检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2013年第3期11卷 385-392页

作者：王晓锋何卫龙蔡卫佳阮倩倩潘婷季孔庶林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学南京210037

本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个contig,其中33772个contig被注释为相应的331669对生物学功能,... 详细信息

本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个contig,其中33772个contig被注释为相应的331669对生物学功能,10647个contig被注释具有酶功能。根据KEGGpathway数据库,对马尾松转录组的contig进行Pathway生物学通路的注释和预测,共识别出10647个contig具有对应的1029种酶功能,并关联到135条生物学通路。SSR查找发现,从83680个contig中找到889个SSR位点,占contig总数的比例为1.06%。其中,三核苷酸重复所占比例最高,达到48.37%,其次是六核苷酸重复,为19.12%,比例最低的是四核苷酸重复,仅为4.72%,二核苷酸重复和五核苷酸重复基本相同,分别为14.62%和13.16%。SSR不同重复基元类型中,出现频率最高的为AT/AT,其次是AGC/CTG和AAG/CTT。

关键词：马尾松转录组测序 Ⅲumina高通量测序技术 SSR

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基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析

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林业科学 2013年第8期49卷 43-50页

作者：温强徐林初江香梅李江顾胤聪徐立安黄敏仁南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 江西省林业科学院南昌330032

采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的... 详细信息

采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的;在所有被检索序列的二至六碱基微卫星中,均以二碱基微卫星最多(>55%),并以(AG)n类型为主,但三碱基微卫星在所有EST序列中以(AAG)n类型最多,而在普通油茶基因组序列中则以(AAT)n最多;除六碱基微卫星外,二至五碱基微卫星均表现为不同微卫星重复单元的丰度随着微卫星碱基长度增加而减少。在转录组序列中,除六碱基微卫星之外,不同微卫星单元重复数的变异与重复单元长度呈负相关,推测二碱基微卫星理论多态性最高,而五碱基微卫星理论多态性最低;对在无冗余独立基因各区域中的微卫星进行统计,显示分布比例依次为3'UTR>CDS>5'UTR,在相同区域内比较,UTR区域中二碱基微卫星占总数量比例最大,CDS区域内三碱基微卫星的比例最高,此外5'UTR区域的三碱基微卫星的分布比例均高于3'UTR,初步推断5'UTR区域的微卫星相对3'UTR要保守些。

关键词：山茶属 454高通量测序微卫星

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植物磺肽素在杂交鹅掌楸体胚发生中的作用

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林业科学 2013年第2期49卷 33-38页

作者：陈金慧张艳娟吴亚云王鹏凯王光萍施季森南京林业大学森林资源与环境学院林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

植物磺肽素(PSK),是近年来发现的一种新型植物肽类生长调节物质,具有促进单细胞的分裂增殖等生理功能。以杂交鹅掌楸未成熟胚来源的体胚发生体系为材料,探索PSK-α在植物体胚发生中的作用。研究发现PSK-α能够促进细胞分裂和增殖,有利... 详细信息

植物磺肽素(PSK),是近年来发现的一种新型植物肽类生长调节物质,具有促进单细胞的分裂增殖等生理功能。以杂交鹅掌楸未成熟胚来源的体胚发生体系为材料,探索PSK-α在植物体胚发生中的作用。研究发现PSK-α能够促进细胞分裂和增殖,有利于胚性细胞的形成。在杂交鹅掌楸体胚发生初期添加0.1mg·L-1的PSK-α可提高未成熟胚的脱分化率并能有效改善培养细胞的状态;0.5mg·L-1的PSK-α能够促进胚性愈伤组织的形成和增殖;体胚形成后期添加0.8mg·L-1的PSK-α利于其正常发育以及再生植株的培养。

关键词：杂交鹅掌楸体细胞胚胎发生胚性愈伤组织再生植株植物磺肽素

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百合尖孢镰刀菌鳞茎腐烂病研究进展

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江苏农业科学 2013年第6期41卷 1-5页

作者：吴祝华詹德智施季森席梦利南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037

由尖孢镰刀菌引起的百合鳞茎腐烂病是百合生产中危害最严重的病害之一,对百合切花生产影响很大。本文综述了该病的发生规律、防治方法及病原菌的鉴定方法,总结了不同百合品系对病原菌的抗性,介绍了百合抗鳞茎腐烂病育种研究现状,并对百... 详细信息

由尖孢镰刀菌引起的百合鳞茎腐烂病是百合生产中危害最严重的病害之一,对百合切花生产影响很大。本文综述了该病的发生规律、防治方法及病原菌的鉴定方法,总结了不同百合品系对病原菌的抗性,介绍了百合抗鳞茎腐烂病育种研究现状,并对百合抗病育种的前景进行了展望。

关键词：百合鳞茎腐烂病尖孢镰刀菌抗性抗性育种

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马尾松胚乳DNA高效提取及SSR-PCR体系优化

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林业科技开发 2013年第1期27卷 15-18页

作者：何卫龙杨立恒王晓锋林能庆季孔庶南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 福建省上杭白砂国有林场

以马尾松胚乳为试验材料,用CTAB-SDS法提取单粒胚乳DNA,对其浓度和纯度进行检测。结果表明:运用CTAB-SDS法提取的马尾松胚乳DNA浓度高、纯度好,琼脂糖凝胶电泳条带清晰,点样孔干净。此外,还对影响PCR结果的Mg2+、dNTP、模板DNA、引物浓... 详细信息

以马尾松胚乳为试验材料,用CTAB-SDS法提取单粒胚乳DNA,对其浓度和纯度进行检测。结果表明:运用CTAB-SDS法提取的马尾松胚乳DNA浓度高、纯度好,琼脂糖凝胶电泳条带清晰,点样孔干净。此外,还对影响PCR结果的Mg2+、dNTP、模板DNA、引物浓度、TaqDNA聚合酶5个因素进行了正交设计试验,建立了适合马尾松SSR-PCR的反应体系:即在10μL反应体系中,Mg2+浓度为2.80 mmol/L,dNTP浓度为0.35 mmol/L,引物浓度为0.075μmol/L,模板DNA浓度为20 ng/10μL,TaqDNA聚合酶浓度为0.50 U/10μL。

关键词：马尾松胚乳DNA CTAB-SDS法 SSR-PCR

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广西猫儿山鹅掌楸天然种群动态研究

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广西植物 2013年第2期33卷 242-246,207页

作者：李博冯源恒杨章旗袁晓峰叶靖李火根南京林业大学林木遗传与生物技术/省部共建教育部重点实验室南京210037 广西壮族自治区林业科学研究院南宁530001

为进一步探讨鹅掌楸濒危的机制,对广西桂林猫儿山鹅掌楸天然种群进行了调查,以种群生命表及生存分析理论为基础,以林木径级结构代表龄级结构,编制鹅掌楸种群静态生命表,分析种群结构的动态变化特点。结果表明:鹅掌楸种群龄级结构为金字... 详细信息

为进一步探讨鹅掌楸濒危的机制,对广西桂林猫儿山鹅掌楸天然种群进行了调查,以种群生命表及生存分析理论为基础,以林木径级结构代表龄级结构,编制鹅掌楸种群静态生命表,分析种群结构的动态变化特点。结果表明:鹅掌楸种群龄级结构为金字塔型,幼龄个体数量较多,中龄个体数居中,而老龄个体则相对数量较少,表现为增长型种群;在第Ⅳ龄级时该种群出现死亡高峰,其种群存活曲线属Deevey-Ⅱ型;猫儿山鹅掌楸天然种群具有前期种群数量快速减少,中后期稳定,末期衰退的特点。该研究结果对鹅掌楸天然种群的保护提供参考依据。

关键词：鹅掌楸龄级静态生命表种群结构动态

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休哈塔假丝酵母转化木糖和葡萄糖为乙醇的发酵转录谱

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微生物学报 2013年第4期53卷 338-345页

作者：熊许洁蔡鹏徐勇勇强余世袁南京林业大学化工学院江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室林木遗传与生物技术教育部重点实验室南京210037

【目的】探究木糖发酵典型菌株休哈塔假丝酵母在己糖和戊糖发酵中的转录谱及差异,筛选出与木糖利用和乙醇发酵代谢途径及调控相关的关键性酶和功能蛋白质基因。【方法】应用新一代高通量测序技术454 GS FLX Titanium分别构建了休哈塔假... 详细信息

【目的】探究木糖发酵典型菌株休哈塔假丝酵母在己糖和戊糖发酵中的转录谱及差异,筛选出与木糖利用和乙醇发酵代谢途径及调控相关的关键性酶和功能蛋白质基因。【方法】应用新一代高通量测序技术454 GS FLX Titanium分别构建了休哈塔假丝酵母木糖、葡萄糖发酵的cDNA文库,并进行De novo转录组的表达序列标签大规模测序和序列比较分析,进而挖掘出该酵母中参与木糖代谢和乙醇发酵的相关基因。【结果】分别对木糖和葡萄糖发酵样本进行二分之一RUN测序并各自得到60万条reads,序列平均长度400 bp。共拼接得到7250条(木糖)和7168条(葡萄糖)contigs,并利用BLAST对木糖样品和葡萄糖样品中的2421个基因(contig)和2456个基因(contig)进行了功能注释和GO分类。通过两个文库间的序列对比分析,共发现158个基因属于差异表达状态(P<0.05)。基于经典的糖酵解及乙醇发酵途径筛选出与木糖乙醇发酵相关的候选基因,并且比较分析其转录水平的差异。【结论】基于大规模转录谱测序和比较分析首次筛选出休哈塔假丝酵母中参与木糖代谢和乙醇发酵的基因群,可为后续的分子生物学及代谢调控研究提供基础数据。

关键词：休哈塔假丝酵母木糖代谢乙醇发酵转录谱表达序列标签

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杉木成年优良无性系的不定芽增殖研究

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林业科学研究 2013年第3期26卷 299-304页

作者：周小红周艳威张元莉施季森郑仁华陈金慧南京林业大学森林资源与环境学院林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 福建省林业科学研究院国家林业局南方山地用材林培育重点实验室福建福州350012

以杉木成年优良无性系的无菌组培苗为外植体,研究激素、活性炭等对不定芽增殖的影响,在此基础上探讨接种方式对杉木增殖效率的影响。研究表明:6-BA浓度为1.5 mg·L-1时能有效促进不定芽增殖,但继续添加则起抑制作用,并容易引起玻璃... 详细信息

以杉木成年优良无性系的无菌组培苗为外植体,研究激素、活性炭等对不定芽增殖的影响,在此基础上探讨接种方式对杉木增殖效率的影响。研究表明:6-BA浓度为1.5 mg·L-1时能有效促进不定芽增殖,但继续添加则起抑制作用,并容易引起玻璃化;去除顶端优势的接种方式能将不定芽的增殖效率提高一倍多;不同的基因型间平均不定芽数相差1;BA、KT、NAA的组合使用较单一激素使用有利于不定芽的伸长,适量的活性炭有利于杉木不定芽的伸长生长。

关键词：杉木接种方式器官发生不定芽

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柽柳不同遗传材料的扦插成活率及苗期生长变异

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林业科技开发 2013年第3期27卷 33-36页

作者：张如华白天道徐立安南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 山东省临沂大学生命科学学院

对来自4个种源共33个柽柳无性系的扦插试验及苗期生长变异研究表明:柽柳不同种源、不同无性系扦插苗在扦插成活率和生长性状上存在广泛变异,几个主要性状的差异达到显著或极显著水平,种源内无性系间差异大于种源间。3年生时,4个种源中... 详细信息

对来自4个种源共33个柽柳无性系的扦插试验及苗期生长变异研究表明:柽柳不同种源、不同无性系扦插苗在扦插成活率和生长性状上存在广泛变异,几个主要性状的差异达到显著或极显著水平,种源内无性系间差异大于种源间。3年生时,4个种源中以利津种源生长最差,其他3个种源在各性状上差异不大。盐城种源相对具有较多>1cm分枝。利用主成分分析对无性系进行评价,选出了生长相对稳定,生长和分枝数均较优的3个无性系YC-2、YC-1及KL-2。结合聚类分析,将3年生参试无性系分为4类,前3类无性系可根椐不同培育目标加以繁殖利用。

关键词：柽柳扦插种源无性系生长变异

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杉木成年优树组培生根研究

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南京林业大学学报(自然科学版) 2013年第6期37卷 169-172页

作者：周小红张元莉李美平赵芳芳陈金慧郑仁华肖晖黄金华张志才李勇郑雪燕施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室福建省林业科学研究院福建省洋口国有林场

以3个成年杉木优良无性系茎段为外植体,研究基因型、生长调节剂、活性炭、基本培养基对杉木生根效率的影响。结果表明:基因型和生长素NAA是影响杉木生根效率的主要因素。1#基因型的杉木生根能力强,在1/4 DCR培养基（添加IBA 1.0 mg/L或N... 详细信息

以3个成年杉木优良无性系茎段为外植体,研究基因型、生长调节剂、活性炭、基本培养基对杉木生根效率的影响。结果表明:基因型和生长素NAA是影响杉木生根效率的主要因素。1#基因型的杉木生根能力强,在1/4 DCR培养基（添加IBA 1.0 mg/L或NAA 0.5;.0 mg/L）上生根率可达90%以上;2#基因型的杉木生根能力较弱,添加1.5 mg/L IBA或1.0 mg/L NAA的1/2 DCR培养基更适合其生根;对于3#基因型的杉木,3/4 DCR培养基最适合其生根,添加IBA 1.5 mg/L或NAA1.0 mg/L时生根率最高。对3个基因型的生根试验研究表明,活性炭对杉木生根不能起到促进作用。

关键词：杉木器官发生生根基因型

来源：评论

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