本文使用高通量测序技术Illumina HiSeqTM2000对稀杯盔形珊瑚(Galaxea astreata)进行转录组测序分析,共获得50360620条短序列(reads).利用Trinity软件对所有reads从头组装后得到81014条单基因簇(unigenes).60471条(74.58%)编码蛋白框(Coding Sequences,CDs).与Nr(Non-redundant,非冗余)、COG Cluster of Orthologous Groups of proteins,蛋白相邻类的聚簇)、KEGG Kyoto encyclopedia of genes and genomes,京都基因与基因组百科全书)、Swissprot四大数据库比对共获得36545条注释基因.其中与C0G数据库比对获得14491条注释基因并分为24个功能类别,参与一般功能预测类的unigene数最多,有4642条;KEGG分析比对获得16021条注释基因,分成241类,包括代谢通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路等,在所有通路中参与代谢途径的基因数最多共有2450条(15.29%);GO(Gene Ontology,基因本体)功能分类将unigene分为47个类别.本次研究获得了稀杯盔形珊瑚大量的unigene,为挖掘新的功能基因,如:耐热基因、钙化基因等提供可能,也为了解珊瑚对环境变化的适应性打下基础.
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