检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报（自然科学版） 2020年第6期44卷 27-32页

作者：刘大伟侯森林周用武费宜玲何建南京森林警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室国家林业和草原局森林公安司法鉴定中心江苏南京210023

【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank... 详细信息

【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树。【结果】在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种。其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高。对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%。对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%。两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔。COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支。【结论】基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定。在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险。

关键词：偶蹄目 DNA条形码物种鉴定 COI Cyt b 基因片段

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银缕梅MADS-box家族基因PsuA P1的克隆、生物信息学表达分析

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分子植物育种 2021年第1期19卷 72-79页

作者：陈云霞薛晓明南程慧蒋敬郭海涛南京森林警察学院南京210023 南京森林警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023

本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个AP1-like基因的c DNA全长序列,命名为Psu AP1。利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码... 详细信息

本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个AP1-like基因的c DNA全长序列,命名为Psu AP1。利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码248个氨基酸,分子质量约28.62 k D,理论等电点为9.84,是一种不稳定亲水蛋白。保守结构域分析表明该基因属于MADS-box家族基因;序列比对分析显示其氨基酸序列与连香树相似性最高,达78.57%,进化树聚类分析也表明Psu AP1与连香树的氨基酸亲缘关系最近。亚细胞定位分析显示该蛋白定位于细胞核。二级结构中同时含有琢-螺旋、延伸链和无规则卷曲结构,分别占比47.18%、11.29%、41.53%。荧光实时定量PCR分析表明,Psu AP1基因在花及果实中均有大量表达,推测其与花的发育以及果实的成熟相关。Psu AP1基因的克隆以及表达分析使银缕梅开花调控机理的研究取得了新的突破,为该基因功能的进一步深入研究提供了实验材料以及理论基础。

关键词：银缕梅(Parrotia subaequalis) MADS-box 基因克隆序列分析表达分析

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浙江长兴金钱松群落优势种生态位分析

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植物资源与环境学报 2020年第5期29卷 58-65页

作者：谢春平刘大伟南程慧李浩黄晨杨张健南京森林警察学院刑事科学技术学院江苏南京210023 南京森林警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室江苏南京210023

为了解浙江长兴金钱松〔Pseudolarix amabilis(***)Rehd.〕群落内优势种的生态位特征,以21个样方内各优势种的重要值为基础,对群落内各优势种的生态位宽度指数(包括Levins指数和Shannon-Wiener指数)、Pianka生态位重叠指数和Schoener生... 详细信息

为了解浙江长兴金钱松〔Pseudolarix amabilis(***)Rehd.〕群落内优势种的生态位特征,以21个样方内各优势种的重要值为基础,对群落内各优势种的生态位宽度指数(包括Levins指数和Shannon-Wiener指数)、Pianka生态位重叠指数和Schoener生态位相似比例进行了分析。结果表明:供试21个样方内共有木本植物37科56属74种,包含18个优势种,其中,水竹(Phyllostachys heteroclada Oliver)、金钱松和毛竹〔Phyllostachys edulis(Carr.)***.〕的总体重要值排在前3位,分别为27.0%、13.8%和10.2%。金钱松、水竹和山胡椒〔Lindera glauca(*** Zucc.)Bl.〕的Levins指数和Shannon-Wiener指数排在前3位,其Levins指数分别为15.69、10.05和8.83,Shannon-Wiener指数分别为2.87、2.35和2.24;而青榨槭(Acer davidii Franch.)、茶条槭(Acer ginnala Maxim.)和枫香树(Liquidambar formosana Hance)的Levins指数和Shannon-Wiener指数均较低。在该群落优势种组成的153个种对中,26个种对的Pianka生态位重叠指数在0.5及以上,占种对总数的17.0%;6个种对的Schoener生态位相似比例在0.5以上,占种对总数的3.9%。金钱松与7个优势种的Pianka生态位重叠指数在0.5以上,仅与2个优势种的Pianka生态位重叠指数在0.3以下;其与2个优势种的Schoener生态位相似比例在0.5以上,与8个优势种的Schoener生态位相似比例在0.3以下。综上所述,浙江长兴金钱松群落内多数优势种间的生态位重叠水平和生态位相似性较低,但金钱松与其他优势种的生态位重叠水平相对较高。另外,水竹对金钱松种群的发展存在潜在威胁。

关键词：金钱松优势种重要值生态位宽度生态位重叠生态位相似性

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江苏省发现白化画眉

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野生动物学报 2020年第1期41卷 248-251页

作者：刘大伟刘宏毅侯森林南京森林警察学院南京210023 野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023 南京林业大学南京210037

2018年8月,在江苏省连云港市花果山区玉女峰附近发现一例画眉白化个体。该个体完全白化,其体长、嘴峰长、嘴裂长、翼长、跗蹠长、尾长、趾连爪长均在正常个体参数范围内。这为进一步对白化鸟类的生理生态研究提供科学依据。

关键词：江苏白化画眉

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基于机器学习鸟声识别算法研究进展

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生物多样性 2023年第11期31卷 164-189页

作者：申小虎朱翔宇史洪飞王传之江苏警官学院刑事科学技术系南京210031 国家林业和草原局野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023 科大讯飞科技有限公司合肥230088

监测生态系统中鸟类多样性的状态和趋势是一项重大挑战,需要广泛适用的基于机器学习的鸟鸣识别算法。为准确把握基于机器学习的鸟声识别方法的研究现状与发展趋势,本文介绍了鸟鸣识别任务的基本概念,并从模型结构设计角度对基于机器学... 详细信息

监测生态系统中鸟类多样性的状态和趋势是一项重大挑战,需要广泛适用的基于机器学习的鸟鸣识别算法。为准确把握基于机器学习的鸟声识别方法的研究现状与发展趋势,本文介绍了鸟鸣识别任务的基本概念,并从模型结构设计角度对基于机器学习的鸟鸣识别算法进行概述。鉴于基于机器学习的鸟鸣识别技术的跨学科性质,根据研究方向将算法分为:概率模型(probabilistic model)、模板匹配(template matching)、时序分析(time series analysis)、迁移学习(transfer learning)、数据融合(data fusion)、集成学习(ensemble learning)、度量学习(metric learning)和无监督聚类(unsupervised clustering)的鸟鸣识别算法。本文回顾了这些方法在完成鸟声识别任务时的技术脉络,以及这些算法的特点和局限性,并比较了它们在鸟鸣识别方面的有效性。本文还讨论了常用的标准化鸟声开源数据集和评估指标。最后,本文指出当前方法所面临的挑战和该领域潜在的未来研究方向。本综述旨在为从事鸟声识别研究的学者和开发人员提供一个全面的参考框架,以便更好地理解现有技术和潜在发展趋势。

关键词：鸟声识别机器学习深度学习鸟类多样性鸟声数据集评估指标

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白鹭和大白鹭羽毛显微结构观察

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南京林业大学学报（自然科学版） 2022年第1期46卷 156-162页

作者：侯森林费宜玲刘大伟张宁南京森林警察学院刑事科学技术学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室江苏南京210023 国家林业和草原局森林公安司法鉴定中心江苏南京210023

【目的】探讨鸟类羽毛微观结构的差异,并据此鉴别鸟类。【方法】选取白鹭(Egretta garzetta)和大白鹭(***)的飞羽、胸羽、尾羽及蓑羽4类羽毛作为研究对象,利用扫描电镜观察4类羽毛的羽小钩、腹齿及纤毛等微观结构的数量,利用SPSS 18.0... 详细信息

【目的】探讨鸟类羽毛微观结构的差异,并据此鉴别鸟类。【方法】选取白鹭(Egretta garzetta)和大白鹭(***)的飞羽、胸羽、尾羽及蓑羽4类羽毛作为研究对象,利用扫描电镜观察4类羽毛的羽小钩、腹齿及纤毛等微观结构的数量,利用SPSS 18.0对所观察的数据进行分析比较。【结果】飞羽中除腹齿数外,有钩羽小枝基柄长、羽小钩数、纤毛数以及无钩羽小枝基柄长在白鹭和大白鹭间均存在极显著差异;胸羽和尾羽有钩羽小枝的基柄长、腹齿数、羽小钩数、纤毛数以及无钩羽小枝的基柄长和腹齿数在白鹭和大白鹭间均存在显著或极显著差异;蓑羽纤毛数和基柄长在白鹭和大白鹭间存在极显著差异。【结论】除飞羽的腹齿外,所选的其他指标均可为白鹭和大白鹭的鉴别提供参考。

关键词：白鹭大白鹭羽毛显微结构

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CITES监管植物习志野叶绿体基因组结构特征及系统发育分析

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种子 2024年第3期43卷 18-25,F0002页

作者：陈云霞南程慧吴显坤黄娅琳薛晓明南京警察学院刑事科学技术学院南京210023 南京警察学院/野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023

利用二代测序技术Illumina平台对CITES附录监管物种习志野(Tephrocactus geometricus)进行叶绿体全基因组测序与组装,并对其基因组结构特征及系统进化关系进行分析。结果表明,习志野叶绿体基因组具备典型的环状四分体结构,全长116183 bp... 详细信息

利用二代测序技术Illumina平台对CITES附录监管物种习志野(Tephrocactus geometricus)进行叶绿体全基因组测序与组装,并对其基因组结构特征及系统进化关系进行分析。结果表明,习志野叶绿体基因组具备典型的环状四分体结构,全长116183 bp,包含72个蛋白编码基因、6个rRNA基因和30个tRNA基因。习志野叶绿体基因组共编码16119个密码子,编码亮氨酸(Leu)的最多;共发现微卫星位点259个,其中最多的是单核苷酸重复序列186个。采用ML法构建系统进化树,习志野与巨人柱属的巨人柱(Carnegiea gigantea)亲缘关系最近。本研究为习志野的分子标记开发、系统发育关系研究、叶绿体转化技术、濒危机制的解析等提供了基础数据参考,同时也丰富了仙人掌科植物的叶绿体基因组遗传信息。

关键词：习志野叶绿体基因组结构特征系统进化

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黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组全序列分析及系统进化

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基因组学与应用生物学 2024年第6期43卷 1066-1077页

作者：陈云霞黄娅琳侯森林周用武南京警察学院刑事科学技术学院南京210023 南京警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023

黄颈亚马逊鹦鹉(Amazona auropalliata)属于《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录Ⅱ监管物种。为了更好地了解黄颈亚马逊鹦鹉的起源、进化以及在鹦形目中的系统发育地位,本研究使用一代直接测序法获得了黄颈亚马逊鹦鹉的线粒体基因组序... 详细信息

黄颈亚马逊鹦鹉(Amazona auropalliata)属于《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录Ⅱ监管物种。为了更好地了解黄颈亚马逊鹦鹉的起源、进化以及在鹦形目中的系统发育地位,本研究使用一代直接测序法获得了黄颈亚马逊鹦鹉的线粒体基因组序列,全长18679 bp,并针对全序列进行了结构分析。结果表明,黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组中碱基含量具有明显的AT偏好性,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA编码基因和2个rRNA编码基因,除了nad6在L链上以外,其他的蛋白编码基因都在H链上。黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组有基因重叠现象且排列紧密,重叠序列长度范围从1 bp到6 bp,总长度共17 bp,共计8处;基因间隔序列的长度范围从1 bp到40 bp,总长度共154 bp,共计24处,有7处基因排列无间隙。基于线粒体基因序列分析发现,除了tRNA中trnC、trnF、trnG和trnH缺少反密码子环,trnP和trnQ缺少TΨC环,trnL-Ⅰ、trnS-Ⅱ和trnW呈短棒状,其他tRNA具有经典的三叶草二级结构。采用最大似然法(maximum likelihood method,ML)和近邻相接法(neighbor-joining method,NJ)对40种鹦形目物种线粒体全基因组序列构建系统进化树,结果表明黄颈亚马逊鹦鹉与黄冠亚马逊鹦鹉(Amazona ochrocephala)的亲缘关系最近。

关键词：黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组结构特征系统进化

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不同城市居民头发中碳、氮稳定同位素比值特征研究

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质谱学报 2021年第6期42卷 1183-1192页

作者：于子洋梅宏成朱军杨瑞琴胡灿刘昌景郭洪玲王萍郑继利权养科王桂强中国人民公安大学北京100038 公安部物证鉴定中心北京100038 南京森林警察学院国家林业局森林公安司法鉴定中心野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室江苏南京210023

头发中蕴含了个体的饮食情况等信息,不同地区居民饮食习惯不同,其头发中碳(C)、氮(N)稳定同位素比值也具有一定的差异性。本研究采集了华中、华东、华南、西南和西北地区8个城市常住居民的头发样本,利用元素分析仪-稳定同位素比质谱(EA-... 详细信息

头发中蕴含了个体的饮食情况等信息,不同地区居民饮食习惯不同,其头发中碳(C)、氮(N)稳定同位素比值也具有一定的差异性。本研究采集了华中、华东、华南、西南和西北地区8个城市常住居民的头发样本,利用元素分析仪-稳定同位素比质谱(EA-IRMS)进行C、N稳定同位素比值检测。结果表明:部分城市间居民头发中C、N稳定同位素比值存在显著差异。居民头发δ13 C与人均蔬菜消费量呈显著负相关,居民头发δ15 N与人均肉类消费量呈显著正相关,鱼类的大量摄入可能会提高居民头发δ15 N值。男性和女性居民头发中C、N稳定同位素比值没有显著性差异,女性居民头发δ13 C与年龄呈较弱负相关。中国与其他国家居民头发中C、N稳定同位素比值存在差异,这主要是由不同国家居民的饮食习惯不同导致的。

关键词：人头发 C、N稳定同位素比值特征

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基于Cyt b的复杂生物样本中濒危动物的快速鉴别

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基因组学与应用生物学 2021年第7期40卷 2468-2475页

作者：陈云霞薛晓明周用武费宜玲郭海涛蒋敬南京森林警察学院南京210023 国家林业局森林公安司法鉴定中心南京210023 野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室南京210023

本研究将二代高通量测序与DNA条形码技术相结合,通过人工制备多物种混合样本,以线粒体基因Cyt b为条形码,对混合样本中的动物种属进行同步鉴别,并确认濒危物种。结果表明,在属和种水平下,混合样本中物种的同步检出率均高达89%,而且灵敏... 详细信息

本研究将二代高通量测序与DNA条形码技术相结合,通过人工制备多物种混合样本,以线粒体基因Cyt b为条形码,对混合样本中的动物种属进行同步鉴别,并确认濒危物种。结果表明,在属和种水平下,混合样本中物种的同步检出率均高达89%,而且灵敏度高,低至1%含量的物种成分被检出,但是种水平的物种分辨率并不高,近50%分类匹配为非目标匹配。本研究可得出,迷你型Cyt b片段可以作为混合生物样本中动物种属同步鉴别的条形码,在属水平下的鉴别率较高。在种水平下存在高检出、低分辨率的问题,后期可以通过增加条形码长度等方法进行进一步改善。本研究利用DNA宏条形码技术对条形码Cyt b在多物种混合生物样本中鉴别濒危动物的可行性进行评估,以期能为推进DNA宏条形码方法在动植物法医鉴定领域的常规化应用奠定前期基础。

关键词： DNA条形码 DNA宏条形码高通量测序 Cyt b 物种鉴别

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