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第三届环北部湾高校研究生海洋论坛

作者：廖健张顺龙水生黄承勤郭昱嵩王忠铎广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江

以雷州半岛红树林海区虾虎鱼科仔稚幼鱼为研究对象,获得了5种虾虎鱼类的45条线粒体COI基因序列,其T、C、A、G碱基平均含量分别为:29.9％、28.4％、23.9％、17.8％.45条序列共定义23个单倍型,其中检测到变异位点184个,双带缟虾虎鱼单倍... 详细信息

以雷州半岛红树林海区虾虎鱼科仔稚幼鱼为研究对象,获得了5种虾虎鱼类的45条线粒体COI基因序列,其T、C、A、G碱基平均含量分别为:29.9％、28.4％、23.9％、17.8％.45条序列共定义23个单倍型,其中检测到变异位点184个,双带缟虾虎鱼单倍型比例最高(80.0％),湖栖鳍虾虎鱼单倍型比例最低(18.2％).Kimura2-parameter遗传距离显示:种间遗传距离在0.1376-0.2635之间,种内遗传距离在0.0000-0.0208之间.NJ进化树及ML进化树均表明聚为5大支系的虾虎鱼类中,阿部氏鲻虾虎鱼与诸氏鲻虾虎鱼亲缘关系最近,湖栖鳍虾虎鱼与其他四种虾虎鱼的亲缘关系稍远.基于群体内等位基因频率分布的中性检验结果表明,双带缟虾虎鱼、小口拟虾虎鱼、阿部氏鲻虾虎鱼、诸氏鲻虾虎鱼4个群体存在大量的低频等位基因位点,而湖栖鳍虾虎鱼群体中是由中等频率的等位基因占主导.本研究从分子水平研究了雷州半岛红树林海区虾虎鱼类的分类、遗传关系、系统进化,为虾虎鱼类保护生物学和系统进化提供分子生物学理论基础.

关键词：虾虎鱼类线粒体 COI基因基因变异系统进化

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养殖密度对珍珠龙胆石斑鱼摄食行为和生长的影响

养殖密度对珍珠龙胆石斑鱼摄食行为和生长的影响

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2015年全国海水养殖学术研讨会

作者：王丽娜申玉春广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524088

在工厂化养殖条件下,设置60尾/m3、120尾/m3和140尾/m3三种养殖密度,研究了养殖密度了养殖密度对珍珠龙胆石斑鱼摄食行为、生长及血液生理生化指标的影响.结果表明:(1)在摄食行为方面重点阐述了不同密度组鱼群的摄食水层、摄食形态、摄... 详细信息

在工厂化养殖条件下,设置60尾/m3、120尾/m3和140尾/m3三种养殖密度,研究了养殖密度了养殖密度对珍珠龙胆石斑鱼摄食行为、生长及血液生理生化指标的影响.结果表明:(1)在摄食行为方面重点阐述了不同密度组鱼群的摄食水层、摄食形态、摄食时间、摄食量以及摄食表现等,研究发现不同密度组在相同时间内摄食行为具有差异,高密度组摄食较为激烈,攻击抢食行为更为明显,集群摄食现象也较为显著;相同密度组在实验初期摄食形态主要为碗状,摄食主要集中在中层或中上层,在实验后期摄食形态主要为平铺状,摄食主要集中在上层或表层.

关键词：珍珠龙胆石斑鱼养殖密度摄食行为生长特性

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鱼类视蛋白的研究进展

鱼类视蛋白的研究进展

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第三届环北部湾高校研究生海洋论坛

作者：余娟王中铎郭昱嵩刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524088

鱼类作为脊椎动物最重要的类群之一,在其生长发育和进化中,视蛋白在视觉图像形成和生物钟昼夜节律等非图像形成功能调节方面起着至关重要的作用,根据其是否直接参与视觉成像分视觉视蛋白和非视觉视蛋白两大类.本文对国内外鱼类视蛋白生... 详细信息

鱼类作为脊椎动物最重要的类群之一,在其生长发育和进化中,视蛋白在视觉图像形成和生物钟昼夜节律等非图像形成功能调节方面起着至关重要的作用,根据其是否直接参与视觉成像分视觉视蛋白和非视觉视蛋白两大类.本文对国内外鱼类视蛋白生物学的最新研究进展进行了综述,重点介绍鱼类视觉系统视蛋白和非视觉系统视蛋白的研究进展,包括各自的组成、分类、分布、生理功能及视蛋白基因等,为进一步深入研究鱼类视觉感知的分子机制及鱼类资源的保护及应用奠定理论基础.

关键词：鱼类视蛋白视觉系统非视觉系统

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投喂不同蛋白源饲料对褐点石斑粪便碳、氮稳定同位素的影响

投喂不同蛋白源饲料对褐点石斑粪便碳、氮稳定同位素的影响

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2015年全国海水养殖学术研讨会

作者：周晖陈刚广东海洋大学水产学院湛江524025 广东省普通高校南海水产经济动物增养殖重点实验室湛江524025

本研究目的是测定投喂不同蛋白源饲料对褐点石斑鱼大规格幼鱼粪便碳、氮稳定同位素变化情况,通过分析5个实验组褐点石斑鱼粪便样品的碳氮稳定同位素值与饲料之间的差异,评估褐点石斑鱼对饲料蛋白的稳定同位素分馏效应.为此,配制了5种等... 详细信息

本研究目的是测定投喂不同蛋白源饲料对褐点石斑鱼大规格幼鱼粪便碳、氮稳定同位素变化情况,通过分析5个实验组褐点石斑鱼粪便样品的碳氮稳定同位素值与饲料之间的差异,评估褐点石斑鱼对饲料蛋白的稳定同位素分馏效应.为此,配制了5种等氮等能的饲料,D1以全鱼粉作为蛋白源,D2和D3分别用脱脂豆粕替代10％和20％鱼粉,D4以啤酒酵母粉替代10％鱼粉,D5以玉米蛋白粉替代10％鱼粉,投喂褐点石斑鱼42d.分别在3d,7d,14d,28d和42d采集实验鱼粪便样品并测定其碳、氮稳定同位素值.

关键词：褐点石斑鱼蛋白源饲料稳定同位素分馏效应

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附着生物对流沙湾海草床喜盐草的光合代谢强度的影响

附着生物对流沙湾海草床喜盐草的光合代谢强度的影响

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2015年中国水产学会学术年会

作者：李英子黄翔鹄南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室水域生态与养殖环境研究室广东海洋大学

从2014年10月开始,对广东流沙湾海草床三个海岸带(远岸带A、中海岸带B及近岸带C)中的喜盐草(Halophila ovalis)进行了季节性调查,研究喜盐草上附着生物的现存量、叶绿素a含量的季节变化及其对喜盐草的光合作用速率的影响。研究结果发现... 详细信息

从2014年10月开始,对广东流沙湾海草床三个海岸带(远岸带A、中海岸带B及近岸带C)中的喜盐草(Halophila ovalis)进行了季节性调查,研究喜盐草上附着生物的现存量、叶绿素a含量的季节变化及其对喜盐草的光合作用速率的影响。研究结果发现,附着生物的现存量及叶绿素a含量存在明显的季节性,其变化依次是春季﹥冬季﹥夏季﹥秋季,于春季达到最高峰,附着生物现存量和叶绿素a含量分别为0.605 mg/g和0.118 mg/g;而且在近岸带附着生物的含量要略高于中海岸带和远岸带。附着生物对喜盐草的光合作用速率存在着明显的抑制效应,并且随着附着生物含量的增加,其抑制作用增强。在春季,最大光合抑制率可以达50.72%,冬季和夏季次之,在附着生物含量最低的秋季,抑制率也可达30.61%。研究表明,水体中营养盐浓度的增加会促使喜盐草上附着生物不断生长和累积,进而导致喜盐草的衰亡加速。

关键词：海草床附着生物喜盐草光合作用速率

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稀杯盔形珊瑚转录组分析

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广东海洋大学学报 2015年第6期35卷 1-8页

作者：刘金豆刘丽黄元佳广东海洋大学水产学院//南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室//南海生物资源开发与利用协同创新中心广东湛江524088

以高通量测序技术Illumina Hi SeqTM2000对稀杯盔形珊瑚(Galaxea astreata)进行转录组测序分析,共获得50 360 620条短序列(reads)。利用Trinity软件对所有reads从头组装后得到81 014条单基因簇(Unigenes),60 471条(74.58%)编码蛋白框(Coding Sequences,CDs)。与Nr(Non-redundant,非冗余)、COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins,蛋白相邻类的聚簇)、KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,京都基因与基因组百科全书)、Swissprot四大数据库比对共获得36 545条注释基因。其中与COG数据库比对获得14 491条注释基因,分为24个功能类别,其中参与一般功能预测类的Unigene数最多,有4 642条;KEGG分析比对获得16 021条注释基因,分成241类,包括代谢通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路等,在所有通路中参与代谢途径的基因数最多,共有2 450条(15.29%);GO(Gene Ontology,基因本体)功能分类将Unigene分为47个类别。

关键词：转录组稀杯盔形珊瑚 Unigene 信号通路

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卵形鲳鲹肉碱棕榈酰基转移酶Ⅰ全长cDNA序列的克隆及生物信息学分析

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广东海洋大学学报 2015年第3期35卷 7-15页

作者：方玲玲王忠良陈刚汤保贵张健东黄建盛周晖广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东海洋大学广东省普通高校南海水产经济动物增养殖重点实验室广东湛江524088 广东海洋大学广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

采用RACE-PCR克隆卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)肉碱棕榈酰基转移酶Ⅰ(carnitine palmitoyltransferaseⅠ,CPTⅠ)c DNA序列全长,并对其编码氨基酸进行生物信息学分析。结果表明,卵形鲳鲹CPTⅠ基因(Gen Bank登录号KP987456)c DNA序列全长2 841 bp,其开放阅读框(ORF)为2 363 bp,编码787个氨基酸,3'非编码区(URT)335 bp,5'非编码区142 bp;生物信息预测显示CPTⅠ基因编码的蛋白无信号肽序列,脂溶指数高达85.63,亲水性平均值(GRAVY)为-0.213,具有2个跨膜区螺旋,在第312和367氨基酸残基处存在N-糖基化位点,在19个丝氨酸(Ser)、9个苏氨酸(Thr)和14个酪氨酸(Tyr)残基上可能发生磷酸化;二级结构中α螺旋(Alpha helix)占比例最大,为40.66%;该蛋白亚细胞定位预测其主要分布于细胞质和线粒体中;分子系统进化分析显示,卵形鲳鲹CPTⅠ蛋白与花鲈(Lateolabrax japonicas)的同源性最高,达94%,与大黄鱼(Larimichthys crocea)、金鲷(Sparus aurata)的次之,均为93%,与人(Homo sapiens)、鼠(Mus musculus)等的同源性较低(65%)。

关键词：卵形鲳鲹肉碱棕榈酰基转移酶I 基因克隆生物信息分析

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丛生盔形珊瑚ferritin基因cDNA的克隆及原核表达

丛生盔形珊瑚ferritin基因cDNA的克隆及原核表达

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第六届海峡两岸珊瑚礁生物学与海洋保护区研讨会

作者：刘金豆刘丽刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室南海生物资源开发与利用协同创新中心广东湛江 524088

利用Polymerase Chain Reaction(PCR)技术获得丛生盔形珊瑚(Galaxeafascicularis)Ferritin(Fe)基因的全长cDNA.结果表明：该基因序列长680bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为519bp,编码一条含172 个氨基酸的多肽.

关键词：

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高温胁迫下稀杯盔形珊瑚(Galaxea astreata)转录组测序及Hsp90基因的克隆及表达分析

高温胁迫下稀杯盔形珊瑚(Galaxea astreata)转录组测序及Hsp90基...

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第六届海峡两岸珊瑚礁生物学与海洋保护区研讨会

作者：刘丽刘金豆刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室南海生物资源开发与利用协同创新中心广东湛江 524088

随着全球气候变暖，世界范围内珊瑚礁出现大面积的白化和死亡现象。本研究应用高通量测序技术获得常温和高温胁迫下稀杯盔形珊瑚转录组数据，分析了高温胁迫下上调和下调表达的基因，揭示了其复杂的调控网络。同时，克隆了温度相关的hsp...

随着全球气候变暖，世界范围内珊瑚礁出现大面积的白化和死亡现象。本研究应用高通量测序技术获得常温和高温胁迫下稀杯盔形珊瑚转录组数据，分析了高温胁迫下上调和下调表达的基因，揭示了其复杂的调控网络。同时，克隆了温度相关的hsp90 基因并应用实时荧光定量技术分析其基因表达量的变化。

关键词：

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丛生盔形珊瑚ferritin基因cDNA的克隆及原核表达

丛生盔形珊瑚ferritin基因cDNA的克隆及原核表达

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2015年中国水产学会学术年会

作者：刘金豆刘丽刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室南海生物资源开发与利用协同创新中心

利用Polymerase Chain Reaction(PCR)技术获得丛生盔形珊瑚(Galaxea fascicularis)Ferritin(Fe)基因的全长c DNA。结果表明:该基因序列长680bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为519bp,编码一条含172个氨基酸的多肽。采用PET-32a载体和BL21(DE3)菌株构建铁蛋白原核表达系统,通过异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(Isopropylβ-D-1-thiogalac-topyranoside)IPTG诱导,SDS-PAGE电泳显示出分子量大小约41k Da的特异性融合蛋白。对表达条件进行优化,发现当IPTG浓度为0.7mmol/L,温度为32℃时融合蛋白表达量达到最大。随着时间的延长蛋白表大量逐渐增多,6h获得最大量的融合蛋白。

关键词：丛生盔形珊瑚(Galaxea fascicularis) ferritin基因原核表达

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