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西北林学院学报 2024年第5期39卷 61-67页

作者：虞晨音杨杰温小荣杨丽叶金盛汪求来南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学林学院江苏南京210037 广东省林业调查规划院广东广州510520

基于激光雷达手段获取杨树林木表型参数的方法,探究树木点云提取更优林木表型参数的能力,为林木经营方案的编制提供有力的数据支撑与参考依据。根据地基激光雷达(TLS)与机载激光雷达(ALS)的融合点云数据,利用几何特征树木骨架、提取不... 详细信息

基于激光雷达手段获取杨树林木表型参数的方法,探究树木点云提取更优林木表型参数的能力,为林木经营方案的编制提供有力的数据支撑与参考依据。根据地基激光雷达(TLS)与机载激光雷达(ALS)的融合点云数据,利用几何特征树木骨架、提取不完全模拟水分和养分传输的算法(ISTTWN),建立三维单木模型,并获取杨树单木的胸径、树高以及枝条属性因子。结果表明,融合数据的胸径、树高提取值的平均值均高于TLS数据的提取值,同时提取精度也更高。在所提取的枝条属性因子中,提取精度依次为着枝高度>枝长>弦长>着枝角度>分枝角度>弓高,且融合数据的提取精度更高。从RMSE、MAE、MAPE、R^(2)4个方面对枝条属性因子进行提取精度评价,枝长的拟合度最高,地基和融合点云提取值分别达到0.985、0.989;角度的拟合度相对较低,TLS着枝角度提取值的R^(2)仅0.775,但融合后的着枝角度的拟合度提升明显,达到0.887。基于不同相对着枝高度对提取精度分析,未融合前相对着枝高度0.4~0.6的枝条属性精度最高,而后其精度随着冠层高度的增加而降低,由于融合后的冠层点云密度提高,枝条属性因子的提取精度较融合前显著提升,且在相对着枝高度0.8~1.0时提高最为明显,相对提取精度最低的弓高提高了10.04%。研究认为TLS与ALS融合点云数据后,由于数据之间的相互弥补,有效提高点云密度,在三维树木模型研建中能够显著提高林木表型参数的数据提取精度,其中冠层提取精度提升最为明显。

关键词：地基激光雷达融合点云数据 ISTTWN算法林木表型参数枝条属性因子

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青钱柳种子雨的季节动态及土壤种子库特征

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南京林业大学学报(自然科学版) 2023年第2期47卷 18-26页

作者：黄梓良徐子恒孙操稳福建林业职业技术学院江苏省淮安市林业技术指导站南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院

【目的】研究青钱柳（Cyclocarya paliurus）种子雨的季节动态及土壤种子库特征，以阐明其种群更新和演替规律。【方法】以江苏溧阳大石山3种林分密度（1 050、720和525株/hm2,代号依次为C1、C2、C3）青钱柳人工林为对象，对其种子雨季... 详细信息

【目的】研究青钱柳（Cyclocarya paliurus）种子雨的季节动态及土壤种子库特征，以阐明其种群更新和演替规律。【方法】以江苏溧阳大石山3种林分密度（1 050、720和525株/hm2,代号依次为C1、C2、C3）青钱柳人工林为对象，对其种子雨季节动态及种子性状进行观测和分析；在江西九岭山5个青钱柳天然群落设样方调查，并对样方内的土壤种子库分枯枝落叶层（Ⅰ层）和土壤层（Ⅱ层）进行种子筛选和分析。【结果】根据青钱柳种子雨密度，将落种时期分为3个阶段：落种前期（8月20日—9月20日）、落种中期（9月21日—12月10日）和落种后期（12月11日—12月30日）;种子雨出现2个高峰（9月10日和12月20日）,落种前期和落种后期其单位面积落种量分别占全年的42.4%和43.5%;不同落种阶段的种子雨密度和具生活力的种子数差异显著，但其他种子性状差异不显著。林分密度显著影响青钱柳饱满种子数和种子千粒质量，但未影响其他种子性状。青钱柳天然群落的土壤种子库密度均呈现为Ⅰ层（37.4粒/m2）>Ⅱ层（17.9粒/m2）,群落间的种子库密度差异达显著水平；Ⅱ层种子直径、厚度及体积均小于Ⅰ层种子。青钱柳群落土壤种子库的种子饱满度和生活力均较低，分别为13.0%～27.1%和0～10.4%;相比较而言，Ⅰ层种子生活力和饱满度总体上大于Ⅱ层，说明种子库中的种子寿命随着时间的延长呈下降趋势。【结论】青钱柳林分种子雨呈双峰特征，林分密度显著影响了种子雨密度和千粒质量，但对种子饱满度和生活力的影响不大；土壤种子库枯枝落叶层（Ⅰ层）种子数量和质量均优于土壤层（Ⅱ层）种子，贮存在土壤种子库的种子休眠被解除，有利于青钱柳群落的更新和演替。

关键词：青钱柳种子雨林分密度季节动态土壤种子库天然更新

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桂花OfWRKY120基因鉴定及盐胁迫响应功能研究

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2024年第5期52卷 144-154页

作者：宰舟颖王柳丁卉芬杨展栋王良桂岳远征杨秀莲南京林业大学风景园林学院江苏南京210037 南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

【目的】根据前期基因家族鉴定分析得到OfWRKY120,对该基因盐胁迫响应的功能进行分析,为桂花盐胁迫下的调控机制研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对OfWRKY120保守结构域、系统进化进行分析,并采用qRT-PCR技术研究盐胁迫下OfWRK... 详细信息

【目的】根据前期基因家族鉴定分析得到OfWRKY120,对该基因盐胁迫响应的功能进行分析,为桂花盐胁迫下的调控机制研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对OfWRKY120保守结构域、系统进化进行分析,并采用qRT-PCR技术研究盐胁迫下OfWRKY120在桂花叶片中的相对表达量。构建OfWRKY120超表达载体,使用亚细胞定位、酵母自激活检测等探究其特性,将该基因瞬时转化本氏烟草后,对烟草进行盐处理,利用DAB、NBT染色和相关生理指标的测定,解析瞬时转化OfWRKY120对本氏烟草耐盐性的影响。【结果】OfWRKY120基因全长为1422 bp,编码474个氨基酸,存在WRKY superfamily保守结构域。盐胁迫能够激活桂花叶片中OfWRKY120的表达,在72 h时相对表达量最高,与对照有显著差异。亚细胞定位结果表明,OfWRKY120定位于细胞核。酵母自激活结果显示OfWRKY120无自激活活性。盐胁迫后,OfWRKY120瞬时过表达植株的超氧阴离子(O-·2)和脯氨酸含量显著高于空载对照,且DAB和NBT染色表现出更深的颜色。本氏烟草中的qRT-PCR结果显示,OfWRKY120显著降低了NbCAT的表达,而显著提高了NbP5CS1、NbP5CS2和NbP5CR的表达。【结论】OfWRKY120过表达增加了盐胁迫下本氏烟草中活性氧(ROS)的含量,导致植物对盐胁迫的敏感性提高。

关键词：桂花 OfWRKY120基因盐胁迫抗逆育种

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紫茉莉科植物组培生根研究进展

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分子植物育种 2024年第18期22卷 6160-6169页

作者：黄涛祝遵凌南京林业大学风景园林学院南京210037 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学艺术设计学院南京210037

紫茉莉科作为石竹目中重要的观赏类植物群,拥有重要的多元应用价值,植物组织培养是紫茉莉科植物资源实现价值的重要手段,然而整个组培过程中还是存在很多品种出现生根困难、根系纤维不发达等现象,导致繁殖系数小、移栽成活率低。本研究... 详细信息

紫茉莉科作为石竹目中重要的观赏类植物群,拥有重要的多元应用价值,植物组织培养是紫茉莉科植物资源实现价值的重要手段,然而整个组培过程中还是存在很多品种出现生根困难、根系纤维不发达等现象,导致繁殖系数小、移栽成活率低。本研究阐述了近些年紫茉莉科植物的应用概况;阐述了组培苗生根的生理及分子机理;从植物种类和基因型及植物材料生理状态分析了影响紫茉莉科组培苗生根的内部因素,从培养基类型、植物生长调节剂及培养条件分析了影响紫茉莉科组培苗生根的外部因素;最后从培养方式、酶活性、分子生物学三个角度提出目前关于紫茉莉科植物组织生根研究中的欠缺不足及发展方向,以望为紫茉莉科植物生根开辟新思路,以期对紫茉莉科植物产业发展有所脾益。

关键词：紫茉莉科组织培养生根机理生长素

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基于流式细胞术对观赏海棠品种的基因组大小测定

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植物科学学报 2024年第3期42卷 359-365页

作者：张艳艳彭冶林峰杨立梅张往祥南京林业大学南方现代林业协同创新中心生命科学学院南京210037 南京林业大学分析测试中心南京210037 南京林业大学林草学院、水土保持学院南京210037

核DNA C值和基因组大小是重要的生物多样性特征,本研究以18个观赏海棠(Malus spp.)品种的嫩叶为材料,并以玉米(Zea mays L.)品种‘B73’为内参样本,利用流式细胞术对观赏海棠基因组大小进行了测定。结果显示:18份观赏海棠C值大小范围为0... 详细信息

核DNA C值和基因组大小是重要的生物多样性特征,本研究以18个观赏海棠(Malus spp.)品种的嫩叶为材料,并以玉米(Zea mays L.)品种‘B73’为内参样本,利用流式细胞术对观赏海棠基因组大小进行了测定。结果显示:18份观赏海棠C值大小范围为0.74~1.50 pg,平均为0.96 pg;其中,‘玛丽波特’(‘Mary Potter’)C值最大,达到1.50 pg,而‘红珠宝’(‘Red Jewel’)C值最小,为0.74 pg。方差分析结果表明观赏海棠品种间C值大小存在显著差异。观赏海棠不同品种间DNA C值和基因组大小存在显著的多样性。

关键词：观赏海棠流式细胞术基因组大小 DNA含量

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徐州市侧柏人工林群落不同演替阶段物种多样性变化

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年第1期49卷 171-178页

作者：隋夕然李军陈娟华军沈谦杨洪胜何前程李由王伟彭冶葛之葳张增信南京林业大学林草学院水土保持学院南方现代林业协同创新中心徐州市云龙湖风景名胜区管理委员会南京林业大学生命科学学院南京林业大学生态与环境学院

【目的】探究徐州市典型石灰岩山地侧柏(Platycladus orientalis)人工林不同演替阶段植物群落组成及物种多样性，揭示物种替代和群落结构变化的规律。【方法】采用空间代替时间变化法及典型样地调查法，揭示徐州市4个不同演替阶段(灌草... 详细信息

【目的】探究徐州市典型石灰岩山地侧柏(Platycladus orientalis)人工林不同演替阶段植物群落组成及物种多样性，揭示物种替代和群落结构变化的规律。【方法】采用空间代替时间变化法及典型样地调查法，揭示徐州市4个不同演替阶段(灌草丛、针叶林、针阔混交林、阔叶林)的侧柏人工林群落特征及影响因素。【结果】(1)所调查的样地共有植物种类105种，隶属于58科96属，各演替阶段所出现的物种数分别为灌草丛14科18属20种、针叶林33科49属51种、针阔混交林43科59属64种、阔叶林27科44属45种；(2)不同演替阶段植物群落物种重要值方面，乔木层中侧柏的重要值均居于首位，灌木层中构树(Broussonetia papyrifera)的重要值均居于首位并呈现先下降再升高的趋势；草本层4个不同的演替阶段中，重要值分别位居首位的物种为马兜铃(Aristolochia debilis)、茅莓(Rubus parvifolius)、白英(Solanum lyratum)、常春藤(Hedera nepalensis);(3)不同演替阶段植物群落Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数、Pielou均匀度指数和Simpson优势度指数变化趋势较为一致，均随着演替的正向发展均呈现先上升后下降的趋势，其中，多样性指数在针阔混交林阶段达到峰值；(4)物种多样性指数与环境因子的相关性分析结果显示，郁闭度、坡位和坡向与徐州石灰岩山地侧柏人工林演替过程中物种多样性的变化关系密切，其中郁闭度与群落Shannon-Wiener多样性指数相关性最为显著(P<0.05)。【结论】徐州石灰岩山地侧柏人工林物种多样性在针阔混交林阶段达到最高值，其中郁闭度、坡位和坡向对物种多样性发挥着关键影响作用，研究结果可为该地区近自然林分改造与经营提供理论依据。

关键词：徐州石灰岩山地侧柏人工林植物群落群落演替物种多样性林分改造

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菌根真菌修复重金属污染土壤研究进展

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农业生物技术学报 2024年第7期32卷 1681-1692页

作者：杜运付伍金花高海健李广平张长青南京林业大学林草学院、水土保持学院南方现代林业协同创新中心金陵科技学院园艺园林学院

重金属污染由于其难降解性和积累性，已经成为土壤环境问题中的一大难点。菌根真菌能够与寄主植物形成互惠共生的关系，从而提高植物的重金属抗性，有利于加速污染地的植被覆盖，并能固持重金属，实现污染土壤再利用。真菌对寄主植物重... 详细信息

重金属污染由于其难降解性和积累性，已经成为土壤环境问题中的一大难点。菌根真菌能够与寄主植物形成互惠共生的关系，从而提高植物的重金属抗性，有利于加速污染地的植被覆盖，并能固持重金属，实现污染土壤再利用。真菌对寄主植物重金属的解毒机制主要包括结构固定、营养稀释、基因调控、螯合与辅助螯合、抗氧化等。为系统了解不同菌根真菌(内生菌根真菌,外生菌根真菌)对重金属胁迫下寄主的作用，本文综述了不同类型的菌根真菌对土壤重金属污染的修复作用并系统介绍了其作用机制，讨论了未来的研究方向。本综述为菌根真菌在修复重金属污染土壤中的应用提供理论参考。

关键词：菌根真菌土壤微生物重金属修复技术

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植物病原真菌聚酮类次级代谢产物研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年

作者：苏胜荣陈凤毛李欢王立超黄山学院生命与环境科学学院南京林业大学林草学院南方现代林业协同创新中心

在植物与病原真菌相互作用中，病原真菌通过产生次级代谢产物协助其对植物的入侵和致病。由聚酮合酶（polyketide synthase， PKS）参与合成的真菌聚酮类化合物是真菌中最丰富的次级代谢产物，通过合成重要的色素、致病因子和真菌毒素... 详细信息

在植物与病原真菌相互作用中，病原真菌通过产生次级代谢产物协助其对植物的入侵和致病。由聚酮合酶（polyketide synthase， PKS）参与合成的真菌聚酮类化合物是真菌中最丰富的次级代谢产物，通过合成重要的色素、致病因子和真菌毒素帮助病原真菌逃避和破坏寄主植物的免疫机制，从而成功侵染。笔者综述了真菌Ⅰ型聚酮合酶多功能域重复串联催化的结构特点；独立及偶联其他酶类催化基因簇合成包括真菌毒素、抗生素和色素在内的多种化合物类型，赋予真菌发育、抗逆和致病等诸多功能；并总结了转录因子、表观遗传学修饰和次级代谢通路对聚酮化合物合成的调控方式；着重列举近年来主要植物病原真菌聚酮类产物及其合成基因簇；并对真菌聚酮类次级代谢产物调控网络解析、合成生物学和产物鉴定等研究方向进行展望。通过分析以期为揭示病原真菌致病机制和植物真菌病害的防控提供研究思路和策略。

关键词：丝状真菌聚酮化合物基因簇致病功能调控机制

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基于SNP分子标记的华东地区松材线虫种群遗传分化研究

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第4期46卷 21-28页

作者：汪青桐丁晓磊叶建仁史秀峰南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心上海市林业总站

【目的】华东地区的苏浙皖鲁是中国松材线虫病发生最早的4个省区，华东地区也是松材线虫最适生长区，研究该区域松材线虫种群的遗传分化情况，可为建立我国松材线虫病的疫源追溯体系提供重要的基础信息。【方法】收集华东地区安徽(AH)... 详细信息

【目的】华东地区的苏浙皖鲁是中国松材线虫病发生最早的4个省区，华东地区也是松材线虫最适生长区，研究该区域松材线虫种群的遗传分化情况，可为建立我国松材线虫病的疫源追溯体系提供重要的基础信息。【方法】收集华东地区安徽(AH)、福建(FJ)、江苏(JS)、江西(JX)、山东(SD)和浙江(ZJ)6个省份的60个县级行政区松材线虫病疫木样本，经过分离纯化获得虫株，提取虫株DNA并进行高通量全基因组重测序，运用生物信息学软件分析各区域松材线虫虫株的SNP位点数量和种类，依此遗传标记采用聚类分析方法比较各区域不同虫株间的遗传分化情况，后采用Treemix分析群体间的基因渗入路线。【结果】共分离收集到华东地区松材线虫虫株67个，对所有虫株进行全基因组测序。经序列比对分析，67个虫株中共有SNP基因型12种，其中A→G、C→G、C→T、G→A、G→C、T→C这6种基因型出现的频率明显高于其他6种基因型。从67个虫株中共获得6 531 684个SNP位点，不同虫株间的SNP位点数量存在差异。不同地理区域松材线虫的SNP总数、纯合子数量、缺失SNP数量以及特有SNP数量在省际均未表现显著差异，与入侵时间也无特别显著的相关性。主成分分析结果表明，67个虫株可以分为3个类群，各类群与地理来源存在着一定的相关性。大多数虫株属于类群1,它包括了所有的浙江虫株和江西虫株，以及其他4个省份的大多数虫株；类群2涉及江苏、安徽、山东和福建的14个虫株；类群3仅涉及安徽、福建和山东的7个虫株。通过Treemix检测得到2条基因迁移路线，分别为类群2的江苏(2-JS)向类群1的安徽(1-AH)迁移、类群3的山东(3-SD)向类群2的安徽(2-AH)迁移。【结论】华东地区松材线虫虫株存在较为丰富的SNP位点，不同虫株间SNP特征存在较大差异，SNP多样性变化与入侵时间没有呈现明显规律性。总体上华东地区松材线虫虫株可以分为3个类群，不同类群与地理区域间呈现一定的相关性，在1-AH和2-AH所在区域可能存在被其他区域的其他类群虫株再次入侵的情况。

关键词：松材线虫 SNP 基因组重测序遗传分化华东地区

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青钱柳产业发展历程及资源培育研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第6期46卷 115-126页

作者：方升佐南京林业大学林学院南京林业大学青钱柳研究与开发中心南方现代林业协同创新中心

青钱柳为我国特有的单种属植物，是集药用、保健、材用和观赏等多种价值于一身的珍贵树种，有广阔的发展前景。关于青钱柳的研究始于20世纪70年代末，2013年青钱柳叶被国家卫生和计划生育委员会列入新资源食品目录，极大地推动了我国青... 详细信息

青钱柳为我国特有的单种属植物，是集药用、保健、材用和观赏等多种价值于一身的珍贵树种，有广阔的发展前景。关于青钱柳的研究始于20世纪70年代末，2013年青钱柳叶被国家卫生和计划生育委员会列入新资源食品目录，极大地推动了我国青钱柳产业向前发展。笔者简述了青钱柳的天然分布及其潜在适宜栽培区概况，从青钱柳相关的论文发表、专利申请及社会关注度等视角探讨了青钱柳研究的脉络及青钱柳产业的发展历程；重点关注了青钱柳叶用林资源培育的研究，阐述了青钱柳种质资源收集评价及种群遗传多样性、基因组学与生物活性物质代谢调控、叶生物活性物质的地理变异及叶用林定向培育理论与技术等方面的进展。同时，分析了青钱柳产业发展中存在的主要问题，提出了强化青钱柳定向优良品种创制及其无性系化、优化青钱柳人工林的定向培育模式及“良好农业规范”(GAP)栽培、加强青钱柳活性物质提取与功能研究、重视青钱柳高附加值产品开发及产业化等建议，旨在推动我国青钱柳产业的健康和可持续发展。

关键词：青钱柳食品新资源生物活性物质种质资源定向培育产品开发

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