检索结果-内蒙古大学图书馆

中国病原生物学杂志 2024年第8期19卷 917-922页

作者：代禹美杜文雅乐林芝马涛王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

目的应用生物信息学方法分析预测结核分枝杆菌Rv0592基因编码蛋白Mce2D的结构和功能。方法从NCBI网站查询Rv0592基因及其编码蛋白的基本信息,通过Uniprot数据库获取Mce2D蛋白的氨基酸序列。运用ORF Finder、Protpatam、SOPMA、SWISS-M... 详细信息

目的应用生物信息学方法分析预测结核分枝杆菌Rv0592基因编码蛋白Mce2D的结构和功能。方法从NCBI网站查询Rv0592基因及其编码蛋白的基本信息,通过Uniprot数据库获取Mce2D蛋白的氨基酸序列。运用ORF Finder、Protpatam、SOPMA、SWISS-MODEL、ProtScale、Signal IP 4.1 Server、TMHMM、ProtComp、SYFPEITHI、IEDB等生物信息学软件分别对Mce2D蛋白的开放阅读框架、理化性质、二级结构、三级结构、亲疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、T细胞表位和B细胞表位等生物特征进行预测。结果 Rv0592基因全长1 527 bp,共有8个开放阅读框架,编码蛋白的氨基酸数为508个。Mce2D蛋白的等电点为5.06,总平均亲水性为-0.109,为亲水蛋白。蛋白的二级结构中无规卷曲占42.52%、α-螺旋占41.54%,含有多个T细胞表位和B细胞表位。该蛋白有一个信号肽、跨膜螺旋数为一、亚细胞定位于细胞膜。结论生物信息学预测Mce2D蛋白为含多个的B细胞和T细胞表位,可作为结核病诊断和治疗的有效靶点。

关键词：结核分枝杆菌结核免疫逃逸 Rv0592 Mce2D蛋白生物信息学分析

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lncRNA MALAT1及GAS5的多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联

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中华疾病控制杂志 2023年第5期27卷 587-592页

作者：卫美蓉王笑峰罗兵西京学院医学院基础医学教研室西安710123 青岛大学医学院基础医学院微生物学教研室青岛266021

目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)人肺腺癌转移相关的转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALATl)及生长阻滞特异性转录本5(growth arrest specific transcript 5,GAS5)基因多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关联。方法收集225例HCC患者的癌组织及220例健康体检者外周静脉血标本,提取癌组织及血标本的DNA分别当作本病例对照研究的病例组与对照组。同时利用TaqMan MGB等位基因分型试剂盒对两组病例MALAT1 rs11227209及GAS5 rs55829688位点的单核苷酸多态性(single nucleotide olymorphism,SNP)进行检测,采用SPSS 17.0软件分析实验结果。结果MALAT1 rs11227209位点基因型频率(CC、CG、GG)在病例组中分布为:46.2%、42.7%、11.1%,在对照组中分布为:50.0%、42.7%、7.3%。分别进行纯合突变基因型CC与显性模型CG+GG基因型组比较,以及纯合野生基因型GG与隐性模型CG+CC基因型组的比较,发现两组基因型分布差异无统计学意义(χ^(2)=0.636,P=0.425;χ^(2)=1.933,P=0.164)。GAS5 rs55829688基因型频率(TT、TC、CC)在病例组中的分布为:45.3%、43.6%、11.1%,在对照组中的分布为:57.7%、38.2%、4.1%。病例组CC基因型人群分布高于对照组(OR=3.459,95%CI:1.546~7.738,P=0.003)。病例组C等位基因携带频率也高于对照组(OR=1.624,95%CI:1.208~2.184,P=0.001);C等位基因为风险基因,个体携带C等位基因可以增加罹患HCC的风险(OR=1.647,95%CI:1.132~2.395,P=0.009)。遗传易感性分层分析结果显示,女性患者携带GAS5 rs55829688 CT+TT基因型可降低HCC的发病风险(OR=0.161,95%CI:0.045~0.580,P=0.005),且≥50岁人群分组中若携带该位点CT+TT基因型,则HCC发病风险也降低(OR=0.232,95%CI:0.074~0.728,P=0.012)。结论GAS5 rs55829688位点SNP与HCC的发病风险相关,携带CC基因型个体HCC的发病风险增高。同时年龄及性别和GAS5 rs55829688位点的SNP可能会共同影响HCC的发病风险。而MALAT1 rs11227209位点SNP与HCC发病风险无相关性。

关键词：肝细胞癌长链非编码RNA 人肺腺癌转移相关的转录本1 生长阻滞特异性转录本5 单核苷酸多态性易感性

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旋毛虫蛋白抑制巨噬细胞炎症反应的作用探索

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中国药理学通报 2025年第2期41卷 250-257页

作者：杨姣姣申晓荣闫欢杨勇樊卫平山西医科大学基础医学院微生物与免疫学教研室山西太原030000

目的探讨旋毛虫(trichinella spiralis,Ts)蛋白对脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导巨噬细胞株RAW264.7产生炎症反应的影响及其机制。方法通过LPS刺激RAW264.7细胞建立炎症模型,实验共分为4组:对照(negative control,NC)组、Ts组(Ts 2 mg·L^(-1))、LPS处理组(LPS 1 mg·L^(-1))、Ts+LPS组(Ts 2 mg·L^(-1)+LPS 1 mg·L^(-1))。qRT-PCR检测巨噬细胞极化分子标志物iNOS、Arg1以及炎症因子IL-1β、IL-6的表达,Western blot检测IL-1β、IL-6、BRD2蛋白表达,免疫荧光实验检测BRD2。为探索Ts蛋白抑制炎症是否通过BRD2发挥作用,我们用siRNA靶向敲低BRD2分子,再次分组实验,qRT-PCR检测 iNOS、Arg1、IL-1β、IL-6 的表达,Western blot检测IL-1β、IL-6的表达。结果与对照组相比,LPS促进iNOS、IL-1β、IL-6及BRD2的表达,Ts蛋白干预可降低iNOS、IL-1β、IL-6、BRD2的表达。敲低 BRD2 后,Ts蛋白进一步降低iNOS,而Arg1、IL-1β、IL-6水平有所上升。结论 Ts蛋白通过调控巨噬细胞极化、抑制BRD2从而缓解LPS诱导的巨噬细胞炎症反应。

关键词：旋毛虫蛋白巨噬细胞炎症 BRD2 M1/M2极化 LPS

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安徽省部分地区硬蜱蜱种鉴定及蜱携带无形体检测

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中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 302-307页

作者：赵雪 Lerato Khakhane 陆皖晴吴鑫云宋芳菲新宇张莹莹邢晨徐可瀚何茂章柳燕安徽医科大学基础医学院微生物教研室合肥230032

目的了解安徽省部分地区硬蜱蜱种种类、蜱种分布及蜱虫携带无形体情况,为蜱传无形体防控提供参考依据。方法于2023年4月至8月,在安徽省金寨县、含山县、旌德县、巢湖市等地通过布旗法和从动物身上采集硬蜱共计630只。用体式显微镜进行... 详细信息

目的了解安徽省部分地区硬蜱蜱种种类、蜱种分布及蜱虫携带无形体情况,为蜱传无形体防控提供参考依据。方法于2023年4月至8月,在安徽省金寨县、含山县、旌德县、巢湖市等地通过布旗法和从动物身上采集硬蜱共计630只。用体式显微镜进行形态学鉴定,设计蜱特异性引物进行蜱种分子生物学鉴定。设计无形体16S rRNA特异性引物用巢式PCR检测单只蜱虫无形体携带情况。利用MEGA11.0构建系统发育树并分析。结果安徽省金寨县微小扇头蜱占18.8%(18/96)、长角血蜱占81.2%(78/96),含山县、巢湖市均为长角血蜱,旌德县均为微小扇头蜱。长角血蜱携带无形体阳性率为30.9%(102/330),包括牛无形体1.8%(6/330)、嗜吞噬细胞无形体21.8%(72/330)和一种uncultured无形体7.3%(24/330),微小扇头蜱携带嗜吞噬细胞无形体13.6%(18/132)。牛无形体和未培养无形体在游离蜱检测出,在24.4%的寄生蜱和15.8%的游离蜱检测出嗜吞噬细胞无形体。结论安徽省调查县的蜱种包括长角血蜱和微小扇头蜱,长角血蜱和微小扇头蜱及其游离蜱和寄生蜱均携带无形体。

关键词：蜱蜱种鉴定长角血蜱微小扇头蜱无形体安徽省

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表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB突变株的构建和生物学特性

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微生物学报 2025年第2期65卷 629-643页

作者：尚爽婕陈卫国张晓奎朱健鹏白松陈晓婷武有聪大理大学基础医学院病原生物学综合实验室云南大理大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室云南大理

【目的】探究VraSR通过CidA-LrgAB系统调控表皮葡萄球菌的生物学功能。【方法】构建重组质粒pKOR1-ΔlrgAB,并将其转化至表皮葡萄球菌SE1457ΔvraSR突变株中。通过同源重组技术,在ΔvraSR突变株上进一步敲除lrgAB基因。利用PCR、RT-PCR... 详细信息

【目的】探究VraSR通过CidA-LrgAB系统调控表皮葡萄球菌的生物学功能。【方法】构建重组质粒pKOR1-ΔlrgAB,并将其转化至表皮葡萄球菌SE1457ΔvraSR突变株中。通过同源重组技术,在ΔvraSR突变株上进一步敲除lrgAB基因。利用PCR、RT-PCR和测序技术鉴定表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB疑似突变株,并检测其生长特性、药物敏感性、自溶能力以及生物被膜形成能力。【结果】成功构建了表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB突变株。与表皮葡萄球菌SE1457、ΔvraSR和ΔlrgAB菌株相比,ΔvraSR-lrgAB突变株生长迟缓,特别是在25℃和40℃下尤为明显(P<0.001)。该突变株的药物敏感性增强(P<0.01),自溶能力显著增强(P<0.001),生物被膜形成能力降低(P<0.01)。【结论】VraSR可能部分通过LrgAB调控表皮葡萄球菌的生长、药物敏感性、自溶能力和生物被膜的形成。

关键词： VraSR LrgAB 同源重组表皮葡萄球菌

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“三全育人”背景下成长档案袋在医学微生物学教学中的应用

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微生物学通报 2025年

作者：周晶卢曙光胡启文李明赵岩李刚胡晓梅杨裔乐率饶贤才陆军军医大学基础医学院微生物学教研室

“三全育人”背景下，加强全员全程全方位育人是课程教学改革的必然要求。本研究针对医学微生物学教学中全员协同育人效果不佳、全程促学培优成绩不显、全方位素质提升考核不全等问题，探索了利用成长档案袋贯彻落实“三全育人”理念的... 详细信息

“三全育人”背景下，加强全员全程全方位育人是课程教学改革的必然要求。本研究针对医学微生物学教学中全员协同育人效果不佳、全程促学培优成绩不显、全方位素质提升考核不全等问题，探索了利用成长档案袋贯彻落实“三全育人”理念的有效途径，阐述了成长档案袋的构建策略、应用方法和评价体系。通过问卷调查和访谈，发现学生对成长档案袋的总体认可度达90.44%，学习成绩提高，医学生核心能力提升，教师教学评价多元化，教学反思加强，“教师-辅导员-家庭”三方协同育人联系紧密，有效实现了综合育人目标。

关键词：三全育人成长档案袋医学微生物学教学改革协同育人

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结核分枝杆菌致病相关蛋白Rv2387的生物信息学分析

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第11期40卷 983-989页

作者：乐林芝马涛代禹美杜文雅王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

目的通过生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌(Mtb)Rv2387基因编码蛋白的结构和功能。方法从美国国家生物信息(NCBI)数据库中获取Rv2387基因及其编码蛋白的基本信息。利用ProtParam和ProtScale工具对蛋白质进行理化性质及亲/疏水性的预... 详细信息

目的通过生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌(Mtb)Rv2387基因编码蛋白的结构和功能。方法从美国国家生物信息(NCBI)数据库中获取Rv2387基因及其编码蛋白的基本信息。利用ProtParam和ProtScale工具对蛋白质进行理化性质及亲/疏水性的预测;通过TMHMM-2.0、SignalP-6.0、ProtCompB分析蛋白的跨膜区域、信号肽和亚细胞定位;运用NetPhos-3.1、NetNGlyc-1.0、YinOYang-1.2预测蛋白的磷酸化位点、N-糖基化位点和O-糖基化位点;选择SOPMA、SWISS-MODEL预测蛋白二、三级结构;使用IEDB数据库和SYFPEITHI预测蛋白的B细胞优势表位和T细胞优势表位;通过NCBI中自带的Blast工具对Rv2387氨基酸序列进行比对,运用MEGA 11软件构建进化树;采用STRING数据库预测分析蛋白质相互作用。结果Rv2387基因全长1254 bp,共编码417个氨基酸。预测结果显示该蛋白有8个开放阅读框。Rv2387蛋白是一种稳定的亲水性跨膜蛋白,其等电点为5.39,不含信号肽,且亚细胞定位显示在细胞膜上。该蛋白经预测具有27个氨基酸磷酸化位点,3个N-糖基化位点和41个O-糖基化位点。二级结构中α-螺旋占比为47.96%,β-转角占比为4.80%,无规则卷曲占比为35.25%,延伸链占比为11.99%;存在多个抗原表位,与Rv2423、Rv2067c、eccD2、Rv3899c和glnB多个蛋白质有相互作用。结论生物信息学预测出Rv2387为亲水性蛋白,存在多个磷酸化位点并能够与多种蛋白相互作用,该蛋白存在多个T、B细胞抗原表位,可作为Mtb的疫苗候选抗原,为Mtb治疗提供新思路。

关键词：结核分枝杆菌(Mtb) Rv2387 抗原表位生物信息学

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铁死亡在感染性疾病中的作用研究进展

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中国比较医学杂志 2024年第7期34卷 175-180页

作者：乐林芝马涛代禹美杜文雅王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

铁死亡是一种新发现的程序性细胞死亡方式,主要以细胞内铁依赖的脂质过氧化累积为主要特征。目前对铁死亡的研究主要集中在癌症领域,但越来越多的证据表明铁死亡与感染性疾病的发生有关,在新型冠状病毒肺炎、结核病及隐球菌性脑膜炎等... 详细信息

铁死亡是一种新发现的程序性细胞死亡方式,主要以细胞内铁依赖的脂质过氧化累积为主要特征。目前对铁死亡的研究主要集中在癌症领域,但越来越多的证据表明铁死亡与感染性疾病的发生有关,在新型冠状病毒肺炎、结核病及隐球菌性脑膜炎等疾病中均发现铁死亡参与。本文就铁死亡在感染性疾病中的作用作一综述,以期为铁死亡相关感染性疾病的防治提供新思路。

关键词：铁死亡病毒细菌真菌

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干扰素调控COVID-19发生及发展的研究进展

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病毒学报 2025年

作者：张遥马宏炜何进伟张芳琳延安大学延安医学院病原生物学教研室空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室

自2019年12月至今，严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致的新型冠状病毒肺炎（Coronavirus disease 2019, COVID-19）疫情蔓延全球，对人类健康和社会经济产生了严重影响。病毒感染后机体可启动以干扰素（Interferon,IFN）为核心的固有免疫应答，而IFN作为一种重要的固有免疫分子，具有抗病毒和调节免疫反应的双重作用。近期研究表明，SARS-CoV-2可通过多种机制逃逸IFN反应，且在IFN应答缺陷或机体产生IFN自身抗体的条件下，COVID-19患者重症率增加、预后差，提示IFN对COVID-19病情转归具有重要调控作用。本综述将重点讨论IFN在SARS-CoV-2感染中的作用及其对疾病预后的影响，为COVID-19的防控和治疗提供理论支持。

关键词： IFN SARS-CoV-2 COVID-19 固有免疫疾病预后

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发动蛋白及其蛋白超家族的功能

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生物化学与生物物理进展 2024年第11期51卷 2821-2831页

作者：杨紫雁蒋昭泓周倩仪陈志明南华大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室衡阳421000 国家卫健委出生缺陷研究与预防重点实验室长沙410008

发动蛋白(dynamin)作为一种复杂的多结构域蛋白质,因其在促进内吞囊泡形成和断裂,诱导囊泡从质膜脱离过程中发挥重要功能而广为人知。其经典功能是在网格蛋白介导型胞吞作用中发挥“膜剪刀”的作用,但是由于其结构和功能的多样性,不同... 详细信息

发动蛋白(dynamin)作为一种复杂的多结构域蛋白质,因其在促进内吞囊泡形成和断裂,诱导囊泡从质膜脱离过程中发挥重要功能而广为人知。其经典功能是在网格蛋白介导型胞吞作用中发挥“膜剪刀”的作用,但是由于其结构和功能的多样性,不同同源异构体间具有组织表达和分布差异性,促使其广泛参与细胞内重要的生理过程,因此具有重要的研究价值。近期研究揭示了发动蛋白的一些非经典功能,包括参与调控网格蛋白介导型胞吞作用(clathrin-mediated endocytosis,CME)的早期阶段、影响肌动蛋白细胞骨架和细胞分裂等。本文主要综述了发动蛋白在CME膜剪切过程中发挥经典功能的最新进展,总结了其非经典功能的挖掘现状,同时阐述了其他发动蛋白超家族蛋白(dynamin superfamily protein,DSP)成员的功能,如抵抗病原体入侵、参与调控线粒体、过氧化物酶体、液泡膜的分裂,以及线粒体、内质网、液泡、过氧化物酶体膜的融合,此外,DSP成员也在调节细胞器间的物质运输,介导细菌胞质分裂和囊泡分泌等方面发挥功能。本综述通过对DSP成员功能的总结和梳理,将为人类疾病相关的分子机制研究提供思路。

关键词：发动蛋白胞吞作用膜剪刀发动蛋白超家族蛋白

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