检索结果-内蒙古大学图书馆

辽宁石油化工大学学报 2009年第4期29卷 7-11页

作者：张凤华王婵李飞刘慧玲辽宁石油化工大学化学与材料科学学院辽宁抚顺113001 辽宁石油化工大学教务处辽宁抚顺113001 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130021

在密度泛函和从头算的理论下,研究了双重态[Si,O,C,P]自由基的结构和生成路径。在B3LYP/6-311G(d)水平下,计算得到13个异构体和15个过渡态。在QCISD/6-311G(d)水平下,环状结构的O-cCSiP5和两个弯曲的异构体OSiCP1和SiCPO3是动力学稳定... 详细信息

在密度泛函和从头算的理论下,研究了双重态[Si,O,C,P]自由基的结构和生成路径。在B3LYP/6-311G(d)水平下,计算得到13个异构体和15个过渡态。在QCISD/6-311G(d)水平下,环状结构的O-cCSiP5和两个弯曲的异构体OSiCP1和SiCPO3是动力学稳定的异构体。三个异构体的价键结构和异构体1和5可能的生成路径被讨论。预测的结构和生成路径对[Si,O,C,P]自由基将来的实验室制备和星际探测具有帮助作用。

关键词：结构 [Si,O,C,P]自由基生成路径

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二聚体C_2H_4-nFn-BrF(n=0,2)的结构和π溴键性质的研究

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绥化学院学报 2005年第3期25卷 158-160页

作者：李瑞延李志儒内蒙古民族大学化学学院内蒙古通辽028043 吉林大学理论化学研究所国家重点实验室吉林省长春130021

本文计算使用了高精度的CP(counterpoise)校正方法,在MP2/aug-cc-pVDZ水平,得到了C2H4-BrF、trans-C2H2F2-BrF和cis-C2H2F2-BrF的结构。与C2H4-BrF对比,发现在F取代效应的影响下,C2H4-nFn-BrF(n=2)的π-Br键(Br…C=C)变长和倾斜了。F取代效应降低了π-Br键的相互作用能,电子相关效应增加了π-Br键的相互作用能。在C2H4-nFn-BrF(n=2)体系中发现了新的二级相互作用。

关键词：质的研究结构相互作用校正方法 cis 效应发现

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双二十面体生长模式的镍团簇(Ni20-Ni30)研究

双二十面体生长模式的镍团簇(Ni20-Ni30)研究

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第十一届全国量子化学会议

作者：宋薇吕文彩臧庆军 C.Z.Wang K.M.Ho 吉林大学理论化学研究所理论和化学计算国家重点实验室吉林长春130021 吉林大学理论化学研究所理论和化学计算国家重点实验室吉林长春130021 青岛大学纤维新材料与现代纺织重点实验室山东青岛266071 青岛大学纤维新材料与现代纺织重点实验室山东青岛266071 Department of Physics and Astronomy and Ames Laboratory-U.S.DOE and lowa State Univcrsity Ameslow

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针对聚电解质体系的杂化粒子场分子动力学模拟方法

针对聚电解质体系的杂化粒子场分子动力学模拟方法

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2015年全国高分子学术论文报告会

作者：朱有亮吕中元孙昭艳中国科学院长春应用化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室吉林大学理论化学研究所

对于长链的聚电解质分子,常规的分子动力学模拟方法很难对其进行研究。一方面由于分子链间的拓扑限制而导致的缠结相互作用,使其在本体的松弛时间与链长的三次方成正比。另一方面对电荷的长程静电相互作用的计算非常耗时,且在周期性边... 详细信息

对于长链的聚电解质分子,常规的分子动力学模拟方法很难对其进行研究。一方面由于分子链间的拓扑限制而导致的缠结相互作用,使其在本体的松弛时间与链长的三次方成正比。另一方面对电荷的长程静电相互作用的计算非常耗时,且在周期性边界条件下需考虑镜像体系的静电作用。粗粒化的模型可以很好地提高模拟的时间和空间尺度,但仍很难在描述足够多的分子细节的同时,快速地得到聚电解质体系的平衡结构。最近由Milano等人提出了一种杂化的粒子场分子动力学模拟方法。这种方法结合了自洽场和分子动力学的优点,被称为MD-SCF方法。由于把分子与分子之间的多体相互作用转变成分子与场的单体相互作用,所以体系的平衡时间与体系的尺寸成正比,而与分子长度无关。我们在这种方法中发展了对于静电相互作用的描述。此外,我们通过GPU对于这种模拟方法进行加速,使其能够达到微秒时间尺度的模拟。预期这种方法可以很好地对聚电解质的自组装和相分离等性质进行研究。

关键词：聚电解质粒子场相分离 GPU加速分子动力学

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基于微流控液滴的单细胞拉曼分析技术

基于微流控液滴的单细胞拉曼分析技术

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第十九届全国光散射学术会议

作者：孙丹曹方浩丛丽丽徐蔚青陈奇丹徐抒平吉林大学理论化学研究所超分子结构与材料国家重点实验室吉林大学珠海学院化学与药学系

本研究将微流控液滴技术与拉曼光谱结合用于单个细胞表面碱性磷酸酶(ALP)的活性评价以及药物(索拉菲尼)对癌细胞(Hep G2)的治疗效果评价。肝癌是世界范围内第五位常见的癌症,也是所有癌症

关键词：肝癌细胞碱性磷酸酶拉曼光谱微流控液滴单细胞

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软各向异性胶体粒子聚集结构设计与调控的模拟研究

软各向异性胶体粒子聚集结构设计与调控的模拟研究

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2015年全国高分子学术论文报告会

作者：李占伟吕中元孙昭艳中国科学院长春应用化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室吉林大学理论化学研究所

具有各向异性表面特性的"补丁"胶体粒子构筑单元的出现给材料科学领域带来了一场令人难以置信的革命。由于能够发生部分形变和重叠,软"补丁"胶体粒子为设计新颖的纳米结构提供了更丰富的构筑单元。因此,针对不同类... 详细信息

具有各向异性表面特性的"补丁"胶体粒子构筑单元的出现给材料科学领域带来了一场令人难以置信的革命。由于能够发生部分形变和重叠,软"补丁"胶体粒子为设计新颖的纳米结构提供了更丰富的构筑单元。因此,针对不同类型的软"补丁"胶体粒子体系,我们发展了一种既简单有效又能够描述其软形变及各向异性本质的、普适性的模拟模型及方法。在我们的软"补丁"胶体粒子模型中,"补丁"的个数、大小、方向以及排列方式都是任意可调的。同时,为了提高软"补丁"胶体粒子模型的计算效率,我们对相关的模拟算法进行了GPU加速。因此,我们的模型能够在更大的时空尺度上模拟各种软"补丁"胶体粒子的聚集行为,为设计及调控软"补丁"胶体粒子的聚集结构提供一定的理论指导。通过合理设计不同的软"补丁"胶体粒子构筑单元,我们模拟得到了各种新颖的聚集结构,同时明晰了不同聚集结构的形成条件及动力学机制。

关键词：软各向异性胶体粒子自组装计算机模拟

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分子排列对材料发光性质影响的理论计算研究

分子排列对材料发光性质影响的理论计算研究

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第十一届全国计算（机）化学学术会议

作者：王海涛白福全张红星李敏吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林大学材料科学与工程学院汽车材料教育部重点实验室吉林大学材料科学与工程学院汽车材料教育部重点实验室

分子构象、分子在聚集态的排列方式等因素对材料的发光、电荷与能量的转移及载流子传输等性质有着重要的影响。但无论是实验上还是在理论研究中,获取分子聚集态的准确结构是极其困难的,因此,相关的理论研究并没有得到广泛开展。本论文... 详细信息

分子构象、分子在聚集态的排列方式等因素对材料的发光、电荷与能量的转移及载流子传输等性质有着重要的影响。但无论是实验上还是在理论研究中,获取分子聚集态的准确结构是极其困难的,因此,相关的理论研究并没有得到广泛开展。本论文利用新近发展的密度泛函方法(DFT-D,M06-2x),通过二聚体堆砌模型,详细地研究了BTD-1,BOXD-1,TH-1

关键词：分子排列发光材料密度泛函弱相互作用

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助溶剂对两亲性嵌段共聚物自组装的影响

助溶剂对两亲性嵌段共聚物自组装的影响

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中国化学会第30届学术年会

作者：李柄谕吕中元超分子结构与材料国家重点实验室吉林大学理论化学研究所中国长春130023

两亲性嵌段共聚物因其易形成胶束或囊泡等自组装结构被广泛应用于食品、化妆品、医药等领域。本文采用耗散粒子动力学方法，模拟研究助溶剂在两亲性嵌段共聚物自组装过程中起到的重要作用及其对最终聚集结构的影响。

关键词：两亲性嵌段共聚物自组装助溶剂

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基于酶解反应实现胰蛋白酶的SERS检测

基于酶解反应实现胰蛋白酶的SERS检测

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第十九届全国分子光谱学学术会议

作者：杨丽园吴桐付翠翠徐抒平徐蔚青吉林大学理论化学研究所超分子结构与材料国家重点实验室吉林长春 130012

胰蛋白酶是一种丝氨酸蛋白水解酶.作为一种生物催化剂,其活性及浓度与生命活动息息相关.表面增强拉曼光谱(SERS)作为一种光谱技术被广泛地应用于酶体系,从分子水平研究酶反应.本研究利用胰蛋白酶的催化特性,酶解反应后体系电势发生变化... 详细信息

胰蛋白酶是一种丝氨酸蛋白水解酶.作为一种生物催化剂,其活性及浓度与生命活动息息相关.表面增强拉曼光谱(SERS)作为一种光谱技术被广泛地应用于酶体系,从分子水平研究酶反应.本研究利用胰蛋白酶的催化特性,酶解反应后体系电势发生变化从而进行静电组装,提出了一种用于检测胰蛋白酶活性及专一性的新SERS方法.该方法同样适用于复杂生物体系中,体现了SERS生物传感在酶活性分析中的优越性和应用前景.

关键词：胰蛋白酶酶解反应静电组装表面增强拉曼光谱

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分子动力学模拟程序GALAMOST的多GPU并行进展介绍

分子动力学模拟程序GALAMOST的多GPU并行进展介绍

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中国化学会2016年软物质理论计算与模拟会议

作者：朱有亮吕中元孙昭艳中国科学院长春应用化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室吉林大学理论化学研究所

我们发展了一个通用的分子动力学模拟程序包,称为GALAMOST,是GPU-accelerated large-scale molecular simulation toolkit的缩写[1]。GALAMOST程序包可以充分利用GPU的运算能力。GALAMOST的所有运算都在GPU上完成,没有GPU显存和主机内存之间的数据传递,因此大大提高了GPU的利用效率。GALAMOST程序包除了包含一些通用的分子动力学模拟方法外,还包含了一些最近发展的针对高分子体系的粗粒化模型和模拟方法,比如粒子-场方法[2],迭代玻尔兹曼粗粒化方法[3],软的各向异性粒子模型[4],以及链增长聚合反应模型[5]。在之前的工作中我们发展了高度优化的单GPU的GALAMOST代码。最近我们在单GPU代码的基础上,进一步发展了多GPU并行的GALAMOST代码。多GPU并行的代码利用空间划分的算法,一个GPU负责计算一个区域空间内的粒子,数据传递通过MPI完成。利用节点内的Peer-to-Peer和节点间的Remote Direct Memory Access技术,GALAMOST还支持GPU间的直接通信,进一步提高程序的计算效率。希望GALAMOST能为科学研究者提供一个方便、快捷和强大的分子模拟工具。

关键词：分子动力学 GALAMOST GPU 高分子粗粒化

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