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西南林业大学学报（自然科学） 2022年第1期42卷 178-188页

作者：冯凯陈颖刘瑞马娟娟赵斌南京林业大学南方现代林业协同创新中心生物与环境学院江苏南京210037

基于类黄酮化合物在银杏叶用林培育、药物生产加工等方面的重要理论研究和应用价值,从环境、细胞培养、分子水平3个方面对近年来银杏类黄酮代谢的调控研究进行了综述。得出光照、温度、水分等环境条件的改变可以调控银杏类黄酮的代谢;... 详细信息

基于类黄酮化合物在银杏叶用林培育、药物生产加工等方面的重要理论研究和应用价值,从环境、细胞培养、分子水平3个方面对近年来银杏类黄酮代谢的调控研究进行了综述。得出光照、温度、水分等环境条件的改变可以调控银杏类黄酮的代谢;诱导子、微量元素的调整是细胞培养中类黄酮生产的有效调控手段;随着银杏全基因组测序地完成,人们通过基因组学与高通量测序技术挖掘出了许多关键酶基因和转录因子,丰富了人们对银杏黄酮代谢进行调控的手段。在未来的应用和研究中,建议通过多组学研究挖掘更多的相关基因和关键酶,从上游和下游的基因簇共调节研究黄酮的代谢通路,并结合合成生物学实现银杏黄酮的智能调控。

关键词：银杏黄酮代谢细胞培养关键酶基因转录因子

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太阳光/Fe(Ⅱ)/柠檬酸/激活过硫酸盐对污水二级出水中罗红霉素的降解效能

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环境化学 2021年第10期40卷 3122-3132页

作者：郑琴琴张若琦闫于飞蔡峰丁淳李威南京林业大学南方现代林业协同创新中心生物与环境学院南京210037

本文以柠檬酸作为Fe(Ⅱ)的螯合剂,引入模拟太阳光强化Fe(Ⅱ)/柠檬酸/螯合物活化过硫酸盐(PS)氧化降解污水处理厂二级出水中的罗红霉素,探讨了该体系对罗红霉素的降解效果、影响因素、活性物种的贡献和降解路径.结果表明,太阳光/Fe(Ⅱ)/... 详细信息

本文以柠檬酸作为Fe(Ⅱ)的螯合剂,引入模拟太阳光强化Fe(Ⅱ)/柠檬酸/螯合物活化过硫酸盐(PS)氧化降解污水处理厂二级出水中的罗红霉素,探讨了该体系对罗红霉素的降解效果、影响因素、活性物种的贡献和降解路径.结果表明,太阳光/Fe(Ⅱ)/柠檬酸/PS体系能有效降解罗红霉素,在Fe(Ⅱ)浓度为0.25 mmol·L^(-1),PS为4 mmol·L^(-1),Fe(Ⅱ)/柠檬酸物质的量比为1∶2,反应60 min时,罗红霉素的去除率可达到92%以上.淬灭实验表明,·OH是反应体系的主要活性物种,其对罗红霉素降解的贡献为78.3%—86.4%,而SO4·-的作用相对较弱,其贡献仅为7.3%—12.5%.基于高效液相色谱高分辨质谱鉴别出8种罗红霉素的降解产物,它们主要是由罗红霉素的肟侧链断裂(—C_(4)H_(8)O_(2))、脱克拉定糖(—C_(8)H_(14)O_(3))和脱羟胺(—NH_(2)OH)形成的,其中DP679(C_(33)H_(63)O_(12)N_(2))和DP749(C_(37)H_(69)O_(13)N_(2))是最主要的降解产物.

关键词：罗红霉素过硫酸盐 Fe(Ⅱ)-柠檬酸螯合物活性物种降解产物

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染井吉野樱PEBP基因家族鉴定及生物信息学分析

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分子植物育种 2023年第7期21卷 2152-2160页

作者：吴水涵宋炎峰李蒙叶琦伊贤贵王绍军王贤荣南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037 眉山盛世园林绿化有限责任公司眉山620010

磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein,PEBP)基因家族的氨基酸结构中存在保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域,对调控植物开花起着至关重要的作用。本研究以染井吉野樱全基因组数据为基础,采用生物信息学方法... 详细信息

磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein,PEBP)基因家族的氨基酸结构中存在保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域,对调控植物开花起着至关重要的作用。本研究以染井吉野樱全基因组数据为基础,采用生物信息学方法鉴定出13个PEBP基因,依次命名为PYPEBP1~PYPEBP13,然后进一步分析了家族中各基因结构、理化性质,对PEBP蛋白的亚细胞定位、二级结构以及磷酸化位点进行预测,并构建系统发育树。结果表明,染井吉野樱的PEBP基因家族不同蛋白质序列的长度和特性都存在较大差异;13个染井吉野樱PEBP基因大部分成员含有4个外显子和3个内含子,motif 3、motif 4、motif 5和motif 6是染井吉野樱PEBP基因的特征基序;蛋白的亚细胞定位预测显示,这13个PEBP基因的蛋白分别位于细胞核与细胞质中;蛋白质二级结构分析显示,染井吉野樱PEBP基因的蛋白质二级结构十分相似,PYPEBP5和PYPEBP12蛋白结构中无规则卷曲占比最高,而β-转角比例最低;潜在的磷酸化位点预测分析表明,除PYPEBP3、PYPEBP7、PYPEBP8和PYPEBP10蛋白没有潜在的酪氨酸Tyr磷酸化位点外,其余PEBP蛋白均含有潜在的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点,各蛋白中不同磷酸化位点的数量差异显著;系统发育分析表明,染井吉野樱PEBP基因与拟南芥PEBP基因亲缘关系最近,各个家族成员均可聚到一起。本研究结果为后续深入研究染井吉野樱PEBP基因家族的功能提供参考。

关键词：染井吉野樱 PEBP 生物信息学分析蔷薇科

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不同月份麋鹿食源植物δ^(13)C和δ^(15)N及其贡献率分析

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生态学报 2025年第5期45卷 2494-2504页

作者：赵璐瑶吴永波查晶晶魏逸荪安玉亭王立波南京林业大学生态与环境学院南京210037 江苏省南方现代林业协同创新中心南京210037 江苏大丰麋鹿国家级自然保护区盐城224136 江苏盐城湿地珍禽国家级自然保护区盐城224333

食源分析是麋鹿保护中研究麋鹿栖息地需求的核心,也是了解麋鹿与环境之间的相互关系、判断环境容量以及进行资源管理的前提和基础。选取保护区第一核心区和第三核心区为研究区域,分别于2019年5月、7月、10月和12月进行野外调查,收集麋... 详细信息

食源分析是麋鹿保护中研究麋鹿栖息地需求的核心,也是了解麋鹿与环境之间的相互关系、判断环境容量以及进行资源管理的前提和基础。选取保护区第一核心区和第三核心区为研究区域,分别于2019年5月、7月、10月和12月进行野外调查,收集麋鹿食源植物样本及粪便样本,运用碳氮稳定同位素技术分别对不同月份互花米草、碱蓬、白茅、狼尾草、狗牙根和糙叶薹草6种食源植物及麋鹿粪便进行测定并进行相关性分析,应用贝叶斯模型分析不同植物对麋鹿食源的贡献率,分析不同季节麋鹿食性变化。研究发现,食源植物的种类、数量及营养价值均影响麋鹿取食行为。结果显示,5月、7月、10月和12月对麋鹿食源贡献率最高的植物分别为互花米草、狗牙根、互花米草和互花米草,贡献率分别为39.0%、42.8%、47.9%和31.9%。5月、7月、10月和12月,狗牙根和互花米草对麋鹿食源的贡献存在显著变化,表明麋鹿对食源植物的选择存在季节差异。C_(3)植物和C_(4)植物在不同月份对麋鹿的贡献率存在差异。在不同季节,麋鹿粪便的δ^(13)C值与食源植物的δ^(13) C值显示出一定变化趋势,保护区内麋鹿混食C_(3)和C_(4)植物,尽管C_(4)植物占比大于C_(3)植物,但不能确定麋鹿更喜爱C_(4)植物;互花米草对第三核心区麋鹿食源的贡献率较高,狼尾草对麋鹿食源的贡献率较低,表明麋鹿在选择食物时偏好营养价值高的植物;不同月份麋鹿粪便的δ^(13) C和δ^(15) N值变化表明,不同季节麋鹿的食物组成不同,以满足其营养需求。了解麋鹿食性变化不仅为今后制定有效管理和保护策略提供科学支持,也为麋鹿保护区的管理与生境恢复提供理论依据。

关键词：麋鹿食源分析稳定性同位素技术互花米草

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被子植物同域物种形成研究进展

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广西植物 2022年第1期42卷 14-24页

作者：汪章沛陈林王贤荣南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037

同域物种形成是指在缺少地理隔离的情况下分化出新种,相比异域物种形成更为罕见,存在较多的研究空白。该文分析了近十年来与被子植物同域物种形成相关的国内外研究,着重论述同域物种形成的影响因素和种对间的生殖隔离。考虑到历史上的... 详细信息

同域物种形成是指在缺少地理隔离的情况下分化出新种,相比异域物种形成更为罕见,存在较多的研究空白。该文分析了近十年来与被子植物同域物种形成相关的国内外研究,着重论述同域物种形成的影响因素和种对间的生殖隔离。考虑到历史上的地理隔离难以确定,加之种对间亲缘关系很近,同域物种的判定容易引发争议。其成因可分为生态因素和突变因素:生态因素即特殊小生境产生的分化选择压,促使原始群体分化出差异显著的偏好,并借助资源竞争和协同演化不断加强;突变因素涉及杂交和多倍化,以异源多倍体成种的贡献最大,而同倍体杂交成种和同源多倍体成种虽广泛发生但少见成功案例。生殖隔离是影响物种形成的重要因素之一,可分为前隔离和后隔离,其中以花期隔离和传粉者隔离为主的前隔离起主导作用,而花粉竞争、配子不亲和以及杂种不活、不育和杂种衰退等后隔离会带来高额的生殖成本,从而加速前隔离或自交的演化。同域物种的形成是各方因素共同作用的结果,种间通常同时存在着较强的生殖隔离和一定的基因交流,以生态位竞争为前提,尤其是在充足的分化选择压下,即使基因流较为频繁也能分化形成同域物种。

关键词：被子植物同域物种形成分化选择模型生殖隔离

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自然恢复对橡胶林皆伐后土壤胞外酶活性及其化学计量变化特征的影响

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年

作者：张贝贝鲁强卢晓强洑香香南京林业大学林草学院南方现代林业协同创新中心生态环境部南京环境科学研究所国家环境保护生物多样性与生物安全重点实验室

【目的】探究橡胶林皆伐后自然恢复对土壤性状和土壤养分循环的影响。【方法】以西双版纳橡胶林皆伐后通过4个阶段自然恢复（1、10、20和40a，分别记为SF＿1、SF＿10、SF＿20和SF＿40）的次生林和约100a的天然林（PF）为研究对象，以20... 详细信息

【目的】探究橡胶林皆伐后自然恢复对土壤性状和土壤养分循环的影响。【方法】以西双版纳橡胶林皆伐后通过4个阶段自然恢复（1、10、20和40a，分别记为SF＿1、SF＿10、SF＿20和SF＿40）的次生林和约100a的天然林（PF）为研究对象，以20年生橡胶人工林（RP）为对照，测定了干湿两季土壤理化性质、微生物生物量以及4种土壤胞外酶活性。【结果】随恢复时间的延长，土壤碳、氮、磷（C、N、P）含量与微生物生物量碳氮磷（MBC、MBN和MBP）均呈现明显的上升趋势，土壤全磷（TP）、有效磷（AP）与MBP含量均在SF＿40林分达最高值（质量分数分别为0.34g/kg、13.65mg/kg和83.28mg/kg），但在PF林分土壤中下降并趋于稳定。土壤碳和磷获取酶活性（β-1，4-葡萄糖苷酶，BG；酸性磷酸酶，ACP）随恢复年限的延长表现为先升高后降低的趋势，分别在SF＿40和SF＿20林分中达峰值，干季分别为926和3 296nmol/（g·h），且干季显著大于湿季；而氮获取酶活性（β-1，4-n-乙酰氨基葡萄糖苷酶，NAG；亮氨酸氨基肽酶，LAP）变化规律不明显，总体上干季低于湿季。土壤C、N、P 获取酶活性对数转换后的比值为1∶1.55∶1.37，表明研究区内存在一定的N限制。相关性分析结果表明土壤MBP、AP、可溶性有机碳（DOC）含量和土壤pH为自然恢复过程中土壤胞外酶活性的主要调控因子。【结论】随着自然恢复年限的延长，土壤理化性质得到改善，微生物量显著增加；RP林分土壤养分含量、土壤胞外酶活性和微生物生物量与SF＿1林分相当，但显著低于相同恢复年限的次生林分（SF＿20）。本研究为揭示土壤微生物-胞外酶之间养分循环耦合机理提供理论支持，对理解热带季雨林生态系统中生物地球化学循环机制具有重要意义。

关键词：土壤胞外酶自然恢复化学计量比橡胶林养分限制

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树干甲烷的研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2021年第5期45卷 235-241页

作者：郭亮丁九敏徐侠南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心

在全球变暖背景下,甲烷（CH4）作为陆地生态系统中仅次于CO2的重要温室气体受到了广泛关注,其在百年时间尺度上的温室效应潜力是CO2的28～34倍,对全球变暖的贡献占20%～30%。现有对森林生态系统CH4的研究主要集中在土壤,但基于热带森林... 详细信息

在全球变暖背景下,甲烷（CH4）作为陆地生态系统中仅次于CO2的重要温室气体受到了广泛关注,其在百年时间尺度上的温室效应潜力是CO2的28～34倍,对全球变暖的贡献占20%～30%。现有对森林生态系统CH4的研究主要集中在土壤,但基于热带森林地表排放估算和卫星CH4通量之间的差异报告,以及近年的研究证明了树木是森林CH4预算的重要来源和汇。笔者综合分析了树干CH4的来源、通量大小、影响因素及其对陆地碳预算的影响,结果发现:（1）树干释放出的CH4是来自土壤或者树木心材,然后主要通过树干扩散释放到空气中;（2）树干CH4的通量范围为（-37.5±18.75）～（16 937.50±6 812.50）μmol/（m2·h）;（3）树干表面CH4通量具有较大的时空差异性,这些差异主要来自树种、年龄、组织类型、立地特征和环境条件等;（4）在不考虑树干CH4通量的前提下,森林湿地（或木本沼泽）生态系统的CH4释放量部分可能被低估,而旱地或者高山森林中CH4的吸收量部分可能被高估。树干甲烷作为陆地碳循环的"新成员",应该被充分重视,这对于预测未来全球气候变化具有重要意义。

关键词：树干甲烷温室气体碳循环陆地生态系统

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洪泽湖河湖交汇区典型杨树人工林碳通量月尺度变化特征

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第2期46卷 19-26页

作者：崔皓韩建刚郭俨辉季淮朱咏莉李萍萍南京林业大学生物与环境学院南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏洪泽湖湿地生态系统国家定位观测研究站

【目的】揭示洪泽湖水位夏低冬高的独特水文特点对河湖交汇区杨树人工林净生态系统碳交换（NEE,简称碳通量）产生的影响。【方法】采用涡度相关及土壤水热监测系统，对洪泽湖湿地河湖交汇区典型杨树人工林碳通量及其环境因子进行了连续... 详细信息

【目的】揭示洪泽湖水位夏低冬高的独特水文特点对河湖交汇区杨树人工林净生态系统碳交换（NEE,简称碳通量）产生的影响。【方法】采用涡度相关及土壤水热监测系统，对洪泽湖湿地河湖交汇区典型杨树人工林碳通量及其环境因子进行了连续3 a（2016—2018年）的观测，分析月尺度上碳通量变化及其与环境因子的关系。【结果】（1）洪泽湖河湖交汇区杨树人工林的NEE值具有明显“V”形变化曲线，白天表现为碳吸收，夜间表现为碳释放，日均碳汇时间为10 h;（2）研究期间各旬NEE值在2018年的2月上旬最高（7.117 g/m2）,最低值出现在2017年的7月中旬（-212.256 g/m2）;3年间年均NEE值为-1 413.403 g/m2;（3）在洪泽湖开闸时期（5—8月）水位低，土壤含水率和风速是影响NEE的主要因素，关闸时期（9月至翌年4月）水位高，NEE主要受空气温度和饱和水汽压差影响。【结论】夏季对洪泽湖开闸放水，有利于河湖交汇区杨树生长及碳汇增加，冬季蓄水地下水位抬高，对杨树生长产生的不利影响可以通过开沟筑垄来消除，进而有利于区域杨树人工林全年碳汇功能的提升。

关键词：杨树人工林碳通量涡度相关环境因子洪泽湖

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基于高通量测序的禁牧对土壤微生物群落结构的影响

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生态学报 2022年第17期42卷 7137-7146页

作者：朱怡吴永波安玉亭南京林业大学生物与环境学院南京210037 江苏省南方现代林业协同创新中心南京210037 盐城市麋鹿研究所盐城224136

麋鹿的采食、躺卧和践踏行为均会对栖息地土壤环境造成影响,进而影响土壤微生物群落结构。利用高通量测序技术,分析江苏大丰麋鹿国家级自然保护区禁牧点和补饲点土壤细菌和真菌群落结构差异,并结合土壤理化性质探究禁牧对土壤微生物群... 详细信息

麋鹿的采食、躺卧和践踏行为均会对栖息地土壤环境造成影响,进而影响土壤微生物群落结构。利用高通量测序技术,分析江苏大丰麋鹿国家级自然保护区禁牧点和补饲点土壤细菌和真菌群落结构差异,并结合土壤理化性质探究禁牧对土壤微生物群落结构的影响。结果表明细菌群落的优势菌门为变形菌门,真菌群落的优势菌门为子囊菌门。禁牧改变了土壤微生物群落结构,在门水平上提高了变形菌门、放线菌门和担子菌门的相对丰度,降低了绿弯菌门、厚壁菌门和子囊菌门的相对丰度,禁牧点与补饲点土壤微生物群落多样性的相似性较低。冗余分析中,细菌受土壤环境因子的影响大于真菌,其中土壤pH是影响细菌和真菌群落最大的土壤环境因子。研究揭示了禁牧对土壤微生物群落结构的影响,为保护区制定麋鹿生境恢复方案提供参考。

关键词：禁牧土壤微生物群落结构高通量测序

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基因组时代的物种形成研究

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遗传 2025年第1期47卷 71-100页

作者：王则夫刘建全南京林业大学生态与环境学院林木遗传育种全国重点实验室南方现代林业协同创新中心南京210037 兰州大学生态学院草种创新与草地农业生态系统全国重点实验室兰州730000

自达尔文时代起,物种形成便是演化生物学研究领域的核心科学问题之一。物种形成研究有助于人们深入理解生物多样性的形成过程,为其保护提供坚实基础。由于很多物种的演化历程十分复杂,使得物种形成研究充满了各种挑战。近年来,随着基因... 详细信息

自达尔文时代起,物种形成便是演化生物学研究领域的核心科学问题之一。物种形成研究有助于人们深入理解生物多样性的形成过程,为其保护提供坚实基础。由于很多物种的演化历程十分复杂,使得物种形成研究充满了各种挑战。近年来,随着基因组测序与分析等技术的不断发展,物种形成研究领域进展迅速。本文综述了基因组时代的物种形成研究,从物种界定、二歧式物种分化、杂交物种形成、多倍化物种形成、生殖隔离基因、物种形成基因等方面,重点对相关概念进行了区分,并回顾了相关研究方法、对其特点与局限性等进行了探讨;最后,对物种形成研究的未来发展趋势与挑战进行了展望。

关键词：物种形成基因组学研究方法研究进展未来展望

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