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利用DFT方法探究一类自组装[Pt2M4(C≡CH)8](M=Cu，Ag)簇合物的电子结构和光谱性质

中国科学（B辑） 2009年第11期39卷 1494-1500页

作者：白福全夏宝辉张红星杨宝珠王建孙磊理论化学计算国家重点实验室、吉林大学理论化学研究所长春130023 吉林大学化学学院长春130023

应用TD-DFT(time-dependent density functional theory)并PCM(polarizable continuum model)模型研究了一类自组装的[Pt2M4(C≡CH)8](M=Cu,Ag)簇合物的电子结构和光谱性质.应用DFT(density functional theory)方法优化了该簇合物的基态及激发态结构.综合计算结果,得到与试验结果相一致的结构与光谱特点.[Pt2Ag4(C≡CH)8]具有呈D4和D4h对称性的两个稳定的基态几何结构.Pt-M距离预示弱相互作用的存在.Cu-Cu距离大于俩个Cu原子的范德华半径和而Ag-Ag间距与俩个Ag原子的范德华半径和差别不大.激发过程使得Pt…M,Ag…Ag作用增强,虽然Cu…Cu距离也相应缩短,但是其仍大于范德华半径之和.[Pt2Cu4(C≡CH)8]、[Pt2Ag4(C≡CH)8](A)和(B)的最低能吸收在450、365和375nm处,发射在611、431和435nm处.红外可见谱范围内,[Pt2M4(C≡CH)8]的吸收波带都有Cu或Ag成分的贡献,所以没有ILCT或MPtLCT跃迁特征出现(ILCT:intraligand chargetransfer;MLCT:metal-to-ligand charge transfer).由于最低能吸收和发射具有不同的跃迁特征,所以发射不是来自于最低能吸收.[Pt2Ag4(C≡CH)8]簇合物的M…M相互作用在激发态增强,发射光谱具有显著的ILCT特点,这也是[Pt2Ag4(C≡CH)8]的发射波长相对于其对应的同配体前躯体[Pt(C≡CH)4]2?有少许蓝移的原因.

关键词：电子结构发光性质杂多核配合物 TDDFT

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溶液中类锗烯H2GeClMgCl的结构与异构化反应

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物理化学学报 2009年第1期25卷 121-125页

作者：李文佐程建波李庆忠宫宝安孙家钟烟台大学化学生物理工学院山东烟台264005 吉林大学理论化学计算国家重点实验室长春130012

用密度泛函理论(DFT)和QCISD(quadratic configuration interaction with single and double excitations)方法研究了类锗烯H2GeClMgCl在气相和五种溶剂中的构型与异构化反应.结果表明,类锗烯H2GeClMgCl有三种平衡构型.其中p-配合物型构型能量最低,是其存在的主要构型.讨论了溶剂效应对结构、能量与异构化反应的影响.计算模拟了最稳定构型的红外光谱.

关键词：类锗烯H2GeClMgCl B3LYP QCISD 异构化溶剂效应

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水解酶在二乙基锌与芳香醛加成反应中的应用(英文)

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催化学报 2009年第5期30卷 396-400页

作者：魏晓飞郑清川吉腾飞赵博李春元王萍曹淑桂王智王磊吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室吉林长春130023 吉林大学理论化学计算国家重点实验室吉林长春130023 中国医学科学院药物研究所北京100050

报道了水解酶催化二乙基锌与芳香醛的加成反应,对反应条件进行了优化.在最适条件(嗜热酯酶APE1547为酶源,反应温度40oC,氯仿为溶剂,4-Cl-苯甲醛为底物)下,加成反应生成的光学活性醇产率最高达78%,ee值最高可达56%.通过实验结果和分子动... 详细信息

报道了水解酶催化二乙基锌与芳香醛的加成反应,对反应条件进行了优化.在最适条件(嗜热酯酶APE1547为酶源,反应温度40oC,氯仿为溶剂,4-Cl-苯甲醛为底物)下,加成反应生成的光学活性醇产率最高达78%,ee值最高可达56%.通过实验结果和分子动力学分析对可能的反应机理进行了推测.本研究进一步拓展了酶的非专一性.

关键词：水解酶二乙基锌芳香醛加成酶非专一性

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配体数与电子化物的一阶超极化率的碱金属原子序数依赖性

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高等学校化学学报 2009年第4期30卷 786-788页

作者：徐红亮李志儒吴迪陈巍于广涛王钦吉林大学理论化学研究所理论计算化学国家重点实验室长春130021 日本九州大学分子材料学院福冈816-8580

用MP2方法得到单配位电子化物M—X(M=Li,Na,K;X=NH3,NCH,HF)和二配位电子化物M—(FH)2(M=Li,Na,K)的几何结构.使用高水平的QCISD/6-311++G(3df,3pd)计算了它们的一阶超极化率β0.在单配位的电子化物中,单调的一阶超极化率的碱金属原子... 详细信息

用MP2方法得到单配位电子化物M—X(M=Li,Na,K;X=NH3,NCH,HF)和二配位电子化物M—(FH)2(M=Li,Na,K)的几何结构.使用高水平的QCISD/6-311++G(3df,3pd)计算了它们的一阶超极化率β0.在单配位的电子化物中,单调的一阶超极化率的碱金属原子序数依赖性未表现出来,而二配位电子化物M—(FH)2(M=Li,Na,K)的β0值随着碱金属原子序数的增加而增加,这与文献报道的四配位相关体系的情况一致.这表明,电子化物中配位数与一阶超极化率碱金属原子序数依赖性相关.

关键词：电子化物依赖性超极化率

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碳纳米管内P-Ylide反应的理论研究

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中国科学（B辑） 2009年第11期39卷 1509-1513页

作者：肖波赵景祥丁益宏孙家锺理论化学计算国家重点实验室、吉林大学理论化学研究所长春130023 哈尔滨师范大学化学化工学院哈尔滨150080

碳纳米管空腔不仅可以改变填充到其内部分子的性质,而且对其内部的SN2取代反应有促进或抑制作用,因而被视为一种新型的'固体溶剂'.本文通过密度泛函理论研究了CH2O和PH3CH2在气相、苯溶液和碳纳米管空腔内的[2+2]加成反应.结果... 详细信息

碳纳米管空腔不仅可以改变填充到其内部分子的性质,而且对其内部的SN2取代反应有促进或抑制作用,因而被视为一种新型的'固体溶剂'.本文通过密度泛函理论研究了CH2O和PH3CH2在气相、苯溶液和碳纳米管空腔内的[2+2]加成反应.结果表明,与气相相比,碳纳米管空腔对于[2+2]环加成反应影响不大,这是因为所研究的[2+2]环加成反应中,反应物并不是轴对称的,不同于SN2取代反应的一维线性排列,所以具有较大轴向极化率的碳纳米管对[2+2]环加成反应影响较小.

关键词：碳纳米管 [2+2]环成反应密度泛函理论研究

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Co(Ⅱ)掺杂锐钛矿二氧化钛的理论研究

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化学世界 2009年第7期50卷 399-401页

作者：魏志钢黄雪萍潘湛昌周晓陈世荣杨燕婷广东工业大学轻工化工学院广东广州510006 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130023

采用基于密度泛函理论(DFT)框架下的第一性原理平面波赝势(PWPP)方法,模拟计算Co(Ⅱ)掺杂锐钛矿TiO2,讨论了Co(Ⅱ)掺杂对锐钛矿的晶体结构、能隙、态密度等的影响。结果表明Co(Ⅱ)掺杂锐钛矿TiO2晶体后,Co(Ⅱ)的3d轨道进入禁带并与氧的2... 详细信息

采用基于密度泛函理论(DFT)框架下的第一性原理平面波赝势(PWPP)方法,模拟计算Co(Ⅱ)掺杂锐钛矿TiO2,讨论了Co(Ⅱ)掺杂对锐钛矿的晶体结构、能隙、态密度等的影响。结果表明Co(Ⅱ)掺杂锐钛矿TiO2晶体后,Co(Ⅱ)的3d轨道进入禁带并与氧的2p轨道作用,使禁带宽度(Eg)变小,TiO2的吸收带红移,从而有助于TiO2的光催化活性。

关键词：二氧化钛密度泛函理论电子结构

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La(Ⅲ)掺杂TiO2密度泛函理论的研究

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计算机与应用化学 2009年第4期26卷 409-412页

作者：周晓陈世荣潘湛昌黄雪萍杨燕婷魏志钢广东工业大学轻工化工学院工学四号馆501室广东广州510006 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130023

为了研究La(Ⅲ)掺杂对TiO_2光催化活性的影响,采用基于密度泛函理论(DFT)框架下的第一性原理平面波赝势(PWPP)法,模拟计算La(Ⅲ)掺杂锐钛矿TiO_2,讨论它的晶体结构、能隙、态密度等。结果表明La(Ⅲ)掺杂锐钛矿TiO_2晶体后,La(Ⅲ)的5d轨... 详细信息

为了研究La(Ⅲ)掺杂对TiO_2光催化活性的影响,采用基于密度泛函理论(DFT)框架下的第一性原理平面波赝势(PWPP)法,模拟计算La(Ⅲ)掺杂锐钛矿TiO_2,讨论它的晶体结构、能隙、态密度等。结果表明La(Ⅲ)掺杂锐钛矿TiO_2晶体后,La(Ⅲ)的5d轨道与Ti(Ⅳ)的3d轨道一同构成导带,使禁带宽度(Eg)变小,TiO_2的吸收带红移,从而有助于TiO_2的光催化活性提高。

关键词：二氧化钛 La(Ⅲ)掺杂密度泛函

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有限长单壁碳纳米管的受压频移

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原子与分子物理学报 2009年第4期26卷 619-624页

作者：王志刚姚明光潘守甫金明星刘冰冰吉林大学原子与分子物理研究所长春130012 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 吉林大学理论化学研究所理论计算化学国家重点实验室长春130023 吉林大学超硬材料国家重点实验室长春130012

使用第一原理密度泛函计算方法,我们研究了(5,5)有限长单壁碳纳米管(FSWNT)在气相条件下,结构的变化对振动模式(红外强度和拉曼活性)的影响.我们得到了与无限长单壁碳纳米管(SWNT)有差异的拉曼频谱,发现了A_(1g),E_(1g)和E_(2g)的不同... 详细信息

使用第一原理密度泛函计算方法,我们研究了(5,5)有限长单壁碳纳米管(FSWNT)在气相条件下,结构的变化对振动模式(红外强度和拉曼活性)的影响.我们得到了与无限长单壁碳纳米管(SWNT)有差异的拉曼频谱,发现了A_(1g),E_(1g)和E_(2g)的不同频移特征,并对其原因进行了解释.当结构压缩到1.5 A时,我们得到了一个双管的FSWNT结构,它也具有一个呼吸模(409.26 cm^(-1)),而释放"压力"之后,FSWNT不同于SWNT之处在于其不能恢复到理想的D_(5d)对称性结构,我们得到了一个新的具有C_(2h)对称性的稳定的两端半封闭的FSWNT,其也具有一个明确的呼吸模(365.01cm^(-1)).并且,我们发现了稳定的D_(5d)和C_(2h)对称性结构的不同的电子布居特征.

关键词：有限长单壁碳纳米管第一性原理喇曼光谱频率移动

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人类丁酰胆碱酯酶(BuChE)与抑制剂小分子的对接研究

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中国科技论文在线 2009年第9期4卷 627-631页

作者：孟烜宇楚慧郢郑清川吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用分子力学和分子动力学模拟方法优化人类丁酰胆碱酯酶(BuChE)的晶体结构(PDB Code:1XLU),在此基础上用分子对接程序(Affinity)将其抑制剂利伐斯的明(rivastigmine)和抑制剂TV-3326分别与BuChE进行对接,获得其复合物结构的理论模型。... 详细信息

利用分子力学和分子动力学模拟方法优化人类丁酰胆碱酯酶(BuChE)的晶体结构(PDB Code:1XLU),在此基础上用分子对接程序(Affinity)将其抑制剂利伐斯的明(rivastigmine)和抑制剂TV-3326分别与BuChE进行对接,获得其复合物结构的理论模型。通过配体与受体之间相互作用能和结构的分析给出了与抑制剂的具体结合方式,明确BuChE与抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基,为基于人类丁酰胆碱酯酶三维结构药物设计提供了参考信息。

关键词：人类丁酰胆碱酯酶分子对接利伐斯的明 TV-3326

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两个四硫富瓦烯分子正离子自由基TTF·^＋之间的共价吸引作用

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中国科学（B辑） 2009年第11期39卷 1522-1528页

作者：王芳芳王义王炳强王银锋马方李志儒理论化学计算国家重点实验室、吉林大学理论化学研究所长春130023 中国刑事警察大学公共安全系基础部沈阳110035 山西师范大学化学和材料学学院临汾041004

使用MP2/6-311G方法得到了四硫富瓦烯自由基正离子二聚体(TTF·+-TTF·+)能量极小点的结构.这显示这种正离子间的吸引作用存在.这种新的吸引作用是望远镜形状的20中心2电子分子间共价π/π键.这种共价π/π键的键能约为-21kcal&... 详细信息

使用MP2/6-311G方法得到了四硫富瓦烯自由基正离子二聚体(TTF·+-TTF·+)能量极小点的结构.这显示这种正离子间的吸引作用存在.这种新的吸引作用是望远镜形状的20中心2电子分子间共价π/π键.这种共价π/π键的键能约为-21kcal·mol-1,它被正离子间的库伦排斥作用掩盖.有负离子围绕的四硫富瓦烯自由基正离子二聚体(TTF·+-TTF·+)体系是稳定的.

关键词：正离子吸引自由基二聚体分子间相互作用 π/π键 TTF

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