检索结果-内蒙古大学图书馆

高等学校化学学报 2006年第7期27卷 1298-1302页

作者：郑喜亮张红星孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在H IV-1整合酶(IN)和5C ITEP复合物晶体结构的基础上,用分子对接程序(A ffin ity)将含有单Mg2+和双Mg2+的H IV-1 IN核心区与抑制剂5C ITEP进行对接,获得了能形成复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间的相互作用能和结构分析给出此... 详细信息

在H IV-1整合酶(IN)和5C ITEP复合物晶体结构的基础上,用分子对接程序(A ffin ity)将含有单Mg2+和双Mg2+的H IV-1 IN核心区与抑制剂5C ITEP进行对接,获得了能形成复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间的相互作用能和结构分析给出此种抑制剂的结合模式,并与晶体结构进行比较,揭示出引入的第二个Mg2+原子在整合过程中所起的重要作用.前后相互作用能的变化趋势很明显,配体和受体的作用模式比单Mg2+体系更加清晰.由单Mg2+体系的4种作用方式改变到双Mg2+体系的两种作用方式,相互作用能提高了将近40 kJ/mol.为基于整合酶结构的药物设计提供了参考信息.

关键词： HIV-1整合酶(IN) 分子对接双金属

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亚甲基自由基（^3CH2）与SO反应机理的理论研究

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化学学报 2006年第2期64卷 139-144页

作者：白洪涛黄旭日于广涛李吉来于健康孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各... 详细信息

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各物种的单点能,并对总能量进行了零点能校正.研究结果表明:主要的反应通道都在单重态势能面中,反应物中自由基3CH2的C原子进攻SO分子中的O原子是主要的进攻方式,反应主产物是P1(HS+HCO).反应热为-349.06kJ?mol-1.

关键词：从头算密度泛函理论 ^3CH2自由基反应通道

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SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第3期27卷 535-537页

作者：王嵩黄旭日高雪峰赵熹孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要... 详细信息

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要的参考信息.

关键词： SARS冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂对接分子动力学模拟

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烯丙基自由基（C3H5）与一氧化氮（NO）反应势能面的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第12期27卷 2390-2393页

作者：张浩孙延波李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE水平上对反应·CHCHCH3+NO进行了计算,并建立了其单重态的反应势能面.在该反应中,分别找到生成P1(CH3CHO+HCN),P2(CH3CHO+HNC),P3(CH3CN+HCHO),P4(CH3CCH+HNO)的4条产物通道,其中·CHCHCH3和NO中的氮原子直接连接形成m1(trans-CH3CHCHNO),m1经过顺反异构形成m2(cis-CH3CHCHNO),m2再经过CCNO四元环合,然后发生环解离,最后生成产物P1(CH3CHO+HCN)是最可行的产物通道,其余三条通道为次要产物通道.该体系中生成P1的反应路径与同类体系·C2H3+NO的主要反应路径相类似,两者的差别是前者为动力学可行的反应,而后者为动力学不可行反应,这使得·CHCHCH3+NO反应比·C2H3+NO反应更具有实际意义.

关键词：烯丙基自由基(C3H5) 一氧化氮(NO) 势能面

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聚苯乙烯在石墨表面吸附的分子动力学模拟

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高等学校化学学报 2006年第7期27卷 1340-1342页

作者：赵莉杨华李卓李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用分子动力学（MD）模拟方法研究了单链聚苯乙烯（PS）在石墨表面的吸附．模拟结果表明，吸附后PS在平行于石墨表面的方向可视为准二维椭圆结构，并且在此方向上的均方回转半径值（R^2∥）与其所含单体数目（N）具有指数关系R^2∥～N... 详细信息

采用分子动力学（MD）模拟方法研究了单链聚苯乙烯（PS）在石墨表面的吸附．模拟结果表明，吸附后PS在平行于石墨表面的方向可视为准二维椭圆结构，并且在此方向上的均方回转半径值（R^2∥）与其所含单体数目（N）具有指数关系R^2∥～N^2v，指数2v约等于1．04；最后指出PS吸附过程的主要驱动力为PS链段与表面之间的范德华作用力．

关键词：聚苯乙烯石墨表面吸附分子动力学模拟

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7-氮杂吲哚衍生物分子基态和激发态性质的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第6期27卷 1091-1095页

作者：范建训任爱民封继康薄冬生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林大学化学学院

用从头算HF和密度泛函B3LYP方法对7-氮杂吲哚衍生物1,3-二(N-7-氮杂吲哚基)苯、1,3,5-三(N-7-氮杂吲哚基)苯和4,4′-二(N-7-氮杂吲哚基)联苯进行全优化,计算分子的电离势IP和电子亲和势EA等相关能量,并用ZINDO和TDDFT方法计算吸收光谱,... 详细信息

用从头算HF和密度泛函B3LYP方法对7-氮杂吲哚衍生物1,3-二(N-7-氮杂吲哚基)苯、1,3,5-三(N-7-氮杂吲哚基)苯和4,4′-二(N-7-氮杂吲哚基)联苯进行全优化,计算分子的电离势IP和电子亲和势EA等相关能量,并用ZINDO和TDDFT方法计算吸收光谱,用C IS优化三种化合物分子的S1激发态结构,并分析其能量与发射光谱的关系,计算溶剂中分子的吸收和发射光谱,并与实验结果对照.计算结果表明,从7-氮杂吲哚到上述三种衍生物依次愈来愈容易接受空穴,吸收和发射光谱红移.

关键词：氮杂吲哚衍生物发光性质从头算密度泛函理论

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“哑铃状”偶氮化合物的合成与表征

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高等学校化学学报 2006年第10期27卷 1999-2001页

作者：毛华平于有海陈梁卢晓峰张万金张红星吉林大学麦克德尔米德实验室长春130012 吉林大学理论化学计算国家重点实验室长春130021

A novel azo compound with ’dumbbell shape’ was synthesized successfully and characterized by MALDI-MS,FTIR,elemental analysis,1H NMR and 13C ***-Vis spectrum was used to monitor the trans-cis isomerization and theoretical calculations were used to modelize the trans and cis *** trans and cis isomers of the ’dumbbell shape’ azo compound are both stable at room temperature because of the large end group.

关键词：偶氮哑铃紫外顺反异构理论计算

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氟取代三(8-羟基喹啉)铝衍生物电子结构、电子光谱的量子化学研究:实现蓝色发光的途径

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高等学校化学学报 2006年第11期27卷 2156-2159页

作者：刘晓冬任爱民封继康杨丽许海施敏敏孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林大学化学学院浙江大学高分子科学与工程学系硅材料国家重点实验室杭州310027

采用Gaussian 03程序包和密度泛函理论(DFT)B3LYP/6-31G方法,研究了三(8羟-基喹啉)铝(A lq3)的3种氟代衍生物的电子结构与电子光谱,讨论了氟原子在不同位置取代对A lq3的前线轨道、HOMO-LUMO能隙以及电子光谱的影响,发现氟取代使A lq3... 详细信息

采用Gaussian 03程序包和密度泛函理论(DFT)B3LYP/6-31G方法,研究了三(8羟-基喹啉)铝(A lq3)的3种氟代衍生物的电子结构与电子光谱,讨论了氟原子在不同位置取代对A lq3的前线轨道、HOMO-LUMO能隙以及电子光谱的影响,发现氟取代使A lq3的前线轨道能级降低,在6位碳上氟代的A lq3的HOMO-LUMO能隙变大,吸收和发射光谱发生蓝移,而在5和7位碳上氟代的A lq3能隙变小,吸收和发射光谱发生红移.理论模拟结果与实验事实基本吻合,证明在A lq3分子的合适位置进行化学修饰可实现蓝色发光.

关键词：三(8-羟基喹啉)铝氟代作用基态构型分子轨道分析能级调控电子光谱

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HO_2自由基电子激发态的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第11期27卷 2168-2170页

作者：李步通魏子章潘清江张红星孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023 黑龙江大学化学化工与材料学院哈尔滨150080

采用CASPT2/CASSCF方法对HO2自由基进行统计算,优化了三个电子态的稳定点几何构型,得到详细的频率数据.利用垂直激发计算确定了3个里德堡态、11个价电子态的电子结构以及在三种理论水平上(CASSCF,SS-CASPT2和MS-CASPT2)的能量信息.计算... 详细信息

采用CASPT2/CASSCF方法对HO2自由基进行统计算,优化了三个电子态的稳定点几何构型,得到详细的频率数据.利用垂直激发计算确定了3个里德堡态、11个价电子态的电子结构以及在三种理论水平上(CASSCF,SS-CASPT2和MS-CASPT2)的能量信息.计算中使用了ANO-L和ANO-L+基组,验证了已知实验数据的同时,通过与其它理论计算结果的对比,揭示了应用弥散轨道系数对于该体系激发态研究的重要性.

关键词：电子激发态 CASPT2 里德堡态 HO2自由基

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金属Ir_4 Cluster催化丙烯加氢反应势能面的密度泛函理论研究

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高等学校化学学报 2006年第12期27卷 2372-2375页

作者：耿彩云李吉来孙广领黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023 胜利工程设计咨询有限责任公司东营257026

用密度泛函理论(DFT)对金属Ir4cluster催化丙烯Propene加氢反应的反应机理进行了理论研究.在B3LYP理论水平下优化了反应通道上反应物、中间体、过渡态和产物各驻点物种的几何构型,构建了该反应的基态势能面.计算结果表明,Ir4cluster催... 详细信息

用密度泛函理论(DFT)对金属Ir4cluster催化丙烯Propene加氢反应的反应机理进行了理论研究.在B3LYP理论水平下优化了反应通道上反应物、中间体、过渡态和产物各驻点物种的几何构型,构建了该反应的基态势能面.计算结果表明,Ir4cluster催化丙烯加氢反应,主要通过3条反应通道(c,d和e)进行.主反应通道c是H1原子先经过中间体1加成到丙烯的边端C上形成中间体3,然后H2原子经过渡态TS3—5,中间体5和过渡态TS5-P加成到中间C上生成产物P.c通道无论从动力学角度还是热力学角度都是最有利的;反应通道d和e中的最高势垒和通道c上的相比差别不大,具有一定的竞争性,是次通道.

关键词：密度泛函理论(DFT) 反应通道 Ir4 cluster 丙烯

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