检索结果-内蒙古大学图书馆

世界林业研究 2014年第5期27卷 11-17页

作者：倪建伟杨秀艳张华新倪元颖武海雯魏琦林木遗传育种国家重点实验室北京100091 国家林业局盐碱地研究中心北京100091 中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083

代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学之后新兴的一门交叉学科,是系统生物学的一个重要分支,近年来在研究植物逆境胁迫方面得到了广泛的应用。文中介绍了代谢组学的检测技术、数据处理及分析方法,概述了其在植物逆境胁迫下的研... 详细信息

代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学之后新兴的一门交叉学科,是系统生物学的一个重要分支,近年来在研究植物逆境胁迫方面得到了广泛的应用。文中介绍了代谢组学的检测技术、数据处理及分析方法,概述了其在植物逆境胁迫下的研究概况,包括温度、盐分、干旱、病原菌和其他逆境,以及多种逆境综合胁迫等,展望了代谢组学的发展前景;利用代谢组学分析植物在逆境条件下代谢物的变化,推测应答胁迫植物对代谢途径的调整,可为研究植物耐受性和适应逆境机理提供分析方法。

关键词：代谢组学逆境胁迫植物代谢代谢产物

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耐盐绒毛白蜡特异性SCAR分子标记的鉴定

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西北植物学报 2014年第4期34卷 671-675页

作者：燕丽萍刘翠兰李丽孙超毛秀红李双云赵梁军夏阳山东省林业科学研究院济南250014 山东省林木遗传改良重点实验室济南250014 中国农业大学观赏园艺与园林系北京100193

该研究以耐盐型和盐敏感型绒毛白蜡及其F1代为材料,采用混合品系分析法进行RAPD分析。结果显示:在随机选取的150个10碱基随机引物中,仅有引物S20在耐盐基因池和盐敏感基因池间扩增出特异而可重复的592bp的多态性片段,命名为S20-592。获... 详细信息

该研究以耐盐型和盐敏感型绒毛白蜡及其F1代为材料,采用混合品系分析法进行RAPD分析。结果显示:在随机选取的150个10碱基随机引物中,仅有引物S20在耐盐基因池和盐敏感基因池间扩增出特异而可重复的592bp的多态性片段,命名为S20-592。获得的RAPD标记S20-592经克隆、测序、重新设计一对特异性引物转化成更稳定的SCAR标记。通过F1代个体验证,耐盐型个体均能扩增出此差异条带而盐敏感型个体中不能扩增出此差异条带,证明该SCAR标记的特异引物可用于耐盐绒毛白蜡物种的快速分子鉴定。

关键词：绒毛白蜡耐盐 RAPD标记 SCAR标记

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毛白杨S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的克隆、表达及SNP关联分析

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林业科学 2013年第11期49卷 67-76页

作者：巩琛锐王璐杜庆章张德强北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室林木育种国家工程实验室北京100083

组合运用分子生物学及生物信息学方法,首次从毛白杨成熟木质部中分离出编码S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的cDNA克隆。序列分析表明,毛白杨PtSAHHA cDNA片段全长为1 935 bp,其内部含有大小为1 458 bp的完整开放阅读框架,可编码含有... 详细信息

组合运用分子生物学及生物信息学方法,首次从毛白杨成熟木质部中分离出编码S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因PtSAHHA的cDNA克隆。序列分析表明,毛白杨PtSAHHA cDNA片段全长为1 935 bp,其内部含有大小为1 458 bp的完整开放阅读框架,可编码含有485个氨基酸残基的蛋白质。组织特异性Realtime-PCR结果显示,PtSAHHA在木质部中表达丰度最高,在形成层和老叶中表达丰度中等,在嫩叶中表达丰度最低。在此基础上,组合利用MAGE5.0和DnaSP5软件对毛白杨自然群体中45株基因型个体的PtSAHHA序列进行对比和分析,共检测到166个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/15 bp,多样性指数πT为0.010 58。在外显子区域共检测到88个SNP位点,其中同义突变位点34个,错义突变位点53个及1个无义突变位点;同义突变的核苷酸多样性πSynonymous=0.024 91,是非同义突变核苷酸多样性πNonsynonymous=0.002 33的10倍,推测毛白杨PtSAHHA基因编码区在毛白杨物种演化过程中受到较强的纯化选择压力。对PtSAHHA基因内的SNPs连锁不平衡分析结果表明,随着核苷酸序列长度增加至800 bp,即r2<0.1,SNPs的连锁不平衡水平已衰退至不明显。在此基础上,在由426株毛白杨基因型个体组成的关联作图群体内,对频率大于10%的42个常见SNP标记位点与6个木材品质性状进行关联分析,检测到3个SNP标记与3个表型性状显著关联。研究结果为基于分子标记的毛白杨优良木材品质性状定向辅助育种提供理论依据。

关键词：毛白杨 S-腺苷高半胱氨酸水解酶单核苷酸多态性连锁不平衡木材品质性状

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小黑杨PnsGA20ox1基因的克隆及功能分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2013年第6期37卷 11-16页

作者：张力杰张凯旋魏志刚东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室

根据与小黑杨(Populus simonii×***)亲缘关系较近的几个物种的赤霉素氧化酶基因(GA20ox)保守区设计兼并引物,克隆出小黑杨GA20ox基因片段;利用RACE技术得到其全长为1 678 bp的cDNA序列,进行蛋白质预测,发现其编码385个氨基酸,分子... 详细信息

根据与小黑杨(Populus simonii×***)亲缘关系较近的几个物种的赤霉素氧化酶基因(GA20ox)保守区设计兼并引物,克隆出小黑杨GA20ox基因片段;利用RACE技术得到其全长为1 678 bp的cDNA序列,进行蛋白质预测,发现其编码385个氨基酸,分子质量为44.04 ku,理论等电点为5.97,核酸序列与毛果杨GA20ox1同源性高达99%,将其命名为PnsGA20ox1。荧光定量PCR分析发现,GA20ox1基因在小黑杨各个组织中均表达,其中在成熟木质部中表达量最高,在节间组织中表达量最低。转PnsGA20ox1基因烟草分析表明,过表达PnsGA20ox1基因的烟草综纤维素含量和纤维长度比对照组均有不同程度的提高,而木质素含量与对照无明显差异。

关键词：小黑杨 PnsGA20ox1 实时荧光定量PCR 纤维素木质素

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转TabZIP基因白桦的获得及耐盐性分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2013年第5期37卷 6-12页

作者：李园园杨光韦睿孙延爽郭玉华张瑞萍刘桂丰东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江省教育学院

植物碱性亮氨酸拉链(bZIP)蛋白是一类重要的植物转录因子,该蛋白可与顺式作用元件ABRE等相互作用,使下游许多抗旱、耐盐等抗性相关基因得以表达,从而提高植物的抗逆性。为了获得耐盐白桦转基因新品系,采用农杆菌介导法,将来自于柽柳的... 详细信息

植物碱性亮氨酸拉链(bZIP)蛋白是一类重要的植物转录因子,该蛋白可与顺式作用元件ABRE等相互作用,使下游许多抗旱、耐盐等抗性相关基因得以表达,从而提高植物的抗逆性。为了获得耐盐白桦转基因新品系,采用农杆菌介导法,将来自于柽柳的转录因子TabZIP基因导入白桦基因组,经qRT-PCR及Western blot检测证明获得了6个转基因株系。在质量分数为0.4%的NaCl胁迫条件下,比较了转基因株系的相对高生长、盐害指数及叶绿素荧光参数等指标。结果显示:盐胁迫后TB4株系的相对高生长量最大,达到52.4%,较对照(CK)提高了73.5%;且它的盐害指数仅为0.05,盐伤害最轻,而非转基因对照株系为0.19;NaCl胁迫后,转基因株系TB4的叶绿素荧光参数不同于其他株系,它的非光化学淬灭参数(q NP)最大,实际光化学效率(ΦPSⅡ)及光化学淬灭系数(q P)的降幅最小,而最大光量子效率参数(F v/F m)略高于胁迫前。这些指标的变化均证实外源TabZIP的表达能够提高TB4转基因株系的耐盐能力。

关键词：白桦 TabZIP基因生理指标耐盐性

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甘蓝型油菜热激转录因子的克隆及表达分析

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西北植物学报 2013年第4期33卷 649-655页

作者：沈久源李煦汪晓峰北京林业大学生物学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083

以甘蓝型纯系油菜为试材,用RT-PCR和RACE方法首次从油菜种子中获得油菜热激转录因子的cDNA全长序列,命名为BnHSFA4a,GenBank登录号为HQ435241。结果表明:该cDNA长1 667bp,编码1个具有389aa的蛋白质,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥热激... 详细信息

以甘蓝型纯系油菜为试材,用RT-PCR和RACE方法首次从油菜种子中获得油菜热激转录因子的cDNA全长序列,命名为BnHSFA4a,GenBank登录号为HQ435241。结果表明:该cDNA长1 667bp,编码1个具有389aa的蛋白质,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥热激转录因子AtHSFA4a编码的氨基酸序列间相似度为82%。对34条编码不同热激转录因子的氨基酸序列进行多重比对,结果在100～190aa处序列间氨基酸总相似性超过60%,显示出较高的保守性。构建原核表达载体并成功表达出预期蛋白。半定量RT-PCR结果显示,该基因的表达先于油菜肌醇半乳糖苷合成酶(BnGOLS1)基因,符合该基因调控BnGOLS1的假设。推测AtHSFA4a基因可能通过调控BnGOLS1的表达量进而在油菜种子脱水耐性获得过程中发挥一定的作用。

关键词：甘蓝型油菜 BnHSFA4a 基因克隆基因表达分析

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枣和酸枣基因组大小测定

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北京林业大学学报 2013年第3期35卷 77-83页

作者：吴丽萍唐岩李颖岳尹丹妮庞晓明北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室计算生物学中心

本研究旨在找出最适合枣和酸枣的流式细胞术流程,进而测定它们的基因组大小。结果显示,在所对比的5种裂解液中,WPB最适合枣属植物细胞裂解。以毛果杨为内标,通过比较待测样品和内参G0/G1期峰,计算得出6种枣属植物基因组大小。各枣品种... 详细信息

本研究旨在找出最适合枣和酸枣的流式细胞术流程,进而测定它们的基因组大小。结果显示,在所对比的5种裂解液中,WPB最适合枣属植物细胞裂解。以毛果杨为内标,通过比较待测样品和内参G0/G1期峰,计算得出6种枣属植物基因组大小。各枣品种的基因组大小有一定差异,平均基因组大小约为418.56Mb,其中:‘冬枣’的基因组大小为(393.60±4.72)Mb,即C-值为(0.40±0.01)pg;‘鲁枣2号’的基因组大小为(428.00±3.61)Mb,即C-值为(0.44±0.00)pg;‘金丝小枣’的基因组大小为(424.00±5.81)Mb,即C-值为(0.44±0.01)pg;‘孔府酥脆枣’的基因组大小为(429.60±5.03)Mb,即C-值为(0.44±0.01)pg;‘无核小枣’的基因组大小为(413.60±7.07)Mb,即C-值为(0.42±0.01)pg;酸枣的基因组大小为(441.60±4.29)Mb,即C-值为(0.45±0.01)pg。优化的枣属植物流式细胞术流程,为枣属植物的倍性鉴定奠定了基础。

关键词：流式细胞术基因组大小细胞裂解液毛果杨枣

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油菜种子发育和萌发过程中脱水耐性相关基因的cDNA-AFLP分析

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西北植物学报 2013年第4期33卷 656-663页

作者：马刚汪晓峰北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083

选取甘蓝型油菜种子发育和萌发过程中与脱水耐性相关的不同时间点,采用cDNA-AFLP技术通过128对引物组合分析,共获得394条特异转录衍生片段(TDFs)。经BLAST序列比对,发现其中189条与GenBank数据库中已知功能基因同源,按其功能可分为转录... 详细信息

选取甘蓝型油菜种子发育和萌发过程中与脱水耐性相关的不同时间点,采用cDNA-AFLP技术通过128对引物组合分析,共获得394条特异转录衍生片段(TDFs)。经BLAST序列比对,发现其中189条与GenBank数据库中已知功能基因同源,按其功能可分为转录因子、基础代谢、抗逆胁迫、信号转导等相关蛋白。RT-PCR技术对差异显著性片段验证结果显示,泛素蛋白、油体蛋白、热激蛋白和一些转录因子片段均受到种子脱水诱导表达。研究结果表明,发生在种子发育和萌发过程中的脱水耐性反应非常复杂,涉及植物生命活动的诸多领域。

关键词： cDNA-AFLP 油菜种子脱水耐性 RT-PCR

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转沙冬青锌指蛋白基因AmZFPG烟草非生物胁迫抗性分析

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园艺学报 2013年第4期40卷 713-723页

作者：智冠华史军娜赵晓鑫刘胜利陈玉珍卢存福北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室教育部林木花卉遗传育种重点实验室北京100083

分析了沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)锌指蛋白基因AmZFPG在非生物胁迫下的表达特性,结果显示AmZFPG受低温、干旱、高盐胁迫诱导表达,表明该蛋白参与多种胁迫相关的信号转导和应答反应。为进一步探索AmZFPG的功能,构建了真核表达载... 详细信息

分析了沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)锌指蛋白基因AmZFPG在非生物胁迫下的表达特性,结果显示AmZFPG受低温、干旱、高盐胁迫诱导表达,表明该蛋白参与多种胁迫相关的信号转导和应答反应。为进一步探索AmZFPG的功能,构建了真核表达载体AmZFPG-pCAMBIA2300,将该基因转入烟草(Nicotiana tabacum L.),对转基因烟草T1代进行非生物胁迫分析,结果显示,转基因烟草的耐寒性、耐旱性、耐盐性均获得了提高。

关键词：沙冬青 AmZFPG基因转基因烟草非生物胁迫

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沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式

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植物遗传资源学报 2013年第3期14卷 492-500页

作者：赵晓鑫刘美芹师静智冠华刘胜利张俊琦陈玉珍卢存福北京林业大学生物科学与技术学院/林木育种国家工程实验室/教育部林木花卉遗传育种重点实验室北京100083

对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 k... 详细信息

对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。

关键词：沙冬青 AmLEA5 生物信息学分析表达模式亚细胞定位

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