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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：严思仪蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州 350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

借助对结构敏感的振动探针(酰胺-Ⅰ带)探索天冬酰胺二肽在气相中结构与光谱特征的相关性.研究结果表明,天冬酰胺二肽处于不同构象时振动光谱参数表现出了显著的差异,酰胺-Ⅰ带吸收峰的频率、峰宽对多肽二级结构表现出了明显的特异性,为... 详细信息

借助对结构敏感的振动探针(酰胺-Ⅰ带)探索天冬酰胺二肽在气相中结构与光谱特征的相关性.研究结果表明,天冬酰胺二肽处于不同构象时振动光谱参数表现出了显著的差异,酰胺-Ⅰ带吸收峰的频率、峰宽对多肽二级结构表现出了明显的特异性,为借助振动光谱探针探究多肽二级结构提供了必要的理论依据.

关键词：天冬酰胺二肽酰胺-Ⅰ带振动光谱二级结构

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赖氨酸二肽二级结构与振动光谱特性研究

赖氨酸二肽二级结构与振动光谱特性研究

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：庄丹玲蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州 350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门 361005

利用量子化学方法,在B3LYP/6-31+G(d)水平上系统考察气相中赖氨酸二肽(lysine dipeptide,LYSD)分子骨架上对二级结构敏感的振动探针——酰胺-Ⅰ带的振动光谱.通过势能分布(potential energy distribution,PED)分析方法对酰胺-Ⅰ带振动... 详细信息

利用量子化学方法,在B3LYP/6-31+G(d)水平上系统考察气相中赖氨酸二肽(lysine dipeptide,LYSD)分子骨架上对二级结构敏感的振动探针——酰胺-Ⅰ带的振动光谱.通过势能分布(potential energy distribution,PED)分析方法对酰胺-Ⅰ带振动模式进行指认,探究酰胺-Ⅰ带振动频率与二肽二级结构之间的相关性,为二肽构象态预测提供了有效途径.

关键词：赖氨酸二肽二级结构酰胺-Ⅰ带振动光谱

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溶液中石墨烯界面上Aβ(37-42)振动光谱研究

溶液中石墨烯界面上Aβ(37-42)振动光谱研究

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：杜芬芬郑轩郑荣珍蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州 350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

开展分子动力学模拟,探究溶液中石墨烯界面上Aβ(37-42)片段的动态结构及其表现的振动光谱特征.借助Aβ骨架上酰胺-A带吸收光谱表征其结构变化,为探究石墨烯对Aβ折叠机制的影响提供有力的理论支持.

关键词： β-淀粉样蛋白石墨烯界面振动光谱酰胺-A带

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β-叠氮基丙氨酸二肽振动光谱研究

β-叠氮基丙氨酸二肽振动光谱研究

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：刘亚男郑轩蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州 350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

开展分子动力学模拟,探索了β-叠氮基丙氨酸二肽(β-azidoalanine dipeptide,AAD)在重水中的全原子运动轨迹.将溶剂所产生的静电作用与叠氮基在气/液相中振动频率的频移值相关联,拟合并建立叠氮基振动频率图,实现了溶液相中叠氮基振动... 详细信息

开展分子动力学模拟,探索了β-叠氮基丙氨酸二肽(β-azidoalanine dipeptide,AAD)在重水中的全原子运动轨迹.将溶剂所产生的静电作用与叠氮基在气/液相中振动频率的频移值相关联,拟合并建立叠氮基振动频率图,实现了溶液相中叠氮基振动频率的快速预测,从而借助叠氮基探针振动光谱实现对多肽分子动态结构的实时监测.

关键词： β-叠氮基丙氨酸二肽结构监测振动光谱分子动力学模拟

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β(1→4)糖苷键振动光谱与纤维二糖结构的相关性研究

β(1→4)糖苷键振动光谱与纤维二糖结构的相关性研究

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：刘佳蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

选取了β(1→4)糖苷键作为结构探针,在B3LYP/6-31+G(d)水平上比较了真空环境及在离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐(C4mimCl)中的纤维二糖的特征振动光谱参数,建立起糖苷键振动频率与纤维二糖结构之间的相关性.研究结果为观测溶剂化状态下... 详细信息

选取了β(1→4)糖苷键作为结构探针,在B3LYP/6-31+G(d)水平上比较了真空环境及在离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐(C4mimCl)中的纤维二糖的特征振动光谱参数,建立起糖苷键振动频率与纤维二糖结构之间的相关性.研究结果为观测溶剂化状态下的糖类结构行为提供了理论支持.

关键词：纤维二糖分子构象真空环境离子液体糖苷键振动光谱

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丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图

丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：郑轩蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门 361005

基于分子力学力场构建了丙氨酸二肽(ALAD)在重水溶剂中的酰胺-Ⅰ带振动频率图,将溶剂作用以静电势场的形式投影至ALAD分子骨架中,并且引入骨架二面角对酰胺-Ⅰ带的影响,实现处于不同构象态的ALAD中酰胺-Ⅰ带光谱的快速准确预测.

关键词：丙氨酸二肽振动频率图酰胺-Ⅰ带二级结构

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炔丙基修饰的甘氨酸二肽的振动光谱研究

炔丙基修饰的甘氨酸二肽的振动光谱研究

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：郑荣珍蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门361005

选取了炔丙基作为多肽二级结构探针,模拟炔丙基修饰的甘氨酸二肽在水溶液中的结构动力学特性,构建炔丙基甘氨酸二肽中炔丙基的振动频率图,实现对其振动光谱的快速预测,进一步建立了炔丙基的振动光谱与多肽二级结构之间的相关性.

关键词：氨酸二肽二级结构炔丙基振动光谱

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连续进样一体式免拆卸的红外液体样品池

连续进样一体式免拆卸的红外液体样品池

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：郑荣珍蔡开聪福建师范大学化学与化工学院福建福州 350007 福建省理论与计算化学重点实验室福建厦门 361005

设计了一种固定光程的可自动连续进样的一体式免拆卸红外液体样品池,可用于液体样品的红外光谱测定,尤其适用于易挥发、接触角小等以传统液膜法难以制样的液体样品,并采用微型蠕动泵对样品进行连续进样从而实现红外光谱的实时检测.

关键词：红外光谱红外液体样品池连续进样微型蠕动泵

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Codon Usage Database自动寻错平台CUDer的组建与应用

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生物信息学 2011年第3期9卷 242-246,249页

作者：余劲聪方柏山福建省高校工业生物技术重点实验室(华侨大学) 厦门361021 厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系厦门361005

密码子用法数据库(CUD)是密码子用法与密码子优化研究领域的一个重要的在线服务,为了找出该数据库中潜在的两种不再适用的记录,即已过期的陈旧记录和在遗传密码类型上实际无法有效支持的记录(简称不支持记录),本文通过结合前期自主研发... 详细信息

密码子用法数据库(CUD)是密码子用法与密码子优化研究领域的一个重要的在线服务,为了找出该数据库中潜在的两种不再适用的记录,即已过期的陈旧记录和在遗传密码类型上实际无法有效支持的记录(简称不支持记录),本文通过结合前期自主研发的两个软件BestCodon与CUDassist,组建了CUD自动寻错平台CUDer,并应用于上述问题的研究。结果发现,CUD中存在317条陈旧记录与4条不支持记录。对于陈旧记录,这些记录的物种分类号在NCBI中已发生变更,研究者应该避免使用这些记录的相关数据;对于不支持记录,本文借助CUDer计算得到这些记录正确的密码子用法表(CUT),弥补了当前CUD的不足。此外,该平台也为面向CUD的自动化数据处理,提供了一个新的软件框架,具有一定的借鉴意义。

关键词：密码子用法密码子用法表密码子用法数据库 CUDer平台生物信息学

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纳米La2O2CO3的结构对甲烷氧化偶联反应(OCM)的影响

纳米La2O2CO3的结构对甲烷氧化偶联反应(OCM)的影响

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第十七届全国催化学术会议

作者：侯玉慧翁维正夏文生万惠霖固体表面物理化学国家重点实验室醇醚酯清洁化工国家工程实验室福建省理论与计算化学重点实验室厦门大学化学化工学院厦门361005

随着石油的日益耗竭,以甲烷为主成分的天然气、页岩气的转化与利用吸引了人们的眼球,而甲烷直接转化--甲烷氧化偶联制C2+是其有效利用途径之一.本工作采用水热法成功制备了沿[112]和[110]方向生长的La2O2CO3纳米棒(记为La2O2CO3(H)和La2... 详细信息

随着石油的日益耗竭,以甲烷为主成分的天然气、页岩气的转化与利用吸引了人们的眼球,而甲烷直接转化--甲烷氧化偶联制C2+是其有效利用途径之一.本工作采用水热法成功制备了沿[112]和[110]方向生长的La2O2CO3纳米棒(记为La2O2CO3(H)和La2O2CO3(Href)).

关键词：纳米碳酸氧镧结构甲烷氧化偶联

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