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中南林业科技大学学报 2019年第11期39卷 23-28页

作者：刘明星鄢前飞李明诗南京林业大学林学院江苏南京210037 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 南方现代林业协同创新中心江苏南京210037

林分平均直径100倍圆法在测定林分每公顷胸高断面积的同时,还能测定林分每公顷株数。100倍圆法测定每公顷株数与角规相比较而言,两者的精度如何,两者测定每公顷株数可靠性如何,能否反应林分直径分布规律等都有待验证和评价。对12块马尾... 详细信息

林分平均直径100倍圆法在测定林分每公顷胸高断面积的同时,还能测定林分每公顷株数。100倍圆法测定每公顷株数与角规相比较而言,两者的精度如何,两者测定每公顷株数可靠性如何,能否反应林分直径分布规律等都有待验证和评价。对12块马尾松人工林与杉木人工林样地进行了典型抽样调查,通过内业分析发现100倍圆法测定每公顷株数的平均精度为92.28%,角规测定每公顷株数的平均精度为86.23%,100倍圆法测定每公顷株数的平均精度高于角规约6个百分点。同时,100倍圆法野外测量效率更高一些,也更能反应林分直径分布结构分布规律的特点。此方法是理论到实践的首次应用,可使今后的测树工作更加精准方便。

关键词： 100倍圆法胸高断面积每公顷株数标准地角规精度

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松材线虫拮抗细菌的杀线活性及其发酵培养特性

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生物技术通报 2019年第7期35卷 76-82页

作者：张婉君吴小芹王亚会南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院南京210037 江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室南京210007

旨为筛选具有高效杀松材线虫活性的拮抗细菌。采用浸测法对3株芽孢杆菌进行杀线活性测定,并对高效杀线菌株发酵滤液处理线虫后的虫体进行形态观察及该菌株培养条件和杀线物质稳定性测定。结果表明3株细菌发酵滤液处理松材线虫(Bursaphel... 详细信息

旨为筛选具有高效杀松材线虫活性的拮抗细菌。采用浸测法对3株芽孢杆菌进行杀线活性测定,并对高效杀线菌株发酵滤液处理线虫后的虫体进行形态观察及该菌株培养条件和杀线物质稳定性测定。结果表明3株细菌发酵滤液处理松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)48 h后,线虫校正死亡率均达100%,且松材线虫在蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)JK-XZ3发酵滤液4倍和8倍稀释液中处理48 h后,其校正死亡率分别达99.55%和88.32%,明显高于短小芽孢杆菌(***)HR10和瓦雷兹芽孢杆菌(***)YH-20;该JK-XZ3菌株发酵滤液处理过的线虫虫体断裂,内含物外溢,体壁消解;该菌株在30℃培养4 d的发酵滤液杀线活性最高,且松材线虫在发酵滤液4倍和8倍稀释液中处理48 h后,其校正死亡率均达100%;松材线虫在40℃、60℃、80℃和100℃处理后的发酵滤液8倍稀释液中处理48 h后,其校正死亡率均在84%以上;在pH为8-10的发酵滤液8倍稀释液处理48 h后,其校正死亡率均在88%以上;说明该菌株发酵滤液具有耐高温和耐碱特性。蜡样芽孢杆菌JK-XZ3是一株具有开发和应用潜力的高毒力杀线菌株。

关键词：松材线虫蜡样芽孢杆菌发酵滤液杀线活性

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林木根际细菌JYZ-SD5的促生抗逆性能及种类鉴定

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生物技术通报 2019年第3期35卷 31-38页

作者：徐秀倩吴小芹吴天宇曾梦嫚南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院南京210037 江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室南京210007

旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉... 详细信息

旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉盆栽幼苗,观测对水杉生长的影响;采用形态、生理生化测试及16S rRNA基因序列分析,对菌株JYZ-SD5进行种类鉴定。结果显示,菌株JYZ-SD5具有固氮、解磷、解钾的能力;不加色氨酸前提下产IAA量可达6.818 6μg/mL;对链格孢(Alternaria sp.)、异色状拟盘多毛孢(Pestalotiopsis vesicolor)有一定拮抗活性,可产生蛋白酶和纤维素酶;对重金属Mn7+、Cr6+耐受性强,最高均可达400 mg/L;温室盆栽试验表明,根际细菌JYZ-SD5可提高水杉苗木叶绿素相对含量,对水杉株高和地径增长具有促进作用。结合形态学、生理生化和分子鉴定的方法初步确定该菌为拟蕈状芽孢杆菌(Bacillus paramycoides)。根际细菌JYZ-SD5具有良好的促生抗逆特性,具有成为新型生物菌肥的开发潜力和野外应用价值。

关键词：根际细菌促生特性抗逆特性种类鉴定

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森林保护实验室生物安全探讨

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教育现代化 2020年第18期 67-69页

作者：林司曦丁晓磊赵银娟南方现代林业协同创新中心/江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室/南京林业大学林学院

以森林保护学实验室为例,探讨了生物实验室的生物安全建设问题。从国内外生物安全的相关规范及标准出发,分析了森林保护实验室等生物实验室生物安全工作的特殊性,并针对相关问题,从强化安全意识、建立健全规章制度及环境仪器管护等方面... 详细信息

以森林保护学实验室为例,探讨了生物实验室的生物安全建设问题。从国内外生物安全的相关规范及标准出发,分析了森林保护实验室等生物实验室生物安全工作的特殊性,并针对相关问题,从强化安全意识、建立健全规章制度及环境仪器管护等方面提出具体的应对建议。通过明确管理部门及实验室师生的权责,确保相应制度的有效执行,实现实验室的安全稳定运作及生物安全。

关键词：生物安全森林保护实验室生物安全建设

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浅谈计算机信息技术在高等林业院校实习林场管理中的应用——以在南京林业大学实习林场管理应用为例

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科学与信息化 2020年第9期 132-133页

作者：贾永正喻方圆胡永清南京林业大学实验室与基地建设管理处江苏南京 210037 南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院江苏南京 210037

随着科学技术的不断进步,计算机信息处理技术得到了快速的发展,在各行各业中都得到了广泛的普及和应用,为人们的生活、教学、科研、学习和工作带来了极大的便利.计算机信息处理技术在办公自动化、高校教学实习实训中学生实习成绩的管理... 详细信息

随着科学技术的不断进步,计算机信息处理技术得到了快速的发展,在各行各业中都得到了广泛的普及和应用,为人们的生活、教学、科研、学习和工作带来了极大的便利.计算机信息处理技术在办公自动化、高校教学实习实训中学生实习成绩的管理、教学实践、科研数据信息的整理和服务、林场森林资源监测与植物保护、林场相关档案资料管理以及森林防火中的应用作用也日益凸显.本文通过对南京林业大学实习林场有关计算机信息处理技术在林场管理中的应用,进行了实地调研和分析,并就目前的应用状况进行了总结和展望.

关键词：计算机信息处理实习实训基地国有林场高等林业院校

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观赏海棠不同叶位色素组分动态研究

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中南林业科技大学学报 2019年第4期39卷 99-106页

作者：姜文龙李千惠周婷江皓张往祥南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心江苏扬州225200 扬州小苹果园艺有限公司江苏扬州225200

以57个观赏海棠品种为研究对象,对上位叶(Upper leaf)、中位叶(Middle leaf)、下位叶(Lower leaf)的色素组分进行测定,研究了海棠品种不同叶位间色素组分关系以及动态规律,为海棠优良观叶种质的筛选以及叶色改良提供理论参考。基于紫外... 详细信息

以57个观赏海棠品种为研究对象,对上位叶(Upper leaf)、中位叶(Middle leaf)、下位叶(Lower leaf)的色素组分进行测定,研究了海棠品种不同叶位间色素组分关系以及动态规律,为海棠优良观叶种质的筛选以及叶色改良提供理论参考。基于紫外—可见分光光度计的色素绝对含量测定和基于Unispec-SC光谱分析仪的色素相对含量测定,分别构建了花青素(Anth)、类胡萝卜素(Car)、叶绿素(Chl)3大色素组分绝对含量与相对含量之间的拟合函数:y_(Anth)=0.522 1x^2-0.111 4x+0.013 3(R^2=0.979 3);y_(Car)=0.456 2x+0.072 6(R^2=0.980 9);y_(Chl)=1.428 7x-0.672 6(R^2=0.901 6)。采用Origin 9.0软件构建了57个海棠品种的3大色素组分含量及权重的三维分布图。结果表明:1)基于紫外—可见分光光度计的色素绝对含量测定和基于Unispec-SC光谱分析仪的色素相对含量测定,分别构建了花青素(Anth)、类胡萝卜素(Car)、叶绿素(Chl)3大色素组分绝对含量与相对含量之间的拟合函数。2)基于上位叶叶绿素含量、花青素含量及其权重的聚类分析表明:57个海棠品种可分为2大色系4个子色系类群,即绿色系(含深绿色系、褐绿色系)、红色系(含紫红色系、红棕色系),各色系间差异显著。3)绿色系之A_1子色系含有较低的花青素含量,且随着叶位的下降,其含量变化平稳,绿色呈现效果较好。4)A_2子色系在上位叶阶段虽含有一定量的花青素,但不足以使叶片呈现出"全红"状态,因此绿色表达效果不如A_1子色系。5)红色系之B_1子色系的花青素含量及稳定性皆高于B_2子色系,在上位叶、中位叶,B_1子色系的花青素含量分别为B_2子色系的2.1倍和2.6倍,显著提高了呈色效果。6)此外,在中位叶,B_1子色系的花青素含量虽较上位叶有所淡化,但仍达到了B_2子色系在上位叶的含量水平。

关键词：海棠叶片叶位色素组分动态规律江苏省扬州市

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基于RAD-seq技术的鹅掌楸基因组SNP标记开发

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南京林业大学学报(自然科学版) 2019年第4期43卷 1-7页

作者：陆叶龙晓飞王鹏凯陈金慧施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学南方现代林业协同创新中心苏州农业职业技术学院

【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶Eco... 详细信息

【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶EcoR I对包括2个亲本和198个子代在内的200个单株的基因组DNA进行酶切,构建RAD(restriction-site associated DNA)文库并进行RAD-seq测序。采用读长为91 bp的双末端测序。2个亲本的平均测序深度为2×,198个子代的平均测序深度为0.8×,平均产量为1.94 Gb,共获得约387.21 Gb数据。用Stacks软件将每个样品的RAD-reads作生物信息学分析,对候选位点进行卡方检验和缺失率检验,再将符合孟德尔遗传的标记及与之相对应的RAD-tag序列和鹅掌楸参考基因组序列进行比对。最后,从本研究开发的SNP标记中选取27个候选SNP位点,设计引物,对随机挑选的16个F1代进行PCR扩增并将结果进行测序,同时验证SNP的有效性。【结果】从候选群体中共鉴定到22 019个SNP位点,符合孟德尔遗传规律的标记为4 233个,最终获得3 501个候选SNP标记。SNP验证中,共有293个SNP标记完成测序并能判读结果,所有位点都为SNP位点,共有194(66.2%)个SNP变异类型得到了验证。【结论】基于RAD-seq技术和鹅掌楸参考基因组序列为基础的策略,能够作为一种快速有效的手段,实现大规模的分子标记开发,可用于鹅掌楸等林木的高密度遗传图谱的构建。

关键词：北美鹅掌楸鹅掌楸限制性位点关联DNA测序(RAD-seq)技术 SNP标记遗传连锁图谱

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柳杉维管形成层及木质部区转录组序列及基因表达分析

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分子植物育种 2019年第3期17卷 762-770页

作者：曹玉婷莫家兴欧阳磊施季森徐进南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学林学院南京210037 福建省林业科学研究院福州350012

柳杉是中国南方重要的针叶用材树种,具有树形高大,纹理直等特点,已广泛用于板材和建筑生产中,研究柳杉木材形成过程中维管形成层及木质部区转录组特征,为木材形成主要过程的分子机理,木材形成有关基因调控,培育优良材质的林木提供理论... 详细信息

柳杉是中国南方重要的针叶用材树种,具有树形高大,纹理直等特点,已广泛用于板材和建筑生产中,研究柳杉木材形成过程中维管形成层及木质部区转录组特征,为木材形成主要过程的分子机理,木材形成有关基因调控,培育优良材质的林木提供理论参考。本研究以柳杉形成层组织为材料,通过Illumina Hiseq测序平台对4个不同发育阶段的柳杉维管形成层进行转录组测序;对Unigene进行了蛋白功能注释、分类及KEGG代谢通路分析等。测序数据参照无参转录组测序流程进行分析,一共产生105.9 Gb的数据,过滤后Clean reads均达到90%以上。Clean reads经Trinity软件进行组装,一共产生64 969个Unigene,对Unigene进行拼接,拼接后的Contigs序列有29 381条、Singletons有35 588条,总长度为83 003 836 bp。将Unigen与七大功能数据库(NR, NT, GO, COG, KEGG, Swissprot, Interpro)进行比对,共有42 836个Unigene得到注释,占总Unigene的66.05%。GO注释共有89 644个转录本得到注释。对GO注释转录本进行分类,其中有38 432个转录本(42.87%)注释为生物过程,有32 749个转录本(36.53%)注释为细胞组分,有18 463个转录本(20.6%)注释为分子功能。KEGG注释有31 580个Unigene得到注释。分为6大类为:细胞代谢过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、代谢作用、生物体系统。其中代谢作用涉及的Unigene最多达18 580个,占KEGG总注释Unigene的58.83%。另有37 762个Unigene得到COG注释,被分为25类,其中注释数目最多的类型是仅预测一般功能的Unigene,占总数的16.9%;其次是转录,比例为8.8%;再次是复制、重组及修复,占总数的7.8%。本研究最后分析了可能参与木材形成重要功能基因,为探讨木材发育的分子机制及进行重要功能基因的挖掘提供了提供了依据。

关键词：柳杉维管形成层转录组测序

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瓦雷兹芽孢杆菌YH-20发酵液的抑菌特性初探

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西部林业科学 2019年第5期48卷 81-88页

作者：丁森叶建仁南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室

为掌握瓦雷兹芽孢杆菌YH-20发酵液的抑菌稳定性及其抑菌物质,采用生长速率法测定菌株YH-20发酵液对12株病原菌的抑制作用,以葡萄座腔菌为病原指示真菌测定发酵液在不同条件下抑菌稳定性,根癌农杆菌为病原指示细菌测定提取物质的抑菌活性... 详细信息

为掌握瓦雷兹芽孢杆菌YH-20发酵液的抑菌稳定性及其抑菌物质,采用生长速率法测定菌株YH-20发酵液对12株病原菌的抑制作用,以葡萄座腔菌为病原指示真菌测定发酵液在不同条件下抑菌稳定性,根癌农杆菌为病原指示细菌测定提取物质的抑菌活性;采用硫酸铵沉淀法和酸沉淀法提取发酵液中的蛋白类物质和脂肽类物质,并以特定培养基检测菌株产蛋白酶和纤维素酶的能力,以正丁醇、乙酸乙酯和石油醚对发酵液中的活性物质进行萃取。结果表明,菌株YH-20发酵液对供试的11种病原真菌和1株病原细菌均具有较好的抑制能力,该发酵液经普通光照和紫外光照处理后,发酵液的抑菌率保持稳定,经80℃处理120min后,抑菌率仍可达到49.24%,在pH6-9处理后,仍可保持较高的抑菌率。在4℃最少可储存30d而抑菌能力不发生改变。菌株YH-20可产生抑菌性蛋白和脂肽、蛋白酶、纤维素酶及嗜铁素。以极性较高的正丁醇和乙酸乙酯可萃取出发酵液中的抑菌活性物质。菌株YH-20对植物病原菌具有广谱抑菌能力和较好的抑菌稳定性,可产生多种抑菌物质。

关键词：瓦雷兹芽孢杆菌抑菌谱稳定性抑菌物质

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利谷隆对穗状狐尾藻的毒性影响

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农药 2020年第5期59卷 352-356页

作者：陈诗卉王艮梅王宏伟姜锦林单正军续卫利生态环境部南京环境科学研究所国家环境保护农药环境评价与污染控制重点实验室南京210042 南京林业大学林学院现代南方林业协同创新中心南京210037

[目的]通过科学评价利谷隆对穗状狐尾藻的毒性效应,为该农药的生态环境风险评估提供基础数据。[方法]试验采用半静态法,将穗状狐尾藻暴露14 d,观察其生长状态,确定利谷隆在水沉积物系统中对穗状狐尾藻营养生长的影响。[结果]利谷隆对穗... 详细信息

[目的]通过科学评价利谷隆对穗状狐尾藻的毒性效应,为该农药的生态环境风险评估提供基础数据。[方法]试验采用半静态法,将穗状狐尾藻暴露14 d,观察其生长状态,确定利谷隆在水沉积物系统中对穗状狐尾藻营养生长的影响。[结果]利谷隆对穗状狐尾藻茎长、根长、整株长度、鲜重及干重的14 d平均比生长率抑制半效应浓度(14 d-ErC50)分别为0.278、0.331、0.225、0.390、0.318 mg/L,平均生物量增长量抑制半效应浓度(14 d-EyC50)分别为0.173、0.259、0.164、0.247、0.222 mg/L。[结论]利谷隆对穗状狐尾藻茎长、根长、整株长度、鲜重及干重的生长影响在低质量浓度(0.03 mg/L)时表现出刺激作用;高质量浓度(2.43 mg/L)时对茎长、根长、整株长度、鲜重及干重的抑制呈现良好的剂量-效应关系,即随着利谷隆溶液浓度增加,抑制作用呈上升趋势。

关键词：利谷隆穗状狐尾藻生长毒性

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