检索结果-内蒙古大学图书馆

南方农业学报 2019年第3期50卷 506-514页

作者：王宇晨曲春浦刘关君东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛选鉴定ASPAT基因家族成员,利用生物信息学软件分析各基因家族... 详细信息

【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛选鉴定ASPAT基因家族成员,利用生物信息学软件分析各基因家族成员序列和基因结构及编码蛋白的理化性质、亚细胞定位和保守基序等,并利用实时荧光定量PCR检测正常施氮处理(1 mmol/L NH4NO3)下其在杨树根、茎和叶中的组织表达特异性。【结果】从杨树基因组中共鉴定出9个ASPAT基因家族成员,包括7个真核型ASPAT(AAT)基因(PtASPAT1～PtASPAT7)和2个原核型ASPAT(PAT)基因(PtASPAT8～PtASPAT9),编码区(CDS)序列长度1215～1791 bp,编码的氨基酸数目304～480个,外显子数7～14个,编码蛋白的等电点5.66～8.99,相对分子质量33.11～53.31 kD,脂融指数76.36～93.54,分别定位于叶绿体、线粒体和胞质中,除PtASPAT6和PtASPAT7为不稳定蛋白,其他均为稳定蛋白。拟南芥和杨树的ASPAT蛋白可聚为两大类,Ⅰ类为AAT蛋白,包括PtASPAT1～PtASPAT7和AtASPAT1～AtASPAT5;Ⅱ类为PAT蛋白,包括PtASPAT8、PtASPAT9和拟南芥PAT(AtPAT)。PtASPAT1～PtASPAT6均含有5个保守基序,PtASPAT7缺少2个保守基序,PtASPAT8和PtASPAT9均仅含有1个与AtPAT相同的保守基序。9个杨树ASPAT蛋白均含有磷酸吡哆醛结合位点(SGTHNYSSK)、同源二聚体多肽结合位点(GAVAER)和催化残留活性位点(K)。正常氮素处理下,PtASPAT1基因在杨树根、茎和叶中表达量无明显差异;PtASPAT2～PtASPAT9基因在根部的表达量较在茎和叶中的高,尤其是PtASPAT4和PtASPAT8基因表达量较高。【结论】杨树ASPAT基因家族成员主要在根部表达,尤其是PtASPAT4和PtASPAT8基因在杨树根部的初级氮素同化中发挥重要作用。

关键词：杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT) 基因家族生物信息学基因表达

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杨树PtBBE9a基因异源过表达功能分析

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江苏农业科学 2020年第23期48卷 66-70页

作者：施天元程玉祥东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

小檗碱桥酶(berberine bridge enzyme,简称BBE)是一类典型的黄素双共价氧化酶家族,参与植物生长发育的多个生物过程。PtBBE9a是笔者所在课题组前期从杨树发育木质部分离、鉴定的糖蛋白。PtBBE9a基因表达在杨树木质部呈现高丰度水平,并... 详细信息

小檗碱桥酶(berberine bridge enzyme,简称BBE)是一类典型的黄素双共价氧化酶家族,参与植物生长发育的多个生物过程。PtBBE9a是笔者所在课题组前期从杨树发育木质部分离、鉴定的糖蛋白。PtBBE9a基因表达在杨树木质部呈现高丰度水平,并且随着茎木质化程度的增强而升高。组织β-葡萄糖苷酸酶(GUS)活性染色结果显示,PtBBE9a启动子活性集中在ProPtBBE9a::GUS转基因拟南芥幼苗的顶端分生组织、成熟果荚皮及根组织。通过构建PtBBE9a-GFP过表达载体发现,PtBBE9a过表达拟南芥比野生型拟南芥早开花。进一步研究发现,转基因拟南芥的叶片数少于野生型拟南芥,而其茎木质素含量高于野生型拟南芥。推测PtBBE9a可能通过调控拟南芥生长发育周期而产生早花表型。

关键词：杨树 PtBBE9a基因异源过表达启动子转基因拟南芥 BBE

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白桦四倍体×紫雨桦二倍体杂交种子活力及杂种子代生长特性分析

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温带林业研究 2025年第1期8卷 1-8页

作者：赵钰婷陈冬瑶杨柳李晶楠宁广亮姜静东北林业大学林木遗传育种全国重点实验室黑龙江哈尔滨150040 铁法煤业(集团)有限责任公司林业总场辽宁铁岭112700

【目的】通过杂交及后续的筛选得到生长快且叶色艳丽的紫雨桦杂种三倍体。【方法】试验以优异白桦四倍体为母本与二倍体‘紫霞1号’、‘紫霞2号’杂交,获得2个紫雨桦杂种三倍体家系,同时以8个白桦家系(4个白桦三倍体家系、4个白桦二倍... 详细信息

【目的】通过杂交及后续的筛选得到生长快且叶色艳丽的紫雨桦杂种三倍体。【方法】试验以优异白桦四倍体为母本与二倍体‘紫霞1号’、‘紫霞2号’杂交,获得2个紫雨桦杂种三倍体家系,同时以8个白桦家系(4个白桦三倍体家系、4个白桦二倍体家系)为对照,开展家系间种子千粒重、种子活力、叶色参数及苗期生长等分析。【结果】种子千粒重、发芽率、发芽势、发芽值、发芽指数及活力指数在不同家系间的差异达到了极显著水平(P<0.01)。在种子千粒重方面,紫雨桦杂种三倍体家系的千粒重显著高于二倍体家系;在种子活力方面,发芽率、发芽势、发芽值、发芽指数呈现相同的规律,即白桦二倍体高于或显著高于紫雨桦杂种三倍体及白桦三倍体;白桦二倍体和紫雨桦杂种三倍体的活力指数高于白桦三倍体;叶色参数分析显示,紫雨桦杂种三倍体的紫叶家系Z1和Z2的a^(*)值显著高于其他家系,L^(*)值显著低于其他家系,即Z1和Z2家系的叶片偏红偏暗;在光合色素含量方面,Z1和Z2家系的叶绿素和花青素的相对含量显著高于其他绿叶家系;在苗期生长方面,Z1和Z2三倍体家系的株高均显著高于二倍体紫雨桦,在植物生长发育时期,Z1及Z2家系叶色变异丰富。【结论】研究结果为后续筛选叶色鲜艳、观赏性高的优异紫叶三倍体紫雨桦提供指导。

关键词：紫雨桦三倍体种子活力苗期生长叶色

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水曲柳FmWRKY44基因克隆及表达分析

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植物研究 2019年第4期39卷 529-538页

作者：李新宇何利明詹亚光东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

克隆水曲柳FmWRKY44基因,探究其在非生物胁迫和激素胁迫中的作用。利用水曲柳干旱转录组序列设计特异引物,克隆FmWRKY44基因的完整ORF序列,并对该序列及其编码产物进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术分析FmWRKY44表达模式。克隆了一个... 详细信息

克隆水曲柳FmWRKY44基因,探究其在非生物胁迫和激素胁迫中的作用。利用水曲柳干旱转录组序列设计特异引物,克隆FmWRKY44基因的完整ORF序列,并对该序列及其编码产物进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术分析FmWRKY44表达模式。克隆了一个水曲柳WKRY基因,编码区长1383bp,编码460氨基酸。对其编码蛋白分析发现其为稳定亲水蛋白,亚细胞定位预测主要在细胞核,进行保守域及同源性分析分析,属于WRKYⅠ类家族,命名为FmWRKY44。qRT-PCR分析发现,FmWRKY44在种子中高度表达,并不同程度响应低温、高温、盐和干旱4种非生物胁迫。同时发现FmWRKY44与NAA、ABA、GA3、JA植物激素响应,水曲柳FmWRKY44基因积极响应低温、高温胁迫。

关键词：水曲柳 WRKY基因基因克隆表达分析

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水曲柳2个PLT转录因子基因的克隆及表达分析

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植物研究 2019年第1期39卷 139-147页

作者：丁一巍詹亚光张佳薇何利明东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

为初步探究水曲柳根发育中PLT转录因子的基因功能及遗传调控机理,以水曲柳转录组数据为基础,参考拟南芥AtPLT2和AtPLT3基因序列,通过PCR技术从水曲柳中克隆了两个PLT转录因子基因,通过同源比对将它们命名为FmPLT2和FmPLT3,分别编码532和... 详细信息

为初步探究水曲柳根发育中PLT转录因子的基因功能及遗传调控机理,以水曲柳转录组数据为基础,参考拟南芥AtPLT2和AtPLT3基因序列,通过PCR技术从水曲柳中克隆了两个PLT转录因子基因,通过同源比对将它们命名为FmPLT2和FmPLT3,分别编码532和497个氨基酸残基。生物信息学分析表明,其相对分子质量分别为59和55kDa,等电点分别为5.98和5.79,均为亲水性不稳定蛋白,均含有2个AP2保守结构域。系统进化分析结果显示,其与同属木犀科的油橄榄OePLT2和OeOLT3转录因子的同源性最高,亲缘关系最近。亚细胞定位预测显示,FmPLT2和FmPLT3蛋白都主要集中于细胞核中。通过qRT-PCR技术分析FmPLT2和FmPLT3在不同组织部位及生根期间的表达情况,结果表明:FmPLT2和FmPLT3具有相似的组织特异性表达,在根中表达含量均最高,在叶中的表达含量均最低;FmPLT2在生根期间的表达量变化极为显著,21天时的表达量是0天时的32倍,但FmPLT3的表达量变化并不显著,表明FmPLT2不仅在根发育中起重要作用,还可能参与细胞增殖和生长等多个发育途径。

关键词：水曲柳 PLT转录因子基因克隆表达分析根发育

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杨树重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs)基因的鉴定及表达分析

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植物研究 2019年第6期39卷 935-946页

作者：王琪许志茹陈瑾元张双黄佳欢刘关君东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

金属伴侣在植物的生理活动中发挥关键作用,负责结合金属离子并将其转运至靶蛋白以维持细胞的金属离子稳态。目前关于HIPP(heavy metal-associated isoprenylated plant protein)金属伴侣蛋白的特性和功能分析多集中于模式植物拟南芥。... 详细信息

金属伴侣在植物的生理活动中发挥关键作用,负责结合金属离子并将其转运至靶蛋白以维持细胞的金属离子稳态。目前关于HIPP(heavy metal-associated isoprenylated plant protein)金属伴侣蛋白的特性和功能分析多集中于模式植物拟南芥。本研究在毛果杨(Populus trichocarpa)中鉴定了14个PtHIPPs蛋白,均具有两个保守的金属离子结合基序MXCXXC,氨基末端可以形成βαββαβ二级结构,羧基末端具有保守的异戊二烯化基序;一些PtHIPPs还具有赖氨酸和/或甘氨酸富集区。根据基因结构、蛋白质的保守基序和进化树分析,PtHIPPs蛋白可分为3个亚组。PlantGenIE的组织特异性表达数据及荧光定量PCR鉴定结果显示,毛果杨PtHIPPs基因及小黑杨(Populus simonii×Populus nigra)PnHIPPs基因具有特定的组织表达特异性且存在差异。此外,利用缺铜及过量铜离子处理小黑杨植株不同时间后,不同组织部位中PnHIPPs基因的表达模式发生改变。本研究为鉴定木本模式植物杨树HIPPs蛋白在维持铜离子稳态过程中发挥的作用提供了参考依据。

关键词：杨树 HIPPs蛋白生物信息学分析铜胁迫基因表达

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杉木幼龄期良种与密度控制的生长动态效应

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江西农业大学学报 2020年第4期42卷 778-787页

作者：李晓燕段爱国张建国赵世荣冯随起中国林业科学研究院林业研究所/国家林业和草原局林木培育重点实验室/林木遗传育种国家重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 福建省邵武卫闽国有林场福建邵武354006

【目的】探讨杉木良种和初植密度2个控制因子对杉木幼龄期林分生长的影响及其互作效应,旨在为杉木良种与初植密度的优化配置提供理论依据,以切实通过良种良法的有效结合提升杉木人工林产量与质量。【方法】采用随机区组试验设计,在福建... 详细信息

【目的】探讨杉木良种和初植密度2个控制因子对杉木幼龄期林分生长的影响及其互作效应,旨在为杉木良种与初植密度的优化配置提供理论依据,以切实通过良种良法的有效结合提升杉木人工林产量与质量。【方法】采用随机区组试验设计,在福建省邵武卫闽国有林场营造杉木良种和初植密度互作试验林,根据8年的逐年定位观测资料,分析杉木良种和密度控制的林分生长动态效应。【结果】林分生长前期密度效应差异不显著,后期随林龄增长各密度间树高、胸径、冠幅、单株材积生长差异逐渐增大,一般到7~8 a时,各密度间生长差异达显著性水平;整个调查期间,各密度间蓄积量生长差异达极显著水平。在6 a时,冠幅生长的良种效应差异达显著性水平,8 a时,胸径生长的良种效应差异达显著性水平;整个调查期间,树高、单株材积和蓄积量生长的良种效应未达显著性水平。初植密度与良种水平交互作用对幼龄期林分生长未达显著性水平。【结论】良种和初植密度对杉木幼龄期林分生长的影响具有叠加效应,且随林龄增长,这种叠加效应愈明显,8 a时,林分平均单株材积在3世代良种和初植密度为1667株/hm^2这一组合下最大,为0.0372 m^3,比其他组合至少高27.96%;而蓄积量在3世代良种和初植密度为6667株/hm^2这一组合下最大,为75.3865 m^3/hm^2,比其他组合至少高2.91%。

关键词：杉木幼龄林良种初植密度互作效应

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茶籽象ATP合成酶基因在不同海拔选择压力下的遗传分化及结构变异

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林业科学 2019年第6期55卷 65-73页

作者：张守科方林鑫刘亚宁王毅张威舒金平张亚波汪阳东王浩杰中国林业科学研究院亚热带林业研究所杭州311400 林木遗传育种国家重点实验室北京100091 南京林业大学南京210037 青田县林业局青田323900

【目的】基于不同地区茶籽象线粒体ATP合成酶基因遗传分化及结构变异,研究环境压力尤其是海拔对茶籽象不同地理种群遗传多样性及系统发育关系的影响,探讨ATP合成酶基因在适应环境压力中碱基及氨基酸序列结构变化规律,为茶籽象防控提供... 详细信息

【目的】基于不同地区茶籽象线粒体ATP合成酶基因遗传分化及结构变异,研究环境压力尤其是海拔对茶籽象不同地理种群遗传多样性及系统发育关系的影响,探讨ATP合成酶基因在适应环境压力中碱基及氨基酸序列结构变化规律,为茶籽象防控提供理论依据。【方法】采集不同地理海拔油茶产区的茶籽象种群,设计ATP合成酶基因特异性引物,PCR扩增获取ATP基因,基于ATP基因应用相关分析软件分析碱基序列遗传多样性及系统发育关系,分析氨基酸序列结构差异及氨基酸使用频率。【结果】获得32个单倍型(NCBI: MH560360—MH560391),其中存在5个共享单倍型,包含个体数2~36不等;茶籽象各地理种群遗传多样性分化无明显规律(核酸多样性π为0.000 86 ~ 0.048 03),茶籽象种群扩张不明显(Tajima’s D < 0,P > 0.05;Fu’s Fs > 0);依据地理海拔,茶籽象种群可显著聚为低海拔和高海拔2个分支,2个分支间受到显著的环境正选择(选择系数:高海拔ω=1.65,低海拔ω=2.26,LRTP<0.001),分化明显( F st =0.374,P < 0.001);低海拔分支 ATP[STBX]8[STBZ]编码解氨基酸序列(36个保守位点)较高海拔分支(27个保守位点)更为保守,且高海拔分支酸性氨基酸使用率较高,这可能与昆虫为适应高海拔而增加蛋白稳定性、提高氧结合效率以及氧化呼吸效率有关。【结论】茶籽象种群ATP合成酶基因分化程度不高,但存在对海拔明显的适应性进化。

关键词：茶籽象 ATP合成酶基因遗传分化系统发育海拔选择压力

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江苏省植物细胞遗传学研究回顾与展望

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遗传 2021年第5期43卷 397-424页

作者：王海燕龚志云蒋甲福周宝良娄群峰曹清河席梦利陈佩度顾铭洪张天真陈发棣陈劲枫李宗芸王秀娥南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室/JCIC-MCP南京210095 扬州大学农学院江苏省作物遗传生理重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室扬州225009 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所徐州221131 南京林业大学林学院南京210037 江苏师范大学生命科学学院徐州221116 浙江大学农业与生物技术学院杭州310058

20世纪初“遗传的染色体学说”的提出和证明标志着细胞遗传学交叉学科建立,伴随相关学科的发展,20世纪60年代末期细胞遗传学又与分子遗传学相结合,建立发展了分子细胞遗传学交叉学科。分子细胞遗传学以DNA分子原位杂交技术为核心,不断... 详细信息

20世纪初“遗传的染色体学说”的提出和证明标志着细胞遗传学交叉学科建立,伴随相关学科的发展,20世纪60年代末期细胞遗传学又与分子遗传学相结合,建立发展了分子细胞遗传学交叉学科。分子细胞遗传学以DNA分子原位杂交技术为核心,不断拓展应用领域,为生命科学研究提供了直观、高效的技术手段。原位杂交技术与基因组、细胞生物学等技术结合,被广泛应用于人类、动物、植物的起源、进化、驯化等基础研究和远缘杂交、染色体工程等应用研究。通过形象地展示DNA、RNA、蛋白质在细胞中的实际位置,揭示DNA序列之间的实际位置和顺序、亲缘物种间的进化关系和结构重排、基因组拼接序列的质量、转录水平RNA和翻译水平蛋白质的位置和数量变化等。江苏省遗传学会会员单位南京农业大学、扬州大学、南京林业大学、江苏师范大学、徐淮地区农科院等自20世纪中期开展细胞遗传学理论技术研究,伴随学科发展不断创新,建立了较完善的分子细胞遗传技术体系,并成功应用于开展植物系统进化、远缘杂交、染色体工程、基因组学等研究,取得了一批研究成果。本文将主要综述江苏省在该领域取得的重要进展,并展望未来发展方向。

关键词：江苏省遗传学会分子细胞遗传学 DNA分子原位杂交染色体工程基因组学

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刚毛柽柳S-腺苷甲硫氨酸合成酶(ThSAMS)基因的克隆及表达分析

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植物研究 2019年第1期39卷 113-122页

作者：张悦赵鑫侯峥王艳敏王玉成王超东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 黑龙江省林业科学研究所哈尔滨150081

通过对刚毛柽柳转录组分析,克隆获得了一条与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性高的基因,命名为ThSAMS。序列分析结果表明:ThSASM基因全长cDNA为1185bp,编码394个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为97.85kDa,理论等电点为5.02。通过生... 详细信息

通过对刚毛柽柳转录组分析,克隆获得了一条与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性高的基因,命名为ThSAMS。序列分析结果表明:ThSASM基因全长cDNA为1185bp,编码394个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为97.85kDa,理论等电点为5.02。通过生物信息学分析表明,ThSASM基因编码的氨基酸与其他物种SAMS基因编码的氨基酸具有很高的同源性,其中与枣的同源性最高,达95%。实时荧光定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT-PCR)分析表明,ThSASM表达受NaCl、聚乙二醇(PEG)和ABA处理做出应答,暗示ThSASM可能参与了刚毛柽柳对盐和干旱的胁迫应答,为进一步研究SAMS基因在植物胁迫应答中的功能及作用机制提供了参考依据。

关键词：刚毛柽柳 ThSAMS基因 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因表达

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