检索结果-内蒙古大学图书馆

基于线粒体COI基因的雷州半岛马尾藻属常见种DNA条形码鉴定及系统进化分析

广东海洋大学学报 2016年第4期36卷 17-22页

作者：贺亮廖健全秋梅梁忠谢恩义刘丽刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

采用DNA 条形码技术辅以传统形态分类方法，对雷州半岛马尾藻属（Sargassum）6 常见种进行物种鉴定和系统进化分析。测得6 种马尾藻线粒体COI 基因序列，该序列与GenBank 和BOLD 数据库中马尾藻序列同源性均大于或等于99%，该结果与形... 详细信息

采用DNA 条形码技术辅以传统形态分类方法，对雷州半岛马尾藻属（Sargassum）6 常见种进行物种鉴定和系统进化分析。测得6 种马尾藻线粒体COI 基因序列，该序列与GenBank 和BOLD 数据库中马尾藻序列同源性均大于或等于99%，该结果与形态分类学鉴定结果一致。COI 基因序列特征分析表明，6 种马尾藻保守位点421 个，变异位点58 个，简约信息位点21 个，单一突变位点37 个，变异率7.7%，T、C、A、G 平均含量分别为39.1%、18.9%、19.1%、22.9%，A+T 含量（58.2%）高于C+G 含量（41.8%），UUU 所编码的苯丙氨酸（F）使用频率最高，达12.5%，最大似然法估算的转换颠换比值为2.42，种间遗传距离多在0.030±0.013 ~ 0.100±0.016之间。聚类分析结果与形态学鉴定、同源性分析结果一致。

关键词：马尾藻属 mtDNA-COI 基因物种鉴定分子系统进化 DNA 条形码

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基于线粒体cox1基因序列探讨弹涂鱼属鱼类系统进化关系

基于线粒体cox1基因序列探讨弹涂鱼属鱼类系统进化关系

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2016年中国水产学会学术年会

作者：张顺黄承勤廖健郭昱嵩王中铎刘楚吾广东海洋大学南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

本文基于线粒体cox1基因DNA条形码对我国雷州半岛红树林区常见弹涂鱼进行分类鉴定,并结合从GenBank中获得的12种弹涂鱼的cox1基因序列,探讨16种弹涂鱼之间的系统进化关系。在所分析的82条cox1基因同源序列(599bp)中共检测到44个单倍型、... 详细信息

本文基于线粒体cox1基因DNA条形码对我国雷州半岛红树林区常见弹涂鱼进行分类鉴定,并结合从GenBank中获得的12种弹涂鱼的cox1基因序列,探讨16种弹涂鱼之间的系统进化关系。在所分析的82条cox1基因同源序列(599bp)中共检测到44个单倍型、212个核苷酸多态位点(占35.4%),种间平均核苷酸差异数为4(占2.01%)。基于最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建的系统发育树,并结合分类阶元的遗传距离,显示各弹涂鱼属大都独自形成一个独立的分支,亲缘关系明显,齿弹涂鱼属(Periophthalmodon)镶嵌于弹涂鱼属(Periophthalmus)内,大弹涂鱼属(Boleophthalmus)与青弹涂鱼属(Scartelaos)形成并列的分支,亲缘关系较近。依化石记录标定的松散分子钟估算的物种分歧时间,表明各弹涂鱼属出现明显分化大约发生于渐新世末期至中新世早期(23.61～15.65Mya)。

关键词：弹涂鱼属线粒体DNA cox1基因系统进化

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基于线粒体Cytb基因片段序列探讨5种鲷科鱼类分子系统进化关系

基于线粒体Cytb基因片段序列探讨5种鲷科鱼类分子系统进化关系

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2016年中国水产学会学术年会

作者：贺亮刘丽黄元佳廖健全秋梅林斌全广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

对采自广东省海陵岛的4属5种鲷科鱼类36个个体的线粒体Cytb基因进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank已有的同源序列,共56条Cytb基因序列进行序列变异、分子系统进化研究。结果显示,碱基T、C、A、G的平均含量分别为:30.3%、31.1%、23.4%... 详细信息

对采自广东省海陵岛的4属5种鲷科鱼类36个个体的线粒体Cytb基因进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank已有的同源序列,共56条Cytb基因序列进行序列变异、分子系统进化研究。结果显示,碱基T、C、A、G的平均含量分别为:30.3%、31.1%、23.4%、15.2%,A+T含量(53.7%)高于C+G含量(46.3%),其中保守位点490个,变异位点244个,简约信息位点226个,单一突变位点18个,由密码子UUU编码的苯丙氨酸(Phe)具有较强偏倚性;种间、种内平均遗传距离分别在0.001～0.048、0.109～0.208之间,5种鲷科鱼类共聚为两大类群(Taxon),并分别对应两种不同体色类型,即银灰体色的灰鳍棘鲷、黑棘鲷与平鲷聚为TaxonⅠ;红体色的黄牙鲷、二长棘鲷形成TaxonⅡ;综合中性检验与mismatch分布,5种鲷科鱼类群体大小处于稳定,且符合中性进化假设。

关键词：鲷科鱼类细胞色素b基因分子系统进化

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珊瑚白化与温度相关基因的研究进展

珊瑚白化与温度相关基因的研究进展

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2016年中国水产学会学术年会

作者：袁吉贵刘丽张艳苹广东海洋大学南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

由于全球气候变化引起海洋表面平均温度升高的影响,珊瑚礁遭受到严重袭击导致珊瑚礁严重退化。研究珊瑚白化相关基因已经成为了当今热点,通过分析珊瑚相关基因在环境胁迫条件下的表达与调控,可以深入了解相关基因在珊瑚白化机制与恢复... 详细信息

由于全球气候变化引起海洋表面平均温度升高的影响,珊瑚礁遭受到严重袭击导致珊瑚礁严重退化。研究珊瑚白化相关基因已经成为了当今热点,通过分析珊瑚相关基因在环境胁迫条件下的表达与调控,可以深入了解相关基因在珊瑚白化机制与恢复机制中的作用。本文综述珊瑚礁、珊瑚礁的现状、珊瑚白化与温度的关系、珊瑚温度相关基因的研究进展,并重点介绍了细胞响应机制中的细胞生长调控基因、去除受损大分子相关基因、维持DNA稳定与修复相关基因、细胞免疫相关基因、钙化相关基因以及其它重要基因的研究,为进一步研究珊瑚白化机制及珊瑚礁保护提供理论基础。

关键词：珊瑚白化温度胁迫响应基因表达

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非诺贝特对卵形鲳鲹PPARα及CPTI基因表达的影响

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广东海洋大学学报 2016年第1期36卷 13-18页

作者：方玲玲陈刚王忠良汤保贵张健东黄建盛周晖广东海洋大学水产学院广东省普通高校南海水产经济动物增养殖重点实验室广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

对卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)腹腔注射20、50、100 mg/kg的激动剂非诺贝特,用RT-PCR检测肝脏、肌肉中PPARα和CPTI基因表达的变化趋势,研究激动剂对卵形鲳鲹PPARα和CPTI基因表达的影响。结果表明,PPARα基因表达量50 mg/kg非诺贝特... 详细信息

对卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)腹腔注射20、50、100 mg/kg的激动剂非诺贝特,用RT-PCR检测肝脏、肌肉中PPARα和CPTI基因表达的变化趋势,研究激动剂对卵形鲳鲹PPARα和CPTI基因表达的影响。结果表明,PPARα基因表达量50 mg/kg非诺贝特组高于其他组,差异有统计学意义(P<0.05),而CPTI表达量在20 mg/kg组有较高的表达水平(P<0.05);50 mg/kg非诺贝特组中PPARα基因表达量随着时间的变化呈现先降低后恢复至初始水平的趋势,CPTI表达量随时间变化先升高后降低,随后又升高的变化趋势,肝脏组织中,CPTI表达量在注射后30 h达到最高(P<0.05),而在肌肉组织中18 h时达到最高值(P<0.05);非诺贝特组PPARα和CPTI基因的表达量均高于PBS对照组(P<0.05)。非诺贝特可诱导PPARα基因的表达,但CPTI与PPARα基因表达无较明显的相关性。

关键词：卵形鲳鲹基因表达 PPARα CPTI 非诺贝特 RT-PCR分析

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雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼群体分化研究

雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼群体分化研究

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2016年中国水产学会学术年会

作者：廖健黄承勤龙水生郭昱嵩王中铎广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

为探索雷州半岛两岸新纪录种湖栖鳍虾虎鱼遗传差异,选取COI基因和控制区序列作为分子标记分析两岸群体遗传结构。COI结果显示:变异位点29个;T、C、A、G碱基组成分别为:27.8%、31.0%、23.7%、17.5%,且A+T(51.5%)高于C+G(48.5%);单倍型多... 详细信息

为探索雷州半岛两岸新纪录种湖栖鳍虾虎鱼遗传差异,选取COI基因和控制区序列作为分子标记分析两岸群体遗传结构。COI结果显示:变异位点29个;T、C、A、G碱基组成分别为:27.8%、31.0%、23.7%、17.5%,且A+T(51.5%)高于C+G(48.5%);单倍型多样性比较,九龙山群体(0.695)>高桥群体(0.324);遗传分化分析表明东、西群体分化显著(Snn=0.0.591,0.01

关键词： COI D-loop 湖栖鳍虾虎鱼遗传分化

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雷州半岛3种棘鲷属鱼类cox1基因序列分析及系统进化

雷州半岛3种棘鲷属鱼类cox1基因序列分析及系统进化

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2016年中国水产学会学术年会

作者：龙水生廖健黄承勤张海瑞黄顺楷王中铎广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

对雷州半岛3种棘鲷属鱼类cox1基因序列分析及系统进化研究,经PCR扩增与序列测定获得594bp的cox1基因片段,碱基A﹑T﹑G﹑C的平均含量分别为24.0%﹑31.5%﹑18.1%﹑26.4%,A+T的含量为55.5%,C+G的含量为44.5%;在密码子使用频率中,密码子使... 详细信息

对雷州半岛3种棘鲷属鱼类cox1基因序列分析及系统进化研究,经PCR扩增与序列测定获得594bp的cox1基因片段,碱基A﹑T﹑G﹑C的平均含量分别为24.0%﹑31.5%﹑18.1%﹑26.4%,A+T的含量为55.5%,C+G的含量为44.5%;在密码子使用频率中,密码子使用频率存在偏向性,AUU(苯丙氨酸,F)的平均使用频率最高;44个个体中存在12个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.8425,核苷酸多样性(Pi)为0.05695,平均核苷酸差异数(K)为33.828;灰鳍棘鲷和黄鳍棘鲷的种间遗传距离最大(0.114),其次是灰鳍棘鲷和黑棘鲷的种间遗传距离(0.086)和黄鳍棘鲷和黑棘鲷的种间遗传距离(0.086);从系统进化树上看,灰鳍棘鲷是最原始的种,黑棘鲷和黄鳍棘鲷是比灰鳍棘鲷晚分化出来的种。雷州半岛棘鲷属鱼类遗传多样性较丰富,有较强的环境适应能力,种质资源具有良好的遗传改良潜力。

关键词：棘鲷属﹑cox1基因﹑序列﹑遗传多样性

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基于16SrRNA基因部分序列的8种虾虎鱼科鱼类系统发育关系分析

基于16SrRNA基因部分序列的8种虾虎鱼科鱼类系统发育关系分析

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2016年中国水产学会学术年会

作者：黄元佳全秋梅贺亮刘丽广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室

本研究对采自海陵岛的4种虾虎鱼科鱼类进行16SrRNA基因特异扩增测序,并与从GenBank下载的11条同源序列结合,共15条序列进行序列联合分析和系统发育研究。研究表明:15条序列T、C、A、G碱基含量分别为21.5%,25.0%,30.6%,22.9%,有保守位点... 详细信息

本研究对采自海陵岛的4种虾虎鱼科鱼类进行16SrRNA基因特异扩增测序,并与从GenBank下载的11条同源序列结合,共15条序列进行序列联合分析和系统发育研究。研究表明:15条序列T、C、A、G碱基含量分别为21.5%,25.0%,30.6%,22.9%,有保守位点333个,变异位点153个,简约信息位点131个,单一突变位点22个。运用MAGA6计算8种虾虎鱼科鱼类之间的遗传距离,结果显示8种虾虎鱼科鱼类的平均遗传距离为0.1329,其中犬牙细棘虾虎鱼和红狼牙虾虎鱼的种间遗传距离最大,青弹涂鱼和大弹涂鱼的遗传距离最小。利用最小进化法和邻位连接法构建分子系统发育树,两种方法构建的系统发育树的拓扑结构完全相同,其中斑纹舌虾虎鱼位于进化树的基部,拟矛尾虾虎鱼位于进化树的顶端。研究旨为虾虎鱼科鱼类的分类提供依据,并为其进一步的研究和保护提供参考。

关键词：虾虎鱼 16SrRNA 系统进化海陵岛

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澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚排卵前后小穗生长特征

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生态学报 2015年第2期35卷 306-312页

作者：申玉春杨小东刘丽金磊广东海洋大学水产学院、南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室湛江524025

澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚排卵前后分别采集珊瑚小穗,在实验室条件下进行为期60 d的养殖,观察其生长特性,结果表明:3种珊瑚排卵前后骨骼密度变化在1.541—2.137 g/cm3之间,差异不显著。3种珊瑚小穗的生长率表现出相对一致... 详细信息

澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚排卵前后分别采集珊瑚小穗,在实验室条件下进行为期60 d的养殖,观察其生长特性,结果表明:3种珊瑚排卵前后骨骼密度变化在1.541—2.137 g/cm3之间,差异不显著。3种珊瑚小穗的生长率表现出相对一致的变化趋势,同一规格珊瑚小穗排卵前期生长率明显高于排卵后期;同一时期大规格珊瑚小穗生长率明显高于小规格珊瑚小穗,而且养殖中后期生长较快,养殖前期生长较慢,差异显著(P<0.05)。澄黄滨珊瑚小穗边缘组织延伸度排卵后期大于排卵前期,大管孔珊瑚小穗边缘组织延伸度排卵前期大于排卵后期,以上两种珊瑚的小规格珊瑚小穗与大规格珊瑚小穗组织延伸度相当。随着养殖时间的持续,丛生盔形珊瑚小穗螅体增殖速率加快,各养殖阶段螅体数差异显著(P<0.05),珊瑚小穗规格和养殖季节对其小穗螅体增殖数量没有显著影响。3种珊瑚小穗生长指标间多呈显著正相关,仅大管孔珊瑚小穗初始直径、初始重量与组织延伸度间,以及丛生盔形珊瑚小穗初始重量与初始螅体数量、生长率间相关性不明显。

关键词：生长率组织延伸度排卵期珊瑚小穗

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千年笛鲷早期发育及视蛋白基因表达规律分析

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水生生物学报 2015年第4期39卷 758-765页

作者：谢子强王中铎郭昱嵩刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室湛江524025

初步观察千年笛鲷早期发育各个时期的形态特征,同时使用实时荧光定量PCR方法对4种视蛋白基因在早期发育中的表达规律进行分析。研究观察到千年笛鲷卵为圆球形,属浮性卵,中心有一明显的油球。在水温(24.5±0.5)℃的条件下,千年笛鲷... 详细信息

初步观察千年笛鲷早期发育各个时期的形态特征,同时使用实时荧光定量PCR方法对4种视蛋白基因在早期发育中的表达规律进行分析。研究观察到千年笛鲷卵为圆球形,属浮性卵,中心有一明显的油球。在水温(24.5±0.5)℃的条件下,千年笛鲷胚胎发育共经历6个发育阶段18个时期,从受精卵到孵化一共经历24h。仔鱼经历12—15d发育为稚鱼,30d—35d发育为幼鱼。同时对7个胚胎发育时期和2个仔鱼发育时期4种视蛋白(LWS、SWS1、SWS2、RH)基因的表达情况进行检测,在下包1/2、胚孔封闭、视囊这3个时期有显著性表达(P<0.05),尤其在胚孔封闭时期,表达量达到最高。其余时期4种基因的表达水平显著下降,但在2个仔鱼时期表达量比孵化期略有增加。结果表明千年笛鲷4种视蛋白基因在早期表达过程中与神经胚的形成有密切的联系。

关键词：千年笛鲷早期发育视蛋白基因实时荧光定量PCR

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