目的探讨基于SNaPshot技术的精液特异性编码区单核苷酸多态性(coding region single nucleo⁃tide polymorphism,cSNP)遗传标记检测在精液(斑)溯源及混合体液(斑)鉴定中的可行性。方法制备16例精液斑和11例精液-静脉血混合斑样本,提取其...
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目的探讨基于SNaPshot技术的精液特异性编码区单核苷酸多态性(coding region single nucleo⁃tide polymorphism,cSNP)遗传标记检测在精液(斑)溯源及混合体液(斑)鉴定中的可行性。方法制备16例精液斑和11例精液-静脉血混合斑样本,提取其基因组DNA(genomic DNA,gDNA)和总RNA,并将总RNA逆转录为互补DNA(complementary DNA,cDNA)。在已验证的精液特异性mRNA编码基因上筛选cSNP遗传标记。基于SNaPshot技术构建cSNP复合检测体系并通过CE对样本进行基因分型。结果成功构建了包含5个精液特异性cSNP的复合检测体系。在16例精液样本中,除了位于TGM4基因上的cSNP在cDNA的检测结果中出现等位基因丢失外,其余cSNP的gDNA和cDNA分型结果高度一致。检测精液-静脉血混合斑时,检出的cSNP分型结果均与精液提供者的基因型一致,未受到静脉血提供者基因型的干扰。结论应用SNaPshot技术检测精液特异性cSNP的方法可以应用于法医学精液(斑)的基因分型,并为混合体液(斑)中精液来源个体的判定提供信息。
目的：基于网络药理学方法挖掘香青兰总黄酮治疗脑缺血/再灌注损伤（CIRI）的中药活性成分及其作用的主要靶点，运用分子对接探究活性成分与靶蛋白的结合能力，以期寻找高特异性的靶向改善CIRI的小分子药物。方法：依据TCMSP、HERB数据库及相关文献结合Pubchem、Swiss Institute of Bioinformatics筛选香青兰总黄酮主要活性成分的单体；GeneCards、OMIM及DisGeNET数据库筛选CIRI的相关靶点；运用jvenn筛选交集基因并绘制Venn图，STRING数据库绘制蛋白互作网络图；运用微生信平台及Metacape数据将交集基因进行GO、KEGG富集分析；将活性单体成分与核心基因进行分子对接。结果：香青兰总黄酮中筛选出活性单体成分20个，预测改善CIRI相关靶点2053个，GO及KEGG富集分析显示，香青兰总黄酮活性单体成分改善CIRI机制主要涉及对缺氧的反应、凋亡过程负向调控、炎症反应等生物过程，所涉及的通路包括氧化应激、细胞凋亡、PI3K-Akt等。结论：香青兰总黄酮改善CIRI具有多成分、多靶点的作用效果，其主要活性单体成分对不同靶点具有不同的结合能力，故提取高纯度的高特异性的活性单体成分可能提高香青兰总黄酮靶向改善CIRI的能力。
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