检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2019年第6期17卷 1788-1795页

作者：王大玮沈兵琪周凡周军西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室昆明650224 西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650224 北方民族大学生物科学与工程学院银川750021

本研究以云南‘火把梨’转色前后的梨果皮为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq TM 2000/MiSeq)对两种梨材料全转录功能基因组测序后组装,再通过GO、Swiss-Prot两大数据库进行花青素相关差异表达基因筛选,以了解可能与花青素... 详细信息

本研究以云南‘火把梨’转色前后的梨果皮为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq TM 2000/MiSeq)对两种梨材料全转录功能基因组测序后组装,再通过GO、Swiss-Prot两大数据库进行花青素相关差异表达基因筛选,以了解可能与花青素合成相关的基因及其表达模式,同时将差异基因在NCBI数据库进行Blast序列比对,对其功能进行分析。最终共获得7.52 Gb数据,组装过滤后共获得75 227 538条Clean reads,3 920条差异表达基因,通过通路分析和Pathway功能注释,在花青素合成过程中的两条通路中共注释到30条与花青素合成相关的差异表达基因,初步对这些差异基因的功能进行鉴定和分析,对后期基因克隆及转基因等研究具有重要意义。

关键词：梨花青素转录组功能注释

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白桦BpMYB21基因的克隆及其表达模式分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2018年第4期42卷 119-126页

作者：孙璐杨杰王思瑶李欣李影徐志强詹亚光尹静东北林业大学生命科学学院东北林业大学林木遗传育种与生物技术国家重点实验室

【目的】研究了白桦（Betula platyphylla Suk.）MYB基因功能,分析其在茉莉酸（Me JA）和水杨酸（SA）诱导下的表达特性。【方法】以白桦为试材,通过RT-PCR等方法克隆得到1条白桦MYB转录因子家族基因序列,运用生物信息学方法,分析其蛋... 详细信息

【目的】研究了白桦（Betula platyphylla Suk.）MYB基因功能,分析其在茉莉酸（Me JA）和水杨酸（SA）诱导下的表达特性。【方法】以白桦为试材,通过RT-PCR等方法克隆得到1条白桦MYB转录因子家族基因序列,运用生物信息学方法,分析其蛋白质性质和亲缘关系,通过实时荧光定量PCR分析Me JA和SA诱导处理下该基因的表达特性及组织特异性。【结果】获得了1条新的白桦MYB转录因子家族基因,命名为BpMYB21,包含完整的开放阅读框,长度为1 014 bp,编码337个氨基酸。BpMYB 21蛋白与其他植物MYB氨基酸同源性为51%64%,其中与胡桃（Juglans regia）MYB30-Like的亲缘关系最近。BpMYB21在白桦根、茎、叶中均有表达,且在叶中的表达量高于茎和根,但差异不显著;与对照相比,100μmol/L Me JA和50 mg/L SA分别处理白桦苗6 h时,BpMYB21在茎和叶中的表达较高,处理12～48 h逐渐降低。【结论】BpMYB21为MYB转录因子家族新成员,与胡桃MYB基因亲缘关系较近。该基因响应激素诱导,推测其可能在白桦生长发育及在次生代谢过程发挥重要作用。

关键词：白桦 BpMYB21 基因克隆表达模式

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植物非生物胁迫中的bZIP转录因子

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分子植物育种 2020年第8期18卷 2534-2541页

作者：马璇胡小倩张颖翌闫海芳东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

bZIP转录因子广泛地存在于真核生物界中。大量研究表明,种类丰富的bZIP转录因子存在于所有植物的细胞核中并参与植物体内的各种生理反应。多种恶劣环境造成的非生物胁迫,是影响植物生长发育的重要因素,bZIP转录因子在植物对非生物胁迫... 详细信息

bZIP转录因子广泛地存在于真核生物界中。大量研究表明,种类丰富的bZIP转录因子存在于所有植物的细胞核中并参与植物体内的各种生理反应。多种恶劣环境造成的非生物胁迫,是影响植物生长发育的重要因素,bZIP转录因子在植物对非生物胁迫抵抗中起关键作用。本综述着重于植物bZIP转录因子参与非生物胁迫调控的研究进展,并对今后通过基因工程手段提高植物的抗逆性,培育多抗性植物新品种提供了理论支持。

关键词： bZIP 非生物胁迫盐胁迫低温胁迫干旱胁迫植物激素胁迫

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3个白桦细胞色素P450基因生物信息学及表达分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2018年第6期42卷 27-34页

作者：杨杰孙璐王思瑶李影翟睿林香雨詹亚光尹静东北林业大学生命科学学院林木遗传育种与生物技术国家重点实验室

【目的】研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式。【方法】筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpC... 详细信息

【目的】研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式。【方法】筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14,利用生物信息学分析BpCYP450蛋白的分子结构特征及其与其他物种CYP450蛋白的亲缘关系。采用QRT-PCR技术,对白桦BpCYP450组织特异性、激素信号及伤害诱导下的表达特征进行分析。【结果】生物信息学结果表明BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14 cDNA序列长度分别为1 569、1 584和1 530 bp,具有完整的开放阅读框(ORF),分别编码522、527和509个氨基酸,均为亲水性跨膜蛋白,主要定位于叶绿体。白桦BpCYP450与百脉根、扁豆及豌豆等豆科植物CYP450蛋白亲缘性较高。组织特异性分析结果显示,3个BpCYP450基因在叶和根中表达较高,茎中较低。激素信号及伤害诱导结果表明,3个BpCYP450基因不同程度地响应Me JA、SA、GA3、ABA、乙烯利激素信号及伤害诱导。【结论】3个BpCYP450基因均为CYP450基因家族的新成员,具有组织特异性及激素诱导表达特性,可能在白桦生长发育、抵御胁迫及代谢物合成中发挥重要作用。

关键词：白桦 BpCYP450 表达模式分析生物信息学分析

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梨DREB基因家族全基因组鉴定及分析

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基因组学与应用生物学 2018年第9期37卷 3889-3902页

作者：周凡李丹周军王大玮沈兵琪邓浪纪晴高晓宇西南林业大学云南省高校林木遗传育种改良与繁育重点实验室昆明650244 西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点重点实验室昆明650244 北方民族大学生物科学与工程学院银川750021

本研究为鉴定梨DREB基因,分析其生理特性和结构,并研究DREB蛋白的相互作用以及在不同逆境中的表达差异,通过生物信息学方法,对梨DREB转录因子进行了鉴定与分析。如利用本地BLAST、Pfam等搜索、鉴定DREB蛋白;采用Protparam、Signal P、SP... 详细信息

本研究为鉴定梨DREB基因,分析其生理特性和结构,并研究DREB蛋白的相互作用以及在不同逆境中的表达差异,通过生物信息学方法,对梨DREB转录因子进行了鉴定与分析。如利用本地BLAST、Pfam等搜索、鉴定DREB蛋白;采用Protparam、Signal P、SPOMA、MEME数据库、DNAMAN、MEGA6.0等对蛋白进行结构特性和进化关系分析;基于String数据库对DREB蛋白进行功能互作分析;并运用拟南芥Illumia RNA-Seq数据进行同源表达分析。从梨全基因组中鉴定了60个DREB基因,通过与拟南芥DREB基因聚类分析,共分为6个亚组（A1-A6）。编码的氨基酸残基数在99-496个之间,平均含有250个氨基酸残基,整体呈弱酸性。系统分析了Pbr DREBs蛋白的保守基序和基因结构,发现这些Pbr DREBs蛋白都含有一个典型的AP2/ERF结构域,这个结构域含有55个左右的氨基酸残基,大部分以YRG保守元件开始,到RAYD保守元件终止。对Pbr DREBs蛋白之间的功能联系网络进行了系统的研究,发现DREB转录因子在梨的生长发育过程及其多种逆境反应的信号转导中发挥着重要作用,且在逆境调控中各亚组成员之间也可能存在交叉作用,其中,A1亚组即CBF转录因子在蛋白质相互调控中起重要作用。并利用同源拟南芥RNASeq数据对Pbr DREBs蛋白进行了低温、干旱等非生物胁迫下的同源分析,表明DREB蛋白在多种胁迫中都起到了重要作用。初步鉴定出的梨60个DREB基因在功能、结构、特性等方面与拟南芥及其它已报道的物种DREB基因相似,并在低温、干旱等逆境中起到重要作用。

关键词：梨 DREB基因全基因组鉴定生物信息学分析蛋白质互作

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3个梅花R2R3-MYB类转录因子PmPAP基因的克隆与表达分析

3个梅花R2R3-MYB类转录因子PmPAP基因的克隆与表达分析

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2019年中国观赏园艺学术研讨会

作者：邱丽珂郑唐春何金儒王佳程堂仁张启翔花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室园林环境教育部工程研究中心林木花卉遗传育种教育部重点实验室园林学院北京林业大学北京100083

为了探究梅花花色调控的分子机理,根据全基因组信息,以'三轮玉碟'梅花为试验材料,克隆出3个PAP同源基因PmPAPs,并结合转录组及定量PCR对PmPAPs转录水平进行分析.序列分析结果表明3个PmPAPs基因在核苷酸与氨基酸水平上存在一定差... 详细信息

为了探究梅花花色调控的分子机理,根据全基因组信息,以'三轮玉碟'梅花为试验材料,克隆出3个PAP同源基因PmPAPs,并结合转录组及定量PCR对PmPAPs转录水平进行分析.序列分析结果表明3个PmPAPs基因在核苷酸与氨基酸水平上存在一定差异.开放读码框长度分别为729bp(PmPAPI)、732bp(PmPAP2)和726bp(PmPAP3);分别编码242、243和241个氨基酸;均含有2个保守的R结构域,属于R2R3-MYB转录因子家族.同源性比对和系统进化结果显示,3个基因彼此相似度最高达94％,PmPAP1与欧洲李和碧桃基因相似性最高,为95％,在进化树中PmPAPs被细分至李属小分支中,与欧洲李、碧桃、樱桃李及甜樱桃聚到一起.qRT-PCR结果显示,3个PmPAPs基因营养器官、果实和四轮花器官中均有表达,尤其在紫红色萼片和粉红色花瓣中具有较高表达,推测PmPAPs基因在调控梅花花色苷合成途径中起重要作用.

关键词：梅花 R2R3-MYB PAP基因花色苷基因克隆表达分析

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油松胚性愈伤组织培养中褐化因素研究及增殖培养基的优化

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华南农业大学学报 2017年第5期38卷 91-96页

作者：付双彬李慧赵健符学军朱松林张金凤林木育种国家工程实验室/林木花卉遗传育种教育部重点实验室/国家林业局树木花卉育种生物工程重点开放实验室/北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 山西吕梁山国有林管理局国家油松良种基地山西临汾041300

【目的】调查油松Pinus tabulaeformis胚性愈伤组织增殖培养阶段不同因素对于褐化产生的影响,并结合增殖率对培养基进行调整优化以降低褐化率,提高利用率。【方法】以3个年份的9个细胞系的油松胚性愈伤组织为材料,利用单因素试验设计对... 详细信息

【目的】调查油松Pinus tabulaeformis胚性愈伤组织增殖培养阶段不同因素对于褐化产生的影响,并结合增殖率对培养基进行调整优化以降低褐化率,提高利用率。【方法】以3个年份的9个细胞系的油松胚性愈伤组织为材料,利用单因素试验设计对放置不同数量愈伤块、pH、植物凝胶含量、糖种类和含量以及培养时间的褐化率和增殖率进行测定计算。采用正交试验选出最佳培养条件。【结果】单因素试验结果表明,褐化率在不同基因型间差异显著,且与增殖继代年龄显著正相关;在培养皿中放置6~7块愈伤组织、pH 5.8~6.0、培养基中添加2.0~3.0 g·L^(-1)植物凝胶、添加10 g·L^(-1)蔗糖能保证较低的褐化率和较高的增殖率,且蔗糖优于葡萄糖和麦芽糖。【结论】结合正交设计,90 mm培养皿中放置7块愈伤组织,培养基中添加2.5 g·L^(-1)植物凝胶、10 g·L^(-1)蔗糖,调节pH为5.9时,褐化率、增殖率和利用率最理想。

关键词：油松胚性愈伤褐化增殖正交设计

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基于微卫星分子标记的云南松及其近缘种遗传关系分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2017年第1期37卷 1-9页

作者：许玉兰蔡年辉白青松何承忠王大玮段安安康向阳西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室云南昆明650224 北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083

采用SSR分子标记技术,对云南松分布区内或相邻地区的松属双维管束亚属3种、3变种及扭曲的云南松共7个种或变种(变型)进行遗传分析。利用9对SSR引物,从7个种或变种(变型)100份材料中检测出31个等位基因,单个位点的等位基因数为2~6个,平均... 详细信息

采用SSR分子标记技术,对云南松分布区内或相邻地区的松属双维管束亚属3种、3变种及扭曲的云南松共7个种或变种(变型)进行遗传分析。利用9对SSR引物,从7个种或变种(变型)100份材料中检测出31个等位基因,单个位点的等位基因数为2~6个,平均3.4个;思茅松群体遗传多样性较高,而细叶云南松较低。基于Nei's遗传距离利用非加权配对算术平均数法(UPGMA)聚类,云南松等7个种、变种(变型)可以分成3大类,其中马尾松和思茅松各自独立成为一类,其余5个种、变种(变型)聚为一类,以云南松与扭松的遗传关系最近,无明显的遗传分化,它们的表型变异可能由人为生产活动的负向选择或环境恶化引起。

关键词：云南松 SSR 遗传多样性遗传关系

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植物miRNA启动子研究进展

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中国生物工程杂志 2016年第5期36卷 125-131页

作者：陈敏陈慧包海黄鹏王延伟北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083

MicroRNA（miRNA）是广泛存在于植物基因组中的一类非编码小分子RNA,长度为20-24个核苷酸（nucleotides,nt）,作为一类重要的负调控因子,广泛参与植物的生长发育和逆境胁迫响应的调控。真核生物启动子是基因表达不可缺少的重要调控元件... 详细信息

MicroRNA（miRNA）是广泛存在于植物基因组中的一类非编码小分子RNA,长度为20-24个核苷酸（nucleotides,nt）,作为一类重要的负调控因子,广泛参与植物的生长发育和逆境胁迫响应的调控。真核生物启动子是基因表达不可缺少的重要调控元件,包含转录起始位点（transcription start sites,TSS）、TATA框（TATA box）和上游的顺式作用元件。miRNA基因上游启动子与植物miRNA的组织、发育时期和胁迫诱导的表达特异性密切相关,而研究植物miRNA基因的启动子是揭示miRNA特异性表达的分子基础。因此,有必要系统阐述miRNA启动子的特点、核心元件和顺式作用元件的鉴定方法及植物中miRNA启动子研究的最新进展,进而分析植物miRNA启动子研究中存在的问题,为探讨miRNA介导的植物基因表达调控分子机制提供参考。

关键词：启动子 miRNA 顺式作用元件植物

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北美枫香雄花和花序轴诱导体细胞胚胎发生

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北京林业大学学报 2016年第3期38卷 32-37页

作者：王晓琪胥明赵健张炎周晨刘学增郭会芳张金凤北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局树木花卉育种生物工程重点开放实验室100083 上海辰山植物园园艺部河南鄢陵龙源花木公司

北美枫香是适应性强、生长速度快、秋叶红艳美丽的园林绿化树种。为了提高其繁殖效率,以北美枫香雄花和花序轴为外植体,采用完全随机区组设计,研究外植体类型,基因型,TDZ浓度对北美枫香愈伤组织的诱导、体胚分化和萌发的影响。结果表明... 详细信息

北美枫香是适应性强、生长速度快、秋叶红艳美丽的园林绿化树种。为了提高其繁殖效率,以北美枫香雄花和花序轴为外植体,采用完全随机区组设计,研究外植体类型,基因型,TDZ浓度对北美枫香愈伤组织的诱导、体胚分化和萌发的影响。结果表明:雄花作为外植体,合适的诱导培养基为改良Blaydes培养基+TDZ 0.15 mg/L+水解酪蛋白1 g/L+蔗糖40 g/L+3%植物凝胶;花序轴作为外植体,合适的诱导培养基为改良Blaydes培养基+TDZ0.01 mg/L+水解酪蛋白1 g/L+蔗糖40 g/L+3%植物凝胶。合适的萌发培养基为不含水解酪蛋白的基本培养基。如果出现球形胚,将培养物转接到不含任何生长调节剂的改良Blaydes培养基上,体胚经成熟可进一步形成完整小植株。该体胚体系的建成将显著提高北美枫香的繁殖效率。

关键词：北美枫香体细胞胚胎发生体细胞胚

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