检索结果-内蒙古大学图书馆

中华疾病控制杂志 2023年第1期27卷 29-35页

作者：乔婷婷张焕文罗涛赵辉张国珍戴江红新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室乌鲁木齐830000

目的探寻血脂相关膳食模式与糖尿病的关联,为糖尿病的膳食干预提供科学依据。方法选取4 759名来自伊犁州霍城县的农村居民作为研究对象,通过问卷调查、体格检查及实验室检测收集研究对象的相关资料。通过降秩回归法提取血脂相关膳食模... 详细信息

目的探寻血脂相关膳食模式与糖尿病的关联,为糖尿病的膳食干预提供科学依据。方法选取4 759名来自伊犁州霍城县的农村居民作为研究对象,通过问卷调查、体格检查及实验室检测收集研究对象的相关资料。通过降秩回归法提取血脂相关膳食模式;利用Pearson相关分析评估血脂相关膳食模式评分及各食物组摄入量与血脂的相关性;并通过logistic回归分析模型探寻血脂相关膳食模式与糖尿病患病风险之间的关联。结果血脂相关膳食模式主要以小麦、畜肉和油炸面食摄入较多,而杂粮、蔬菜和水果等摄入较少为特征。血脂相关膳食模式与TC (r=0.296,P<0.001)、LDL-C(r=0.225,P<0.001)及TG(r=0.332,P<0.001)呈正相关,而与HDL-C(r=-0.237,P<0.001)呈负相关。logistic回归分析模型分析结果显示,调整混杂因素后,血脂相关膳食模式评分Q4组比Q1组的糖尿病患病风险增加99%(OR=1.99;95%CI:1.47~2.68;P<0.001),且随着膳食模式评分增高,糖尿病患病风险具有升高的线性趋势(P_(趋势)<0.001)。结论血脂相关膳食模式评分与糖尿病患病风险呈正相关,通过膳食来优化血脂水平可能有助于糖尿病的早期预防。

关键词：降秩回归血脂膳食模式糖尿病

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RNN、JPR及ARIMA 3种模型预测中国农村孕产妇死亡率的比较

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中华疾病控制杂志 2023年第11期27卷 1308-1313页

作者：尹小兰何芯芯杜林李远盛张俊辉西南医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室泸州646000

目的利用循环神经网络(recurrent neural network,RNN)模型、Joinpoint回归(Joinpoint regression,JPR)模型、差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型预测中国农村孕产妇死亡率(maternal mortality rate,MMR)的应用价值,并对《“健康中国2030”规划纲要》等文件提出的MMR下降目标能否实现进行统计预测。方法基于2000―2019年中国农村MMR数据建立RNN、JPR及ARIMA模型,通过平均绝对误差(mean absolute error,MAE)、均方误差(mean squared error,MSE)、均方根误差(root mean square error,RMSE)比较3种模型的回代拟合效果,通过残差及相对误差比较3种模型对2020年中国农村MMR数据进行点预测的效果,利用优选模型对2021―2030年中国农村的MMR进行预测。结果2000―2020年中国农村的MMR整体呈持续下降趋势。3种模型回代拟合效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA,RNN模型的MAE、MSE、RMSE均<0.02。3种模型的点预测效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA。最优的RNN模型预测结果显示,2022年中国农村MMR预测值为18.02/10万,能够实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标;2025及2030年中国农村MMR预测值分别为17.58/10万、17.27/10万,均不能实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标。结论RNN模型预测效果优于JPR模型及ARIMA模型,JPR模型预测效果一般,ARIMA模型不太适合本数据的预测。

关键词：孕产妇死亡率循环神经网络模型 Joinpoint回归模型差分自回归移动平均模型预测

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基于肠道菌群的帕金森病早期预测模型建立及生物信息分析

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中华疾病控制杂志 2024年第9期28卷 1096-1103页

作者：何长颖韦雨婷陈佳陆军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准... 详细信息

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准化及ZicoSeq降维,采用基于自适应最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)变量选择的logistic回归算法建立预测模型,使用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评价模型预测效能,采用临床决策曲线(decision curve analysis,DCA)进行临床使用价值的评价;另一方面,对肠道菌群宏基因KO组数据使用limma包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。通过结合蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI)、支持向量机-递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)对DEGs进行筛选。结果基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型的ROC曲线以及校准曲线显示模型预测效果良好。DCA结果显示模型净收益较大。通过PPI网络分析及机器学习方法,最终筛选出6个核心DEGs,即阿拉伯糖转运系统渗透蛋白(L-arabinose operon Q,araQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶,Ⅱ型、dCTP脱氨酶(dCTP deaminase,dcd)、颗粒19 kDa蛋白(signal recognition particle 19,SRP19)、加工前体5,核糖核酸酶P/MRP亚基(芽殖酵母)[processing of precursor 5,ribonuclease P/MRP subunit(***),POP5]、肌醇-3-磷酸合酶1(inositol-3-phosphate synthase 1,ISYNA1)。结论基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型对PD的预测具有优势,从而实现对PD患者的早发现、早干预、早治疗;相关核心基因的发现为PD的治疗提供科学指导和帮助。

关键词：帕金森病肠道菌群机器学习生物信息学分析

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河南农村人群中血清孕酮水平与成年人冠心病的关联分析及体力活动的修饰效应

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郑州大学学报（医学版） 2023年第5期58卷 671-676页

作者：刘欢黄奕琰刘道瀚任心宇刘贺洋宋宇王冕郇昌盛贾泽鑫聂璐婷毛振兴霍文倩郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院卫生统计学教研室郑州450001

目的:研究血清孕酮水平与成年人冠心病(CHD)患病的关联性及体力活动对此关系的修饰作用。方法:以“河南农村队列研究”为依托,采用病例对照(1∶1)研究方法,共纳入CHD患者253例、正常人253人。运用Logistic回归模型和限制性立方样条图探... 详细信息

目的:研究血清孕酮水平与成年人冠心病(CHD)患病的关联性及体力活动对此关系的修饰作用。方法:以“河南农村队列研究”为依托,采用病例对照(1∶1)研究方法,共纳入CHD患者253例、正常人253人。运用Logistic回归模型和限制性立方样条图探讨孕酮与CHD之间的关联性及其剂量反应关系。根据体力活动程度的不同进行亚组分析,并比较不同亚组中孕酮与CHD关联性的差异,以评估体力活动对孕酮-CHD关联的修饰效应。结果:在总人群中,调整相关混杂因素后,与低水平血清孕酮组相比,中水平血清孕酮组CHD患病风险降低(OR=0.27,95%CI为0.14~0.52),高水平血清孕酮组CHD患病风险增加(OR=2.34,95%CI为1.46~3.74)。限制性立方样条图显示孕酮在总人群中以0.66μg/L为剂量反应关系改变的临界点。体力活动程度分层分析结果显示,中度体力活动下高水平血清孕酮不增加CHD患病风险,而轻度、重度体力活动下中水平孕酮对CHD的保护作用不再显著。中度-轻度体力活动对高水平孕酮修饰效应显著(P<0.05)。结论:在河南农村人群中,中水平孕酮与CHD患病风险降低相关,而高水平孕酮与CHD患病风险升高相关,中等体力活动可以改善孕酮对CHD的不良效应。

关键词：孕酮冠心病体力活动修饰效应河南农村队列研究

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机器学习方法在FAERS布加替尼不良反应信号检测中的应用

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中国药物警戒 2023年第6期20卷 639-645页

作者：陈枭郭晓晶许金芳韦连慧陈晨鑫梁际洲郑轶叶小飞海军军医大学卫生统计学教研室上海200433

目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究... 详细信息

目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究药品构建一个输入数据集,包括药品标签上列出的已知不良反应和未知不良反应。对于已知不良反应,训练4种机器学习算法,并通过曲线下面积(AUC)评估机器学习算法[随机森林(random forest,RF)、极限梯度提升机(extreme gradient boosting)、Logistic回归和邻近算法(k-NearestNeighbor,kNN)]与传统不相称分析方法[报告优势比(ROR)]和信息成分(IC)]进行比较。结果kNN算法具有最高的AUC,平均值0.875,其余方法中Logistic回归(0.852),XGBoost(0.722),RF(0.662)和DPA(0.548)。在未知不良反应数据集中,以kNN算法建立的机器学习模型检出6个额外信号(占15.8%),传统不相称方法检出4个额外信号(占10.5%)。结论以kNN算法建立的机器学习模型比传统DPA方法在药品不良反应信号检测方面性能更佳。

关键词：不相称分析布加替尼信号检测药品不良反应机器学习算法美国食品药品监督管理不良反应事件报告系统

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多阅片者多病例设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法

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中国循证医学杂志 2024年第9期24卷 1085-1093页

作者：何倩潘喆敏向蔓宛慧琴秦婴逸贺佳海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rocket... 详细信息

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rockette(OR)与Dorfman-Berbaum-Metz(DBM)方法的原理和步骤。实例部分研究共纳入了100例受试者,其中67例疾病患者。四名阅片者分别采用传统胶卷影像方法和数字化影像方法进行阅片。通过OR与DBM方法对阅片结果进行分析。结果实例研究显示,OR和DBM方法结果具有较高的一致性。当OR方法采用Jackknife估计协方差矩阵时,其结果与DBM方法完全吻合。结论为准确评估影像诊断试验的临床性能,推荐采用OR和DBM方法进行影像诊断试验准确性评价的统计分析,以确保阅片者因素对评价结果的影响得到充分考虑。OR与DBM方法的结果较为接近,实际应用时应考虑具体数据特点和研究设计选择合适的分析方法。同时,OR与DBM方法的应用目前仍存在一定挑战,如软件实现、缺失数据处理,未来仍需要进一步的探索。

关键词：多阅片者多病例影像诊断试验准确性

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哮喘后慢性阻塞性肺疾病发生风险及影响因素

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中国医科大学学报 2025年第2期54卷 103-108,114页

作者：郭贵雅宋旺辰王爱民孔雨佳王素珍石福艳山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的研究哮喘后发生慢性阻塞性肺疾病(COPD)的风险,探讨哮喘发生及进一步发展为COPD的影响因素。方法基于英国生物样本(UKB)数据库构建随访队列,采用多状态模型(MSM)进行哮喘和COPD转归风险预测及影响因素分析。结果在不考虑协变量... 详细信息

目的研究哮喘后发生慢性阻塞性肺疾病(COPD)的风险,探讨哮喘发生及进一步发展为COPD的影响因素。方法基于英国生物样本(UKB)数据库构建随访队列,采用多状态模型(MSM)进行哮喘和COPD转归风险预测及影响因素分析。结果在不考虑协变量影响的情况下,3种转归路径中由COPD到死亡的累积风险最高,然后为哮喘到COPD、哮喘到死亡。高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高、吸烟频率增加和家族史是哮喘人群发展为COPD的危险因素;高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高和吸烟频率增加是哮喘人群发生死亡的危险因素;高龄、男性、糖尿病、汤森剥夺指数增高是COPD人群发生死亡的危险因素。结论高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高、吸烟频率增加和家族史会增加哮喘人群COPD的发生风险。多状态模型可用于预测哮喘后发生COPD的影响因素及程度,揭示COPD进程的变化规律。

关键词：哮喘慢性阻塞性肺疾病英国生物样本数据库多状态模型影响因素

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医学科研人员对P值理解的现况

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上海预防医学 2024年第10期36卷 1003-1007页

作者：郭轶斌郭威吴骋海军军医大学卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

【目的】探究医学生、科研人员及医学统计学教师对统计学中P值的理解程度及其相关因素,以期为医学统计学教学改进提供参考。【方法】采用方便抽样,通过问卷星发放问卷175份。问卷基于案例设计了6个关于P值的是非题。通过调查评估医学生... 详细信息

【目的】探究医学生、科研人员及医学统计学教师对统计学中P值的理解程度及其相关因素,以期为医学统计学教学改进提供参考。【方法】采用方便抽样,通过问卷星发放问卷175份。问卷基于案例设计了6个关于P值的是非题。通过调查评估医学生、科研人员、专业教师对P值理解的正确率。采用描述性分析和logistic回归分析探究P值理解的相关因素。【结果】共收集问卷170份,医学生组、科研人员组和专业教师组分别收集问卷50、98和22份。结果显示,专业教师组的正确率最高(89.5%),医学生组的正确率较低(31.6%)。logistic回归分析结果显示,博士学历者较本科及以下学历者正确率高(OR=2.10,95%CI:1.18~3.76,P=0.012),接受过医学统计学(OR=4.20,95%CI:2.23~7.93,P<0.001)或医学科研设计课程培训的研究人员(OR=2.40,95%CI:1.33~4.33,P=0.004)正确率较高。【结论】医学生和科研人员普遍对P值存在误解,建议通过加强学历教育阶段医学统计学教学,开设医学科研设计课程,增加学生自主讨论,以及加强继续教育和科普活动等措施来提高对P值的理解。

关键词： P值医学统计学医学科研人员医学生

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基于Fine-Gray竞争风险模型的小肝癌患者预后模型构建与验证

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中华肿瘤防治杂志 2023年第23期30卷 1435-1443页

作者：钱迪涂博祥陈枭张鹤巍叶小飞赵艳芳海军军医大学卫生勤务系军队卫生统计学教研室上海200433

目的探究小肝癌患者预后影响因素,构建预后预测模型,为患者的个体化预后评估提供更精确的工具。方法通过SEER数据库收集2004-2015年确诊的2648例小肝癌患者信息,按照7∶3的比例,将患者随机分成训练集(1853例)与验证集(795例)。使用Fine-... 详细信息

目的探究小肝癌患者预后影响因素,构建预后预测模型,为患者的个体化预后评估提供更精确的工具。方法通过SEER数据库收集2004-2015年确诊的2648例小肝癌患者信息,按照7∶3的比例,将患者随机分成训练集(1853例)与验证集(795例)。使用Fine-Gray竞争风险模型对训练集资料进行单因素和多因素分析,探究影响小肝癌患者预后的独立危险因素,建立预后模型,从区分度和校准度两个角度分别对训练集与验证集数据的预测效果进行验证,基于预后模型结果绘制列线图并采用R-shiny构建生存率计算器。结果多因素分析结果表明,年龄(HR=1.165,95%CI为1.005~1.349,P=0.042)、婚姻状况(HR=1.250,95%CI为1.084~1.440,P=0.002)、肿瘤分级(HR=1.440,95%CI为1.197~1.733,P<0.001)、N分期(HR=0.442,95%CI为0.285~0.684,P<0.001)、M分期(HR=0.502,95%CI为0.325~0.776,P=0.002)、肿瘤大小(HR=1.216,95%CI为1.052~1.404,P=0.008)、手术情况(HR=2.732,95%CI为2.311~3.230,P<0.001)是小肝癌患者预后的独立影响因素。根据独立影响因素构建的列线图,在训练集中1、3和5年特异性生存率的曲线下面积分别为0.782、0.761和0.741,在验证集中分别为0.772、0.756和0.737;校准曲线显示在训练集与验证集中1、3和5年预测模型的预测发生率与实际发生率基本一致。结论Fine-Gray竞争风险模型能高效辨别小肝癌患者的预后独立影响因素,以此为依据构建的预后模型能更准确预测患者的特异性生存率,为医师进行决策提供有价值的参考依据。

关键词：小肝癌特异性生存率列线图 SEER数据库预后

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基于GEO和TCGA数据库对肺腺癌差异表达基因的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第6期49卷 1491-1503页

作者：叶汇孙哲周丽婷齐雯叶琳吉林大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生教研室吉林长春130021

目的:采用生物信息学方法筛选影响肺腺癌(LUAD)的关键基因,分析其生物学功能及其对LUAD预后的影响。方法:于高通量基因表达(GEO)数据库下载GSE118370和GSE136043芯片数据,癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选LUAD相关数据。采用R软件分析共... 详细信息

目的:采用生物信息学方法筛选影响肺腺癌(LUAD)的关键基因,分析其生物学功能及其对LUAD预后的影响。方法:于高通量基因表达(GEO)数据库下载GSE118370和GSE136043芯片数据,癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选LUAD相关数据。采用R软件分析共同表达的差异表达基因(DEGs)。采用clusterProfile R包对DEGs进行基因本体(GO)功能富集分析,DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。采用Cytoscape筛选连接度排名前10位的关键基因,GEPIA数据库和人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析正常肺组织和LUAD组织中关键基因mRNA和蛋白表达情况及不同分期LUAD组织中关键基因表达情况。关键基因免疫浸润分析和生存分析获取关键基因表达与患者生存期的相关关系。结果:共筛选DEGs 428个。GO分析,LUAD的DEGs在主要富集于上皮-间质转化(EMT)等生物过程(BP)方面、细胞基部等细胞组分(CC)方面和细胞外基质(ECM)结构形成等分子功能(MF)方面。KEGG分析,LUAD的DEGs主要富集于细胞因子受体相互作用通路等方面。筛选DNA拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、果蝇纺锤体异常基因(ASPM)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)、人类细胞分裂周期相关基因8(CDCA8)、含杆状病毒IAP重复序列蛋白5(BIRC5)、苏氨酸激酶(AURKA)、驱动蛋白超家族成员20A(KIF20A)、中心体相关蛋白55(CEP55)、着丝粒蛋白F(CENPF)和微管组织因子(TPX2)为关键基因。与正常肺组织比较,LUAD患者肺组织中TOP2A、CCNB1、CDCA8、BIRC5、AURKA、KIF20A、CEP55、CENPF和TPX2 mRNA表达水平均增加(P<0.01),蛋白表达均增加。CCNB1、CDCA8、BIRC5、AURKA、KIF20A、CEP55和TPX2 mRNA在不同LUAD分期的表达水平差异均有统计学意义(P<0.01)。与Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ期LUAD患者比较,Ⅳ期LUAD患者肺组织中CCNB1、CDCA8、AURKA、KIF20A、CEP55和TPX2 mRNA表达水平增加(P<0.01);与Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ期LUAD患者比较,Ⅲ期LUAD患者肺组织中BIRC5 mRNA表达水平增加(P<0.01)。10个关键基因表达与B淋巴细胞浸润均呈负相关关系(-0.253≤r≤-0.014,P<0.01);TOP2A、ASPM、CDCA8、BIRC5、CEP55、CENPF和TPX2表达与中性粒细胞浸润呈正相关关系(0.049≤r≤0.165,P<0.01);CCNB1和AURKA表达与CD4 T淋巴细胞、巨噬细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(-0.210≤r≤-0.100,P<0.01)。CDCA8高表达会增加LUAD恶化风险(P<0.01),TOP2A、CCNB1、CDCA8、BIRC5、AURKA、KIF20A、CEP55、CENPF和TPX2高表达会增加患者死亡风险(P<0.01)。结论:TOP2A、ASPM、CCNB1、CDCA8、BIRC5、AURKA、KIF20A、CEP55、CENPF和TPX2是参与LUAD发生进展过程的关键基因,可能通过加速EMT过程促进LUAD发展,其高表达提示LUAD患者预后不良和死亡风险升高。

关键词：肺肿瘤关键基因上皮-间质转化免疫浸润预后因子腺癌

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