检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报（自然科学版） 2021年第1期45卷 63-69页

作者：臧明月李璇方炎明南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037

【目的】利用SSR分子标记,对白栎天然居群进行遗传多样性分析,为其种质资源的合理开发与保护提供指导。【方法】采用筛选出的SSR引物对3个群体进行遗传多样性与遗传结构研究,并计算遗传参数;基于个体间的遗传距离进行主成分分析,运用Gen... 详细信息

【目的】利用SSR分子标记,对白栎天然居群进行遗传多样性分析,为其种质资源的合理开发与保护提供指导。【方法】采用筛选出的SSR引物对3个群体进行遗传多样性与遗传结构研究,并计算遗传参数;基于个体间的遗传距离进行主成分分析,运用GenAlEx 6.5进行遗传距离与地理距离的相关性Mantel检验,软件Arlequin用于分子方差分析,聚类分析采用MEGA 7中的UPGMA法;同时,使用Structure软件中的贝叶斯聚类算法探究群体遗传结构。【结果】6对SSR引物共检测到75个等位基因,平均有效等位基因数、观察杂合度和期望杂合度分别为7.16、0.70和0.80,Shannon信息指数为2.05。AMOVA表明,群体内部的分子变异率高达97.41%,而群体之间的遗传变异仅为2.59%。黄山(YM)与天目山(TM)群体间的基因流为12.908,显著高于其他群体之间的交流水平,而二者间有着最近的遗传距离为0.272。贝叶斯法与UPGMA法聚类结果一致,表明来自YM与TM的个体亲缘关系更近。【结论】白栎具有较高的遗传多样性水平,且不同居群间的水平相当。YM和TM居群的基因交流最为密切,遗传分化不明显。白栎绝大部分遗传变异来源于群体内部,对于该物种的保护应减少不合理的人为开发行为,以原地保护为主,同时开展种质资源的收集与遗传改良工作。

关键词：白栎 SSR 遗传多样性遗传结构

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基于基因组学的栎树生物学研究进展

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南京林业大学学报（自然科学版） 2022年第6期46卷 64-72页

作者：方炎明朱福远李垚李璇南京林业大学南方现代林业协同创新中心国家林业和草原局亚热带森林生物多样性保护重点实验室南京林业大学生物与环境学院江苏南京210037

栎树(Quercus spp.)是北半球重要的经济与生态树种。夏栎(***)、加州白栎(***)、麻栎(***)等树种基因组的公布,对栎树生物学研究产生了深刻的影响。近5年来,栎树生物学出现了包括系统进化与物种鉴定、基因渐渗与适应进化、景观基因组学... 详细信息

栎树(Quercus spp.)是北半球重要的经济与生态树种。夏栎(***)、加州白栎(***)、麻栎(***)等树种基因组的公布,对栎树生物学研究产生了深刻的影响。近5年来,栎树生物学出现了包括系统进化与物种鉴定、基因渐渗与适应进化、景观基因组学与生态保育、生物共存与互作机制、次生代谢与生长发育、DNA甲基化与表观遗传调控及基因与长寿机制等方面的研究热点。虽然基于基因组学的栎树生物学若干研究前沿已经形成,但尚处于起步阶段,笔者预期未来会向4个方面深入:①强调栎树基因组资源的深度应用。应用景观基因组学途径,探究栎树的杂交渐渗与适应进化;联合基因组、转录组、蛋白组等多组学技术,探究栎树生长发育与胁迫响应过程中的基因调控网络与信号通路;优化体细胞发生和遗传转化体系,攻克栎树遗传改良和基因资源开发技术瓶颈。②促进栎树研究体系的广度拓展。随着壳斗科其他树种全基因组序列的公布,基于从分子到群落的不同生物层次的模式系统,将对欧亚大陆和北美不同区域的栎树,包括白栎组、红栎组、冬青栎组、麻栎组等不同栎树类群,以及壳斗科其他属树种基因组生物学研究产生深远影响。③关注栎树资源利用的遗传与发育主题。用栎树基因组资源对其结构的、代谢的和农艺性状的差异及其优化加以解析,全基因组关联研究(GWAS)也将应用于栎树,从而为阐释木材发育和木栓形成的机制奠定基础。④聚焦栎林保育的生态与进化主题。在全球气候变化背景下,通过增加耐受胁迫的基因型,以缓解气候变化对森林生态系统的影响。同时维持和保护栎树在自然生态系统中的生态与进化过程,阐明栎树多样性、迁移与适应、趋异与趋同生态适应等方面进化成功的机制。

关键词：栎树基因组基因渐渗景观基因组学资源保育

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中国东部地区马尾松与黄山松群落分类及群落结构和物种多样性特征

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南京林业大学学报（自然科学版） 2024年第1期48卷 47-58页

作者：范明阳胡萌杨园方炎明南京林业大学生命科学学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037

【目的】马尾松(Pinus massoniana)是中国亚热带地区主要的针叶树种,黄山松(***)是中国东部亚热带中山地区的主要建群种,两个物种在水平区域内分布基本重合,但垂直分布差异明显。深入了解马尾松林与黄山松林的分布格局,可以为科学管理... 详细信息

【目的】马尾松(Pinus massoniana)是中国亚热带地区主要的针叶树种,黄山松(***)是中国东部亚热带中山地区的主要建群种,两个物种在水平区域内分布基本重合,但垂直分布差异明显。深入了解马尾松林与黄山松林的分布格局,可以为科学管理保护马尾松和黄山松森林资源提供理论依据。【方法】基于中国亚热带东部地区8个典型马尾松林与黄山松林分布地域开展植被调查,采用非度量多维标度分析(NMDS)和多元回归树(nultivariate regression trees,MRT)探讨两种松林群落结构的差异及主要影响因子,采用线性混合效应模型定量分析各物种多样性指标对非生物因子的响应;在遵从《中国植被志》研编规范的基础上,对马尾松林与黄山松林进行初步的数量分类。【结果】马尾松群落与黄山松群落结构存在明显差异,主要影响因子为海拔;年均气温对两种群落物种丰富度影响显著,对两种群落总体物种丰富度影响最显著的因子是年均降水量,海拔对两种群落总体的均匀度产生显著的影响;对马尾松林与黄山松林进行初步植被分类,马尾松林被划分为6个群丛,黄山松林被划分为5个群丛。【结论】海拔变化塑造了中国东部地区马尾松林与黄山松林群落结构的差异,并直接或间接地影响两种群落的物种多样性。通过植被分类可以了解两种松林植被类型的多样化,并为后续两种松林分类后续工作提供参考。

关键词：马尾松林黄山松林群落结构物种多样性植被分类中国东部地区

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银缕梅SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

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分子植物育种 2018年第16期16卷 5340-5346页

作者：张丽芳方炎明南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业局重点实验室南京210037

为有效利用SSR-PCR技术分析国家一级重点保护植物银缕梅的遗传多样性,采用正交试验设计L16(43),即3因素4水平,对影响SSR-PCR扩增结果的因素(引物,模板DNA浓度和循环数)进行优化筛选,并在此基础上对聚丙烯酰胺凝胶上样量进行优化,建立了... 详细信息

为有效利用SSR-PCR技术分析国家一级重点保护植物银缕梅的遗传多样性,采用正交试验设计L16(43),即3因素4水平,对影响SSR-PCR扩增结果的因素(引物,模板DNA浓度和循环数)进行优化筛选,并在此基础上对聚丙烯酰胺凝胶上样量进行优化,建立了适合银缕梅的最佳SSR-PCR反应体系:10μL 2×PCR Mix、40 ng模板DNA、10μmol/L引物,其余用dd H_2O补齐至20μL。PCR扩增程序为:95℃预变性15 min,95℃变性30 s,57.5℃退火1.5 min,72℃延伸1 min,30个循环,循环结束后,60℃延伸30 min,扩增产物4℃保存。聚丙烯酰胺凝胶电泳上样量以1.5~2.0μL为最佳。利用优化后体系进行引物筛选,从18对引物中筛选出11对具有多态性引物,说明该反应体系具有良好的稳定性。该体系的建立可以为今后利用SSR标记对银缕梅遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供基础。

关键词：银缕梅正交设计 SSR-PCR 最佳上样量引物筛选

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21世纪以来蕨类植物研究论文的发表情况:基于Web of Science的数据统计

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生物多样性 2019年第11期27卷 1245-1250页

作者：张开梅沈羽周晓丽方炎明南京林业大学南方现代林业协同创新中心生物与环境学院亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室南京210037 国家环境保护武夷山生态环境科学观测研究站南京210037

蕨类植物是地球上起源最为古老的维管植物,在陆生植物演化中具有重要意义。本文通过Web of Science核心数据库(Core Collection)对目前所有关于"fern"、"lycophyte"、"pteridophyte"、"pteridophyta... 详细信息

蕨类植物是地球上起源最为古老的维管植物,在陆生植物演化中具有重要意义。本文通过Web of Science核心数据库(Core Collection)对目前所有关于"fern"、"lycophyte"、"pteridophyte"、"pteridophyta"等的科研论文进行了分析。结果表明:(1) 2000年后,蕨类植物论文数量增加迅速,特别是2006年以来增加显著,现在年均已突破600篇;(2)2010年以来的以蕨类植物为研究材料和对象的学科和研究领域变得越来越多元化,多学科结合和交叉的研究方向成为新趋势;(3)中国正在成为蕨类植物研究的热点国家并且成果显著;(4)中国蕨类植物研究在快速发展的同时也出现了各研究机构之间的发展不同步。期望本论文能给蕨类植物的相关研究提供新的方向,为中国蕨类植物工作者提供借鉴。

关键词：蕨类植物 Web of Science 数据分析文献计量分析

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重要林木樟科植物全基因组测序研究进展

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植物学报 2024年第2期59卷 302-318页

作者：杨智杨永南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037 南京林业大学国家林业和草原局亚热带森林生物多样性保护重点实验室南京210037

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因... 详细信息

近年来,随着测序技术的革新、测序成本的降低和生物信息学软件的开发,植物全基因组研究蓬勃发展。樟科(Lauraceae)隶属被子植物木兰类,泛热带分布,物种多样性高,其中很多物种具有重要的经济和生态价值,目前已发表包括8个物种的13个基因组。该文从樟科全基因组研究现状、基因组特征、起源和进化以及功能基因和基因家族4个方面进行综述,着重介绍基于组学数据的木兰类及樟科的系统发生、樟科经历的多倍化事件以及与樟科花器官进化和代谢产物相关的基因鉴定。结合研究现状展望了樟科基因组研究的发展方向,建议通过增加测序基因组分支的代表性并关注具有特殊价值的物种,及研究物种特异性功能基因以加深对该家族基因功能和进化的理解。

关键词：樟科演化核基因组功能基因系统发生

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分子标记技术在樱属植物研究中的应用进展

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世界林业研究 2018年第6期31卷 16-24页

作者：朱弘伊贤贵朱淑霞王华辰王贤荣南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业局重点实验室

蔷薇科樱属植物地理分布广泛,种类繁多,具有重要的生态、观赏、经济和文化价值。文中介绍了近年来国内外有关樱属分子标记技术的报道,着重综述分子遗传多样性、分子系统学和亲缘地理学3个方面的研究进展,总结研究现状并提出未来研究展望... 详细信息

蔷薇科樱属植物地理分布广泛,种类繁多,具有重要的生态、观赏、经济和文化价值。文中介绍了近年来国内外有关樱属分子标记技术的报道,着重综述分子遗传多样性、分子系统学和亲缘地理学3个方面的研究进展,总结研究现状并提出未来研究展望,以期为今后开展我国樱属种质资源分类鉴定、遗传育种、开发利用等研究提供思路与借鉴。

关键词：樱属种质资源分类界定分子标记系统进化开发利用

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黄山常绿阔叶林甜槠群落优势种种间关联分析

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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第4期43卷 77-84页

作者：许宝坤许晓岗李垚李小东陈水飞丁晖蒋晓辉苟凌晨方炎明南京林业大学生物与环境学院南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037 生态环境部南京环境科学研究所自然保护与生物多样性研究中心武夷山国家生物多样性综合观测站国家环境保护武夷山生态环境科学观测研究站国家环境保护生物安全重点实验室江苏南京210042 黄山风景区管理委员会园林局安徽黄山245800

【目的】探讨黄山常绿阔叶林的物种组成、群落结构以及种间关联性。【方法】以黄山常绿阔叶林10.24 hm^2动态监测样地为对象,在样地调查基础上,通过重要值排序确定了14个优势种,基于2×2列联表,采用方差比率法、χ^2检验、联结系数(... 详细信息

【目的】探讨黄山常绿阔叶林的物种组成、群落结构以及种间关联性。【方法】以黄山常绿阔叶林10.24 hm^2动态监测样地为对象,在样地调查基础上,通过重要值排序确定了14个优势种,基于2×2列联表,采用方差比率法、χ^2检验、联结系数(AC)和Pearson相关系数分析优势种在3个不同径级下的种间关联和相关关系。【结果】方差比率法检验显示,优势种在整体、中径级尺度呈相对独立关系,小径级尺度呈显著正关联,大径级尺度呈显著负关联;χ^2检验显示,种对间呈显著关联与极显著关联,对数之和在整体、小、中、大径级下依次为29、29、30、25;AC联结系数检验显示,正负关联比在整体、小、中、大径级下依次为0.915、1.263、1.023、0.717;Pearson相关系数检验显示,正负相关比在整体、小、中、大径级下依次为0.896、1.275、0.936、0.542。【结论】黄山常绿阔叶林不同径级下的种对间关联关系存在明显差异;种间正负关联比随着径级变大而减小,样地内种间竞争随着径级变大而增多及增强。

关键词：亚热带常绿阔叶林森林动态样地径级优势种联结系数甜槠黄山地区

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福建省薹草属植物新记录

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植物资源与环境学报 2023年第5期32卷 98-100页

作者：宋强孟德昌陈水飞郑笑李蒙丁晖段一凡南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学生物与环境学院亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室江苏南京210037 生态环境部南京环境科学研究所国家环境保护武夷山生态环境科学观测研究站江苏南京210042

经过野外调查和标本鉴定,发现了福建省薹草属(Carex Linn.)植物分布新记录7种(变种),即长穗薹草(*** Hayata)、灰帽薹草(原变种)(*** *** Franch.)、具芒灰帽薹草(*** *** Ohwi)、三阳薹草(*** *** Savat.)、肿胀果薹草(***(Kük.)O... 详细信息

经过野外调查和标本鉴定,发现了福建省薹草属(Carex Linn.)植物分布新记录7种(变种),即长穗薹草(*** Hayata)、灰帽薹草(原变种)(*** *** Franch.)、具芒灰帽薹草(*** *** Ohwi)、三阳薹草(*** *** Savat.)、肿胀果薹草(***(Kük.)Ohwi)、点囊薹草(*** ***)和反折果薹草(*** Kük.),均发现于武夷山国家公园福建片区。凭证标本保存于南京林业大学树木标本室(NF)。

关键词：福建省武夷山薹草属新记录

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红栎树种资源与园林应用前景

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西部林业科学 2020年第2期49卷 10-16页

作者：尤禄祥张夕飞田西龙李垚陈军方炎明南京林业大学南方现代林业协同创新中心亚热带森林生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室生物与环境学院江苏南京210037 淮安市洪泽区林果工作站江苏淮安223100

红栎类树种原产于美洲,因生长快速、适应性强、秋色优美,被广泛引种至我国多省,在国内彩叶苗木市场占有重要地位。为了拓展对红栎树种资源的认识,本文综述了该类树种的分类地位、资源分布、生态适应性和潜在应用价值等。红栎属于栎亚属,... 详细信息

红栎类树种原产于美洲,因生长快速、适应性强、秋色优美,被广泛引种至我国多省,在国内彩叶苗木市场占有重要地位。为了拓展对红栎树种资源的认识,本文综述了该类树种的分类地位、资源分布、生态适应性和潜在应用价值等。红栎属于栎亚属,共124种;资源分布于美国、墨西哥、中美洲和哥伦比亚等地;在重叠分布区,共存栎树常常发生种间杂交;园林应用引种主要从适生性、观赏性和木材的可利用性等方面考虑。研究综述可为红栎的科学引种驯化提供合理建议。

关键词：红栎栎属园林应用资源分布彩叶树种

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