为后续的基因功能研究和分子育种实验提供了可靠的基础。

关键词：欧美杨 ‘渤丰3号’杨原生质体酶解原生质体纯化

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Zn对解淀粉芽孢杆菌JK-JS8生物膜形成及拮抗能力的影响

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微生物学通报 2022年第10期49卷 4134-4143页

作者：汤雨葳于孟叶建仁南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

【背景】锌(Zn)是一种微量元素,对细菌细胞的结构和调节系统非常重要。细菌在环境中会受到高浓度锌离子影响,进而影响其自身的功能。【目的】研究Zn对解淀粉芽孢杆菌JK-JS8生物膜及拮抗松枯梢病病菌能力的影响,探讨二者之间的联系和可... 详细信息

【背景】锌(Zn)是一种微量元素,对细菌细胞的结构和调节系统非常重要。细菌在环境中会受到高浓度锌离子影响,进而影响其自身的功能。【目的】研究Zn对解淀粉芽孢杆菌JK-JS8生物膜及拮抗松枯梢病病菌能力的影响,探讨二者之间的联系和可能的作用机制,为生防菌在不同环境条件下的应用提供理论依据。【方法】观察解淀粉芽孢杆菌JK-JS8在不同浓度锌离子条件下生物膜的形成情况,采用平板对峙法探究非致死浓度的锌离子对解淀粉芽孢杆菌JK-JS8拮抗松枯梢病病菌效果的影响,通过RT-qPCR检测ZnCl_(2)处理后生物膜相关基因的表达,检测抗菌产物的生成情况。【结果】300μmol/L ZnCl_(2)对解淀粉芽孢杆菌JK-JS8的生长量无影响,但显著抑制了JK-JS8生物膜形成能力及拮抗病原菌能力。Zn胁迫下,tasA、spo0A和bamD等生物膜相关基因的表达量与对照组相比明显下调,通过液相色谱检测到抑菌产物bacillomycin D的产量在24、48和72 h时分别降低了39.1%、58.8%和61.0%。【结论】环境中的锌离子浓度过高会影响解淀粉芽孢杆菌JK-JS8的生物膜形成,进而降低其拮抗病原菌的能力。

关键词： Zn 解淀粉芽孢杆菌生物膜拮抗作用

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不同四照花观赏价值的综合评价

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植物资源与环境学报 2022年第6期31卷 43-51页

作者：崔毅婵林雪茜杨玲洑香香南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 苏州林业站江苏苏州215128

对4月至12月间尖叶四照花〔Cornus elliptica(Pojarkova)*** et Boufford〕、秀丽四照花〔*** ***(*** et ***)***〕、东京四照花〔*** ***(***)***〕、日本四照花(*** *** ex Hance)、四照花〔*** ***(Osborn)***〕、四照花品种‘中国女孩’(*** ***‘China Girl’)和大花四照花(*** Linn.)(前3个为常绿四照花,后4个为落叶四照花)的物候期进行观测,并基于叶片、花苞片和果实的12个观赏指标,采用层次分析(AHP)法对这些四照花的观赏价值进行综合评价。结果表明:不同四照花的物候期存在差异,其观赏价值不仅体现在丰富多彩的花苞片和果实颜色上,还体现在春、秋季叶色变化上。而且,落叶四照花的花期和果期早于常绿四照花。花苞片颜色、叶色变化、花苞片形状和花期持续天数对目标层的权重分别为0.3122、0.1552、0.0927和0.0927。根据综合得分,供试四照花分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级,其中,Ⅰ级包括东京四照花、大花四照花和秀丽四照花,综合得分分别为3.350、3.175和3.171;Ⅱ级包括日本四照花和尖叶四照花,综合得分分别为3.028和2.963;Ⅲ级包括四照花及四照花品种‘中国女孩’,综合得分分别为2.866和2.704。然而,秀丽四照花的大田栽培适应性较差,故将其归入Ⅱ级。综上所述,四照花的观赏价值主要体现在花苞片颜色、叶色变化、花苞片形状和花期持续天数上;东京四照花和大花四照花为优质四照花资源,可作为长江中下游地区四照花推广和应用的备选对象。

关键词：四照花物候期观赏指标层次分析(AHP)法观赏价值综合评价

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滨海盐碱地典型人工林土壤有机碳分布特征与关键影响因素研究

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生态与农村环境学报 2025年

作者：郑辉杰彭翔李涛张金池曾婧祎张水锋刘鑫南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏省水土保持与生态修复重点实验室华设设计集团股份有限公司南京警察学院

本研究旨在阐明滨海盐碱地人工林土壤有机碳分布特征及其主要影响因素，以期为进一步提升滨海盐碱地人工林生态系统碳汇增量提供科学依据。本研究以江苏滨海盐碱地同时期造林的5种林龄为15年的典型人工林杨树（Populus tomentosa）、速... 详细信息

本研究旨在阐明滨海盐碱地人工林土壤有机碳分布特征及其主要影响因素，以期为进一步提升滨海盐碱地人工林生态系统碳汇增量提供科学依据。本研究以江苏滨海盐碱地同时期造林的5种林龄为15年的典型人工林杨树（Populus tomentosa）、速生白蜡（Fraxinus chinensis）、岩榆树（Ulmus thomasii）、榉树（Zelkova serrata）、皂荚（Gleditsia sinensi）为研究对象，通过测定0-20cm、20-40cm、40-60cm等3个土层土壤物理性质、化学性质、酶活性和土壤碳含量等指标，利用结构方程模型（SEM）等分析方法进行综合分析。结果表明：（1）各林地间土壤物理性质改良效果无显著差异（p>0.05），随着土层加深，滨海盐碱地人工林土壤密度逐渐升高，而土壤通气度、孔隙度逐层下降。（2）榉树林与皂荚林的土壤pH值、电导率和碱化度在各林地中较低，对盐碱土的改良效果较好，而杨树林和速生白腊林则改良效果较差。（3）杨树林地土壤蔗糖酶活性最高，而岩榆林地土壤β-葡萄糖苷酶和脲酶活性最高，皂荚林则最低。（4）各林分表层（0-20cm）土壤有机碳含量之间差异不显著（p>0.05），而20cm以下土层林分间的土壤有机碳含量存在显著差异（p<0.05），其中，岩榆林的土壤碳固持占据优势。（5）土壤酸碱度和脲酶活性是影响滨海盐碱地土壤固碳能力的主要因素。因此，通过优化滨海盐碱地人工林深层土壤结构，提高脲酶等土壤酶活性，可有效提升深层土壤有机碳含量，增强土壤固碳能力。

关键词：滨海盐碱地人工林土壤固碳酶活性

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杉木人工林林分空间结构分析及综合指数评价

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西北林学院学报 2024年第6期39卷 10-16页

作者：张俊鹏徐钊温小荣汪求来叶金盛南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学林学院江苏南京210037 江苏省森林资源监测中心江苏南京210036 广东省林业调查规划院广东广州510520

基于广东省羊角山林场、连山林场和金鸡林场9个杉木人工林样地的实测数据,对杉木人工林林分空间结构参数进行评价和分析,为优化和调整杉木人工林的林分空间结构奠定基础。采用角尺度、混交度、大小比数、开敞度和竞争指数5个林分空间结... 详细信息

基于广东省羊角山林场、连山林场和金鸡林场9个杉木人工林样地的实测数据,对杉木人工林林分空间结构参数进行评价和分析,为优化和调整杉木人工林的林分空间结构奠定基础。采用角尺度、混交度、大小比数、开敞度和竞争指数5个林分空间结构参数,分析不同龄组(幼龄林、中龄林、近成熟林)以及不同密度(1 700、2 000、2 300株/hm^(2))杉木林林分空间结构特征,通过熵权法构建林分空间结构综合指数。结果表明,9个样地的杉木林各龄组的角尺度处于均匀分布和随机分布状态之间;林分混交度普遍较低;杉木各龄组的大小比数都接近中庸状态,林木分化水平较低;开敞度在不同龄组间差异显著;竞争指数在3个龄级之间呈极小幅度的波动;不同龄组的林分空间结构理想程度为:中龄林>近成熟林>幼龄林;不同密度的林分空间结构理想程度为:低密度>中密度>高密度。以样地林分空间结构分析与评价为依据,采取合理的营林措施,可以使杉木人工林的林分水平分布格局逐渐趋向随机分布,混交状态逐渐趋向最高混交,林分竞争状态逐渐趋向优势态竞争,从而促进其可持续经营。

关键词：杉木人工林林分空间结构熵权法林分空间结构综合指数

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基于多源遥感数据的溧阳市林地植被覆盖度时空差异研究

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南京林业大学学报(自然科学版) 2023年第6期47卷 183-191页

作者：王艳芳谭露郭红丽吴芳齐斐蒙雯婷徐雁南南京林业大学林草学院南方现代林业协同创新中心江苏省水文水资源勘测局江苏省水利科学研究院

【目的】分析不同空间分辨率影像各季节林地植被覆盖度(fractional vegetation cover, FVC)提取的精度差异，为选择遥感影像提取林地植被覆盖因子提供理论支持和参考。【方法】选择江苏溧阳市林地为研究区，以Sentinel-2、Landsat-8、MO... 详细信息

【目的】分析不同空间分辨率影像各季节林地植被覆盖度(fractional vegetation cover, FVC)提取的精度差异，为选择遥感影像提取林地植被覆盖因子提供理论支持和参考。【方法】选择江苏溧阳市林地为研究区，以Sentinel-2、Landsat-8、MODIS等几种常用的不同空间分辨率的遥感影像为数据源，基于像元二分模型提取FVC,利用半变异函数阐明不同季节FVC的空间变异特征，通过混淆矩阵对比分析各个季节不同分辨率影像提取FVC的精度差异。【结果】(1)用半变异函数可以有效描述FVC的空间变异特征，空间变异程度的季节差异表现为冬季>春季>秋季>夏季。(2)用不同分辨率影像提取的FVC在水陆交界处及林地斑块边缘差异最为显著，各个季节FVC的提取精度表现为夏季>秋季>春季>冬季。其中，夏季30、250以及500 m空间分辨率影像提取FVC的精度分别为90.99%、76.28%、76.71%。(3)植被盖度等级对FVC提取精度有显著影响，高覆盖等级提取精度较高，低覆盖等级提取精度较低。低分辨率影像FVC提取精度在植被生长茂盛的夏季显著提升。【结论】不同FVC等级地表对高分辨率影像的监测需求有较大的分异性，夏季利用低分辨率影像提取FVC的可替代性最高，本研究结果有利于提高植被动态监测的精度和效率。

关键词：植被覆盖度 Sentinel-2 Landsat-8 MODIS 半变异函数江苏溧阳

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