检索结果-内蒙古大学图书馆

高等学校化学学报 2002年第8期23卷 1542-1545页

作者：孙延波李泽生黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

用 B3 LYP/ 6-3 1 1 G(d,p)密度泛函方法对 B2 H+ 5阳离子和 B2 H·5自由基的几何异构体的空间构型进行了优化 ,并在此基础上用 QCISD(T) / 6-3 1 1 ++G(3 df,2 p)偶合簇法进行了单点能计算和零点能校正 .结果表明 ,B2 H+ 5单态有 ... 详细信息

用 B3 LYP/ 6-3 1 1 G(d,p)密度泛函方法对 B2 H+ 5阳离子和 B2 H·5自由基的几何异构体的空间构型进行了优化 ,并在此基础上用 QCISD(T) / 6-3 1 1 ++G(3 df,2 p)偶合簇法进行了单点能计算和零点能校正 .结果表明 ,B2 H+ 5单态有 2种稳定的几何构型 (D3h,C1 ) ,其中 C1 构型是新发现的 .B2 H+ 5三重态阳离子除已知 Cs构型外 ,又发现两种稳定构型 (C1 ) .对于 B2 H·5自由基体系 ,共有 4种异构体 (包括两种新发现的构型 Cs) ,其中 ,具有单桥结构的 C2 v最稳定 .用二级多体微扰理论和密度泛函方法对前人所认为稳定的 B2 H+ 5单态的C2 v构型进行了全优化 ,结果发现该构型始终具有一个虚频 ,不是稳定构型 .对 B2 H- 5阴离子体系的单态和三重态进行的全优化 ,理论上得出单态时具有 C2 v和 Cs两种稳定构型 ,而三重态只有 C2

关键词：乙硼烷离子自由基结构量子化学计算三重态势能面三中心二电子氢桥键

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亚甲基自由基（^3CH2）与SO反应机理的理论研究

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化学学报 2006年第2期64卷 139-144页

作者：白洪涛黄旭日于广涛李吉来于健康孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各... 详细信息

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各物种的单点能,并对总能量进行了零点能校正.研究结果表明:主要的反应通道都在单重态势能面中,反应物中自由基3CH2的C原子进攻SO分子中的O原子是主要的进攻方式,反应主产物是P1(HS+HCO).反应热为-349.06kJ?mol-1.

关键词：从头算密度泛函理论 ^3CH2自由基反应通道

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SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第3期27卷 535-537页

作者：王嵩黄旭日高雪峰赵熹孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要... 详细信息

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要的参考信息.

关键词： SARS冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂对接分子动力学模拟

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分子动力学研究亚铁血红素激活蛋白转录激活机理

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高等学校化学学报 2008年第4期29卷 819-823页

作者：赵熹黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较... 详细信息

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较性分析显示,涉及到上游活化序列(Upstream activation sequences,UAS)识别的蛋白质-DNA相互作用分布与实验观测到的3种蛋白转录活性一致.进一步对3个复合物进行柔性分析显示,3个DNA分子具有相似的柔性,而又有所不同,特别在涉及UAS识别的N-端和Zn2Cys6结构域前部有明显的柔性差异.蛋白质柔性的差别导致不同的蛋白质-DNA相互作用.因此亚铁血红素激活蛋白的N-端和Zn2Cys6结构域前部的柔性大小能够调节亚铁血红素激活蛋白转录激活功能.

关键词：分子动力学转录激活柔性亚铁血红素激活蛋白

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SiNP分子结构及稳定性的理论研究

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高等学校化学学报 2005年第5期26卷 894-896,F007页

作者：于健康陈广慧黄旭日李卓孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用B3LYP/6-311G(d),QCISD和CCSD(T)方法,对单重态和三重态SiNP体系的异构化进行了研究.在QCISD/6-311G(d)水平下,得到了7个稳定的异构体,它们由4个过渡态所连接,其中三重态线型异构体SiNP(31,3Σ1),单重态环状异构体SiNP(14,1A′)和... 详细信息

采用B3LYP/6-311G(d),QCISD和CCSD(T)方法,对单重态和三重态SiNP体系的异构化进行了研究.在QCISD/6-311G(d)水平下,得到了7个稳定的异构体,它们由4个过渡态所连接,其中三重态线型异构体SiNP(31,3Σ1),单重态环状异构体SiNP(14,1A′)和单重态线型异构体SiNP(11,1Σ)都具有较大的热力学及动力学稳定性.

关键词： B3LYP SiNP 异构体势能面结构

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C_(20)三个异构体稳定性的从头计算研究

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高等学校化学学报 2005年第6期26卷 1126-1129页

作者：张国张明瑜孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用HF,B3LYP,MP2和QCISD等理论方法在6-31G和6-31G*基组水平上,对C20的3个主要异构体碟型(Bowl)、笼型(Cage)和环型(Ring)的结构进行理论研究,得出这3个异构体的相对稳定性的次序为:Ring>Bowl>Cage.计算结果显示,分子轨道具有离... 详细信息

采用HF,B3LYP,MP2和QCISD等理论方法在6-31G和6-31G*基组水平上,对C20的3个主要异构体碟型(Bowl)、笼型(Cage)和环型(Ring)的结构进行理论研究,得出这3个异构体的相对稳定性的次序为:Ring>Bowl>Cage.计算结果显示,分子轨道具有离域特性,电子的这种离域特征有利于原子间更好的成键,可避免出现大的张力,这是Cage型异构体虽然违反“五元环隔离规则”(Isolatedpentagonrule)却能稳定存在的原因.

关键词：从头计算密度泛函轨道多中心特性张力稳定性

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二氧化三氮(N_3O_2)中性分子和离子的一些重要反应过程的理论研究

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高等学校化学学报 2007年第1期28卷 132-135页

作者：张浩孙延波李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先... 详细信息

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先在光照下解离为与其具有相同的W构型的中性分子和一个电子,这个中性分子是一个过渡态,它将打破C2v构型变成具有Cs对称性的W型中间异构体,然后再经过一个过渡态,裂解成N2O+NO两个小分子.这个裂解过程的能垒非常低(5.96 kJ/mol),因此在实验中很难检测到W型的中间异构体.在另一个重要的[N3O2]体系的反应(NO+N2O N2+NO2)中,找到了两条反应通道,其中不经过中间异构体的一步转化通道更为可行.

关键词：中性二氧化三氮(N3O2)分子光解离稳定中间体多步转化一步转化

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气相离子-分子反应B_2H_3^-+CS_2——B_2H_3S^-+CS的理论研究

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高等学校化学学报 2001年第9期22卷 1530-1534页

作者：屈正旺李泽生丁益宏孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

用密度泛函方法 B3LYP/ 6-31 1 ++G( d,p)和高级电子相关的偶合簇法 CCSD( T) / 6-31 1 ++G( d,p)研究了气相离子 -分子反应 B2 H- 3 +CS2 B2 H3S- +CS的机理 .结果表明 ,B2 H- 3 最可能进攻 CS2 中碳原子形成三元环中间体 ,随后通过氢... 详细信息

用密度泛函方法 B3LYP/ 6-31 1 ++G( d,p)和高级电子相关的偶合簇法 CCSD( T) / 6-31 1 ++G( d,p)研究了气相离子 -分子反应 B2 H- 3 +CS2 B2 H3S- +CS的机理 .结果表明 ,B2 H- 3 最可能进攻 CS2 中碳原子形成三元环中间体 ,随后通过氢迁移和最终消除 CS的反应步骤形成硫原子转移产物 H3BBS- +CS,反应大量放热且不需要活化能 . B2 H- 3 直接对 CS2 中硫原子进攻夺取硫原子的反应方式存在一定能垒阻碍 .计算结果有助于深入了解 B2 H- 3 ,B3H- 6 和 B4H-

关键词：硼氢负离子气相离子-分子反应反应机理二硫化碳密度泛函

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梳型嵌段共聚物微观相分离的耗散粒子动力学模拟

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高等学校化学学报 2008年第6期29卷 1200-1204页

作者：刘英涛李占伟吕中元李泽生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中... 详细信息

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中影响梳形嵌段共聚物微观相分离的主要因素,包括嵌段共聚物的组成、拓扑结构以及不同粒子间的排斥力.

关键词：微观相分离耗散粒子动力学模拟梳形嵌段共聚物

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聚合物链长及表面吸附强度对三维受限下嵌段共聚物微观相分离的影响

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高等学校化学学报 2007年第2期28卷 316-319页

作者：陈梨俊张志杰吕中元孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用动态密度泛函(Dynamic density functional theory,DDFT)方法研究了三维受限下嵌段共聚物的微观相分离,讨论了共聚物链长和表面吸附强度对微观相形成与取向的影响.体系中随机分布的等径微球提供三维限制结构,体积分数为0.6.增加微... 详细信息

利用动态密度泛函(Dynamic density functional theory,DDFT)方法研究了三维受限下嵌段共聚物的微观相分离,讨论了共聚物链长和表面吸附强度对微观相形成与取向的影响.体系中随机分布的等径微球提供三维限制结构,体积分数为0.6.增加微球的半径和体积分数,能够使其从破坏微相规整结构的纳米掺杂过渡到提供三维限制结构.调整嵌段共聚物与微球表面的相互作用对微相形成与取向有重要影响.

关键词：微观相分离三维受限动态密度泛函方法

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