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第三届中国林业学术大会

作者：张得芳李淑娴夏涛南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南210037 南京林业大学森林资源与环境学院江苏南京210037

EST-SSR 是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用.本研究通过下载数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST 序列,运用生物信息学... 详细信息

EST-SSR 是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用.本研究通过下载数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST 序列,运用生物信息学的方法,调查六个属中SSR 的分布规律及特点.结果表明蔷薇科六个属间SSR 分布频率差别较大,从悬钩子属的10.94％到梨属的43.49％.二碱基和三碱基重复类型在六个属中占据优势,其中二碱基重复类型主要为AG/CT、GA/TC 及AT/TA,而三碱基重复类型在六个属中差异较大,优势类型主要为AGA/TCT、GAA/TTC 和AAG/CTT 及CAC/GTG 和ACA/TGT等类型,显示出属间特异性.该结果对于研究蔷薇科植物的分子系统发育与进化,种质资源鉴定,遗传多样性以及遗传作图提供了研究平台.

关键词：蔷薇科 SSR EST

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杉木次生木质部MYB基因的克隆与分析

杉木次生木质部MYB基因的克隆与分析

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第三届中国林业学术大会

作者：吕运舟陈金慧施季森董筱昀黄利斌南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 江苏省林业科学研究院南京211153

林木植物木质部发育过程的调控是一个涉及多种转录因子的复杂调控网络,其中MYB基因被认为与次生壁加厚过程的调控有直接关系.本实验以 '6421'无性系杉木为研究材料,在已有杉木木质部组织转录组数据基础上,通过RT-PCR方法克隆了1... 详细信息

林木植物木质部发育过程的调控是一个涉及多种转录因子的复杂调控网络,其中MYB基因被认为与次生壁加厚过程的调控有直接关系.本实验以 '6421'无性系杉木为研究材料,在已有杉木木质部组织转录组数据基础上,通过RT-PCR方法克隆了15个杉木MYB基因,其中14个为典型的R2R3-MYB基因.经生物信息学方法比对分析并命名,推测ClMYB1,ClMYB4,ClMYB5,ClMYB10,ClMYB11和ClMYB12可能与杉木木质部细胞次生壁合成或木质素合成过程的调控有关.此外,荧光实时定量PCR分析发现,ClMYB1和ClMYB4在杉木次生木质部中的相对表达量最高,ClMYB7、ClMYB8和ClMYB11次之,表达量最低的是ClMYB3和ClMYB12基因.因此,初步认为ClMYB1、ClMYB4、ClMYB8和ClMYB11可能与木质部次生壁合成的调控相关,可以作为杉木木质素等次生壁化学成分生物合成调控的候选转录因子继续研究.

关键词：无性系杉木木质部组织次生壁转录因子 MYB基因基因克隆生物合成

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蔷薇科六个属植物EST-SSR特征分析

蔷薇科六个属植物EST-SSR特征分析

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中国林学会树木学分会第十六届学术年会

作者：张得芳李淑娴夏涛南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 南京林业大学森林资源与环境学院江苏南京210037

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用.本研究通过下载数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生物信息学的... 详细信息

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用.本研究通过下载数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生物信息学的方法,调查六个属中SSR的分布规律及特点.结果表明蔷薇科六个属间SSR分布频率差别较大,从悬钩子属的10.94％到梨属的43.49％.二碱基和三碱基重复类型在六个属中占据优势,其中二碱基重复类型主要为AG/CT、GA/TC及AT/TA,而三碱基重复类型在六个属中差异较大,优势类型主要为AGA/TCT、GAA/TTC和AAG/CTT及CAC/GTG和ACA/TGT等类型,显示出属间特异性.该结果对于研究蔷薇科植物的分子系统发育与进化,种质资源鉴定,遗传多样性以及遗传作图提供了研究平台.

关键词：蔷薇科 SSR EST

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碳酸钠―蒸汽爆破预处理对麦草化学成分及酶水解效率的影响

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纤维素科学与技术 2013年第1期21卷 23-29页

作者：曹杰徐韬杨林峰金永灿徐勇南京林业大学江苏省制浆造纸科学与技术重点实验室江苏南京210037 重庆市轨道交通(集团)有限公司重庆400042 南京林业大学林木遗传与生物技术教育部重点实验室江苏南京210037

研究了碳酸钠―蒸汽爆破预处理对麦草化学成分及后续酶水解的影响。结果表明,预处理麦草浆料中木质素含量随预处理中碳酸钠用量的增大而下降,木聚糖和阿拉伯聚糖含量随碳酸钠用量的增大而上升。当碳酸钠用量增加到8%以后,继续增加碳酸... 详细信息

研究了碳酸钠―蒸汽爆破预处理对麦草化学成分及后续酶水解的影响。结果表明,预处理麦草浆料中木质素含量随预处理中碳酸钠用量的增大而下降,木聚糖和阿拉伯聚糖含量随碳酸钠用量的增大而上升。当碳酸钠用量增加到8%以后,继续增加碳酸钠用量,预处理麦草浆料中的葡聚糖、木聚糖、阿拉伯聚糖和木质素含量基本保持稳定。酶用量较低时,不添加碳酸钠的预处理麦草浆料酶水解葡聚糖得率最大。除不添加碳酸钠的预处理外,酶水解葡聚糖和总糖得率随木质素含量下降而提高。提高酶用量后木质素含量对预处理麦草浆料酶水解葡聚糖得率的影响变缓。

关键词：麦草碳酸钠蒸汽爆破预处理酶水解

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柳杉初级种子园遗传多样性研究

柳杉初级种子园遗传多样性研究

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中国林学会林木遗传育种分会第七届全国林木遗传育种学术大会

作者：徐进刘子梁欧阳磊黄信金翁怀峰施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏省南京210037 福建省林业科学研究院福州350012 福建省霞浦杨梅岭林场霞浦355100

本研究首次采用SSR分子标记技术,对福建霞浦杨梅岭国有林场柳杉初级种子园12种源地,共计96份种源林优良无性系植株,进行遗传多样性的的分析,主要得出以下结论:26对SSR分子标记检测出柳杉种子园处于较高的遗传多样性水平,共扩增得到103... 详细信息

本研究首次采用SSR分子标记技术,对福建霞浦杨梅岭国有林场柳杉初级种子园12种源地,共计96份种源林优良无性系植株,进行遗传多样性的的分析,主要得出以下结论:26对SSR分子标记检测出柳杉种子园处于较高的遗传多样性水平,共扩增得到103个多态位点.平均等位基因数3.9615个,平均有效等位基因数2.7282个;平均观察杂合度为0.4966,Shannon信息指数平均为0.9945,Nei多样性指数平均为0.5336.其遗传变异主要存在于种源内,不同种源基因分化系数为0.1670.这些遗传信息为柳杉种质资源的保护和利用提供了一定依据.

关键词：柳杉种质资源遗传多样性分子标记技术

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樟子松球花芽形态分化研究

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安徽农业科学 2013年第21期41卷 8961-8962,8978页

作者：蔡卫佳郭天玮季孔庶高崇华李维向宋利平南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 内蒙古鄂尔多斯市林业治沙科学研究院内蒙古鄂尔多斯017000 内蒙古鄂尔多斯市霍洛林场内蒙古鄂尔多斯017000

[目的]观察研究樟子松大小孢子叶球分化的过程及形态学特征。[方法]采用石蜡切片法对内蒙古樟子松雌雄花芽分化过程进行形态学观察。[结果]小孢子叶原基于7月20日左右形成,8月中旬形成小孢子囊,经过冬季休眠,于第2年4月中下旬开始减数分... 详细信息

[目的]观察研究樟子松大小孢子叶球分化的过程及形态学特征。[方法]采用石蜡切片法对内蒙古樟子松雌雄花芽分化过程进行形态学观察。[结果]小孢子叶原基于7月20日左右形成,8月中旬形成小孢子囊,经过冬季休眠,于第2年4月中下旬开始减数分裂,5月7日左右花粉粒成熟;大孢子叶球原基于8月5日左右形成,随后加速分裂,在8月中旬形成芽鳞原基及中轴,第2年5月上旬,苞鳞原基分化,5月20日左右大孢子叶球原基趋于完善,胚珠形成。[结论]确定了各个分化时期的时间,为樟子松花期调控提供帮助。

关键词：樟子松雄球花芽雌球花芽形态分化

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里氏木霉液体发酵选择性合成果胶酶

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南京林业大学学报(自然科学版) 2012年第1期36卷 93-96页

作者：徐勇华凤飞朱均均勇强余世袁南京林业大学化学工程学院南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室

在摇瓶液体发酵的条件下研究了碳源、氮源、酵母汁和营养盐等因素对里氏木霉选择性合成果胶酶的影响规律,并测定了酶学性质。结果表明:从经济角度考虑宜选用脱汁橘皮粉制备果胶酶;在Mandels营养盐中添加1.0 g/L蛋白胨适合于里氏木霉产... 详细信息

在摇瓶液体发酵的条件下研究了碳源、氮源、酵母汁和营养盐等因素对里氏木霉选择性合成果胶酶的影响规律,并测定了酶学性质。结果表明:从经济角度考虑宜选用脱汁橘皮粉制备果胶酶;在Mandels营养盐中添加1.0 g/L蛋白胨适合于里氏木霉产果胶酶;以25 g/L脱汁橘皮粉液体发酵48 h,果胶酶活力最高值达到32.6μmol/(***),其中纤维素酶和木聚糖酶的活力被分别控制在0.18、0.63μmol/(***)。该果胶酶的最适pH为6.0,最适温度为50℃,以16μmol/(min.g)的果胶酶振荡水解10 g/L商品果胶粉50 h,酶解得率达80.3%。高效液相离子色谱的分析结果显示果胶酶的主要水解产物为单体半乳糖醛酸,含量达总水解产物的82.5%以上。

关键词：果胶酶里氏木霉酶的选择性合成酶学性质

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热带假丝酵母木糖乙醇发酵相关基因的筛选与分析

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中国生物工程杂志 2012年第11期32卷 61-69页

作者：徐勇沈翀邱兴天蔡鹏黄敏仁余世袁南京林业大学化工学院南京210037 江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室南京210037 教育部林木遗传与生物技术省部共建重点实验室南京210037

以木糖代谢模式菌株热带假丝酵母为材料,采用抑制性消减杂交技术构建高质量的木糖、葡萄糖发酵产乙醇的正向、反向SSH-cDNA文库。采用ABI3730系统测定2个文库中的1 013和525条EST序列,共拼接注释得到正向、反向文库中525个和288个差异... 详细信息

以木糖代谢模式菌株热带假丝酵母为材料,采用抑制性消减杂交技术构建高质量的木糖、葡萄糖发酵产乙醇的正向、反向SSH-cDNA文库。采用ABI3730系统测定2个文库中的1 013和525条EST序列,共拼接注释得到正向、反向文库中525个和288个差异性表达的已知基因,另有67个和12个可能的新基因,并对已知基因进行了GO分类。通过文库间BLAST比对去除相似序列,再结合经典代谢理论的指导筛选出候选基因,以实时定量PCR对它们进行了验证和转录本的定量比较分析,最终筛选出与部分木糖代谢和乙醇发酵相关的主效基因,包括STP、HAGT、XR2、XDH1、XDH2和ADH。实验为热带假丝酵母及其他木糖发酵菌株的糖代谢和乙醇发酵的转录谱、基因重组、代谢工程及发酵调控等相关研究提供理论指导。

关键词：热带假丝酵母木糖乙醇发酵相关基因抑制性消减文库实时定量PCR

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木糖高效生物转化的新出路

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中国生物工程杂志 2012年第5期32卷 113-119页

作者：徐勇王荥朱均均勇强余世袁南京林业大学化工学院南京210037 江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室南京210037 教育部林木遗传与生物技术省部共建重点实验室南京210037

木糖的高效利用是影响木质纤维资源生物炼制经济效益的关键因素之一,也是构建其工业化生产体系的必要前提,但是木糖生物转化面临着重要的技术瓶颈,必须寻求新的思路。基于对木糖利用的现状及产业发展的综合分析,提出了木糖高效发酵制取... 详细信息

木糖的高效利用是影响木质纤维资源生物炼制经济效益的关键因素之一,也是构建其工业化生产体系的必要前提,但是木糖生物转化面临着重要的技术瓶颈,必须寻求新的思路。基于对木糖利用的现状及产业发展的综合分析,提出了木糖高效发酵制取木糖酸的新出路,论述了本领域首要的科学和技术问题是发酵抑制物的控制与消除;针对抑制物的问题,提出了细胞生理生化、代谢流分析及分子生物学的多层次和多尺度解析的研究方法;在此基础上,基于系统论的观点提出了菌种选育、原料预处理、抑制物控制与脱除、木糖酸高效发酵的技术集成的研究思路。

关键词：木糖的生物转化木糖酸木质纤维素资源生物炼制

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绿液预处理玉米秸秆产纤维素酶的研究

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生物质化学工程 2012年第3期46卷 13-19页

作者：赵士明陆青山谷峰余世袁南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 南京林业大学、江苏省制浆造纸科学与工程重点实验室江苏南京210037

研究了绿液预处理玉米秸秆对里氏木霉产纤维素酶的影响。通过正交试验考察3个预处理条件对玉米秸秆产纤维素酶的影响,从极差和方差分析可知,对绿液预处理玉米秸秆产纤维素酶的影响程度由大到小依次是总碱量、蒸煮温度、硫化度,最大滤纸... 详细信息

研究了绿液预处理玉米秸秆对里氏木霉产纤维素酶的影响。通过正交试验考察3个预处理条件对玉米秸秆产纤维素酶的影响,从极差和方差分析可知,对绿液预处理玉米秸秆产纤维素酶的影响程度由大到小依次是总碱量、蒸煮温度、硫化度,最大滤纸酶活(FPA)达到2.6 IU/mL。比较在蒸煮温度140℃和170℃,总碱量4%,硫化度0、20%、30%与40%下所产的FPA,经综合评定,在最优条件下蒸煮温度140℃,总碱量4%和硫化度0时可以尽量避免原料损失的前提下,保证FPA的大小,结果表明,里氏木霉利用绿液预处理玉米秸秆来产纤维素酶是可行的。以蒸煮温度140℃,总碱量4%和硫化度0的条件下绿液预处理得到的玉米秸秆为碳源,碳源浓度为12 g/L,FPA和β-葡萄糖苷酶活(β-GA)分别达到2.5 IU/mL和1.3 IU/mL,产酶周期5 d。

关键词：纤维素酶里氏木霉绿液预处理玉米秸秆

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