检索结果-内蒙古大学图书馆

高等学校化学学报 2001年第10期22卷 1711-1714页

作者：屈正旺李泽生丁益宏孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

用 B3LYP/6-31 1 G( d,p)密度泛函方法和高级电子相关的 CCSD( T) /6-31 1 G( 2 df,p)偶合簇法研究BH+ 2 与 C2 H2 反应势能面 .结果表明 :该势能面上存在 ( a) H2 B+· C2 H2 ,( b) HBCHCH2 + ,( c) H2 BCCH+ 2 和( d) H2 · B... 详细信息

用 B3LYP/6-31 1 G( d,p)密度泛函方法和高级电子相关的 CCSD( T) /6-31 1 G( 2 df,p)偶合簇法研究BH+ 2 与 C2 H2 反应势能面 .结果表明 :该势能面上存在 ( a) H2 B+· C2 H2 ,( b) HBCHCH2 + ,( c) H2 BCCH+ 2 和( d) H2 · BHCCH+ 四种异构体 ,其中 ( b)能量最低且在动力学上最稳定 ,( a) ,( c)和 ( d)在动力学上均不稳定 ;BH+ 2 通过对 C2 H2 的分步亲电加成以及随后的氢迁移和 H2 消除等反应形成离解产物 HBCCH+ +H2 ,该反应不需要活化能且大量放热 .计算结果有助于深入了解 BH+ 2

关键词：硼氢正离子反应势能面反应机理乙炔量子化学密度泛函

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SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂的理论研究

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高等学校化学学报 2006年第3期27卷 535-537页

作者：王嵩黄旭日高雪峰赵熹孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要... 详细信息

应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要的参考信息.

关键词： SARS冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂对接分子动力学模拟

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分子动力学研究亚铁血红素激活蛋白转录激活机理

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高等学校化学学报 2008年第4期29卷 819-823页

作者：赵熹黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较... 详细信息

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较性分析显示,涉及到上游活化序列(Upstream activation sequences,UAS)识别的蛋白质-DNA相互作用分布与实验观测到的3种蛋白转录活性一致.进一步对3个复合物进行柔性分析显示,3个DNA分子具有相似的柔性,而又有所不同,特别在涉及UAS识别的N-端和Zn2Cys6结构域前部有明显的柔性差异.蛋白质柔性的差别导致不同的蛋白质-DNA相互作用.因此亚铁血红素激活蛋白的N-端和Zn2Cys6结构域前部的柔性大小能够调节亚铁血红素激活蛋白转录激活功能.

关键词：分子动力学转录激活柔性亚铁血红素激活蛋白

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亚甲基自由基（^3CH2）与SO反应机理的理论研究

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化学学报 2006年第2期64卷 139-144页

作者：白洪涛黄旭日于广涛李吉来于健康孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各... 详细信息

应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT),对3CH2自由基与SO分子反应的单、三重态势能面进行了研究.在UB3LYP/6-311G(d,p)水平上优化了反应通道上各驻点(反应物、中间体、过渡态和产物)的几何构型.在CCSD(T)/6-311G(d,p)水平上计算了各物种的单点能,并对总能量进行了零点能校正.研究结果表明:主要的反应通道都在单重态势能面中,反应物中自由基3CH2的C原子进攻SO分子中的O原子是主要的进攻方式,反应主产物是P1(HS+HCO).反应热为-349.06kJ?mol-1.

关键词：从头算密度泛函理论 ^3CH2自由基反应通道

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SiNP分子结构及稳定性的理论研究

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高等学校化学学报 2005年第5期26卷 894-896,F007页

作者：于健康陈广慧黄旭日李卓孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用B3LYP/6-311G(d),QCISD和CCSD(T)方法,对单重态和三重态SiNP体系的异构化进行了研究.在QCISD/6-311G(d)水平下,得到了7个稳定的异构体,它们由4个过渡态所连接,其中三重态线型异构体SiNP(31,3Σ1),单重态环状异构体SiNP(14,1A′)和... 详细信息

采用B3LYP/6-311G(d),QCISD和CCSD(T)方法,对单重态和三重态SiNP体系的异构化进行了研究.在QCISD/6-311G(d)水平下,得到了7个稳定的异构体,它们由4个过渡态所连接,其中三重态线型异构体SiNP(31,3Σ1),单重态环状异构体SiNP(14,1A′)和单重态线型异构体SiNP(11,1Σ)都具有较大的热力学及动力学稳定性.

关键词： B3LYP SiNP 异构体势能面结构

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NC3O分子体系的异构化及其结构和性能的理论研究

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高等学校化学学报 2008年第12期29卷 2457-2461页

作者：赵莹孙家锺黄旭日吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用DFT,QCISD及CCSD(T)方法,对NC3O分子体系的异构化进行了系统的研究,得到了5个稳定的异构体,其中包括4个链状异构体和1个带有支链的平面结构异构体.这5个稳定异构体都具有较高的动力学和热力学稳定性.

关键词： NC3O 势能面异构体结构

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He_2F^-体系的分子间相互作用势能面

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高等学校化学学报 2007年第5期28卷 960-963页

作者：孙晓颖王钦李志儒吴迪孙家锺唐敖庆吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是... 详细信息

使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是0.295nm,∠HeF-He为52.5°.计算了此稳定结构的频率、相互作用能、二体相互作用能和三体相互作用能.在CCSD(T)/d-aug-cc-pVTZ水平下,相互作用能为-1.727kJ/mol.

关键词：相互作用势能面从头算方法三体相互作用能 He2F^-

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梳型嵌段共聚物微观相分离的耗散粒子动力学模拟

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高等学校化学学报 2008年第6期29卷 1200-1204页

作者：刘英涛李占伟吕中元李泽生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中... 详细信息

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中影响梳形嵌段共聚物微观相分离的主要因素,包括嵌段共聚物的组成、拓扑结构以及不同粒子间的排斥力.

关键词：微观相分离耗散粒子动力学模拟梳形嵌段共聚物

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C_(40)异构体的结构和稳定性的理论研究

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高等学校化学学报 2003年第1期24卷 105-108页

作者：刘桂霞张红星孙家锺唐敖庆吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用 Gaussian98程序 ,采用密度泛函 ( DFT)方法中的 B3LYP,选用 6 -31 G基组对富勒烯 ( Fullerene)C40 的 6种异构体 [D5d,Td,D2 h,C3 v,D2 ( ) ,D2 ( ) ]进行了几何构型优化 ,其中 ,对于 Td 对称性的 C40 由于易发生 Jahn-Teller... 详细信息

利用 Gaussian98程序 ,采用密度泛函 ( DFT)方法中的 B3LYP,选用 6 -31 G基组对富勒烯 ( Fullerene)C40 的 6种异构体 [D5d,Td,D2 h,C3 v,D2 ( ) ,D2 ( ) ]进行了几何构型优化 ,其中 ,对于 Td 对称性的 C40 由于易发生 Jahn-Teller畸变 ,则降低其对称性为 D2 d,再进行优化 .对它们的平衡几何和电子结构进行了比较具体的分析 ,同时 ,根据计算得到的总能量推断出这 6种异构体的稳定性顺序是 D2 ( ) >D5d>Td>C3 v>D2 h>D2 ( ) .

关键词：理论研究 C40 异构体电子结构稳定性富勒烯密度泛函

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二氧化三氮(N_3O_2)中性分子和离子的一些重要反应过程的理论研究

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高等学校化学学报 2007年第1期28卷 132-135页

作者：张浩孙延波李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先... 详细信息

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先在光照下解离为与其具有相同的W构型的中性分子和一个电子,这个中性分子是一个过渡态,它将打破C2v构型变成具有Cs对称性的W型中间异构体,然后再经过一个过渡态,裂解成N2O+NO两个小分子.这个裂解过程的能垒非常低(5.96 kJ/mol),因此在实验中很难检测到W型的中间异构体.在另一个重要的[N3O2]体系的反应(NO+N2O N2+NO2)中,找到了两条反应通道,其中不经过中间异构体的一步转化通道更为可行.

关键词：中性二氧化三氮(N3O2)分子光解离稳定中间体多步转化一步转化

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