检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：倪州献徐立安南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

林木种子园亲本材料的遗传特性对其子代有着深远的影响。在自由授粉模式下,由于授粉情况的变化,导致种子遗传品质往往难以预测。本研究以马尾松无性系种子园连续3年份自由授粉子代生长数据为基础,将子代生长年份间差异最小和最大的9个... 详细信息

林木种子园亲本材料的遗传特性对其子代有着深远的影响。在自由授粉模式下,由于授粉情况的变化,导致种子遗传品质往往难以预测。本研究以马尾松无性系种子园连续3年份自由授粉子代生长数据为基础,将子代生长年份间差异最小和最大的9个家系分别记为稳定组与不稳定组,并将种子园内217个无性系作为候选父本,利用27对SSR标记对样本个体进行亲本分析,探究子代年度生长表现稳定与不稳定家系的亲本来源特点。根据亲本分析结果的研究发现,稳定组与不稳定组父本基因多样度在年份间、组间的差异不大,Nei基因多样度变化于0.54～0.55之间;而母本的基因多样度差异较大,不稳定组Shannon指数(I=0.9822)、Nei基因多样度(Nei=0.5441)等参数均高于稳定组母本(I=0.8712;Nei=0.4995)。稳定组与不稳定组的亲本组合遗传距离在2个年份均存在极显著差异(p<0.001),不稳定组亲本平均遗传距离(0.5778)大于稳定组(0.4156),不稳定组亲本组合的遗传距离分布相对分散(各亲本组合间遗传距离变化较大)。说明不稳定(子代生长差异大)家系可能是遗传多样度较大造成,而遗传多样度大的原因可能主要是这些子代的父母本遗传距离较大。研究发现,子代受母本的影响较大。其中,组间两个年份子代单株育种值与母本育种值均存在极显著相关(r=0.52～0.82,p<0.001),而与父本育种值不存在明显相关关系(p>0.05)。将子代按材积均值分为优、良、差组进行分析发现,子代育种值与亲本遗传距离(GD)有一定的正相关性,亲本GD大,子代表现可能越优良,当亲本GD较大时(如GD>0.7),子代分化也大,出现优劣并存现象。分析结果显示,亲本平均遗传距离有优组>良组>差组的趋势,而GD小于0.5的亲本组合比例差组>良组>优组。此外,优组与差组中亲本GD大于0.7的个体比例相似,但优组中这部分子代多表现优良,即子代育种值普遍较高,而差组中这部分子代多表现较差。综上,在杂交育种工作中更应注重遗传距离较大的亲本组合的筛选,尤其要选择育种值较高的个体作母本。

关键词：马尾松种子园子代生长稳定性父本分析相关分析

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与亚洲百合无花粉性状相连锁的SRAP标记

与亚洲百合无花粉性状相连锁的SRAP标记

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中国球宿根花卉2015年会

作者：王帅辛昊阳施季森席梦利南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

百合是世界著名的五大鲜切花之一,在国内外花卉市场上十分畅销,有着显著的经济效益。但在百合的销售和消费过程中,存在一个突出的问题是花药产生的大量花粉污染花瓣和衣物。为了解决这一问题,目前主要采用手工摘除花药的方法,此法费时费... 详细信息

百合是世界著名的五大鲜切花之一,在国内外花卉市场上十分畅销,有着显著的经济效益。但在百合的销售和消费过程中,存在一个突出的问题是花药产生的大量花粉污染花瓣和衣物。为了解决这一问题,目前主要采用手工摘除花药的方法,此法费时费力,不仅增加了切花的成本,而且也降低了百合的商品价值和观赏性。因此,市场迫切需要无花粉或少花粉的百合品种。本研究旨在通过研究亚洲百合无花粉分离群体的SRAP标记特征,筛选与无花粉性状相连锁的SRAP标记,为培育观赏性好、无花粉污染的百合新品种提供依据。试验以亚洲百合‘H08-03'（辛）与‘Pollyanna'（♂）杂交获得的F代分离群体为试材。其中,‘Pollyanna'的花粉量正常,编号‘H08-03'的材料无花粉,F代中有花粉子代和无花粉子代个数分别为54和51个基因型。采用L（4～5）正交设计,对影响SRAP-PCR反应体系的Mg、dNTPs、Taq酶、引物和模板DNA等5因素进行4个水平的优化试验,结合正交直观分析和方差分析,对影响反应较大的几个因素进行单因素实验,以确定最为合适的PCR反应各因素的浓度。之后对两步退火温度分别进行单因素分析,最终确定亚洲百合SRAP-PCR最佳的反应体系。应用建立的SRAP体系,结合BSA法,针对无花粉和有花粉基因型分别混池,对该分离群体进行连锁分析,在无花粉池和有花粉池之间筛选272对SRAP引物组合,以期找出两基因池扩增存在差异条带的引物。将扩增存在差异的引物对用于群体的单株验证,验证该引物对在打开基因池后于分离群体单株间是否存在上述同样差异。若存在同样差异,对其特异片段进行回收、克隆和测序。经正交直观分析和方差分析的结果表明:Mg、Taq酶、模板DNA三个因素对亚洲百合SRAP-PCR反应影响较大,对其进行单因素梯度实验后,最终确定了亚洲百合SRAP-PCR最佳的反应体系为:20¨L体系,模板DNA约100 ng,1×PCR Buffer,3.5 mmol·LMg,0.6 mmol·LdNTPs,上下游引物各0.5μmol·L,Taq酶3 U,不足部分以ddHO补足。PCR反应程序的两步最适退火温度第一步为35℃,第二步为53℃。应用建立的SRAP体系,对272对引物进行多态性筛选,最终筛选出53对扩增多态性丰富且稳定的引物对。53对引物中获得了与无花粉性状连锁的SRAP标记3个,分别是EM2/ME3、EM2/ME9和EM17/ME14。并成功对EM洲E3标记扩增出的特异性片段进行回收、克隆和测序,得到了该片段376 bp的碱基序列。该标记可用于亚洲百合无花粉性状的早期分子辅助育种。

关键词：亚洲百合无花粉 SRAP标记

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基于SSR标记的银杏群体遗传分析

基于SSR标记的银杏群体遗传分析

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江苏省遗传学会2015年学术研讨会

作者：周琦徐立安南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京 210037

银杏(Ginkgo biloba L.)集果用、叶用、材用等用途于一身,素有“活化石”之美誉.本研究以贵州、浙江两省6 个银杏古树分布点和江苏2 个栽培点的共229 个个体为材料,从自主开发的SSR 标记中筛选出116 对多态性引物,并从中选取22 对进行... 详细信息

银杏(Ginkgo biloba L.)集果用、叶用、材用等用途于一身,素有“活化石”之美誉.本研究以贵州、浙江两省6 个银杏古树分布点和江苏2 个栽培点的共229 个个体为材料,从自主开发的SSR 标记中筛选出116 对多态性引物,并从中选取22 对进行群体扩增.结果表明：22 对引物共检测到183 个等位基因,每对引物扩增等位基因数4～21 个不等,平均为8.318,平均有效等位基因Ne 为5.867.

关键词：银杏微卫星遗传结构避难所

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利用SSR分析浙江红山茶群体遗传结构及其保护策略

利用SSR分析浙江红山茶群体遗传结构及其保护策略

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中国林学会珍贵树种分会成立大会暨首届中国珍贵树种学术研讨会

作者：温强刘丽婷叶金山徐立安徐林初江西省林业科学院省植物生物技术重点实验室南昌330032 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

利用16个SSR标记检测12个浙江红山茶天然群体的遗传结构.结果显示,现有浙江红山茶的遗传多样性呈现较低水平(h=0.607),其分布特点是,中部处于怀玉山系及武夷山系群体(如江西大茅山、三清山、浙江古田山群体)多样性水平较高,为浙江红山... 详细信息

利用16个SSR标记检测12个浙江红山茶天然群体的遗传结构.结果显示,现有浙江红山茶的遗传多样性呈现较低水平(h=0.607),其分布特点是,中部处于怀玉山系及武夷山系群体(如江西大茅山、三清山、浙江古田山群体)多样性水平较高,为浙江红山茶多样性分布中心,向西处于衡山系的群体(湖南衡山)多样性最低,而东部泰顺及沿海的霞浦等群体的多样性相对处于中等水平;浙江红山茶各群体存在明显的遗传结构,且具高水平的遗传分化,群体间变异占总变异约25％ (FST=0.245,GST=0.255),其重要原因在于：群体规模较小,部分群体(湖南衡山、江西婺源灵山群体)已经历瓶颈效应,群体内存在近交,群体间基因流较小(Nm=0.731)等.开展浙江红山茶的资源保护与利用迫在眉睫,对多样性较高的群体如江西大茅山、三清山及浙江古田山等群体重点就地保护,可通过建立保护区等方式杜绝砍伐及破坏现象;而对遗传多样性较低的群体,如衡山、福安群体的物种恢复,建议通过引种回归方法;此外,对于多样性较低的分布区域,如江西中西部至湖南等地区,建议通过引种方式丰富资源.

关键词：浙江红山茶 SSR 群体遗传结构保护策略

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杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发

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南京林业大学学报(自然科学版) 2014年第1期38卷 9-14页

作者：徐阳陈金慧李亚洪舟王颖赵亚琦王新民施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

利用已经公布的杉木444条EST序列和未公布的杉木基因组文库中1 142条基因序列,进行引物开发效率的比较。去冗余后,利用MISA搜索SSR位点,分别得到109个和39个含有SSR的位点。杉木EST序列中SSR分布密度为964.58个/Mbp,基因组中平均每Mbp出... 详细信息

利用已经公布的杉木444条EST序列和未公布的杉木基因组文库中1 142条基因序列,进行引物开发效率的比较。去冗余后,利用MISA搜索SSR位点,分别得到109个和39个含有SSR的位点。杉木EST序列中SSR分布密度为964.58个/Mbp,基因组中平均每Mbp出现1 037.24个SSR。在两个独立来源的数据库序列中,六核苷酸重复均为最多的重复类型,且AT-rich的重复类型占较大比例。AGC/CTG是杉木EST序列和基因组库中最多的三碱基重复,通过Primer 3.0分别设计出SSR引物95对和37对。为考察设计引物在杉木不同种源(群体)中的有效性,取12个种源(个体)的优良个体,利用随机抽取的10个EST-SSR和8个gSSR(基因组SSR)进行引物筛选,结果表明:EST-SSR和gSSR各有4对引物在12个种源(个体)中表现出明显的多态性,多态率分别为40%和50%。8对多态性的SSR引物共扩增出25个多态性等位位点,平均每个引物产生3.125个多态性等位位点,平均有效的等位位点为2.399 5,PIC平均值为0.519 1;Hot平均为0.307 4。其中gSSR标记在检测群体间存在较大的分化,4个gSSR比4个EST-SSR扩增出更多的等位位点数、平均等位位点数,以及更大的PIC值。

关键词：杉木基因组SSR EST-SSR

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松属编码区微卫星特征和相应基因功能分析（英文）

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南京林业大学学报(自然科学版) 2014年第2期38卷 47-51页

作者：孔凡明王小龙陈赢男李淑娴徐进尹佟明南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

从GenBank下载453 892条松属EST序列,序列组装后得到20 886条contig。用Sputnik软件从这些contig中查找了2 678个微卫星,其中3碱基重复微卫星占的比例最高,为59.2%,而其他重复长度的微卫星都相对较低,比例分别为:2碱基重复微卫星占12.0... 详细信息

从GenBank下载453 892条松属EST序列,序列组装后得到20 886条contig。用Sputnik软件从这些contig中查找了2 678个微卫星,其中3碱基重复微卫星占的比例最高,为59.2%,而其他重复长度的微卫星都相对较低,比例分别为:2碱基重复微卫星占12.0%,4碱基重复微卫星占13.3%,5碱基重复微卫星占15.5%。3碱基重复微卫星变化引起的基因读码框改变最小,松属树种基因区3碱基重复微卫星的富集显示了强烈的密码子选择效应。此次研究还对查找到的微卫星进行了引物设计和扩增分析。实验结果显示,设计的微卫星引物在云南松中的扩增成功率是72.9%。从扩增成功的引物中进一步选取了155对引物,对14个松属树种和1个黄杉属树种进行了引物通用性实验分析,结果显示155对引物在14个松属树种间的通用性在71.0%以上,而在黄杉属树种中的通用性只有25.2%。对松属树种中含有微卫星的基因进行了功能分类研究,结果显示基因在是否保留微卫星序列方面有显著分化,微卫星参与了如细胞成分分类的共质体组成、病毒颗粒及病毒颗粒组成、生物节律调控,以及生长素转运蛋白等生物学过程。

关键词：表达序列标签序列组装微卫星松属

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杉木第2代种子园双列杂交子代遗传变异及选择

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亚热带农业研究 2015年第2期11卷 73-79页

作者：陈孝丑郑仁华施季森福建省林业科技试验中心福建南靖363600 福建省林业科学研究院国家林业局南方山地用材林培育重点实验室福建福州350012 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037

利用杉木第2代种子园10个速生优良无性系作为杂交亲本,开展双列杂交及子代测定,研究不同林龄家系生长性状和材性遗传变异规律,并开展优良家系及单株选择。结果表明,不同林龄家系间均存在较大的遗传变异,树高、胸径和单株材积等生长性状... 详细信息

利用杉木第2代种子园10个速生优良无性系作为杂交亲本,开展双列杂交及子代测定,研究不同林龄家系生长性状和材性遗传变异规律,并开展优良家系及单株选择。结果表明,不同林龄家系间均存在较大的遗传变异,树高、胸径和单株材积等生长性状均达极显著差异水平。14年生木材的红心率、偏心率、树皮率和基本密度等材质指标的变异系数均较大,家系间存在较大的遗传变异,木材材质也随着林龄增大不断提高。选出单株材积遗传增益最大的5个速生优良家系,与对照相比,单株材积平均遗传增益为6.08%;选出木材基本密度遗传增益最大的5个材性优良家系,与对照相比,木材基本密度平均遗传增益为3.85%。速生和材质两类优良家系可作为杉木高世代种子园建园材料进行推广利用。在优良家系选择的基础上还选出12个优良个体,与对照相比,单株材积遗传增益达38.24%,增产效果明显,不仅是高世代育种的理想材料,而且可以通过无性繁殖加以利用。

关键词：杉木杂交生长性状材性遗传变异选择

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植物磷酸化蛋白质组研究进展

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基因组学与应用生物学 2014年第6期33卷 1405-1414页

作者：甄艳李春映陆叶施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰研究最深入的领域之一,蛋白质磷酸化也是信号转导的关键调控因子。磷酸化修饰可精细地协调激酶和磷酸化酶网络,进而调控细胞生长、增殖及胞内外生物刺激应急反应等。但是由于蛋白质磷酸化短暂性、高动态... 详细信息

蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰研究最深入的领域之一,蛋白质磷酸化也是信号转导的关键调控因子。磷酸化修饰可精细地协调激酶和磷酸化酶网络,进而调控细胞生长、增殖及胞内外生物刺激应急反应等。但是由于蛋白质磷酸化短暂性、高动态性及低丰度的特点,使得磷酸化蛋白质组研究具有挑战性。本文从基于2-DE的植物磷酸化蛋白质组、植物磷酸化肽富集、基于质谱植物磷酸化肽鉴定及位点分析、基于质谱植物磷酸化肽定量分析、植物磷酸化蛋白质数据库等方面综述植物磷酸化蛋白质组研究进展、策略、相应技术的优缺点及展望了未来发展的方向。

关键词：植物磷酸化磷酸化蛋白组磷酸肽质谱

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异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性调查及FISH分析

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分子植物育种 2014年第1期12卷 138-143页

作者：房磊杨斌张伟娜辛昊阳高婷婷施季森郭佳席梦利南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

本研究通过调查异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性及其追踪染色体来源,来探讨异源三倍体的遗传规律。采用核型分析方法,对以雄性不育的二倍体亚洲百合GHC-01为母本,以Longiflorum×Asiatic系列的异源三倍体百合‘Ceb Dazzle’为... 详细信息

本研究通过调查异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性及其追踪染色体来源,来探讨异源三倍体的遗传规律。采用核型分析方法,对以雄性不育的二倍体亚洲百合GHC-01为母本,以Longiflorum×Asiatic系列的异源三倍体百合‘Ceb Dazzle’为父本杂交获得的30个杂交后代及其父母本进行了染色体数目的统计,同时利用45S rDNA荧光原位杂交技术,对父母本以及4个杂交后代进行了45S rDNA荧光原位杂交分析。核型分析结果表明,GHC-01和‘Ceb Dazzle’的染色体数目分别为24(2n=2x=24)和36(2n=3x=36),30个杂交后代中染色体数目为24、25、26、35、36的分别有13、10、4、2、1个基因型的杂交后代;荧光原位杂交结果表明,GHC-01和‘Ceb Dazzle’分别有11个和14个45S rDNA荧光原位杂交位点,4个所研究的杂交后代中均有不同数目的典型父本染色体。基于倍性统计和荧光原位杂交结果,对杂交后代的早期鉴定以及异源三倍体在育种中的作用进行了讨论。

关键词：百合异源三倍体倍性统计荧光原位杂交

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磷酸化蛋白质组定量研究策略

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分子植物育种 2014年第3期12卷 577-583页

作者：甄艳李春映施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

蛋白质磷酸化修饰是调控多样种生物过程的一种重要的翻译后修饰,定量分析内部和外部因子作用下磷酸化蛋白质的分子调控机制对理解生物功能非常重要。早期磷酸化蛋白质组研究的重点是定性检测、鉴定磷酸化蛋白质及磷酸化位点的定位。近年... 详细信息

蛋白质磷酸化修饰是调控多样种生物过程的一种重要的翻译后修饰,定量分析内部和外部因子作用下磷酸化蛋白质的分子调控机制对理解生物功能非常重要。早期磷酸化蛋白质组研究的重点是定性检测、鉴定磷酸化蛋白质及磷酸化位点的定位。近年来,随着质谱技术的快速发展使得定量磷酸化蛋白质组研究有了很大的发展。利用磷酸化蛋白质组的定量分析监测蛋白质磷酸化的动态变化有助于阐明生物过程及其功能的实现机制。本文综述了磷酸化蛋白质组定量分析策略:基于2-DE的磷酸化蛋白质组定量策略,基于无胶的质谱磷酸化蛋白质组标记定量策略及无标记定量分析策略。磷酸化蛋白质组的定量分析将有助于更好的阐明生物的信号传导机制。

关键词：翻译后修饰磷酸化蛋白质组质谱双向电泳

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