检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报(自然科学版) 2022年第6期46卷 251-260页

作者：储陈辰孙明升吴雨涵言震宇李婷冯洋帆国颖尹佟明薛良交江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心

【目的】杨树是重要的速生用材、生态防护和碳汇造林树种，也是林木遗传研究的模式树种。开展杨树泛基因组构建与基因组变异分析，可为杨树精准育种和林木泛基因组研究提供理论先导。【方法】以公开发表的高质量杨树基因组序列为基础，... 详细信息

【目的】杨树是重要的速生用材、生态防护和碳汇造林树种，也是林木遗传研究的模式树种。开展杨树泛基因组构建与基因组变异分析，可为杨树精准育种和林木泛基因组研究提供理论先导。【方法】以公开发表的高质量杨树基因组序列为基础，分析不同类型的序列变异，总结变异特征，并构建基于基因和图形结构的杨树泛基因组。【结果】本研究收集到8个杨属树种和3个二倍体或三倍体杨树杂交品种的基因组序列，3个杂交品种包含7个单倍型亚基因组序列，较好地代表了杨树4个组派的基因组特征。分析结果表明，杨树基因组间存在较多大的结构变异。在基于基因的泛基因组中，共线核心基因、非共线核心基因、次核心基因、非必需基因、特异基因占比分别为12.5%、34.9%、31.4%、16.5%、4.7%。其中，非必需基因在功能上具有较高的多样性。以基因组序列变异为基础构建杨树图形结构泛基因组，大幅提升2代测序数据的变异检测效果。通过泛基因组变异热点分析，鉴定出2个与物候关联的基因位点。【结论】杨属基因组中存在大量染色体重排，进而增加了基因调控的多样性。杨树组/派间的基因组结构变异可能与物候适应存在关联。基于林木基因组序列的复杂性，在林木泛基因组研究中应注意基因组整合范围与研究目标相匹配，结合基因泛基因组和图形结构泛基因组结果，综合解析林木的遗传变异规律和物种演化特征。

关键词：杨属泛基因组结构变异物候关联基因

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DNA甲基化调控植物组织培养过程的分子机制研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2023年第6期47卷 1-8页

作者：国颖杨港归吴雨涵何杰何玉洁廖浩然薛良交林木遗传育种全国重点实验室南方现代林业协同创新中心江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室南京林业大学林草学院

植物细胞具有全能性，创伤和外源激素能够诱导已分化细胞的重编程来再生新的植株，发展的植物组织培养技术已广泛应用于植物快速繁殖、种质保存和性状改良等多个方面。然而，对植物组织培养过程中细胞如何保持分化状态和发育可塑性的分... 详细信息

植物细胞具有全能性，创伤和外源激素能够诱导已分化细胞的重编程来再生新的植株，发展的植物组织培养技术已广泛应用于植物快速繁殖、种质保存和性状改良等多个方面。然而，对植物组织培养过程中细胞如何保持分化状态和发育可塑性的分子调控机制仍知之甚少，尤其是在表观遗传学水平上。DNA甲基化是一种进化上保守的表观遗传修饰，能够复杂地协调植物细胞全能性建立和影响其命运转变。在此，以组织培养过程中的愈伤组织形成、体细胞胚发生为切入点，总结了DNA甲基化参与植物再生过程的最新进展。首先，分析了不同植物再生过程中全基因组DNA甲基化变化模式，认为外植体类型和再生阶段均会对DNA甲基化水平产生影响；其次，重点研究了甲基化转移酶(MET1)等在植物再生过程中的作用，以及DNA甲基化调控再生基因表达的分子机制，包括BBM(baby boom),WOX(wuschel-related homeobox),WIN(wound induced dedifferentiation)等基因，最后，讨论了DNA甲基化在植物再生领域的未来研究方向，指出组织培养与基因工程的结合将为农作物和经济、用材林木的高效繁殖和精准培育提供机遇。

关键词：植物组织培养 DNA甲基化愈伤组织体细胞胚胎发生

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毛果杨copine/BONZAI基因家族全基因组鉴定与组织表达特异性分析

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分子植物育种 2021年第15期19卷 4968-4976页

作者：徐强戴晓港尹佟明李小平南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室南京210000

利用copine蛋白保守序列进行blastx同源比对,鉴定毛果杨copine/BONZAI基因家族,构建系统进化树;通过在线网站进一步分析毛果杨copine蛋白的理化性质、结构和功能。利用数据库数据对copine/BONZAI基因在根、茎和叶等组织器官中的表达模... 详细信息

利用copine蛋白保守序列进行blastx同源比对,鉴定毛果杨copine/BONZAI基因家族,构建系统进化树;通过在线网站进一步分析毛果杨copine蛋白的理化性质、结构和功能。利用数据库数据对copine/BONZAI基因在根、茎和叶等组织器官中的表达模式进行分析。结果显示,毛果杨含有3个copine/BONZAI基因,分别为PtBON1、PtBON2和PtBON3,氨基酸残基数分别为573 aa、576 aa、579 aa;相对分子质量分别为62865.57、63191.81、63980.64 kD;平均理论等电点分别为5.38、5.33、5.99。PtBONs具有明显的疏水区和亲水区,没有Coil区,N端不存在信号肽,不具有跨膜结构域,均为非分泌蛋白。PtBONs二级结构中最主要的结构元件是α-螺旋和无规则卷曲。通过STRING和KEGG预测copine蛋白参与了植物与病原体相互作用过程。本研究结果为今后研究杨树copine蛋白的细胞信号转导通路机制及温度介导的抗病调控机制等提供理论依据。

关键词：毛果杨 copine蛋白生物信息学蛋白序列结构预测分析蛋白功能预测分析

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油用牡丹良种‘凤丹NL10’组织培养与快繁初步研究

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分子植物育种 2021年第16期19卷 5447-5457页

作者：刘佳锦王抒怡李淑娴尹佟明文书生李小平南京林业大学林学院江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室南方现代林业协同创新中心南京210000

牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)属于毛莨科(Ranunculaceae)、芍药属(Paeoniaceae)多年生落叶灌木,为中国特有的木本花卉。除了药用和观赏价值,近年来人们又发现牡丹具有油用作用,并有凤丹牡丹(***)和紫斑牡丹(P. rockii)两大类栽培... 详细信息

牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)属于毛莨科(Ranunculaceae)、芍药属(Paeoniaceae)多年生落叶灌木,为中国特有的木本花卉。除了药用和观赏价值,近年来人们又发现牡丹具有油用作用,并有凤丹牡丹(***)和紫斑牡丹(P. rockii)两大类栽培品种群。目前油用牡丹的繁殖主要以种子繁殖为主,后代个体之间差异较大,性状不稳定,不能保持母本的优良性状。植物组织培养和快繁技术具有能保证原有品种的优良性状、繁殖系数高以达到产业化等特点。本研究利用‘凤丹NL10’为试验材料,选取凤丹的鳞芽和种胚等材料进行试验,主要研究不同消毒剂对外植体消毒、不同基本培养基及植物生长调节剂对鳞芽和愈伤组织的诱导、种胚生根等的影响。研究结果如下:(1)以鳞芽为外植体,先用75%的无水乙醇消毒30 s,再用2%的NaClO消毒20 min,杀菌效果最好。以种胚为外植体,采用75%的无水乙醇消毒30 s、5%的NaClO消毒20 min,杀菌效果最好。(2)鳞芽初代培养的培养基为WPM+6-BA 0.5 mg/L+GA30.4 mg/L。(3)鳞芽增殖培养的培养基为WPM+6-BA 0.5 mg/L+GA30.4 mg/L+PIC 0.6 mg/L+PVP 4 mg/L。(4)种胚在MS培养基中萌发率最高,6-BA 1.0 mg/L有利于种胚成苗,TDZ 0.5 mg/L有利于种胚膨大。适宜种胚子叶诱导愈伤组织的培养基为MS+6-BA 1.0 mg/L+2,4-D 2.0 mg/L。(5)种胚生根的培养基为1/2MS+IBA 1.0 mg/L+GA30.2 mg/L。

关键词： ‘凤丹NL10’ 组织培养快繁鳞芽种胚

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大豆生长素响应因子基因GmARF17对胚轴生长发育的调控作用

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核农学报 2015年第9期29卷 1668-1676页

作者：李小平曾庆发张根生赵娟陈嬴男尹佟明南京林业大学林学院/南方现代林业协同创新中心/江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室江苏南京210037 淮北师范大学生命科学学院/安徽省资源植物重点实验室安徽淮北235000

为丰富大豆分子育种理论,本文研究了生长素对下胚轴的分子调控机制。采用实时荧光定量PCR(q PCR)方法,发现大豆[Glycine max(L.)Merrill]生长素响应因子基因Gm ARF17在大豆子叶、下胚轴、主根和侧根中均有表达,其中侧根中表达量最高,下... 详细信息

为丰富大豆分子育种理论,本文研究了生长素对下胚轴的分子调控机制。采用实时荧光定量PCR(q PCR)方法,发现大豆[Glycine max(L.)Merrill]生长素响应因子基因Gm ARF17在大豆子叶、下胚轴、主根和侧根中均有表达,其中侧根中表达量最高,下胚轴中表达最低;外源生长素可以快速诱导该基因在下胚轴中的表达。同时分析了Gm ARF17和小RNA分子Gm-miR160作用位点,构建了p Gm ARF17∶∶m Gm ARF17(m Gm ARF17)抗降解表达载体并转化大豆。m Gm ARF17转基因大豆叶片、主茎、根和花器官的生长发育与对照组没有显著的区别,但其下胚轴生长受到明显的抑制。m Gm ARF17下胚轴对外源生长素的反应与野生型相比,没有显著差异。m Gm ARF17下胚轴游离IAA含量低于野生型,编码IAA螯合酶的Gm GH3.6表达上调,表明Gm ARF17对生长素动态平衡具有调节作用。在m Gm ARF17下胚轴中,Gm SAUR23,Gm IAA2,Gm ARGOS,Gm ARF10和Gm ARF16表达下降,而Gm MIR160A表达上升,暗示抗降解表达Gm ARF17抑制生长素信号转导并扰动了Gm MIR160A和其靶基因间的平衡。本研究揭示了植物细胞调控下胚轴生长发育的一条新途径:Gm MIR160A和Gm ARF10/16/17组成调节回路并进而影响生长素稳态基因的表达来协调下胚轴细胞伸长,对大豆分子育种具有重要意义。

关键词：生长素响应因子抗降解表达下胚轴小RNA

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