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中国卫生统计 2023年第5期40卷 791-795,800页

作者：宋佳丽孙凤宇刘芝霖李康侯艳北京大学医学部生物统计系 100191 国家药品监督管理局药品审评中心哈尔滨医科大学卫生统计教研室

近年随着精准医疗的发展,越来越多的药物针对疾病的分子作用机制和特定靶点进行开发。在创新药物研发上,以生物标志物为导向的临床试验研究,即探索与药物疗效或安全性相关的生物标志物,根据其识别亚组并制定个体化治疗的临床试验方案,... 详细信息

近年随着精准医疗的发展,越来越多的药物针对疾病的分子作用机制和特定靶点进行开发。在创新药物研发上,以生物标志物为导向的临床试验研究,即探索与药物疗效或安全性相关的生物标志物,根据其识别亚组并制定个体化治疗的临床试验方案,从而使患者接受更有益的治疗、加速药物研发进程、最大限度地规避新药研发的风险,已引起人们的极大关注[1-3]。本文将对以生物标志物为导向的临床试验设计方法和特点进行简要综述,以期对创新药物研究起到一定的助力作用。

关键词：临床试验研究临床试验设计精准医疗个体化治疗新药研发生物标志物分子作用机制药物疗效

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基于生存结局加权多组学数据整合的胶质瘤分子分型

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中国卫生统计 2024年第5期41卷 644-649页

作者：贾聪聪杜港赵鑫师国京房瑞玲李治张岩波曹红艳山西医科大学卫生统计教研室 030001 山西医科大学公共卫生学院重大疾病风险评估山西省重点实验室煤炭环境致病与防治教育部重点实验室中北大学运动人体科学教研室

目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多... 详细信息

目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多组学数据进行结局加权整合分型,并拟合Cox比例风险模型评估不同分型患者预后。对不同分型间的差异表达基因(DEmiRNAs,DEmRNAs,DMGs)进行筛选,对DEmiRNAs靶基因、DEmRNAs、DMGs的重合基因进行GO功能注释;最后对不同分型患者进行免疫浸润分析。结果survClust将胶质瘤患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的2.931倍。不同分型差异基因的分布存在差异,共筛选出194个DEmiRNAs,3396个DEmRNAs,1230个DMGs。将189个重合基因进行GO功能注释,得到52条差异具有统计学意义的GO生物项。此外,不同分型在B淋巴细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和髓样树突状细胞的免疫浸润水平存在统计学差异。结论结局加权整合算法survClust能够有效识别兼具分子异质性和显著预后差异的胶质瘤亚型,同时基于分型结果筛选出的潜在生物标志物将为胶质瘤的个性化治疗提供科学理论依据。

关键词：生存结局加权聚类分子亚型多组学数据整合胶质瘤

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基于因果图模型的非小细胞肺癌治疗质量影响因素分析

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实用肿瘤学杂志 2024年第4期38卷 227-234页

作者：姚雪佩白山奇刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室哈尔滨150001

目的利用快速因果推断(Fast causal inference,FCI)算法构建因果图模型,分析影响非小细胞肺癌治疗质量的直接和间接因素,为改善患者治疗质量提供依据。方法收集10家三甲医院的非小细胞肺癌患者病例信息;确定影响因素为研究变量,不良事... 详细信息

目的利用快速因果推断(Fast causal inference,FCI)算法构建因果图模型,分析影响非小细胞肺癌治疗质量的直接和间接因素,为改善患者治疗质量提供依据。方法收集10家三甲医院的非小细胞肺癌患者病例信息;确定影响因素为研究变量,不良事件发生率为患者治疗质量评价指标,即结局变量;利用FCI算法挖掘病例数据,构建研究变量与结局的因果图模型,分析研究变量与结局变量及不同研究变量之间的因果关系。结果本研究共纳入2846例患者,平均年龄56.00±7.70岁,不良事件发生率为9.63%。因果图模型共包含24个节点,71条边,其中有向边54条,双向边7条。影响不良事件发生的直接因素包括医院类型、组织学分级、是否淋巴结清扫及住院天数;间接因素包括职业、医保类型、现病史、病理分期、综合治疗、手术性质及肺切除类型;因素间相互作用分析结果显示,现病史、组织学分型、综合治疗、手术性质、肺切除类型决定患者是否接受淋巴结清扫;手术性质、肺切除方式、综合治疗影响住院天数;既往史影响肺癌组织学分型;职业、医保类型影响患者就诊医院类型。结论在非小细胞肺癌治疗质量影响因素分析中,因果图模型能够获得影响不良事件发生的直接和间接因素,发现可干预的目标变量,为改善非小细胞治疗质量提供依据;医院可通过提高淋巴结清扫、综合治疗接受率,降低不良事件发生率。

关键词：非小细胞肺癌影响因素因果图模型快速因果推断算法

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基于双重稳健估计方法的非小细胞肺癌治疗过程对院内死亡的因果效应研究

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实用肿瘤学杂志 2024年第4期38卷 235-240页

作者：李健李倩妮徐灵燕姚雪佩刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室哈尔滨150081

目的基于双重稳健估计(Doubly robust,DR)方法估计非小细胞肺癌治疗过程对院内死亡的因果效应大小,为降低非小细胞肺癌院内死亡率提供参考依据。方法依据非小细胞肺癌治疗质量评价体系,计算治疗过程指标的使用率,以治疗过程质量均值得... 详细信息

目的基于双重稳健估计(Doubly robust,DR)方法估计非小细胞肺癌治疗过程对院内死亡的因果效应大小,为降低非小细胞肺癌院内死亡率提供参考依据。方法依据非小细胞肺癌治疗质量评价体系,计算治疗过程指标的使用率,以治疗过程质量均值得分为界限将患者划分为高质量组与低质量组。以院内死亡为结局指标,采用倾向性评分逆概率加权(Inverse probability of treatment weighting,IPTW)法校正的Kaplan-Meier法及Cox回归,分析治疗过程质量对非小细胞肺癌院内死亡的影响;结合DR估计治疗过程对院内死亡的因果效应大小。结果治疗过程指标使用率的中位数为66.88%,患者治疗过程质量得分为0.270±0.124,其中高质量组为0.358±0.069,低质量组为0.158±0.081。经过IPTW法加权后,患者基线特征标准化平均差(Standardized mean difference,SMD)减小;IPTW前后两组患者生存曲线间差异具有统计学意义(P<0.05),高质量组患者的预后优于低质量组患者(IPTW前:HR=0.367,95%CI:0.275~0.491;IPTW后:HR=0.228,95%CI:0.167~0.312)。与低质量组相比,高质量组患者治疗过程对院内死亡的平均因果效应大小为-0.026。结论DR可弥补logistic或IPTW的不足,规避模型出错的风险,可以获得治疗过程质量对院内死亡的因果效应。医疗实践中应提高治疗过程指标的使用率,从而改善患者预后;因果效应研究提示,除治疗过程外,影响院内死亡的其他因素也是不可忽略的。

关键词：非小细胞肺癌倾向性评分逆概率加权双重稳健估计治疗质量

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基于LASSO logistic回归模型的轻度认知障碍逆转预测模型

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中国卫生统计 2022年第5期39卷 653-658页

作者：秦瑶韩红娟陈杜荣王浩基葛晓燕白文琳崔靖余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室锦州医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的探讨轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)患者逆转为认知正常(normal cognition,NC)的相关因素并建立预测模型。方法基于美国公共数据库NACC,数据包括社会人口学信息、体格检查、疾病史、认知功能、抑郁状况、精神症状和... 详细信息

目的探讨轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)患者逆转为认知正常(normal cognition,NC)的相关因素并建立预测模型。方法基于美国公共数据库NACC,数据包括社会人口学信息、体格检查、疾病史、认知功能、抑郁状况、精神症状和日常活动功能,构建LASSO logistic回归模型筛选自变量,通过十折交叉验证法选择模型中的最优调和系数λ;采用AIC和BIC与全变量logistic回归和逐步logistic回归进行比较,基于AUC、Brier评分和校准曲线分别评价预测模型的区分度和准确度,并绘制森林图和列线图。结果共纳入397例MCI患者,其中124例MCI患者逆转为NC,逆转率为31.23%。LASSO logistic回归模型(λ=0.044),纳入的自变量为年龄、BMI、高脂血症、维生素B12缺乏症、他人报告认知障碍、FAQ、MMSE、CDR和动物命名正确数;AIC=188.364,BIC=232.187,均低于全变量logistic回归(207.940/299.570)和逐步logistic回归(196.489/260.232);AUC、Brier评分和校准曲线均显示LASSO logistic回归模型的区分度和准确度更好。结论MCI患者逆转为NC受多个因素影响,应关注未患有高脂血症和维生素B12缺乏症、日常活动功能和认知功能较好的低龄MCI患者,对其进行健康管理干预和预防性护理,减少其未来疾病进展的风险。

关键词：轻度认知障碍逆转认知正常 LASSO logistic回归模型

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伊犁哈萨克自治州农村地区35~74岁居民膳食多样性与高血压相关性研究

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中国预防医学杂志 2023年第8期24卷 795-800页

作者：阿丽亚·艾木都拉王璐穆凯丽席苗苗张焕文戴江红新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830017

目的膳食多样化评分(dietary diversity score,DDS)评价伊犁哈萨克自治州农村地区居民膳食质量,探讨膳食多样性与高血压的关系。方法2018年12月—2019年5月,在伊犁哈萨克自治州霍城县居民开展基线调查,采用半定量的食物频率问卷(food fr... 详细信息

目的膳食多样化评分(dietary diversity score,DDS)评价伊犁哈萨克自治州农村地区居民膳食质量,探讨膳食多样性与高血压的关系。方法2018年12月—2019年5月,在伊犁哈萨克自治州霍城县居民开展基线调查,采用半定量的食物频率问卷(food frequency questionnaires,FFQ)进行膳食调查,计算DDS。将DDS评分按四分位数划分为Q1(0~4分)、Q2(5分)、Q3(6分)、Q(7~9分)。比较高血压组与非高血压组研究对象膳食摄入情况及膳食多样性情况。采用非条件多元logistic回归模型,调整了性别、年龄、民族等混杂因素,探讨膳食多样性与高血压的相关性。结果本研究纳入5781人,男性2719例,女性3062例,年龄(50.96±9.96)岁,高血压2309例,检出率39.94%。总体DDS评分(5.62±1.50)分,低膳食多样性792例(13.70%),膳食种类摄入充足1573名(27.21%)。在9类食物种类中,调查对象谷类、蔬菜、水果、肉类、乳制品摄入较高,豆类、蛋类、鱼类、油脂类摄入较低。对混杂因素进行调整后,与DDS Q1组相比,Q3(OR=0.85,95%CI:0.74~0.97))、Q4(OR=0.74,95%CI:0.57~0.96)的DDS得分与高血压的低风险有相关性。结论DDS高得分与高血压低风险有关,坚持多样化饮食,可以有效预防高血压的发生。

关键词：高血压膳食多样化评分农村

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2004—2018年中国流行性感冒发病率的时空分析及其预测模型研究

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中华疾病控制杂志 2023年第2期27卷 176-183,190页

作者：刘云广黄茜张乐王朝才刘燕青海大学医学部公共卫生系卫生统计与卫生管理教研室西宁810001 青海省疾病预防控制中心传染病预防控制所西宁810007

目的分析2004―2018年中国流行性感冒(简称流感)发病的时空特征和预测发病率,为流感防控提供数据参考。方法获取2004―2018年全国流感发病率资料,采用Arcgis 10.8、Geoda和SaTScan 10.01软件分别进行流感发病率可视化分级地图绘制、空... 详细信息

目的分析2004―2018年中国流行性感冒(简称流感)发病的时空特征和预测发病率,为流感防控提供数据参考。方法获取2004―2018年全国流感发病率资料,采用Arcgis 10.8、Geoda和SaTScan 10.01软件分别进行流感发病率可视化分级地图绘制、空间自相关以及时空扫描分析,同时使用自回归移动平均(autoregressive integrated moving average model,ARIMA)模型、指数平滑(exponentialsmoothing,ETS)模型、指数平滑空间状态(trigonometric seasonality,Box-Cox transformation,TBATS)模型和神经网络自回归(neural network autoregression,NNAR)模型分别预测1年、2年、5年的发病率并比较准确度。结果2004―2018年全国流感的发病率逐年升高,北京市、华东和华南地区发病率明显高于全国平均水平。全国流感基本不存在全局相关但存在局部聚集。北京市和天津市长期呈现高-高或低-高聚集,2014―2016年福建省和江西省呈现高-高聚集。2014―2018年的时空扫描分析与空间相关分析结果基本一致,一类聚集区以江西省为中心、二类聚集区以北京市为中心。1年、2年和5年的最佳预测模型分别为NNAR、ETS和ARIMA模型。结论2004―2018年全国流感发病率逐年升高,北京市、华东和华南大部分地区成为流感的高发地区,各地可根据本地区流感的时空特征制定相应防控措施。

关键词：流行性感冒分级地图空间自相关时空扫描分析预测模型

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乳腺癌多维治疗质量纵向评价的趋势分析

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实用肿瘤学杂志 2024年第4期38卷 213-220页

作者：李倩妮徐灵燕李健姚雪佩刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室哈尔滨150081

目的基于潜变量增长混合模型(Latent growth mixture model,LGMM)分析乳腺癌多维度治疗质量的纵向趋势,识别潜在的变化模式及影响因素,为提高治疗质量和改善患者预后提供科学依据。方法选取国家“特定(单)病种质量监测系统”中连续4年... 详细信息

目的基于潜变量增长混合模型(Latent growth mixture model,LGMM)分析乳腺癌多维度治疗质量的纵向趋势,识别潜在的变化模式及影响因素,为提高治疗质量和改善患者预后提供科学依据。方法选取国家“特定(单)病种质量监测系统”中连续4年的乳腺癌质量监测数据;基于项目反应理论(Item response theory,IRT)计算乳腺癌在术前检查、治疗以及结局3个维度的治疗质量;构建LGMM分析乳腺癌各维度治疗质量的独立以及联合变化趋势,结合实际意义及统计指标确定最优模型。结果在独立变化趋势分析中,术前检查、治疗和结局维度均识别出2个潜在类别,其中,术前检查维度中呈快速上升趋势占9%、呈相对稳定趋势占91%;治疗维度中稳定增长占23%、缓慢下降占77%;结局维度中呈上升趋势占13%、呈下降趋势占87%。在联合变化趋势分析中,识别出2个潜在类别:第一类占比约8%,该类术前检查维度治疗质量较好,其截距和斜率均值分别为3.326和3.367,治疗和结局维度的治疗质量稳步提高;第二类占比约92%,该类治疗维度治疗质量较好,其截距和斜率均值分别为0.548和0.018,术前检查和结局维度的治疗质量仍有改善空间;患者特征中BMI和M分期是治疗质量联合变化趋势的重要影响因素。结论该研究期间乳腺癌治疗质量在术前检查、治疗和结局各维度均有不同程度的改善;在三个维度的联合变化趋势分析中,术前检查维度治疗质量的提高,可为后续治疗提供可行的参考,达到减少并发症的目的。

关键词：乳腺癌治疗质量潜变量增长混合模型变化趋势

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手足口病传播动力学模型的研究进展

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中华流行病学杂志 2022年第6期43卷 966-973页

作者：洪洁赵峥苏晴黄家祺陈希乐佳徐刘修良胡艺高道舟张志杰复旦大学公共卫生学院流行病学与卫生统计教研室上海200032 上海师范大学数学系上海200234

手足口病是由多种肠道病毒引起的常见儿童传染病,我国是全球手足口病报告发病、死亡最多的国家。掌握手足口病的流行规律,可为防控措施的有效制定提供针对性的科学依据。传播动力学模型着眼于传染病的传播机制,可通过增减、细分仓室来... 详细信息

手足口病是由多种肠道病毒引起的常见儿童传染病,我国是全球手足口病报告发病、死亡最多的国家。掌握手足口病的流行规律,可为防控措施的有效制定提供针对性的科学依据。传播动力学模型着眼于传染病的传播机制,可通过增减、细分仓室来模拟真实情景开展疾病的流行规律研究,灵活度较高,受到研究者们的关注。为了更有效地开展手足口病的动力学模型研究,全面了解该领域的相关研究进展是必要的。本文基于研究目的的不同对动力学模型的研究进展进行分类总结。回顾发现,现在的文献多是使用SIR动力学模型或其扩展模型(如SEIR模型),较少含有复杂的因素仓室,研究或通过对某区域的手足口病数据拟合以获得某些重要流行病学参数(如基本再生数);或对不同干预场景进行模拟,评估措施效果;或进行预测,揭示未来流行趋势;也有一些文章考虑了模型中参数的影响因素,尚无动力学模型同时考虑年龄结构、人口流动、季节性与周期性、疫苗接种等因素。

关键词：手足口病数学模型传播动力学

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研究生医学统计学课程思政教学设计与评价

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上海预防医学 2022年第7期34卷 719-723页

作者：吴骋秦婴逸武胜勇王睿海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433

【目的】开展医科院校研究生公共基础课程——医学统计学的课程思政教学设计,并进行实施和评价。【方法】通过专家咨询、文献查阅、调查研究等方法,从3个层面设计课程思政的教学要点,并通过调查问卷了解研究生对课程的认识和需求,评价... 详细信息

【目的】开展医科院校研究生公共基础课程——医学统计学的课程思政教学设计,并进行实施和评价。【方法】通过专家咨询、文献查阅、调查研究等方法,从3个层面设计课程思政的教学要点,并通过调查问卷了解研究生对课程的认识和需求,评价课程的思政效果。【结果】某高校2020级硕士研究生201人,有178人完成调查,占比为88.56%,回收有效问卷率100%。其中,84.27%的研究生认为有必要开展医学统计学课程思政教学,90.45%的研究生希望思政教学能结合案例进行。对比课前、课后的调查结果发现,研究生对待数据采集问题的正确认识有较大提升,从78.65%上升到100.00%;研究生的严谨治学精神从89.88%上升到97.75%。【结论】可结合案例开展研究生医学统计学课程思政教学;对于涉及知识技能实操方面的问题,思政教学效果更好。

关键词：研究生医学统计学课程思政设计实践评价

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