检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第4期46卷 102-108页

作者：冯一宁李因刚祁铭周鹏燕周琦董乐徐立安南京林业大学南方现代林业协同创新中心浙江省林业科学研究院

【目的】闽楠（Phoebe bournei）是珍贵的用材树种，被列为国家Ⅱ级重点保护野生植物。以福建省内保存较好的3个代表性闽楠自然群体为对象，研究其群体间及群体内的遗传变异水平及遗传结构特征，探究其成因，为闽楠天然群体的保护和利... 详细信息

【目的】闽楠（Phoebe bournei）是珍贵的用材树种，被列为国家Ⅱ级重点保护野生植物。以福建省内保存较好的3个代表性闽楠自然群体为对象，研究其群体间及群体内的遗传变异水平及遗传结构特征，探究其成因，为闽楠天然群体的保护和利用提供依据。【方法】利用自行开发的18个多态性SSR标记，对3个群体共计88个样本进行检测，利用Popgene 32软件，分析群体的有效等位基因数（Ne）、观测杂合度（H_o）、期望杂合度（He）、基因分化系数(Fst))等，利用Structure软件研究群体的遗传结构。【结果】3个闽楠群体的平均期望杂合度为0.629,表明遗传多样性较丰富；3个群体的平均观测杂合度明显低于期望杂合度，群体内近交程度较高[近交系数（F）=0.280)],尤其是罗卜岩群体H_o/He差异大（0.399/0.608）、近交程度高（F=0.378）;分子变异分析显示，闽楠的变异主要来源于群体内，群体间存在中等程度的分化(Fst=0.197)。聚类分析结果表明，3个群体闽楠样本可明显区分为两类，两类间存在明显的遗传分化，福建罗卜岩和福建顺昌群体为第Ⅰ类，且两者地理位置较近；福建政和与其距离较远，为第Ⅱ类。【结论】福建闽楠3个代表性群体具有较高的遗传多样性，但具有小群体特征，群体内近交程度较高，而地理隔离和人为活动使闽楠具有一定程度的遗传分化；应采取措施使群体内充分异交，以维持闽楠群体较高的遗传多样性。

关键词：闽楠 SSR标记遗传多样性遗传分化遗传结构

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杨属派间5个种特异性InDel引物及在派间杂交子代鉴别中的应用

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林业科学 2024年第2期60卷 78-86页

作者：戴晓港韩峭子尹佟明林木遗传育种全国重点实验室、南方现代林业协同创新中心、林木遗传与生物技术教育部重点实验室、江苏省林木遗传和高效培育重点实验室、南京林业大学林学院南京210037

【目的】远缘杂交可以实现有利基因的聚合,是种质创新的重要手段。杨属有些派间杂交困难,且杂交子代从形态学难以区分,本研究开发杨属不同派间的特异性引物,为派间杂交创制新种质的真实性鉴定提供技术支撑。【方法】利用在美洲黑杨和小... 详细信息

【目的】远缘杂交可以实现有利基因的聚合,是种质创新的重要手段。杨属有些派间杂交困难,且杂交子代从形态学难以区分,本研究开发杨属不同派间的特异性引物,为派间杂交创制新种质的真实性鉴定提供技术支撑。【方法】利用在美洲黑杨和小叶杨中种特异性InDel位点设计引物,并利用SeqHunter2依次比对胡杨、山杨、小叶杨和大叶杨基因组,再用杨属5个派的自然群体材料进行种内保守及种间多态引物的试验验证,筛选出杨属不同派的特异性引物序列,对杨属不同派间杂交子代进行真实性鉴别。【结果】将从美洲黑杨基因组设计的5000对InDel引物依次分别比对胡杨、山杨、小叶杨和大叶杨基因组,最后筛选出341对引物在上述5个种中是通用的。从不同染色体上共选取48对引物并合成,利用5个树种各1个DNA检测得到43对引物是通用的,其中19对引物在不同种中扩增条带单一且存在差异。利用自然群体混合DNA对试验验证的19对通用引物进行种间多态性和种内保守性检测,初步获得4对多态性引物。最后再用自然群体DNA对这4对引物进行扩增检测,发现引物Chr12_4341229和Chr13_10582756在美洲黑杨、小叶杨、山杨、大叶杨和胡杨中均只能扩增出一个位点,引物Chr12_4341229扩增条带分别为148、152、113、152和159 bp,引物Chr13_10582756扩增条带分别为140、144、116、140和159 bp。利用上述2对引物对小胡杨2号、黑胡杨和黑小杨进行鉴定,发现所有杂交子代个体均能检测它们2个亲本的特征带。引物Chr12_4341229和Chr13_10582756一起使用,可以用于美洲黑杨、小叶杨、山杨、大叶杨和胡杨任意组合杂交子代的真实性鉴别。【结论】本研究获得了杨属5个派间的5个种的特异性InDel引物2对,可以有效地进行杨属不同派5个种之间任意组合种间杂交子代的真实性鉴别,为进一步开展杨树派间杂交创制新种质提供了技术支持。

关键词：杨属远缘杂交物种特异性引物种间杂交分子鉴别

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染色质转座酶可及性测序及其在木本植物中的应用前景

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第5期46卷 1-10页

作者：王子玥甄艳刘光欣席梦利南京林业大学南方现代林业协同创新中心林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing, ATAC-seq)是2013年在人类免疫细胞中建立的用于研究表观遗传调控的重要技术。该技术已在人类及小鼠等模式动物的基因组调控元件... 详细信息

染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing, ATAC-seq)是2013年在人类免疫细胞中建立的用于研究表观遗传调控的重要技术。该技术已在人类及小鼠等模式动物的基因组调控元件鉴定、转录因子结合位点识别及转录调控机制的解析等研究领域发挥了重要作用。然而，ATAC-seq技术在植物领域中的研究应用还处于起步阶段，相关研究主要集中在拟南芥和水稻等模式植物中。笔者主要概述了ATAC-seq技术在植物中的应用，包括染色质可及性图谱绘制、抗逆机制解析、表观修饰鉴定及调控元件识别等领域的研究进展，并进一步阐述了ATAC-seq在木本植物中的应用潜力，以推动ATAC-seq技术在木本植物表观基因组学研究中的应用。

关键词：染色质转座酶可及性测序木本植物染色质可及性表观基因组学

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干旱影响森林土壤有机碳周转及积累的研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第6期46卷 195-206页

作者：徐晨阮宏华吴小巧谢友超杨艳南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心江苏省林业局

随着全球气候变暖趋势加剧，伴之而来的干旱问题成为全球关注的热点。干旱对森林生态系统碳积累和周转可能产生显著影响，其主要过程包括植被地上部分和地下部分凋落物对土壤有机碳的输入、凋落物的分解及土壤有机碳的矿化等。笔者综合... 详细信息

随着全球气候变暖趋势加剧，伴之而来的干旱问题成为全球关注的热点。干旱对森林生态系统碳积累和周转可能产生显著影响，其主要过程包括植被地上部分和地下部分凋落物对土壤有机碳的输入、凋落物的分解及土壤有机碳的矿化等。笔者综合分析了近年来国内外相关研究成果，对干旱影响森林土壤有机碳的主要过程与机制进行了归纳和总结，结果表明：(1)干旱通过促进叶片提前脱落，短期增加森林凋落物量，长期干旱则影响森林植物生长，降低森林初级生产力从而降低植物地上凋落物量。轻度和中度干旱下植物为补偿水分缺失增加细根生物量维持植物生命力，重度干旱下植物丧失自我修复能力导致细根生物量降低，干旱也会造成细根死亡率增加。平均而言，全球范围内干旱会造成森林凋落物量降低(1.9%)和细根生物量降低(8.7%),最终减少植物有机碳向土壤的输入量。(2)干旱可通过改变凋落物化学性质，对分解者——土壤动物、微生物产生胁迫，从而引起凋落物分解速率下降(10%～70%)。干旱使凋落物碳氮含量变化，造成凋落物次生代谢物，如纤维素、木质素、单宁等积累，改变根系分泌物化学组分，从而影响凋落物分解。干旱导致真菌生物量和分解者等土壤动物丰度降低，增加分解者捕食压力，使相关微生物和酶活性下降，造成凋落物分解速率下降。(3)干旱驱动微生物群落组成变化(真菌细菌比、革兰阳阴细菌比增加),造成微生物生物量下降，活性减弱，此外还会降低腐食动物的摄食活性、酶活性，最终导致土壤有机碳矿化速率下降(10%～50%)。(4)干旱对土壤有机碳不同组分影响不同，干旱会减小土壤微生物生物量碳(MBC)库(2%～30%),造成表层土壤溶解性有机碳(DOC)积累(30%～60%)。而在全球范围内的不同区域，干旱对土壤有机碳积累的影响也不同，亚热带森林中干旱对土壤有机碳积累的影响多是负面的，热带森林中则相反。总体而言，干旱对森林土壤有机碳库储量影响可能不大，但降低了土壤碳周转效率。而森林土壤有机碳周转过程不仅受干旱这一单一因素影响，温度、物种等因素会共同作用于土壤有机碳的周转与积累，且单因子的简单叠加模拟可能与现实环境中多因子综合对土壤碳通量的影响有一定差别。未来需要通过长期观测、延长控制实验时间、模拟原生环境条件等，开展多因素综合实验，加强干旱对土壤动物和微生物影响的研究，以深入了解干旱对森林土壤有机碳影响的生物学与生态学的过程与机制。

关键词：森林土壤有机碳输入地上凋落物根系凋落物土壤微生物有机碳矿化土壤呼吸

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簸箕柳×三蕊柳种特异性KASP标记开发及种间杂交子代鉴别

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林业科学 2024年第4期60卷 119-126页

作者：戴晓港魏铭辰林木遗传育种全国重点实验室、南方现代林业协同创新中心、林木遗传与生物技术教育部重点实验室、江苏省林木遗传和高效培育重点实验室、南京林业大学林学院南京210037

【目的】开发簸箕柳和三蕊柳种特异性KASP引物,为开展簸箕柳和三蕊柳杂交选育速生、抗虫新种质的真实性鉴定提供参考。【方法】利用簸箕柳和三蕊柳重测序数据,开展全基因组SNP位点分析,筛选出种特异性的SNP位点并设计KASP引物,利用SeqHu... 详细信息

【目的】开发簸箕柳和三蕊柳种特异性KASP引物,为开展簸箕柳和三蕊柳杂交选育速生、抗虫新种质的真实性鉴定提供参考。【方法】利用簸箕柳和三蕊柳重测序数据,开展全基因组SNP位点分析,筛选出种特异性的SNP位点并设计KASP引物,利用SeqHunter2检测设计引物在簸箕柳中的通用性,并利用簸箕柳和三蕊柳自然群体材料对合成的引物进行实验验证,筛选出簸箕柳和三蕊柳种特异性KASP引物,并对它们的杂交子代进行真实性鉴别。【结果】将三蕊柳和簸箕柳重测序的数据比对到三蕊柳基因组,共获得个6598144个SNPs。经过筛选,最终在簸箕柳中检测到674144个和三蕊柳相比为纯合突变的位点。从每条染色体上随机选取100个位点用于KASP引物设计,在1900个SNPs位点中,750个SNP位点可以成功设计出KASP引物。从每条染色体上选取2组,共选取38组引物,通过SeqHunter2检测得到11组引物在簸箕柳中是通用的。利用簸箕柳和三蕊柳自然群体DNA对合成的10组通用引物进行种内保守和种间差异性检测,获得4组在簸箕柳、三蕊柳和种间杂交子代中聚类明显的引物。引物Stri08_82809、Stri14_11602、Stri14_12274和Stri17_10731在簸箕柳自然群体中分别扩增出纯合G/G、T/T、A/A和T/T位点,在三蕊柳自然群体分别扩增出纯合A/A、C/C、G/G和C/C位点,而在真实杂交子代中分别扩增出G/A、T/C、A/G和T/C杂合位点。利用上述4组引物对簸箕柳×三蕊柳的杂交子代进行鉴定,发现在31个杂交子代中,29个个体扩增出杂合位点,说明同时遗传了2个亲本的特征位点,为真实的种间杂交子代。有2个个体扩增的位点为纯合且和母本相同,说明这2个子代为簸箕柳花粉污染的子代。【结论】本研究获得了簸箕柳和三蕊柳种间特异性KASP标记4组,可以准确快速的开展簸箕柳和三蕊柳种间杂交子代的真实性鉴别,为进一步簸箕柳和三蕊柳种间杂交及回交创制抗虫新品种提供了技术支持。

关键词：簸箕柳三蕊柳种间杂交物种特异性KASP引物种间杂交分子鉴别

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沼液替代化肥及与秸秆联用对稻田土壤反硝化和硝态氮氨化潜力的影响

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土壤学报 2023年第3期60卷 738-748页

作者：杨知书徐传红汤逸帆申建华孟岩韩建刚南京林业大学生物与环境学院南京210037 南京林业大学江苏省南方现代林业协同创新中心南京210037 中粮家佳康(江苏)有限公司江苏东台224200

为揭示沼液替代化学氮肥及与秸秆联用对土壤反硝化(Denitrification,Den)和硝态氮氨化(Dissimilatory nitrate reduction to ammonium,DNRA)特征的影响,以江苏东台典型滨海稻田为对象,进行田间小区实验,设置单施化肥(C)、单施沼液(B)、... 详细信息

为揭示沼液替代化学氮肥及与秸秆联用对土壤反硝化(Denitrification,Den)和硝态氮氨化(Dissimilatory nitrate reduction to ammonium,DNRA)特征的影响,以江苏东台典型滨海稻田为对象,进行田间小区实验,设置单施化肥(C)、单施沼液(B)、沼液秸秆联用(BS)和化肥秸秆联用(CS)以及对照(CK)5个处理,借助15N同位素示踪技术研究水稻不同生育期各处理土壤Den和DNRA潜力的变化特征。结果表明:(1)整个水稻生育期内,沼液替代化肥可有效降低稻田土壤Den强度(1.48μg·kg^(-1)·h^(-1)),N2O总生成量减少27%,但沼液秸秆配施与化肥秸秆配施相比导致N2O生成总量显著增加70%。(2)从不同生育期看,成熟期N2O的调控显得尤为必要。沼液处理(B、BS)与化肥处理(C、CS)均在成熟期出现N2O产生高峰,平均占总产生量的70%~71%与75%~92%。沼液替代化肥有利于氮素在土壤的保存,分蘖期土壤DNRA潜力最高,并且B和BS处理DNRA潜力显著高于C和CS处理。(3)相关性分析发现,单施沼液或化肥处理Den潜力均与pH正相关,与C:N负相关,其中C:N的升高是沼液替代化肥(即B处理)Den强度降低的重要原因。配施秸秆,主导Den潜力变化的因子转变为 NO_(3)^(-)-N和 NH_(4)^(-)-N,且C︰N的降低导致Den强度增加。本研究明确了沼液替代化肥与秸秆还田对稻田土壤Den、DNRA过程的影响及其环境效应评估,并为滨海农田沼液施用模式的探索提供一定理论依据。

关键词：秸秆还田沼液替代化肥反硝化氨化稻田

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柳树痂囊腔菌的基因组测序和比较基因组分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第3期46卷 143-150页

作者：程强赵丽娟南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南方现代林业协同创新中心

【目的】报道柳树痂囊腔菌(Elsino?murrayae)的全基因组序列,与甜橙痂囊腔菌杨树致病型的基因组进行比较分析,为阐述柳树痂囊腔菌的致病和适应性机制提供参考。【方法】采用Illumina HiSeq 2500测序仪对柳树痂囊腔菌的全基因组序列进行... 详细信息

【目的】报道柳树痂囊腔菌(Elsino?murrayae)的全基因组序列,与甜橙痂囊腔菌杨树致病型的基因组进行比较分析,为阐述柳树痂囊腔菌的致病和适应性机制提供参考。【方法】采用Illumina HiSeq 2500测序仪对柳树痂囊腔菌的全基因组序列进行测序,预测蛋白编码基因,筛选与致病相关的碳水化合物活性酶基因、小分泌蛋白基因和次生代谢产物基因簇。根据痂囊腔属真菌基因的直系同源关系,筛选柳树痂囊腔菌和甜橙痂囊腔菌杨树致病型之间共有特异性的基因和二者之间差异基因,并进行GO富集分析。鉴定柳树痂囊腔菌的交配类型位点,使用特异性引物进行PCR,检测分离株的交配类型。【结果】组装获得了1个20.7 Mb基因组,完整度99%;预测出8 256个蛋白编码基因,其中包括486个碳水化合物活性酶基因,193个小分泌蛋白基因和16个次生代谢产物基因簇(GenBank登录号:NKHZ00000000)。系统进化和共线性分析显示柳树痂囊腔菌和甜橙痂囊腔菌杨树致病型亲缘关系最近,两者之间具有12个在其他痂囊腔菌中没有的共有特异性基因。两个真菌的比较基因组分析,筛选出752和1 746个差异基因,主要参与碳水化合物代谢和毒素代谢的生物学过程。已有分离株的交配类型均为MAT1-2。【结论】获得柳树病原真菌-柳树痂囊腔菌的基因组,筛选出痂囊腔菌中负责寄主适应性的候选基因,分析了柳树痂囊腔菌交配系统,这可为柳树病害防治和柳树-病原真菌相互作用研究提供关键信息。

关键词：柳树痂囊腔菌柳树疮痂叶斑病基因组甜橙痂囊腔菌交配类型

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马尾松分布格局对未来气候变化的响应

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第2期46卷 196-204页

作者：吴帆朱沛煌季孔庶南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南方现代林业协同创新中心

【目的】分析并预测未来气候变化对马尾松适宜分布范围，探讨影响马尾松潜在地理分布的主要气候因子，为马尾松潜在分布区种质资源管理和保护提供参考与指导。【方法】以中国数字植物标本馆记录的马尾松分布数据为基础，利用MaxEnt模型... 详细信息

【目的】分析并预测未来气候变化对马尾松适宜分布范围，探讨影响马尾松潜在地理分布的主要气候因子，为马尾松潜在分布区种质资源管理和保护提供参考与指导。【方法】以中国数字植物标本馆记录的马尾松分布数据为基础，利用MaxEnt模型及地理信息系统ArcGIS 10.3软件探讨马尾松当前地理分布特征及其潜在分布区，并针对代表性浓度路径(RCP) 2.6及RCP 8.5两种气候情景下未来(2050年和2070年)马尾松适宜分布范围及主要气候因子进行分析。【结果】当前马尾松高适生区覆盖的地区主要分布于秦岭—淮河线以南。浙江、福建、江西、湖北西南部、湖南、重庆、四川东南部、贵州北部、广西中部、广东北部等地区为马尾松主要分布区，海南、云南及台湾等地为零星分布区。在未来气候情景下，马尾松适生区向我国北部地区迁移，包括河南西部、山东半岛、辽东半岛、河北东部、山西南部等地区，而在云南南部零星地区不会再有马尾松自然分布。在未来两种气候情景4个条件中，相同RCP情景下，不同年限各适生区之间的差异并不明显，变化趋势大致相同；但相同年限的不同RCP情景对应的各适生区面积变化存在明显区别，RCP 8.5的影响要高于RCP 2.6。影响马尾松地理分布的主导生物气候变量为年均降水量、最干月降水量及平均气温日较差，且降水较温度的影响更大。【结论】未来气候变化将导致马尾松分布范围进一步扩大，新增分布区主要集中于当前分布区北部。应以当前马尾松适生环境为基础，针对当地气候类型、土壤条件等环境因素合理建立保护区，以便马尾松能够顺利适应新环境。

关键词：马尾松气候变化 MaxEnt模型代表性浓度路径潜在地理分布主导生物气候因子

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中国马尾松遗传改良研究历程与成就

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南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第6期46卷 10-22页

作者：季孔庶徐立安王登宝倪州献王章荣南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南方现代林业协同创新中心

围绕中国马尾松遗传改良从20世纪50年代末的起步，70年代末80年代初开始的全面发展，到21世纪后现代生物技术的快速融入提升，较全面回顾了60多年3代人坚持不懈的科研历程及取得的主要成就，并着重总结南京林业大学马尾松课题组牵头或... 详细信息

围绕中国马尾松遗传改良从20世纪50年代末的起步，70年代末80年代初开始的全面发展，到21世纪后现代生物技术的快速融入提升，较全面回顾了60多年3代人坚持不懈的科研历程及取得的主要成就，并着重总结南京林业大学马尾松课题组牵头或参与的优良种源筛选、优树选择、母树林与种子园营建、无性系选育、材性遗传改良、现代生物技术辅助育种等相关研究工作，及其创新与引领性作用、对社会的贡献和遗传改良经验。面对新的机遇与挑战，针对马尾松树种特点、现有研究基础及社会需求、结合生物学领域的发展趋势，进行了该树种的相关研究展望，认为未来该树种的遗传改良应围绕种质资源、多目标选育、家系与无性系林业需求、常规与现代生物技术融合等方面展开，同时需侧重抗松材线虫病、纸浆材、高产脂良种选育，将基础性和前沿性研究融入常规育种等领域，从而使该树种的遗传改良推向一个新高度。

关键词：马尾松遗传改良研究进展成就战略对策

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不同质量分数生长素对Cd胁迫的香樟幼苗生理生化特性的影响

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东北林业大学学报 2023年第5期51卷 41-47页

作者：张泽锟张辰阳汪洋艾艳梅徐晓阳冯今萍洪婉悦宋兰萍李小平周际海皖江流域退化生态系统的恢复与重建省部共建协同创新中心(安徽师范大学) 芜湖241002 南方现代林业协同创新中心(南京林业大学)

随着工农业的发展,重金属污染越来越严重,对环境和人类健康造成了极大的威胁。以1年生香樟幼苗为供试材料,采用土培盆栽的方法,探究了在Cd质量分数为20 mg·kg^(-1)胁迫时施加不同质量分数(5、10、40 mg·kg^(-1))的吲哚乙酸(I... 详细信息

随着工农业的发展,重金属污染越来越严重,对环境和人类健康造成了极大的威胁。以1年生香樟幼苗为供试材料,采用土培盆栽的方法,探究了在Cd质量分数为20 mg·kg^(-1)胁迫时施加不同质量分数(5、10、40 mg·kg^(-1))的吲哚乙酸(IAA)对香樟幼苗光合色素、抗氧化酶活性、渗透调节能力的影响。结果表明:Cd胁迫对1年生香樟幼苗生理生化特性均有显著抑制作用,而施加吲哚乙酸可有效缓解Cd对香樟的胁迫,主要表现为吲哚乙酸可增加香樟叶片叶绿素质量分数,降低可溶性糖质量分数、可溶性蛋白质量分数、丙二醛(MDA)质量摩尔浓度、抗坏血酸质量摩尔浓度、谷胱甘肽质量摩尔浓度。外源添加不同质量分数的吲哚乙酸对香樟幼苗Cd胁迫均有不同程度的缓解,其中,施加10 mg·kg^(-1)吲哚乙酸对香樟Cd胁迫的缓解作用最显著,与仅Cd污染处理未施加IAA相比,叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素质量分数分别显著增加60.67%、58.58%、60.13%,可溶性蛋白质量分数、可溶性糖质量分数、丙二醛质量摩尔浓度、抗坏血酸质量摩尔浓度、谷胱甘肽质量摩尔浓度分别显著降低了57.7%、34.89%、22.22%、28.55%、66.03%。外源吲哚乙酸通过缓解由Cd污染导致的氧化胁迫,增强香樟幼苗的光合作用效率,从而提高香樟抗逆境胁迫能力,减少Cd毒害。

关键词：香樟 Cd胁迫吲哚乙酸光合作用生理生化指标

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