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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第4期48卷 254-260页

作者：匡泽宇彭冶方炎明南京林业大学南方现代林业协同创新中心生命科学学院亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室

【目的】检测铁冬青(Ilex rotunda)雌株和雄株开花进程中挥发性成分的种类差异和动态，观察传粉昆虫的种类及行为，明确铁冬青传粉系统特性，探究其挥发性成分的变化规律对传粉昆虫行为的潜在影响，为提高铁冬青授粉效率及其观赏利用价... 详细信息

【目的】检测铁冬青(Ilex rotunda)雌株和雄株开花进程中挥发性成分的种类差异和动态，观察传粉昆虫的种类及行为，明确铁冬青传粉系统特性，探究其挥发性成分的变化规律对传粉昆虫行为的潜在影响，为提高铁冬青授粉效率及其观赏利用价值提供参考。【方法】利用顶空固相微萃取(HS-SPME)和气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术分析铁冬青大蕾期、初绽期、盛开期、末花期4个阶段花挥发性成分的变化；采用观测法，记录传粉昆虫的种类、访问频次，分析昆虫的访花行为及访花频率变化规律。【结果】(1)铁冬青花期共检测出30种挥发性物质，其中雌花检测出19种，雄花检测出21种。(2)挥发性成分中，β-石竹烯等主要成分含量的变化规律是先上升后降低，在盛花期达到峰值。末花期主成分的含量占比普遍降低，醇类、烷烃类的占比有所上升，伴随出现罗勒烯等多种新化合物。(3)铁冬青的授粉昆虫较为单一，为中华蜜蜂(Apis cerana),雌株与雄株的访问高峰期高度重叠，中华蜜蜂更倾向于访问雄花，其访花频率的变化趋势与β-石竹烯含量变化规律一致。【结论】推测β-石竹烯可能作为一种信息物质吸引中华蜜蜂进行授粉；利用中华蜜蜂“集中式”的访花模式，集中且合理搭配栽植铁冬青雌雄株，配合花期一致、雄株花量大的规律，可有效提高提冬青的授粉成功率。

关键词：铁冬青中华蜜蜂挥发性有机化合物传粉昆虫气相色谱-质谱联用技术

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中国东部地区马尾松与黄山松群落分类及群落结构和物种多样性特征

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第1期48卷 47-58页

作者：范明阳胡萌杨园方炎明南京林业大学生命科学学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室

【目的】马尾松(Pinus massoniana)是中国亚热带地区主要的针叶树种，黄山松(***)是中国东部亚热带中山地区的主要建群种，两个物种在水平区域内分布基本重合，但垂直分布差异明显。深入了解马尾松林与黄山松林的分布格局，可以为科学... 详细信息

【目的】马尾松(Pinus massoniana)是中国亚热带地区主要的针叶树种，黄山松(***)是中国东部亚热带中山地区的主要建群种，两个物种在水平区域内分布基本重合，但垂直分布差异明显。深入了解马尾松林与黄山松林的分布格局，可以为科学管理保护马尾松和黄山松森林资源提供理论依据。【方法】基于中国亚热带东部地区8个典型马尾松林与黄山松林分布地域开展植被调查，采用非度量多维标度分析(NMDS)和多元回归树(nultivariate regression trees, MRT)探讨两种松林群落结构的差异及主要影响因子，采用线性混合效应模型定量分析各物种多样性指标对非生物因子的响应；在遵从《中国植被志》研编规范的基础上，对马尾松林与黄山松林进行初步的数量分类。【结果】马尾松群落与黄山松群落结构存在明显差异，主要影响因子为海拔；年均气温对两种群落物种丰富度影响显著，对两种群落总体物种丰富度影响最显著的因子是年均降水量，海拔对两种群落总体的均匀度产生显著的影响；对马尾松林与黄山松林进行初步植被分类，马尾松林被划分为6个群丛，黄山松林被划分为5个群丛。【结论】海拔变化塑造了中国东部地区马尾松林与黄山松林群落结构的差异，并直接或间接地影响两种群落的物种多样性。通过植被分类可以了解两种松林植被类型的多样化，并为后续两种松林分类后续工作提供参考。

关键词：马尾松林黄山松林群落结构物种多样性植被分类中国东部地区

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冬青种质资源叶表型多样性分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第5期48卷 90-96页

作者：王雪洁周鹏侯思璇方炎明张敏南京林业大学南方现代林业协同创新中心生命科学学院亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏省林业科学研究院

【目的】了解冬青种质资源叶表型多样性，揭示冬青种质资源的表型多样性机理，为引种栽培与品种选育提供依据。【方法】对42份冬青种质资源的18个表型性状进行测定，通过差异分析、方差分析、主成分分析和聚类分析研究其表型变异。【结... 详细信息

【目的】了解冬青种质资源叶表型多样性，揭示冬青种质资源的表型多样性机理，为引种栽培与品种选育提供依据。【方法】对42份冬青种质资源的18个表型性状进行测定，通过差异分析、方差分析、主成分分析和聚类分析研究其表型变异。【结果】冬青种质资源叶表型性状变异较大，尤其是叶面积；Shannon多样性指数变化范围为1.00～2.03;冬青种质资源叶表型性状变异丰富，变异主要来源于种间。相关性分析发现，各性状之间存在显著相关，叶片外部性状与叶片解剖性状呈显著负相关；通过主成分分析提取了叶长、叶片紧实度、栅栏组织和气孔密度4个主成分，累计贡献率为85.20%,基本能反映冬青属植物的总体性状表现；聚类分析将42份冬青种质资源分为大叶-大叶柄类、小叶-小叶柄类、中叶-叶硬锯齿类和中叶-叶薄纸质类4大类群。【结论】冬青种质资源叶表型性状变异丰富，属内变异主要来源于物种间。叶片外部性状是冬青种质资源表型分化的主要因素；叶长、叶片紧实度、栅栏组织和气孔密度是划分冬青种质资源的4个主导因子，可作为冬青种质资源的分类鉴定依据。本研究可为冬青属植物的分类、资源利用和栽培繁育提供理论参考。

关键词：冬青属叶表型性状变异聚类分析

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重要林木樟科植物全基因组测序研究进展

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植物学报 2024年第2期59卷 302-318页

作者：杨智杨永南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037 南京林业大学国家林业和草原局亚热带森林生物多样性保护重点实验室南京210037

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因... 详细信息

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因组。该文从樟科全基因组研究现状、基因组特征、起源和进化以及功能基因和基因家族4个方面进行综述,着重介绍基于组学数据的木兰类及樟科的系统发生、樟科经历的多倍化事件以及与樟科花器官进化和代谢产物相关的基因鉴定。结合研究现状展望了樟科基因组研究的发展方向,建议通过增加测序基因组分支的代表性并关注具有特殊价值的物种,及研究物种特异性功能基因以加深对该家族基因功能和进化的理解。

关键词：樟科演化核基因组功能基因系统发生

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基于基因组学的栎树生物学研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第6期46卷 64-72页

作者：方炎明朱福远李垚李璇南京林业大学南方现代林业协同创新中心国家林业和草原局亚热带森林生物多样性保护重点实验室南京林业大学生物与环境学院

栎树(Quercus spp.)是北半球重要的经济与生态树种。夏栎(***)、加州白栎(***)、麻栎(***)等树种基因组的公布，对栎树生物学研究产生了深刻的影响。近5年来，栎树生物学出现了包括系统进化与物种鉴定、基因渐渗与适应进化、景观基因组... 详细信息

栎树(Quercus spp.)是北半球重要的经济与生态树种。夏栎(***)、加州白栎(***)、麻栎(***)等树种基因组的公布，对栎树生物学研究产生了深刻的影响。近5年来，栎树生物学出现了包括系统进化与物种鉴定、基因渐渗与适应进化、景观基因组学与生态保育、生物共存与互作机制、次生代谢与生长发育、DNA甲基化与表观遗传调控及基因与长寿机制等方面的研究热点。虽然基于基因组学的栎树生物学若干研究前沿已经形成，但尚处于起步阶段，笔者预期未来会向4个方面深入：(1)强调栎树基因组资源的深度应用。应用景观基因组学途径，探究栎树的杂交渐渗与适应进化；联合基因组、转录组、蛋白组等多组学技术，探究栎树生长发育与胁迫响应过程中的基因调控网络与信号通路；优化体细胞发生和遗传转化体系，攻克栎树遗传改良和基因资源开发技术瓶颈。(2)促进栎树研究体系的广度拓展。随着壳斗科其他树种全基因组序列的公布，基于从分子到群落的不同生物层次的模式系统，将对欧亚大陆和北美不同区域的栎树，包括白栎组、红栎组、冬青栎组、麻栎组等不同栎树类群，以及壳斗科其他属树种基因组生物学研究产生深远影响。(3)关注栎树资源利用的遗传与发育主题。用栎树基因组资源对其结构的、代谢的和农艺性状的差异及其优化加以解析，全基因组关联研究(GWAS)也将应用于栎树，从而为阐释木材发育和木栓形成的机制奠定基础。(4)聚焦栎林保育的生态与进化主题。在全球气候变化背景下，通过增加耐受胁迫的基因型，以缓解气候变化对森林生态系统的影响。同时维持和保护栎树在自然生态系统中的生态与进化过程，阐明栎树多样性、迁移与适应、趋异与趋同生态适应等方面进化成功的机制。

关键词：栎树基因组基因渐渗景观基因组学资源保育

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福建省薹草属植物新记录

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植物资源与环境学报 2023年第5期32卷 98-100页

作者：宋强孟德昌陈水飞郑笑李蒙丁晖段一凡南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学生物与环境学院亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037 生态环境部南京环境科学研究所国家环境保护武夷山生态环境科学观测研究站江苏南京210042

经过野外调查和标本鉴定,发现了福建省薹草属(Carex Linn.)植物分布新记录7种(变种),即长穗薹草(*** Hayata)、灰帽薹草(原变种)(*** *** Franch.)、具芒灰帽薹草(*** *** Ohwi)、三阳薹草(*** *** Savat.)、肿胀果薹草(***(Kük.)O... 详细信息

经过野外调查和标本鉴定,发现了福建省薹草属(Carex Linn.)植物分布新记录7种(变种),即长穗薹草(*** Hayata)、灰帽薹草(原变种)(*** *** Franch.)、具芒灰帽薹草(*** *** Ohwi)、三阳薹草(*** *** Savat.)、肿胀果薹草(***(Kük.)Ohwi)、点囊薹草(*** ***)和反折果薹草(*** Kük.),均发现于武夷山国家公园福建片区。凭证标本保存于南京林业大学树木标本室(NF)。

关键词：福建省武夷山薹草属新记录

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基于SSR标记的白栎天然居群遗传多样性分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2021年第1期45卷 63-69页

作者：臧明月李璇方炎明南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室

【目的】利用SSR分子标记,对白栎天然居群进行遗传多样性分析,为其种质资源的合理开发与保护提供指导。【方法】采用筛选出的SSR引物对3个群体进行遗传多样性与遗传结构研究,并计算遗传参数;基于个体间的遗传距离进行主成分分析,运用Gen... 详细信息

【目的】利用SSR分子标记,对白栎天然居群进行遗传多样性分析,为其种质资源的合理开发与保护提供指导。【方法】采用筛选出的SSR引物对3个群体进行遗传多样性与遗传结构研究,并计算遗传参数;基于个体间的遗传距离进行主成分分析,运用GenAlEx 6.5进行遗传距离与地理距离的相关性Mantel检验,软件Arlequin用于分子方差分析,聚类分析采用MEGA 7中的UPGMA法;同时,使用Structure软件中的贝叶斯聚类算法探究群体遗传结构。【结果】6对SSR引物共检测到75个等位基因,平均有效等位基因数、观察杂合度和期望杂合度分别为7.16、0.70和0.80,Shannon信息指数为2.05。AMOVA表明,群体内部的分子变异率高达97.41%,而群体之间的遗传变异仅为2.59%。黄山(YM)与天目山(TM)群体间的基因流为12.908,显著高于其他群体之间的交流水平,而二者间有着最近的遗传距离为0.272。贝叶斯法与UPGMA法聚类结果一致,表明来自YM与TM的个体亲缘关系更近。【结论】白栎具有较高的遗传多样性水平,且不同居群间的水平相当。YM和TM居群的基因交流最为密切,遗传分化不明显。白栎绝大部分遗传变异来源于群体内部,对于该物种的保护应减少不合理的人为开发行为,以原地保护为主,同时开展种质资源的收集与遗传改良工作。

关键词：白栎 SSR 遗传多样性遗传结构

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黄山常绿阔叶林群丛数量分类及物种多样性格局——以10.24 hm 2森林动态监测样地为例

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陕西师范大学学报（自然科学版） 2023年第3期51卷 86-95页

作者：解雷陈浩赵荣王丁钱为侯思璇冯玥瑶陈水飞丁晖方炎明南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037 生态环境部南京环境科学研究所自然保护与生物多样性研究中心江苏南京210042 黄山风景区管理委员会园林局安徽黄山245899

零散的植物群落调查不符合群落分布既有连续性、又存在间断性的特点。近年来兴起的森林动态监测样地研究平台为植被分类研究提供了新途径。以黄山10.24 hm^(2)森林动态监测样地为研究对象,以地形因子和物种重要值为变量,使用多元回归树... 详细信息

零散的植物群落调查不符合群落分布既有连续性、又存在间断性的特点。近年来兴起的森林动态监测样地研究平台为植被分类研究提供了新途径。以黄山10.24 hm^(2)森林动态监测样地为研究对象,以地形因子和物种重要值为变量,使用多元回归树、指示种并结合冗余分析将监测样地划分为3个群丛;甜槠在3个群丛中均为重要值最高的物种,森林动态监测样地属于甜槠群系。采用α-多样性指数对该局域尺度下各群丛物种多样性进行分析,并首次引入PER-SIMPER推断黄山常绿阔叶林群落的构建机制。结果表明:群落内的群丛分类主要受海拔和凹凸度的影响,坡度与坡向对群丛分类的影响较小;生态位和扩散过程共同主导黄山植物群落的构建;不同群丛间的物种多样性存在差异,分布于低海拔山脊的群丛α-多样性与分布于山谷的群丛α-多样性存在显著差异。该研究结果为当地森林植被管理与保护提供了决策依据。

关键词：森林动态监测样地多元回归树排序群丛群落构建

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江苏宜兴龙池山自然保护区固定样地物种组成分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2021年第6期45卷 159-168页

作者：伊贤贵董鹏谢春平彭智奇杨国栋董京京钟育谦翟飞飞王贤荣南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业与草原局重点实验室广东海洋大学滨海农学院江苏省环境科学研究院江苏省野生动植物保护站

【目的】宜溧山地是江苏植物多样性及植被保护最好的地区之一,分析江苏宜兴龙池山固定样地的物种组成及群落垂直结构等基本特征,为该区域生物多样性保护、植被恢复策略制定以及生态服务功能的评估等提供参考。【方法】按照CTFS（center ... 详细信息

【目的】宜溧山地是江苏植物多样性及植被保护最好的地区之一,分析江苏宜兴龙池山固定样地的物种组成及群落垂直结构等基本特征,为该区域生物多样性保护、植被恢复策略制定以及生态服务功能的评估等提供参考。【方法】按照CTFS（center for tropical forest science）的建设标准,在江苏省宜兴市龙池山自然保护区建立1hm2（100 m×100 m）的森林监测固定样地。对样地内所有胸径（DBH）≥1 cm的木本植物进行了详细定位调查,并对其挂牌标记、定位和记录,并就群落物种组成、区系特征、重要值、群落垂直结构和径级特征进行了详细分析。【结果】该固定样地内DBH≥1cm的木本植物共有4 944株,隶属于40科66属87种;其中樟科、壳斗科、金缕梅科、漆树科等占有较大优势。在属的水平上,温带区系成分占总属数的51.51%,热带区系成分占45.45%,区系具有过渡性。重要值≥1.00%的物种共有25个,占重要值总和的90%以上,其中山鸡椒、檵木、枹栎和野漆树的重要值较为突出,分别为12.65%、11.00%、7.89%和7.39%。根据群落高度可划分为4层,其中乔木Ⅱ层是当前群落的主体,乔木Ⅲ层较为拥挤。群落径级结构接近倒"J"形,表明群落更新良好。【结论】样地内木本植株数量较多,物种组成丰富,具有天然次生林特征;区系成分较为复杂,具有明显的过渡特征;植被正由常绿与落叶阔叶混交林向常绿阔叶林演替;减少人为干扰和生境破坏,是促进当前群落健康发展及物种多样性的关键。

关键词：物种组成区系特征重要值群落结构龙池山江苏宜兴

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三峡水库蓄水前、后澎溪河食鱼水鸟对越冬栖息地利用的变化

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湿地科学 2022年第5期20卷 636-645页

作者：李秀明程瑞梅孙戈马天苏化龙刘富国刘小云盘凯筠钱法文肖文发中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业和草原局森林保护学重点实验室北京100091 生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室北京100091 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业和草原局森林生态环境重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 中国林业科学研究院亚热带林业实验中心江西分宜336606

三峡水库蓄水后,水位升高直接影响了长江支流中的鱼类群落结构,进而对以鱼为食的水鸟群落分布产生影响,同时也使水鸟栖息地发生改变。在三峡水库蓄水前的2002年、2005年、2006年和蓄水后的2012年、2015年、2016年每年的1月中旬,对长江... 详细信息

三峡水库蓄水后,水位升高直接影响了长江支流中的鱼类群落结构,进而对以鱼为食的水鸟群落分布产生影响,同时也使水鸟栖息地发生改变。在三峡水库蓄水前的2002年、2005年、2006年和蓄水后的2012年、2015年、2016年每年的1月中旬,对长江重庆段支流澎溪河区域的小(Trachybaptus ruficollis)、普通鸬鹚(Phalacrocorax carbo)、赤颈(Podiceps grisegena)、苍鹭(Ardea cinerea)和白鹭(Egretta garzetta)共5种食鱼水鸟开展了调查,利用谷歌地球在线的2005年和2015年每年1月的卫星影像数据,分析澎溪河区域的6种景观指数和人类活动干扰强度变化;利用广义线性模型,研究三峡水库蓄水后澎溪河区域的6种景观指数和人类活动干扰强度对食鱼水鸟数量的影响及其变化。研究结果表明,三峡水库蓄水后,在澎溪河区域,调查到的食鱼水鸟数量从蓄水前的386只增加至1545只,澎溪河上游河流转弯处浅滩面积大幅增加,下游河流转弯处形成了大面积的水域,这些转弯处区域的斑块密度、近圆形形状指数的中值、回转半径的标准差、面积周长比的加权平均数、邻近指数分布的标准差都减小;虽然通过河流景观指数拟合模型,能够解释澎溪河区域食鱼水鸟分布和种群数量的变化,但是效果一般;在拟合精度较高的模型中,三峡水库蓄水前和蓄水后建筑物数量的重要性都大于50%,蓄水后河流景观回转半径的标准差的重要性大于邻近指数分布的标准差。澎溪河流域的鱼类资源和人类活动状况对流域内食鱼水鸟影响较大,正在实施的长江十年禁渔行动将有利于食鱼水鸟和河流生态的保护。

关键词：食鱼水鸟澎溪河越冬栖息地三峡水库

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