检索结果-内蒙古大学图书馆

中南林业科技大学学报 2023年第6期43卷 69-78页

作者：高铖铖燕丽萍吴德军王因花山东省林业科学研究院山东省林木遗传改良重点实验室山东济南250014

【目的】白蜡是北方重要的盐碱地造林树种,了解白蜡居群的遗传多样性和群体结构对于白蜡种质资源的有效保护和开发利用至关重要。【方法】利用筛选的SSR标记,对来自9个不同地理区域的共380份白蜡种质资源进行遗传分化分析、分子变异分析... 详细信息

【目的】白蜡是北方重要的盐碱地造林树种,了解白蜡居群的遗传多样性和群体结构对于白蜡种质资源的有效保护和开发利用至关重要。【方法】利用筛选的SSR标记,对来自9个不同地理区域的共380份白蜡种质资源进行遗传分化分析、分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析。【结果】12对SSR引物在所有白蜡中都能进行扩增,等位基因(Na)共51个,平均每对引物观察到4.287个等位基因,PIC为0.1197~0.7509,平均为0.5329,高于0.5;白蜡居群的群体内近交系数(Fis)平均为0.016,群体近交系数(Fit)平均为0.091,显示杂合频率高,居群近交较多,群体分化率(Fst)平均为0.095,存在中度程度的遗传分化,基因流(Nm)平均为4.199,居群间基因交流非常丰富;AMOVA分析结果表明9个白蜡居群的遗传差异主要来源于个体间(91%);群体结构分析结果显示,9个来自不同地理区域的白蜡居群中存在3个不同的基因库,居群间在进化上相对独立,存在一定程度的遗传混合,遗传组分相对单一,与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。【结论】12个SSR标记多态性较好、稳定性较高,能有效鉴别来自9个不同地理区域白蜡居群的380份种质资源,并揭示种质的遗传多样性和群体遗传结构,可为白蜡的种质保存和育种提供有价值的科学依据。

关键词： SSR标记白蜡遗传多样性群体结构

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实验田4年生转基因毛白杨嫁接苗和自根苗安全性研究

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林业科学研究 2022年第2期35卷 56-66页

作者：侯荣轩赵烨田彦挺佀化玙张华新李娟纪清巨杨庆山孙宇涵李云北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 中国林业科学研究院北京100091 盐山县自然资源和规划局河北沧州061300 沧州市自然资源和规划局种苗站河北沧州061001 山东省林业科学研究院山东济南250014

[目的]对种植于天津滨海的自根苗转AhDREB1基因毛白杨((Populus tomentosa×***)×***)以及种植于沧州盐山的嫁接苗转基因株系进行安全性研究,评估转基因毛白杨对环境可能造成的影响。[方法]利用PCR扩增以及电泳技术,对种植在... 详细信息

[目的]对种植于天津滨海的自根苗转AhDREB1基因毛白杨((Populus tomentosa×***)×***)以及种植于沧州盐山的嫁接苗转基因株系进行安全性研究,评估转基因毛白杨对环境可能造成的影响。[方法]利用PCR扩增以及电泳技术,对种植在天津滨海和沧州盐山实验田的4年生转基因毛白杨基因组DNA、土壤DNA、沧州嫁接苗砧木DNA以及抗性微生物基因组DNA进行PCR特异性检测。对天津实验田土壤中根际微生物数量进行连续动态监测(3月、4月、5月)。分别在天津滨海和沧州盐山实验田模拟自然条件下转基因毛白杨植株枯落物掉落,检测不同生长阶段的不同器官(新生嫩芽、多年生枝条、新生根尖、多年生侧根、新生嫩叶、当年生老叶)的降解时间。通过化感实验,检测天津滨海和沧州盐山实验田转基因毛白杨植株叶片对白菜(Brassica pekinensis)种子的生长是否造成影响。[结果]电泳结果显示:外源基因稳定存在于转基因毛白杨基因组中,实验田土壤DNA、抗性微生物DNA样品以及沧州嫁接苗砧木DNA中均未出现目的基因片段;天津非转基因植株和转基因植株的根际土壤中可培养微生物数量没有显著差异;转基因毛白杨的枯落物,无论是飘落在杂草表面、土壤表面还是埋入土壤,2个月后外源基因均被降解。化感实验结果显示:非转基因植株以及转基因植株对白菜种子的胚轴和胚根生长的影响没有显著差异。[结论]未发现实验田种植4 a的转基因毛白杨对周围的环境造成影响。

关键词：转基因毛白杨嫁接苗与自根苗转基因安全性评价基因水平转移土壤微生物数量

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基于RAD-seq技术的金银花SSR标记开发及鉴定

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北京林业大学学报 2021年第6期43卷 108-117页

作者：李慧刘东超徐瑞瑞侯立娜王天琪刘忠华付晓李圣波北京林业大学林木遗传育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 平邑县金银花果茶发展促进中心山东平邑273300 山东亚特生态技术有限公司山东莒南266071

【目的】通过开发特异性高的多态性分子标记位点,以弥补金银花在简单重复序列(SSR)标记方面的匮乏,推动金银花在遗传资源管理及良种鉴定等方向的研究,为后续全基因组测序及组装策略奠定基础。【方法】运用RAD-seq技术对2份金银花样品进... 详细信息

【目的】通过开发特异性高的多态性分子标记位点,以弥补金银花在简单重复序列(SSR)标记方面的匮乏,推动金银花在遗传资源管理及良种鉴定等方向的研究,为后续全基因组测序及组装策略奠定基础。【方法】运用RAD-seq技术对2份金银花样品进行简化基因组测序,利用MISA软件识别contig上的SSR序列并对各类型序列特征进行归纳分析,进而设计引物并利用生物信息学的方法进行引物筛选和有效性检测。【结果】对‘九丰一号’和‘亚特’金银花进行简化基因组测序,分别获得27.805 Mbp和42.560 Mbp干净读长。在组装的45850个基因序列中共检测到46999个SSR位点,其中单核苷酸重复单元比例最高(49.15%),六核苷酸重复单元最少(0.20%)。SSR位点的重复基序以(A/T)n为主,具有偏向性。除单碱基和二碱基重复类型外,SSR位点基序的重复次数集中在5~6次,且随重复次数增加,SSR位点重复类型出现的频率呈下降趋势。金银花基因组SSR序列长度介于10~310 bp之间,随重复次数增加,各SSR序列出现的频率逐渐下降。利用Primer3.0成功设计出38507对SSR引物,设计成功率为81.93%。对挑选的35对SSR引物进行多态性分析,等位基因数、观测杂合度和多态性信息含量(PIC)的平均值分别为5.057、0.363和0.568,其中高多态信息位点26个,中度多态信息位点9个,均未偏离哈迪–温伯格平衡。【结论】利用RAD-seq技术可实现SSR标记的大量开发和多态性SSR引物的筛选,并为金银花在遗传多样性分析和种质鉴定等相关方面的研究提供数据支持。

关键词：金银花简单重复序列(SSR) RAD-seq 多态性

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蒙古莸全基因组Survey分析

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分子植物育种 2023年

作者：纪若璇于笑杨溢文夏新莉尹伟伦刘超北京林业大学生物科学与技术学院林木育种与生态修复国家工程研究中心林木遗传育种全国重点实验室内蒙古自治区林业科学研究院

蒙古莸(Caryopteris mongholica)是中国干旱与半干旱地区重要的防风固沙灌木，具有较高的生态价值和经济意义。为了深入研究其广泛适应性，确定适合该物种的全基因组的测序研究策略，本研究以蒙古莸为试验对象，基于高通量测序对其基因... 详细信息

蒙古莸(Caryopteris mongholica)是中国干旱与半干旱地区重要的防风固沙灌木，具有较高的生态价值和经济意义。为了深入研究其广泛适应性，确定适合该物种的全基因组的测序研究策略，本研究以蒙古莸为试验对象，基于高通量测序对其基因组进行Survey分析，利用测序数据及生物信息学方法，估计蒙古莸的基因组大小、杂合率及GC含量等与基因组相关的信息。结果表明：蒙古莸基因组的大小约为375 Mb，本次测序深度77×；从K-mer分布曲线发现蒙古莸基因组有明显的杂合峰，杂合率达0.86%，重复序列比例为52.04%。本研究结果对蒙古莸全基因组测序及相关研究提供了基础，为进一步绘制蒙古莸全基因组图谱提供科学依据。

关键词：蒙古莸(Caryopteris mongholica) 基因组 Survey分析

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基于荧光SSR标记的接骨木种质资源遗传多样性分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年第2期49卷 75-82页

作者：姚俊修任飞王因花李庆华燕丽萍郑岩吴德军山东省林业科学研究院山东省生态林草遗传育种重点实验室山东高速鸿林工程技术有限公司

【目的】以收集的245份接骨木属（Sambucus）种质资源和60份接骨木杂交种质为材料，基于SSR分子标记对不同种源接骨木的遗传多样性及亲缘关系进行分析，为接骨木种质资源的合理保护、评价与利用提供科学依据。【方法】以11个种源的305... 详细信息

【目的】以收集的245份接骨木属（Sambucus）种质资源和60份接骨木杂交种质为材料，基于SSR分子标记对不同种源接骨木的遗传多样性及亲缘关系进行分析，为接骨木种质资源的合理保护、评价与利用提供科学依据。【方法】以11个种源的305个体为研究对象，根据转录组测序结果，开发100对SSR引物，对8个不同种接骨木个体进行扩增筛选，获得13对多态性较好的SSR引物，使用Popgene、Genemarker、GeneALeX和NTSYSpc等软件，对接骨木种质资源及杂交子代的遗传多样性、遗传距离、不同种源主坐标、UPGMA关系及进化树等进行分析。【结果】利用13对荧光引物对305个体进行扩增，检测到等位基因总数为162,不同位点等位基因变异幅度为4～34个，平均为12.5个；有效等位基因总数（Ne）为50.408个，变异幅度为1.066 1～11.070 2个，平均为3.878;平均观察杂合度（H_o）为0.331 5,平均期望杂合度（He）为0.521 5,平均Nei's遗传距离为0.520 4,平均多态性信息含量为0.496 4,表明遗传多样性较高；42号位点H_o/He大于1,表明该位点杂合度高，种群内遗传变异程度较大。不同种源参试样本中H_o为0.208（杂交组合1）～0.486（长白县）,平均H_o为0.372。He为0.242（杂交组合1）～0.552（大庆）,平均He为0.434,其中，长白县、朝鲜种源及杂交组合2的H_o/He均大于1,表明这3个种源/杂交组合内群体杂合度较高，种群内遗传变异程度也较大。主坐标分析表明：遗传变异主要存在于个体间，占80%,而种源间遗传变异仅占20%,可能由于不同地区的栽培种源来源于相同省域，造成不同种源间变异较小；Nei's遗传距离和聚类结果表明，种源/杂交组合间的遗传距离变化范围为0.023～0.637,山东青州仰天山天然群体和吉林长白县的遗传分化差异最大；内蒙赤峰和新疆阿勒泰的遗传分化差异最小；聚类可分为3大类群，同一种源个体并未完全聚到相同分支，可能原因是遗传变异或相互引种造成的。【结论】接骨木种质资源具有较高的遗传多样性，在进行接骨木遗传改良时，应首先进行种源内选择育种及单株改良的育种方法，其次可考虑种源间研究。研究结论为接骨木种质资源精准鉴定、核心种质构建及新品种创制等奠定基础。

关键词：荧光SSR标记接骨木种质资源遗传多样性

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基于两种倍性南川百合差异性状的转录组分析

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中国农业科技导报(中英文) 2025年

作者：吕博妍汪莲娟符柳梅高雪贾桂霞北京林业大学园林学院花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室宁波城市职业技术学院景观生态学院湖南借母溪国家自然保护区

为探究南川百合（Lilium rosthornii）四倍体与二倍体性状差异的原因，对2种倍性南川百合叶片的淀粉和可溶性糖含量进行测定，并进一步对其进行转录组测序分析。结果发现，南川百合同源四倍体叶片的可溶性糖及淀粉含量均显著高于二倍体... 详细信息

为探究南川百合（Lilium rosthornii）四倍体与二倍体性状差异的原因，对2种倍性南川百合叶片的淀粉和可溶性糖含量进行测定，并进一步对其进行转录组测序分析。结果发现，南川百合同源四倍体叶片的可溶性糖及淀粉含量均显著高于二倍体，且随生长发育进程差异显著。与二倍体相比，四倍体转录组测序共发现20 441个差异表达基因，其中有5 006个差异表达基因被注释到GO(gene ontology)条目，主要富集在植物生长、信号转导调控等功能中；KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析发现，差异表达基因在外来物质的代谢、玉米素合成、氨基酰基tRNA合成等途径差异显著。此外，筛选出7个与糖代谢相关的差异表达基因，富集在UDP葡萄糖基转移酶活性、O-糖基化合物水解酶活性功能；还筛选出10个与病原菌响应相关的差异表达基因，富集在植物-病原体相互作用、植物MAPK信号通路。以上研究结果为南川百合基因功能的深入研究提供数据基础，为推动百合多倍化进程及优良种质资源培育提供理论依据和数据支持。

关键词：南川百合同源四倍体转录组测序差异表达基因

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野生与不同栽培类型的灵芝种质遗传多态性及群体特征

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菌物学报 2024年第11期43卷 102-116页

作者：贺宗毅王伯初马传贵孙一翡陈岗崔宝凯重庆市中药研究院重庆400065 重庆大学生物工程学院重庆400900 北京京诚生物科技有限公司北京102600 北京林业大学生态与自然保护学院林木资源高效生产全国重点实验室北京100083

灵芝是我国著名的中药材,了解灵芝种质资源遗传多样性和群体结构,对于灵芝种群的有效保护和开发利用至关重要。本文采用全基因组重测序技术对来自野生与不同栽培类型的62份灵芝种质的遗传多态性和群体特征进行了分析。共计获得SNP位点13... 详细信息

灵芝是我国著名的中药材,了解灵芝种质资源遗传多样性和群体结构,对于灵芝种群的有效保护和开发利用至关重要。本文采用全基因组重测序技术对来自野生与不同栽培类型的62份灵芝种质的遗传多态性和群体特征进行了分析。共计获得SNP位点1388506个,InDel位点172341个,高质量的多态性SNP位点2003个,多态性指数PIC 0.031–0.755。灵芝种质资源遗传多态性和群体特征表明,各菌株间的遗传距离介于0.0111–0.5940;遗传距离和系统发育树显示自然栽培菌株、工厂化栽培菌株和部分野生菌株混合聚成一支,自然栽培(大棚栽培)与工厂化栽培菌株可各自聚成一支。自然栽培(林下拟境栽培)与部分自然栽培(大棚栽培)菌株混合聚成一支,且遗传分化小。群体分析的结果显示可将灵芝种质资源分为5个亚群,各亚群已形成遗传分化,除野生菌株构成的亚群外,其他栽培亚群遗传背景均较单一,栽培灵芝种质存在遗传均质化趋势。主成分分析各菌株的位置和相互间的距离也与遗传距离、系统发育树和群体特征相符。本文不但为评估野生与不同栽培类型灵芝种质的多样性和群体分化特征提供了有价值的数据,还为灵芝农艺性状分析和专用型新品种选育、发展提供了理论依据。

关键词：灵芝全基因组重测序种质遗传多态性群体特征

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转BpmiR156基因白桦株系的耐盐性分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2020年第6期44卷 147-151页

作者：叶查龙颜斌申婷婷宁坤李慧玉东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

【目的】探究植物年龄响应因子miR156的耐盐功能。【方法】以BpmiR156过表达白桦株系和非转基因对照株系为材料,通过PCR及qPCR分析各转基因株系中外源BpmiR156的稳定性及表达情况;同时对转基因及对照株系进行NaCl胁迫处理,调查胁迫后盐... 详细信息

【目的】探究植物年龄响应因子miR156的耐盐功能。【方法】以BpmiR156过表达白桦株系和非转基因对照株系为材料,通过PCR及qPCR分析各转基因株系中外源BpmiR156的稳定性及表达情况;同时对转基因及对照株系进行NaCl胁迫处理,调查胁迫后盐害指数、生理指标及生长速度。【结果】各转基因株系中外源BpmiR156已整合到白桦基因组中,且表达量显著高于非转基因对照株系;NaCl胁迫后,转基因株系的HO、丙二醛(MDA)含量及盐害指数高于对照株系,生长速度变慢。【结论】BpmiR156基因在白桦中稳定表达,BpmiR156基因过表达白桦株系与对照株系相比,在盐胁迫后盐害指数增加,生长速度变慢,膜系统损伤更严重,说明转入miR156基因在一定程度上降低了白桦的耐盐性。

关键词：白桦 miR156 转基因盐胁迫丙二醛 H2O2

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北京油松人工林遗传结构变异及与山西山系种群差异分析

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北京林业大学学报 2020年第6期42卷 33-42页

作者：贺快快武文斌张子杰胡现铬韩方旭钮世辉李悦北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083

【目的】本研究旨在揭示与阐明北京主要油松人工林种群的遗传多样性、遗传结构与亲缘关系,引种地对种群遗传结构及生长的影响,尝试追溯其可能的种源,为北京地区油松人工林培育与种质遗传管理提供参考。【方法】试验采用7对多态性高且扩... 详细信息

【目的】本研究旨在揭示与阐明北京主要油松人工林种群的遗传多样性、遗传结构与亲缘关系,引种地对种群遗传结构及生长的影响,尝试追溯其可能的种源,为北京地区油松人工林培育与种质遗传管理提供参考。【方法】试验采用7对多态性高且扩增稳定的核基因组EST-SSR引物,以北京地区20世纪营造的油松人工林8个种群和皇家园林的古油松3个种群及山西省五大山系的油松种群为试验对象,分析种群遗传多样性、遗传结构和种群间的遗传距离等。【结果】结果表明:3类种群中,北京人工林种群间遗传结构差异最大(FST=0.066),山西五山系群体间遗传结构差异次之(FST=0.033),古油松种群遗传结构差异最小(FST=0.023);北京油松人工林和古油松种群均偏离Hardy-Weinberg平衡,且呈现杂合子过剩状态,其中古油松种群杂合子过剩更多;在遗传距离0.020处北京人工林、古油松和山西五山系共16个油松种群聚为3类,各种群之间的遗传距离较近,遗传差异较小,相似程度较高;EST-SSR位点J10、J20、J42和J50在北京人工林、古油松和山西五山系中位点扩增频率差别大可用于未知种源的油松种群种源溯源。【结论】北京油松人工林种群较古油松种群有更丰富的遗传多样性和更大的遗传结构差异;外来种质在引入地胁迫生境下的适合度差异导致部分植株被淘汰,因此保留下来的种群遗传结构发生一定程度的改变;试验为后续北京地区油松人工林的评价、培育和种质种源管理打下了基础。

关键词：油松人工林古油松 SSR标记遗传多样性遗传结构种源溯源

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紫果西番莲子叶再生植株体系的建立

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西部林业科学 2021年第4期50卷 107-112页

作者：朱雅静王亚楠赵李姗余俊玲王雪许玉兰蔡年辉唐军荣西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室云南昆明650224 西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室云南昆明650224

建立高效稳定的紫果西番莲植株再生体系,可为其离体快繁、倍性育种及基因工程等提供前期基础,因此以紫果西番莲的子叶为材料,基于组织培养以直接和间接的方式诱导紫果西番莲器官发生,并对得到的不定芽进行增殖、生根、炼苗移栽。结果显... 详细信息

建立高效稳定的紫果西番莲植株再生体系,可为其离体快繁、倍性育种及基因工程等提供前期基础,因此以紫果西番莲的子叶为材料,基于组织培养以直接和间接的方式诱导紫果西番莲器官发生,并对得到的不定芽进行增殖、生根、炼苗移栽。结果显示:由子叶诱导得到的愈伤组织在1 mg/L 2,4-D+1 mg/L TDZ的MS培养基中通过间接器官发生途径诱导出不定芽,分化率为66.7%;子叶在1.0 mg/L 6-BA+0.5 mg/L IBA的MS培养基中能通过直接器官发生途径分化出不定芽,分化率为83.3%;最适合不定芽生根的配方为1/2 MS+0.5 mg/L NAA+0.1 mg/L IBA+0.2 g/L碳粉,生根率达83.3%;将生根苗于室内炼苗15 d后移栽,其中以红土︰腐殖土︰珍珠岩=1︰2︰1的基质配比效果最好,成活率为93.3%。根据研究结果建立紫果西番莲不定芽发生的2种途径,进一步完善了紫果西番莲的植株再生体系,可为紫果西番莲的优质种苗快繁、种质创新、遗传转化等相关研究提供技术支撑。

关键词：紫果西番莲不定芽植株再生直接器官发生间接器官发生

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