检索结果-内蒙古大学图书馆

华中农业大学学报 2009年第6期28卷 741-745页

作者：张新叶宋丛文杨彦伶张亚东黄敏仁湖北省林业科学研究院武汉430079 南京林业大学林木遗传和基因工程实验室南京210037

利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记。研究结果表明,在获得的94个碱基替代型候选SNPs中,A/G替换类型最多,占32.98%,C/T替换型占13.83%,其它碱基置换型SNPs占53.20%。同时,对其中20个候选S... 详细信息

利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记。研究结果表明,在获得的94个碱基替代型候选SNPs中,A/G替换类型最多,占32.98%,C/T替换型占13.83%,其它碱基置换型SNPs占53.20%。同时,对其中20个候选SNPs位点的重新测序结果表明,有13个(占65%)候选SNPs位点得到证实,其中,11个位点为碱基替代型SNPs,另外2个为杂合型位点。

关键词：单核苷酸多态性表达序列标签杨树

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杨树感抗黑斑病叶片EST序列测定及相关基因表达谱分析

杨树感抗黑斑病叶片EST序列测定及相关基因表达谱分析

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第二届中国林业学术大会-S2 功能基因组时代的林木遗传与改良

作者：张新叶宋丛文黄敏仁湖北省林业科学研究院南京林业大学林木遗传和基因工程实验室

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杨树感抗黑斑病叶片EST序列测定及相关基因表达谱分析

杨树感抗黑斑病叶片EST序列测定及相关基因表达谱分析

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第二届中国林业学术大会——S2 功能基因组时代的林木遗传与改良

作者：张新叶宋丛文黄敏仁湖北省林业科学研究院南京林业大学林木遗传和基因工程实验室

杨叶黑斑病是杨树的主要病害之一,受害杨树光合效率下降并提早落叶,严重影响树木生长。EST技术作为发现新基因和基因表达谱研究的有力工具,受到全世界重视。本研究利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为... 详细信息

杨叶黑斑病是杨树的主要病害之一,受害杨树光合效率下降并提早落叶,严重影响树木生长。EST技术作为发现新基因和基因表达谱研究的有力工具,受到全世界重视。本研究利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的两个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端大规模测序,共测定EST有效序列20023条,平均有效长度615.92bp。有效EST序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个非重复序列(UniGene),其中包括3734个重叠群(Contig),7082个独立的ESTs(Singletons)。经对有功能的基因研究发现,有两类基因的含量较高,一类是杨树叶片组织特异性相关的基因,另一类是杨树叶片受外界胁迫表达的抗逆相关基因。被注释的8853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分三个不同分类角度分类,被赋予功能的基因数累计达21100个。这些EST序列的测定为后期生物信息学分析及进一步利用打下了坚实基础,对阐明杨树抗病机理具有重要意义。

关键词：杨树表达序列标签基因表达

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杂交鹅掌楸转双价抗病基因影响因子研究

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分子植物育种 2007年第4期5卷 588-592页

作者：陈志陈金慧李婷婷吴淳施季森南京林业大学林木遗传和基因工程实验室南京210037

本研究利用在固体培养基上长期保存的杂交鹅掌楸胚性愈伤为外植体,对杂交鹅掌楸进行了遗传转化的研究。对于影响转化效果的众多影响因素,本研究主要讨论了乙酰丁香酮、菌液浓度、侵染时间对杂交鹅掌楸转化结果的影响。试验结果表明,在... 详细信息

本研究利用在固体培养基上长期保存的杂交鹅掌楸胚性愈伤为外植体,对杂交鹅掌楸进行了遗传转化的研究。对于影响转化效果的众多影响因素,本研究主要讨论了乙酰丁香酮、菌液浓度、侵染时间对杂交鹅掌楸转化结果的影响。试验结果表明,在预培养阶段,乙酰丁香酮的使用有利于转化效率的提高,最佳条件时浓度100mg/L,预培养4d。而在共培养阶段,乙酰丁香酮的使用和延长共培养时间并不能显著提高杂交鹅掌楸的遗传转化效率。同时,在侵染时,不同菌液浓度和不同侵染时间对转化结果的影响也无显著的差异。通过PCR检测经过筛选培养获得的阳性植株,初步验证了外源基因已经整合到杂交鹅掌楸基因组中。

关键词：杂交鹅掌揪(Liriodendron hybrids),遗传转化,GAFP,NP1

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杂交鹅掌楸胚性细胞悬浮系的建立

杂交鹅掌楸胚性细胞悬浮系的建立

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2006年全国博士生学术论坛——林业及生态建设领域相关学科

作者：陈志施季森陈金慧边黎明南京林业大学林木遗传和基因工程实验室，南京江苏 210037

通过对影响悬浮培养的一些物理因素如摇床转速、细胞起始密度等的研究，探讨了杂交鹅掌楸胚性细胞悬浮系的建立。结果表明，当摇床转速为100rpm、细胞起始密度为1×103～3x103个/ml时，可建立一个均一性、分散性较好和细胞增值较快... 详细信息

通过对影响悬浮培养的一些物理因素如摇床转速、细胞起始密度等的研究，探讨了杂交鹅掌楸胚性细胞悬浮系的建立。结果表明，当摇床转速为100rpm、细胞起始密度为1×103～3x103个/ml时，可建立一个均一性、分散性较好和细胞增值较快的杂交鹅掌楸胚性细胞悬浮系，其悬浮培养的继代周期以2～4周为宜。悬浮物以直径介于15～280μm的细胞团为主，干重占总干物重65％，与其它直径的细胞团相比，培养效果最好。

关键词：杂交鹅掌楸悬浮培养胚性愈伤摇床转速

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林木全同胞群体的多位点连锁分析

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生物数学学报 2005年第4期20卷 496-504页

作者：童春发施季森南京林业大学林木遗传和基因工程实验室江苏南京210037

多位点连锁分析是构建人类以及动植物的遗传连锁图谱的关键步骤之一,但是由于林木遗传背景的复杂性,多位点连锁分析在林木的全同胞群体中还没有得到应用．本文将多位点连锁分析应用到林木的F1代全同胞群体中．对于全同胞群体的任意分... 详细信息

多位点连锁分析是构建人类以及动植物的遗传连锁图谱的关键步骤之一,但是由于林木遗传背景的复杂性,多位点连锁分析在林木的全同胞群体中还没有得到应用．本文将多位点连锁分析应用到林木的F1代全同胞群体中．对于全同胞群体的任意分离比的两个位点,给出了在不同的连锁相下从一个位点到另一个位点的转移概率矩阵．对于给定的一列标记位点,考虑了不同分离比位点以及两位点间的连锁相信息,采用隐马尔可夫链模型计算极大似然函数和相邻位点间的重组率．本文的方法有助于构建完整的高密度的林木遗传连锁图谱．

关键词：多位点连锁分析隐马尔可夫链模型全同胞群体林木

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大规模EST序列测定中的条件优化

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南京林业大学学报(自然科学版) 2005年第3期29卷 99-102页

作者：张新叶黄敏仁王明庥南京林业大学林木遗传和基因工程实验室江苏南京210037 江苏南京210037 湖北省林业科学研究院南京林业大学林木遗传和基因工程实验室湖北武汉430079

EST技术已广泛用于发现新基因和基因表达谱研究。笔者对EST序列测定中的不同反应体系、Big Dye类型、用量、测序产物纯化及不同测序板等因素进行了比较,确定了大规模EST测序方案,同时对文库质量及其他影响因素进行了讨论,经优化后的方... 详细信息

EST技术已广泛用于发现新基因和基因表达谱研究。笔者对EST序列测定中的不同反应体系、Big Dye类型、用量、测序产物纯化及不同测序板等因素进行了比较,确定了大规模EST测序方案,同时对文库质量及其他影响因素进行了讨论,经优化后的方案可降低大规模EST测序成本及提高测序成功率。

关键词：表达序列标签序列测定条件优化

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香石竹叶片离体再生体系的建立

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植物资源与环境学报 2005年第1期14卷 16-19页

作者：陈英王光萍诸葛强蔡有铭黄敏仁王明庥南京林业大学林木遗传和基因工程实验室江苏南京210037 上海市农业委员会上海200001

以香石竹(DianthuscaryophyllusLinn. )无菌苗叶片为外植体,从不同细胞分裂素及其他激素配合使用等方面进行筛选,建立香石竹叶片离体再生体系。结果表明,不同的细胞分裂素影响叶片不定芽分化频率,其中较低浓度的 6 BA(0. 5mg·L-1 )... 详细信息

以香石竹(DianthuscaryophyllusLinn. )无菌苗叶片为外植体,从不同细胞分裂素及其他激素配合使用等方面进行筛选,建立香石竹叶片离体再生体系。结果表明,不同的细胞分裂素影响叶片不定芽分化频率,其中较低浓度的 6 BA(0. 5mg·L-1 )和TDZ(0. 001mg·L-1 )配合使用能有效诱导香石竹叶片不定芽分化;添加一定浓度的PP333 (4mg·L-1 )可提高叶片不定芽分化频率和平均芽数。香石竹叶片不定芽分化的适宜培养基为:MS+0. 002mg·L-1 TDZ+0. 5mg·L-1 6 BA+0. 2mg·L-1 IAA+4mg·L-1 PP333;壮苗培养基为:MS+0. 2mg·L-1 6 BA+0. 2mg·L-1 IAA;生根培养基为: 1 /2MS。不定芽诱导频率达到 42. 61%,平均芽数为 4. 53个。

关键词：香石竹叶片离体再生体系外植体培养基

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林木全同胞群体遗传图谱构建和QTL定位统计分析

林木全同胞群体遗传图谱构建和QTL定位统计分析

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第三届全国动植物数量遗传学学术研讨会

作者：童春发施季森南京林业大学林木遗传和基因工程实验室南京210037

由于林木自身复杂的生物学特性,育种学家们很难得到象农作物那样的重组近交系用于遗传作图.然而,林木具有高度的杂合性,通常种间或种内杂交所产生的全同胞群体在很多位点会发生分离,因此林木的全同胞群体是一个很好的作图群体.在全同胞... 详细信息

由于林木自身复杂的生物学特性,育种学家们很难得到象农作物那样的重组近交系用于遗传作图.然而,林木具有高度的杂合性,通常种间或种内杂交所产生的全同胞群体在很多位点会发生分离,因此林木的全同胞群体是一个很好的作图群体.在全同胞群体中,分子标记位点的分离比可能是1:1、1:2:1和1:1:1:1等,而位于一个标记区间中的QTL等位基因可能有4种之多,QTL基因型可能有13种.本文论述了利用全同胞群体构建亲本遗传连锁图谱的数学分析步骤,提出了利用该遗传图谱定位QTL的区间作图法.连锁图谱的构建数学分析过程包括二点连锁分析、连锁群的划分、连锁群的排序以及多位点的连锁分析等.

关键词：林木全同胞群体遗传连锁图谱数量性状基因座位 QTL定位

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利用杉木的F_1代群体构建遗传连锁图谱

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Acta Genetica Sinica 2004年第10期31卷 1149-1156页

作者：童春发施季森南京林业大学林木遗传和基因工程实验室南京210037

对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该... 详细信息

对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该作图方法比通常林木上所用的“拟测交”作图方法更有效。采用该作图策略 ,利用句容0号无性系 (♀ )×柔叶杉 (♂ )的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱。在句容 0号无性系的连锁图谱中 ,有 10 1个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 2 82 6cM ,平均图距为 2 2 6cM ,单个连锁群上最多含有 17个标记 ,最少含有 5个标记 ;在柔叶杉的连锁图谱中 ,有 94个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 5 6 5 8cM ,平均图距为 2 7 3cM ,单个连锁群上最多含有 16个标记 ,最少含有 4个标记。构建的句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了 2 6个标记和 2 8个标记 ,双亲的图谱共增加了 5 4个AFLP标记 ,使图谱上的分子标记总数达到 195个 ,双亲遗传图谱的跨度均超过了 2 0 0 0cM ,基本上达到了杉木基因组的长度 ,图谱的覆盖率接近于 10 0 %。利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率。

关键词：杉木遗传连锁图谱 F1代群体连锁相隐马尔可夫链模型

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