检索结果-内蒙古大学图书馆

南方医科大学学报 2013年第6期33卷 870-873页

作者：刘文音朱浩南方医科大学基础医学院生物信息学教研室　　广东广州　　（510515）

目的构建果蝇细胞周期调控的数学模型。方法使用一组常微分方程描述细胞周期网络中核心分子的相互作用，计算分子浓度的连续周期性变化，并捕获分子交互的离散事件。结果计算结果吻合实验观测到的分子浓度的周期变化，揭示和解释了细胞... 详细信息

目的构建果蝇细胞周期调控的数学模型。方法使用一组常微分方程描述细胞周期网络中核心分子的相互作用，计算分子浓度的连续周期性变化，并捕获分子交互的离散事件。结果计算结果吻合实验观测到的分子浓度的周期变化，揭示和解释了细胞周期时程补偿的数学机制与定量特性。结论E2FI（E2F transcription factor 1）所联结的正负反馈是调控G，／S与G：／M时程补偿的核心机制。

关键词：数学模型细胞分裂细胞周期 E2F1

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基于生物电阻抗法的椎弓根螺钉植入导航系统

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电子技术应用 2013年第4期39卷 112-114页

作者：钟胜河朱浩郭劲松梁妃学许俊杰王智运南方医科大学基础医学院生物信息学重点实验室广东广州510515 广州军区广州总医院广东广州510010

介绍一种基于生物电阻抗测量椎弓根螺钉植入手术导航系统。在实验用家猪的6节椎骨上进行了初步实验,所获取的相关生物电阻抗实验数据表明,该导航系统能实时、准确地反应插入电极到达骨组织的不同部位,从而可望在临床椎弓根螺钉植入手术... 详细信息

介绍一种基于生物电阻抗测量椎弓根螺钉植入手术导航系统。在实验用家猪的6节椎骨上进行了初步实验,所获取的相关生物电阻抗实验数据表明,该导航系统能实时、准确地反应插入电极到达骨组织的不同部位,从而可望在临床椎弓根螺钉植入手术中起到导航作用。

关键词：生物电阻抗椎弓根螺钉植入手术 MSP430F1612 直接数字合成技术

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基于多变量趋势分析的心肌梗死风险评估

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生物医学工程学杂志 2012年第5期29卷 835-840页

作者：王见荣邓亲恺夏岚梁妃学郭劲松李伟龙南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广州510515 广州森杨电子科技有限公司广州510000

基于心血管疾病患者的心率变异性(HRV)、心率减速力(DC)以及脉搏波传导速度(PWV)等多变量的测量与分析,研究心肌梗死风险早期评估的可行性。随机选择35名心血管疾病患者(11例心肌梗死、8例冠心病、6例动脉硬化和10例高血压)和31名健康... 详细信息

基于心血管疾病患者的心率变异性(HRV)、心率减速力(DC)以及脉搏波传导速度(PWV)等多变量的测量与分析,研究心肌梗死风险早期评估的可行性。随机选择35名心血管疾病患者(11例心肌梗死、8例冠心病、6例动脉硬化和10例高血压)和31名健康常对照,采用自主研制的心肌梗死风险评估平台,采集15min的心电数据和1min的脉搏波数据,进行HRV、DC和PWV分析,并与对照组结果进行比较;实验结果表明心血管疾病组与对照组的HRV、DC和PWV分析结果具有明显的差异性,而其中DC和HRV时域分析方法中的NN50、PNN50及TINN还能有效反映出相关病理的渐变过程。综合HRV、DC和PWV等参变量的趋势分析能够为心肌梗死早期风险评估、临床筛查和预警提供参考。

关键词：心肌梗死心率变异性心率减速力脉搏波传导速度无创检测

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基于多变量趋势分析的心肌梗塞风险评估

基于多变量趋势分析的心肌梗塞风险评估

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广东省生物医学工程学会成立32周年纪念大会暨2012广州（国际）生物医学工程学术大会

作者：王见荣邓亲恺夏岚梁妃学郭劲松李伟龙南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广州森杨电子科技有限公司

基于心血管疾病患者的心率变异性(HRV)、心率减速力(DC)以及脉搏波传导速度(PWV)等多变量的测量与分析,研究心肌梗塞风险早期评估的可行性。随机选择35名心血管疾病患者(11例心肌梗塞、8例冠心病、6例动脉硬化和10例高血压)和31个正常... 详细信息

基于心血管疾病患者的心率变异性(HRV)、心率减速力(DC)以及脉搏波传导速度(PWV)等多变量的测量与分析,研究心肌梗塞风险早期评估的可行性。随机选择35名心血管疾病患者(11例心肌梗塞、8例冠心病、6例动脉硬化和10例高血压)和31个正常对照组,采用自主研制的心肌梗塞风险评估平台,采集15 min的心电数据和1 min的脉搏波数据,进行HRV、DC和PWV分析,并与对照组结果进行比较;实验结果表明心血管疾病组与对照组的HRV、DC和PWV分析结果具有明显的差异性,而其中DC和HRV时域分析方法中的NN50、PNN50及TINN还能有效反映出相关病理的渐变过程。综合HRV、DC和PWV等参变量的趋势分析能够为心肌梗塞早期风险评估、临床筛查和预警提供参考。

关键词：心肌梗塞心率变异性心率减速力脉搏波传导速度无创检测

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微阵列数据处理平台设计与实现

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南方医科大学学报 2011年第4期31卷 610-614页

作者：孙显赫郭云波刘娜马骊邓亲恺南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广东广州510515

目的研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台。方法构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列... 详细信息

目的研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台。方法构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列实验数据的处理和分析,用户可在网页上提交数据和设置参数,结果通过网页以图形化的方式返回。结果该平台可处理寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列的数据,实现了数据质量评估、预处理、注释、统计分析等功能,操作简单,分析速度快。运用本平台处理了结核杆菌不同临床分型的人类巨噬细胞寡核苷酸微阵列数据,即潜伏期、结核病、结核性脑膜炎,为识别结核杆菌的敏感基因提供了线索。利用本平台还分析不同条件下用异烟肼处理结核分支杆菌的效果,例如低氧条件和敲除katG基因的条件所获得的相关cDNA微阵列数据,发现用异烟肼处理的对数生长期调节的基因将不会在休眠期模型中被差异调节;并且在休眠期,被差异调节的基因总数将减少。结论该平台功能资源整合较全面,克服了当前微阵列数据分析软件或工具包在操作使用方面的不足,应用界面友好,结果显示直观,为生物学家开展微阵列数据分析提供了方便。针对结核分支杆菌的案例研究验证了平台的有效性。

关键词：微阵列生物信息学寡核苷酸微阵列双色点样微阵列 R语言 Bioconductor 结核分支杆菌结核性脑膜炎异烟肼

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家庭、社区远程医疗诊断系统数据传输协议的设计

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中国医疗器械杂志 2011年第5期35卷 361-363页

作者：郭劲松梁妃学邓亲恺南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广州510515

南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515针对社区和家庭远程医疗诊断服务系统的需要,设计了一种医学生理信息存储格式和传输协议。该协议以ASCII字符为基础,以帧为基本结构,分为控制指令帧和数据帧两种。控制指令帧可实现... 详细信息

南方医科大学基础医学院生物信息学研究室,广州,510515针对社区和家庭远程医疗诊断服务系统的需要,设计了一种医学生理信息存储格式和传输协议。该协议以ASCII字符为基础,以帧为基本结构,分为控制指令帧和数据帧两种。控制指令帧可实现启动、结束传输,确认指令,请求启动等功能。数据帧根据传输数据的不同分为7种,完成数据传输的功能。该协议简洁明了,可扩展性强,在实际的系统中完成了预定目标的应用。

关键词：生理信息存储格式传输协议

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基于容积脉搏波的血压参数测量与标定的方法研究

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中国医疗器械杂志 2010年第1期34卷 4-8页

作者：丁有得邓亲恺梁妃学郭劲松南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广东广州510515

提出通过人体指端一点位置测量脉搏波传播时间,进而标定收缩压、舒张压。具体方法是通过交替点亮红光和红外光获取容积脉搏波,经放大滤波及信号处理后得到加速脉搏波,通过测量其中推进波和反射波之间的脉搏波传播时间来建立与血压的关... 详细信息

提出通过人体指端一点位置测量脉搏波传播时间,进而标定收缩压、舒张压。具体方法是通过交替点亮红光和红外光获取容积脉搏波,经放大滤波及信号处理后得到加速脉搏波,通过测量其中推进波和反射波之间的脉搏波传播时间来建立与血压的关系。根据数据回归分析建立收缩压测量方程式,根据容积脉搏波中交直流成分之间存在的线性关系及数据回归分析,建立相应的舒张压测量方程式。通过临床33例人体实验,其中18人作为训练组,15人作为对照组,并与基于传统充气袖带测量的OMRON电子血压仪测量结果作对照验证,结果表明有较好的一致性。此方法简单易行,可望作为一种无创、连续血压参数测量的标定方法。

关键词：容积脉搏波传播时间收缩压舒张压标定

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比较基因组学平台的设计与实现

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南方医科大学学报 2010年第2期30卷 219-223页

作者：刘娜郭云波孙显赫马骊邓亲恺南方医科大学基础医学院生物信息学研究室生物技术学院分子免疫学研究所广东广州510515

目的开发一个基于Web的本地服务器支持的功能全面的基因组比较和可视化平台,以加快对基因组的分析。方法构建以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,优选整合了MUMmer、LAGAN、Mauve等多个基因组学研究的软件和算法,... 详细信息

目的开发一个基于Web的本地服务器支持的功能全面的基因组比较和可视化平台,以加快对基因组的分析。方法构建以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,优选整合了MUMmer、LAGAN、Mauve等多个基因组学研究的软件和算法,针对生物学家不同的应用目的,可直接在网页上提交基因组序列数据和参数选项,经平台处理的结果通过网页以图形化的方式返回用户。结果该平台可以处理多种序列数据输入格式,实现了完整的基因组序列和草图基因组序列比对,近远源物种的双基因组或多基因组比对,基因组间的同线性区域寻找,以及定位大范围的基因组重组(基因插入/缺失、重复、重排和水平转移)和小的核苷酸突变等功能;并将结果以图形化的方式显示。应用本平台,对10种新型甲型流感病毒株作基因组同源性分析,表明PB1基因可能来自于人H3N2,PB2、PA基因可能来自于禽类H3N2,而HA、NS基因可能来自于猪H1N1。在本平台上还对结核分枝杆菌(H37Rv、CDC1551)和牛分支杆菌(AF2122/97)基因组的研究分析,发现插入/缺失和重复序列是导致三个菌株基因组差异的主要来源。结论该平台功能资源整合较全面,应用界面友好,结果显示直观,故可作为比较基因组学常规研究的有效平台。

关键词：比较基因组学基因组比对可视化同线性基因组重组生物信息学甲型流感病毒结核分枝杆菌

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HSV-gB、gD糖蛋白重组串联抗原表位蛋白的表达及鉴定

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中国医科大学学报 2010年第3期39卷 181-183页

作者：高婧一王越赵雨杰房凯张劲松中国医科大学附属第四医院眼科沈阳110005 沈阳市第四人民医院眼科沈阳110031 中国医科大学基础医学院生物信息学教研室沈阳110001

目的制备HSV-gB、gD蛋白串联表位重组蛋白,为单纯疱疹病毒(HSV)疫苗的研制提供新型抗原蛋白以及新的抗原制备方法。方法应用生物信息学软件laser gene DNASTAR分析HSV1-gB、gD和HSV2-gB、gD蛋白的抗原表位。选取9个表位,设计并合成表位... 详细信息

目的制备HSV-gB、gD蛋白串联表位重组蛋白,为单纯疱疹病毒(HSV)疫苗的研制提供新型抗原蛋白以及新的抗原制备方法。方法应用生物信息学软件laser gene DNASTAR分析HSV1-gB、gD和HSV2-gB、gD蛋白的抗原表位。选取9个表位,设计并合成表位串联重组蛋白编码基因X,构建其原核细胞表达重组体,在大肠杆菌BL21(DE3)表达该重组表位蛋白X,Western blot法(抗His标签)鉴定重组蛋白。结果构建了HSV-gB、gD蛋白串联表位重组蛋白X的原核表达体,在BL21菌中表达了X蛋白,Western blot法(抗His标签)鉴定了重组蛋白X。结论建立了制备HSV-gB、gD蛋白重组抗原表位蛋白的方法,为HSV疫苗的研制提供了可能的新型抗原蛋白。

关键词：单纯疱疹病毒 gB糖蛋白 gD糖蛋白表位抗原

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复杂度、近似熵应用于麻醉深度监测中的实验研究

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医疗卫生装备 2010年第1期31卷 19-20,28页

作者：王胜军郭云波杨俊杨绍洲邓亲恺南方医科大学基础医学院生物信息学研究室广州510515 南方医院设备器材科解放军458医院

目的:研究EEG复杂度、近似熵与麻醉深度的关系,筛选既能充分表达麻醉深度、计算方法又相对比较简单的参数。方法:自制虚拟仪器信号采集系统:EEG放大器采用北京祥云公司的体表EEG模块,其放大倍数为1万倍,带宽为0.25～70Hz;MSP430单片机负... 详细信息

目的:研究EEG复杂度、近似熵与麻醉深度的关系,筛选既能充分表达麻醉深度、计算方法又相对比较简单的参数。方法:自制虚拟仪器信号采集系统:EEG放大器采用北京祥云公司的体表EEG模块,其放大倍数为1万倍,带宽为0.25～70Hz;MSP430单片机负责AD转换并通过RS232接口将数据传送至上位机;上位机控制软件在LabView6.0平台上开发,将数据初步处理后存贮。动物实验:10只大耳白兔,麻醉剂使用3%戊巴比妥钠,按每公斤体重0.5ml、0.25ml、0.25ml、0.25ml的剂量分4次于耳缘静脉注射,间隔为20min,麻醉前和每次注射麻醉剂5min后记录2minEEG;之后,在苏醒过程中,每隔10min记录一次,共3次。数据后期处理用Matlab实现。结果:复杂度和近似熵与麻药剂量关系的一致性较好。结论:复杂度算法简单,特别适合用于嵌入式麻醉深度监测系统。

关键词：麻醉深度复杂度近似熵

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