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磷酸化蛋白质组学联合蛋白质组学分析敲除维甲酸诱导蛋白16对人结肠癌细胞的影响

肿瘤防治研究 2024年第10期51卷 820-830页

作者：陈奕孛苗根王文丁翠玲戚中田海军军医大学海军医学系生物医学防护教研室上海200433 海军军医大学海军医学系海军营养与食品卫生学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的分析人结肠癌HCT116细胞敲除维甲酸诱导蛋白16(RAI16)后细胞内总蛋白及磷酸化蛋白质表达的差异,探究RAI16影响HCT116细胞蛋白质功能的可能机制及相关信号通路。方法收集并提取HCT116 KO和WT细胞蛋白,SDS-PAGE检验蛋白提取效果。利... 详细信息

目的分析人结肠癌HCT116细胞敲除维甲酸诱导蛋白16(RAI16)后细胞内总蛋白及磷酸化蛋白质表达的差异,探究RAI16影响HCT116细胞蛋白质功能的可能机制及相关信号通路。方法收集并提取HCT116 KO和WT细胞蛋白,SDS-PAGE检验蛋白提取效果。利用胰蛋白酶酶解蛋白后,标记肽段并进行质谱分析。对鉴定到的差异蛋白及差异磷酸化蛋白质利用GO数据库、KEGG数据库和STRING数据库进行生物信息学分析。结果SDS-PAGE结果提示蛋白无明显降解,且实验组与对照组部分关键条带有明显差异;按Foldchange≥1.5或Foldchange≤1/1.5且P<0.05为条件进行差异蛋白的筛选,共筛选出147个上调差异蛋白和230个下调差异蛋白;并筛选到106个上调磷酸化位点和217个下调磷酸化位点。将去本底差异磷酸化位点功能GO富集分析,发现差异蛋白主要在核质、细胞核及细胞质组成,RNA、钙黏着蛋白及染色质结合,DNA修复、RNA剪接及DNA为模板转录的正调控等多个方面有显著富集趋势。KEGG富集结果显示,差异蛋白主要在核质转运、剪接体、细胞周期、细胞间紧密连接、病毒致癌作用和癌症中的微小RNA等通路具有显著富集趋势。蛋白互作网络主要以DDX17、NCL、EEF2、CDK1、SSRP1和SMARCC1为核心蛋白质。统计发现,SKP1、ORC1和BAD等两组学差异变化均上调,且磷酸化差异变化比蛋白差异变化更显著,RBL1、RB1、CDK1、CDC6、MCM4、TFDP1、CHD4和SNW1等两组学差异变化均下调,且磷酸化差异变化比蛋白差异变化更显著。结论RAI16可能通过SKP1、ORC1、RB1和CDK1等关键蛋白质在多方面生物功能和多条信号通路中发挥作用,影响细胞周期,进而影响癌症发生发展。

关键词：结肠癌维甲酸诱导蛋白16 HCT116细胞磷酸化蛋白质组学

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谷胱甘肽过氧化物酶在胶质瘤患者中的表达及对生存预后的影响

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中国医学科学院学报 2022年第2期44卷 276-285页

作者：任晓梅张立辛宝钱文文夏曾润祁蒙杜小平史传道刘启玲张荣强陕西中医药大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室陕西咸阳712046 青岛大学医学院附属烟台毓璜顶医院临床营养科山东烟台264000 安康市富硒产品研发中心陕西安康725000 陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室陕西咸阳712046

目的探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在胶质瘤组织表达变化与生存预后的关系,构建和评价GPX对胶质瘤患者生存预后的列线图预测模型。方法从肿瘤基因图谱计划数据库中下载胶质瘤患者数据集,获取663例患者的临床参数信息及其GPX表达水平,其... 详细信息

目的探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在胶质瘤组织表达变化与生存预后的关系,构建和评价GPX对胶质瘤患者生存预后的列线图预测模型。方法从肿瘤基因图谱计划数据库中下载胶质瘤患者数据集,获取663例患者的临床参数信息及其GPX表达水平,其中胶质母细胞瘤(GBM)153例、低级别胶质瘤(LGG)510例,分析GPX表达与患者生存之间的关系,利用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选变量,并使用最小绝对收缩选择算子(Lasso)回归进行再次筛选验证,基于筛查结果构建列线图模型,采用一致性指数评价预测模型的区分度,校准曲线评价模型的校准度。结果与对照组相比,GPX1、GPX3、GPX4、GPX7、GPX8的表达在胶质瘤患者中显著升高(P均<0.001),且除GPX3外,GBM患者的表达显著高于LGG患者(P均<0.001);Kaplan-Meier分析显示,GPX1(P=0.013)和GPX4(P=0.040)高表达的GBM患者无进展生存期显著缩短,GPX1、GPX7和GPX8高表达的LGG患者总生存率、疾病特异性生存期和无进展生存期显著缩短(P均<0.001);单因素和多因素Cox及Lasso回归筛选出GPX7和GPX8为影响LGG患者预后的关键因素;利用该结果构建列线图显示,最终进入模型的危险因素为GPX7,一致性指数为0.843(95%CI=0.809~0.853),校准曲线显示预测值与实际值具有较好的一致性。结论GPX7是影响LGG患者预后的独立危险因素,利用其构建的列线图模型可以较好地预测LGG患者的生存率。

关键词：胶质瘤谷胱甘肽过氧化物酶预后模型

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基于数据挖掘的马齿苋治疗非酒精性脂肪肝机制研究

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中华全科医学 2021年第6期19卷 950-953页

作者：王鑫吴巧敏汤雨潇张美芳陈洁文上海交通大学医学院附属第九人民医院临床营养科上海201900 海军军医大学海军医学系营养与食品卫生学教研室上海200433

目的探讨马齿苋治疗非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)的分子基础与作用机制。方法通过TCMSP、Drug Bank、Uniprot等数据库,筛选出马齿苋的有效活性成分及其作用靶点。利用Drugbank、OMMI、GeneCards等数据库... 详细信息

目的探讨马齿苋治疗非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)的分子基础与作用机制。方法通过TCMSP、Drug Bank、Uniprot等数据库,筛选出马齿苋的有效活性成分及其作用靶点。利用Drugbank、OMMI、GeneCards等数据库找出与NAFLD相关的基因靶点,最后取两者交集。最后利用DAVID数据库进行KEGG和GO富集分析。结果通过筛选得出马齿苋有10种有效成分,其中槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷固醇、β-胡萝卜素是主要活性成分。共得到85个关键交集靶点,其中肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(CASP)、Ser/Thr蛋白激酶(AKT1)、炎症趋化因子(CCL2)为重要靶点。DAVID富集分析显示,GO功能分析主要参与调控炎症反应(P<0.001)、细胞缺氧(P<0.001)、凋亡(P<0.001)、相似蛋白质结合(P<0.001)、蛋白质二聚化活性(P<0.001)、细胞因子活性(P<0.001)等方面。KEGG富集分析主要与TNF(P<0.001)、细胞凋亡(P<0.001)、TLR(P<0.001)、NF-κB(P<0.001)等信号通路有关。结论本研究通过初步探讨马齿苋治疗NAFLD的潜在靶点和相关信号通路,为进一步深入揭示其作用机制及开发马齿苋功能性食品提供了理论依据。

关键词：马齿苋非酒精性脂肪肝网络药理学

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医学生食品营养标签知识、态度及行为调查

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中国健康教育 2015年第11期31卷 1046-1048,1072页

作者：徐上知刘玉张鹭李述刚牛强郑荣华冯刚玲丁玉松木拉提王海霞郭淑霞石河子大学医学院预防医学系营养与食品卫生学教研室新疆石河子832000

目的对石河子大学医学院大学生食品营养标签知识、态度及行为情况进行调查,为医学生食品营养标签健康教育提供依据。方法随机抽取医学院1989名大学生进行食品营养标签知识、态度及行为问卷调查。结果医学生食品营养标签知识平均得分为(4... 详细信息

目的对石河子大学医学院大学生食品营养标签知识、态度及行为情况进行调查,为医学生食品营养标签健康教育提供依据。方法随机抽取医学院1989名大学生进行食品营养标签知识、态度及行为问卷调查。结果医学生食品营养标签知识平均得分为(4.83±1.79)分,不同专业知识得分不全相同,其中预防专业学生得分最高[(5.93±1.91)分],影像专业学生得分最低[(4.51±1.41)分],差异有统计学意义(χ~2=80.826,P=0.000);各年级知识得分不全相同,总体来说年级越高得分越高,差异有统计学意义(χ~2=52.978,P=0.000);女生得分[(4.87±1.72)分]高于男生[(4.79±1.88)分],差异有统计学意义(Z=-0.831,P=0.001)。书籍、报纸或杂志是大学生获得食品营养标签知识的主要途径。80.1%(1593/1989)的学生认为有必要在食品包装上标注营养标签,19.5%(117/600)的学生对食品营养标签的内容与形式比较满意,30.2%(600/1989)的学生经常阅读食品营养标签。结论医学生食品营养标签知识得分不高,需要加强宣教和引导,普及营养知识,提高大学生对营养标签的认知和科学使用。

关键词：医学生知识-态度-行为食品营养标签

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石河子大学学生营养知识态度膳食行为状况

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中国学校卫生 2014年第5期35卷 649-650,653页

作者：付蕾徐上知冯刚玲牛强李述刚木拉提丁玉松郑荣华马儒林唐美娥浙江绿城心血管医院杭州310000 石河子大学医学院营养与食品卫生学教研室

目的了解石河子大学学生膳食营养知识、态度及行为状况,为进一步开展营养教育和健康促进提供依据。方法多阶段随机抽取石河子大学13个学院名学生进行膳食营养知识、态度及行为问卷调查。结果石河子大学学生营养知识平均得分为(3.28±... 详细信息

目的了解石河子大学学生膳食营养知识、态度及行为状况,为进一步开展营养教育和健康促进提供依据。方法多阶段随机抽取石河子大学13个学院名学生进行膳食营养知识、态度及行为问卷调查。结果石河子大学学生营养知识平均得分为(3.28±1.82)分。其中女生(3.70±1.75)高于男生的(2.96±1.81)分;汉族学生(3.17±1.79)高于少数民族学生的(2.62±1.70)分;学过营养相关课程学生(3.76±1.92)高于未学过学生的(2.99±1.70)分,差异均有统计学意义(P值均<0.05)。电视、网络是大学生获取营养相关信息和知识的主要途径。对营养问题感兴趣的学生占76.2%(1 445/1 896),没有兴趣的仅占4.6%(88/1 896)。对于吃早餐的行为,坚持天天吃早餐的占58.4%(1 108/1 896)。结论大学生营养知识得分整体不高,不同性别、民族及是否学过营养学课程是大学生营养知识得分的主要影响因素。

关键词：营养状况健康知识,态度,实践饮食习惯学生

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锌离子螯合剂TPEN对脂多糖诱导的BV2细胞NF-кB P65、iNOS表达的影响

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神经解剖学杂志 2013年第4期29卷 410-414页

作者：陆颖韩毓王娟徐广飞南通大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室南通226019 南通大学公共卫生学院职业医学与环境毒理学教研室南通226019 南通大学医学院临床教学综合实验室南通226019

目的:观察锌离子螯合剂TPEN对脂多糖(LPS)刺激下小鼠BV2小胶质细胞核转录因子NF-кB P65亚基磷酸化及诱导型一氧化氮合酶(iNOS)mRNA表达的影响。方法:体外培养BV2细胞,用不同药物进行孵育,分组如下:正常对照组,单独LPS组,TPEN与LPS共处... 详细信息

目的:观察锌离子螯合剂TPEN对脂多糖(LPS)刺激下小鼠BV2小胶质细胞核转录因子NF-кB P65亚基磷酸化及诱导型一氧化氮合酶(iNOS)mRNA表达的影响。方法:体外培养BV2细胞,用不同药物进行孵育,分组如下:正常对照组,单独LPS组,TPEN与LPS共处理组,NF-кB抑制剂BAY11-7082和LPS共处理组。采用实时荧光定量PCR法检测iNOS mRNA表达,Western Blot法检测磷酸化NF-кB P65(p-P65)蛋白表达。结果:TPEN浓度依赖性地减少LPS诱导的p-P65蛋白和iNOS mRNA表达,BAY11-7082浓度依赖性抑制LPS诱导的iNOSmRNA表达的上调。结论:TPEN能够减少LPS诱导的BV2细胞iNOS mRNA表达,该作用可能与其抑制NF-кB信号通路的激活有关。

关键词： TPEN 脂多糖 BV2细胞核转录因子кB 诱导型一氧化氮合酶

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大学生食品安全知识、态度及行为调查

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中国公共卫生 2013年第10期29卷 1512-1514页

作者：徐上知张东星马丹郭朋鸽廖彦秋张学飞戚元亮石河子大学医学院预防医学系营养与食品卫生学教研室新疆石河子832000

目的对石河子大学大学生食品安全知识、态度及行为情况进行调查,并分析其影响因素,为大学生食品安全健康教育提供依据。方法随机抽取17个学院1 492名大学生进行食品安全知识、态度及行为问卷调查。结果大学生食品安全知识平均得分(5.65&... 详细信息

目的对石河子大学大学生食品安全知识、态度及行为情况进行调查,并分析其影响因素,为大学生食品安全健康教育提供依据。方法随机抽取17个学院1 492名大学生进行食品安全知识、态度及行为问卷调查。结果大学生食品安全知识平均得分(5.65±2.00)分,医学生得分[(5.77±1.87)分]高于非医学生[(5.46±2.17)分],差异有统计学意义(Z=-2.51,P=0.01);女生得分[(5.83±1.88)分]高于男生[(5.39±2.13)分],差异有统计学意义(Z=-4.00,P=0.00);汉族得分[(5.79±1.97)分]高于少数民族[(5.01±1.99)分],差异有统计学意义(Z=-5.38,P=0.00);学过食品相关课程的学生得分[(5.98±2.00)分]高于未学过的学生[(5.51±1.99)],差异有统计学意义(Z=-2.67,P=0.01);电视、网络是大学生获取食品安全信息和知识的主要途径。结论大学生食品安全知识得分不高,不同学院、性别、民族及是否学过营养学或食品安全相关课程是大学生食品安全知识得分的主要影响因素。

关键词：大学生食品安全知识-态度-行为

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原发性肝细胞癌细胞系和组织中ARID2的表达

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郑州大学学报（医学版） 2013年第6期48卷 786-788页

作者：姬旭慧张玲张江波陈丹丹刘媛鲁凤民吕全军郑州大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室郑州450001 河南省肿瘤医院肝胆胰外科郑州450008 北京大学医学部基础医学院北京100191

目的:探讨原发性肝细胞癌(HCC)细胞系和组织中ARID2 mRNA的表达与原发性HCC发生发展的关系。方法:应用实时定量荧光PCR方法检测9种HCC细胞系和组织中ARID2 mRNA的表达。结果:不同感染背景下HCC细胞中ARID2 mRNA表达水平不同。与正常肝... 详细信息

目的:探讨原发性肝细胞癌(HCC)细胞系和组织中ARID2 mRNA的表达与原发性HCC发生发展的关系。方法:应用实时定量荧光PCR方法检测9种HCC细胞系和组织中ARID2 mRNA的表达。结果:不同感染背景下HCC细胞中ARID2 mRNA表达水平不同。与正常肝组织相比,ARID2 mRNA在HCC癌旁组织中的表达水平下降(有HBV感染:Z=10.684,P<0.05;无HBV感染:Z=16.015,P<0.05);在无HBV感染背景的HCC组织和配对癌旁组织中ARID2 mRNA表达水平差异有统计学意义(Z=1.886,P<0.05)。不同感染背景的HCC组织中ARID2 mRNA的表达差异有统计学意义(Z=13.479,P<0.001)。结论:ARID2可能与原发性肝细胞癌的发生发展相关。

关键词：人源ARID2蛋白肝肿瘤肝炎病毒,乙型

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石河子大学学生膳食营养知识态度行为

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中国学校卫生 2013年第11期34卷 1306-1308页

作者：徐上知付蕾牛冰马丹牛强李述刚木拉提丁玉松郑荣华冯刚玲石河子大学医学院营养与食品卫生学教研室新疆832000 新疆心脑血管病医院武警新疆总队直升机大队卫生所

目的了解石河子大学学生的营养知识、态度和膳食行为现状,并探讨其影响因素,为开展营养知识教育提供依据。方法采用自制的大学生营养调查问卷,随机抽取石河子大学14个学院2 656名大学生进行营养知识、态度及行为调查。结果大学生膳食营... 详细信息

目的了解石河子大学学生的营养知识、态度和膳食行为现状,并探讨其影响因素,为开展营养知识教育提供依据。方法采用自制的大学生营养调查问卷,随机抽取石河子大学14个学院2 656名大学生进行营养知识、态度及行为调查。结果大学生膳食营养知识平均得分为(3.40±1.80)分,医学生得分(3.71±1.69)高于非医学生(3.28±1.82),差异有统计学意义(Z=-5.57,P<0.05);女生得分(3.71±1.70)高于男生(3.13±1.83),差异有统计学意义(Z=-8.46,P<0.05);汉族学生得分(3.57±1.77)高于少数民族学生(2.62±1.70),差异有统计学意义(Z=10.73,P<0.05)。电视(57.6%)、网络(51.4%)是大学生获取营养相关信息和知识的主要途径。结论大学生营养知识得分不高,不同学院、性别、民族是大学生营养知识得分的主要影响因素。

关键词：饮食习惯健康知识态度实践学生营养调查

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石河子大学学生食品安全知信行调查

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中国学校卫生 2013年第5期34卷 531-533页

作者：徐上知付蕾牛冰张东星马丹郭朋鸽廖彦秋张学飞戚元亮石河子大学医学院预防医学系营养与食品卫生学教研室新疆832000 新疆心脑血管病医院武警新疆总队直升机大队卫生所

目的了解石河子大学学生食品安全知识、态度、行为现状及其影响因素,为大学生食品安全健康教育提供参考依据。方法采用多阶段分层随机整群抽样方法,抽取石河子大学16个学院大学生567名进行自编食品安全知识、态度及行为问卷调查。结果... 详细信息

目的了解石河子大学学生食品安全知识、态度、行为现状及其影响因素,为大学生食品安全健康教育提供参考依据。方法采用多阶段分层随机整群抽样方法,抽取石河子大学16个学院大学生567名进行自编食品安全知识、态度及行为问卷调查。结果大学生食品安全知识平均得分为(5.46±2.17)分,其中女生得分(5.74±2.74)高于男生(5.18±2.17),汉族学生得分(5.54±2.56)高于少数民族学生(4.92±2.23),月消费在301～400元的学生得分最高,差异均有统计学意义(P值均<0.05)。电视(54.5%)、网络(54.1%)是大学生获取食品安全信息和知识的主要途径。大学生食品购买场所主要在超市(80.8%)。当遭受到劣质食品侵害时,选择与经营者交涉更换或退货的占22.4%。结论大学生食品安全知识掌握欠缺,性别、民族、月消费水平是影响大学生食品安全知识得分的主要因素。应有针对性地开展高校营养健康教育工作。

关键词：食品安全健康知识态度实践学生

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