检索结果-内蒙古大学图书馆

高等学校化学学报 2009年第8期30卷 1641-1644页

作者：王嵩赵熹郑清川黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

Exendin-4作为胰腺GLP-1受体上的一种有效的激活剂,是一种含有39个氨基酸残基的多肽,其第13号氨基酸Gln突变为Tyr,使活性增强.应用分子动力学模拟方法,分别优化了突变前后,Exendin-4与蛋白的复合物结构,并对整体结构的性质、静电势、相... 详细信息

Exendin-4作为胰腺GLP-1受体上的一种有效的激活剂,是一种含有39个氨基酸残基的多肽,其第13号氨基酸Gln突变为Tyr,使活性增强.应用分子动力学模拟方法,分别优化了突变前后,Exendin-4与蛋白的复合物结构,并对整体结构的性质、静电势、相互作用模式及能量进行了分析.阐明了Gln突变为Tyr的活性增强的内在原因,结果表明,突变的Exendin-4能够通过改变自身结构的局部柔性调整与蛋白受体相互作用,从而可以改善Exendin-4与其蛋白受体的结合能力.

关键词： Exendin-4 分子动力学模拟复合物静电作用

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用从头算法研究高氯酸钠溶液中存在的离子缔合物种及缔合过程

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高等学校化学学报 2010年第8期31卷 1600-1604页

作者：张浩于健康孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用量子化学计算方法在HF/6-31+G*水平下对高氯酸钠溶液中可能存在的离子缔合物种及浓度升高时溶液中发生的离子缔合过程进行了研究.高氯酸根与水合钠离子可形成溶剂共享离子对、接触离子对、三离子及多离子团簇等离子缔合物种,当体系... 详细信息

采用量子化学计算方法在HF/6-31+G*水平下对高氯酸钠溶液中可能存在的离子缔合物种及浓度升高时溶液中发生的离子缔合过程进行了研究.高氯酸根与水合钠离子可形成溶剂共享离子对、接触离子对、三离子及多离子团簇等离子缔合物种,当体系中水比较充足时,钠离子可以保持较规整的六配位八面体构型,而当水分子比较少时,则生成不规则的五配位构型.以上水合离子缔合物种中的ν1-ClO4-频率与水合硝酸根中的参比值相比,分别发生4.7,8.5及14～17cm-1的蓝移,除以影响因子后,其与实验结果符合得很好.通过将计算结果与实验结果进行对比,高氯酸钠溶液在浓度升高时发生离子缔合的过程可简略表示为"自由水合离子→溶剂共享型离子对→单齿接触离子对→阳-阴-阳型三离子团簇→链状多离子团簇→网状多离子团簇→无定形晶体".这个过程与硫酸镁相似,而与硝酸镁、高氯酸镁和硝酸钠不同.

关键词：从头算高氯酸钠缔合物种缔合过程

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[MAl_5]^+ (M=Si,Ge,Sn,Pb)体系结构和稳定性的理论研究

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高等学校化学学报 2010年第4期31卷 772-776页

作者：贺海鹏崔中华丁益宏吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用B3LYP和CCSD(T)(单点)方法,研究了含Si,Ge,Sn,Pb的六原子体系[MAl5]+中各个异构体的结构及稳定性.研究结果表明,尽管与[CAl5]+一样也具有18个价电子,但[MAl5]+(M=Si,Ge,Sn,Pb)体系并不存在具有平面五配位结构的异构体,其能量的全局... 详细信息

利用B3LYP和CCSD(T)(单点)方法,研究了含Si,Ge,Sn,Pb的六原子体系[MAl5]+中各个异构体的结构及稳定性.研究结果表明,尽管与[CAl5]+一样也具有18个价电子,但[MAl5]+(M=Si,Ge,Sn,Pb)体系并不存在具有平面五配位结构的异构体,其能量的全局极小点为具有Cs对称性的蝶形异构体Int1,这是由于中心原子M(Si,Ge,Sn,Pb)较大的体积显著破坏了[MAl5]+中平面五配位结构的稳定性所致.

关键词： [MAl_5]^+ (M=Si,Ge,Sn,Pd) 平面五配位异构体热力学稳定性

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均聚物链吸附在胶束表面上的非平衡态耗散粒子动力学

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高等学校化学学报 2011年第8期32卷 1845-1848页

作者：李延春刘鸿黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用平衡态耗散粒子动力学(DPD)方法研究了嵌段共聚物自组装形成胶束及均聚物链在其表面的吸附.采用非平衡态耗散粒子动力学(NEDPD)方法,通过加入剪切作用研究了均聚物的脱落和胶束的分裂过程.研究结果表明,在小的剪切速率下,胶束会带... 详细信息

利用平衡态耗散粒子动力学(DPD)方法研究了嵌段共聚物自组装形成胶束及均聚物链在其表面的吸附.采用非平衡态耗散粒子动力学(NEDPD)方法,通过加入剪切作用研究了均聚物的脱落和胶束的分裂过程.研究结果表明,在小的剪切速率下,胶束会带着均聚物滑动和滚动;在大的剪切速率下,胶束会完全破裂,组成胶束的嵌段共聚物也像均聚物一样被拉长;只有在适当的剪切速率范围内,才会有均聚物的脱落和胶束分裂的过程.通过分析给出了剪切速率大小与脱落时间的对应关系.

关键词：剪切速率耗散粒子动力学嵌段共聚物胶束

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MCM-36分子筛的合成及其苯与丙烯烷基化性能研究

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高等学校化学学报 2007年第3期28卷 530-534页

作者：张钰邢海军吴淑杰吴鹏杨飘萍贾明君吴通好孙家锺吉林大学化学学院吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130021

分别从MCM-22和MCM-49前驱体出发合成了MCM-36分子筛,在液-固固定床反应器上对MCM-36分子筛的苯与丙烯液相烷基化反应性能进行了评价.由MCM-22前驱体出发合成的MCM-36(A)结晶度良好,比MCM-22具有更高比表面积和介孔孔容,酸量明显下降.由... 详细信息

分别从MCM-22和MCM-49前驱体出发合成了MCM-36分子筛,在液-固固定床反应器上对MCM-36分子筛的苯与丙烯液相烷基化反应性能进行了评价.由MCM-22前驱体出发合成的MCM-36(A)结晶度良好,比MCM-22具有更高比表面积和介孔孔容,酸量明显下降.由MCM-49前驱体出发合成的MCM-36(B)的比表面积和介孔孔容增加,小角XRD特征衍射峰强度低于MCM-36(A),与MCM-49相比酸量下降幅度较小.在苯与丙烯液相烷基化反应中MCM-36(A)的活性与MCM-22相当,丙烯的转化率大于99.5%,异丙苯的选择性比MCM-22提高了7%.MCM-36(B)的反应活性高于MCM-36(A),而异丙苯的选择性低于MCM-36(A).MCM-36分子筛上苯与丙烯液相烷基化反应活性的提高归因于有效酸性位的增加,异丙苯选择性的提高则主要归因于B酸量的降低.

关键词： MCM-36分子筛 MCM-22前驱体 MCM-49前驱体烷基化

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吲哚咔唑异构体的电子结构和光学性质

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物理化学学报 2010年第1期26卷 115-119页

作者：王会萍白福全郑清川赵增霞赵晓杰张红星吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

分别采用密度泛函理论(DFT)和单激发组态相互作用(CIS),在6-31G(d,p)基组水平上优化了5个吲哚咔唑分子的基态和激发态结构.在此结构的基础上,用含时密度泛函理论(TD-DFT)在相同基组水平和极化连续介质模型(PCM)下计算了模型分子的吸收... 详细信息

分别采用密度泛函理论(DFT)和单激发组态相互作用(CIS),在6-31G(d,p)基组水平上优化了5个吲哚咔唑分子的基态和激发态结构.在此结构的基础上,用含时密度泛函理论(TD-DFT)在相同基组水平和极化连续介质模型(PCM)下计算了模型分子的吸收和发射光谱.这几个吲哚咔唑异构体的发射光谱有明显的差别,如异构体5([3,2-b]型)有较大的振子强度,但是相对于其他异构体,其发射能量最小;异构体4([3,2-a]型)的发射能量最大;异构体2([2,3-b]型)的最大振子强度在250-450 nm范围内,与其他几个分子相比为最小.这主要是由分子的激发态几何变化和轨道能级的不同导致的.本文还考察了这类分子的一阶超极化率,结果显示5个分子极化率在同一水平,但静态第一超极化率(β0)有明显差别,异构体2的β0值最大.

关键词：密度泛函理论含时密度泛函理论吲哚咔唑单激发组态相互作用方法吸收和发射光谱非线性响应

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超价化合物F_nLi_(n+1)(n=1～3)一阶超极化率的理论研究

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高等学校化学学报 2010年第9期31卷 1811-1814页

作者：李莹吴迪吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用UMP2/6-311+G(3df)方法得到了FnLin+1(n=1～3)体系的8个全部实频的异构体构型,并研究了这些体系的非线性光学性质.结果表明,这类超价化合物具有较大的一阶超极化率值(β0=2299.2～12322.3a.u.).超价化合物中弥散的电子云使体系具有... 详细信息

采用UMP2/6-311+G(3df)方法得到了FnLin+1(n=1～3)体系的8个全部实频的异构体构型,并研究了这些体系的非线性光学性质.结果表明,这类超价化合物具有较大的一阶超极化率值(β0=2299.2～12322.3a.u.).超价化合物中弥散的电子云使体系具有较低的跃迁能,从而决定了FnLin+1具有较大的一阶超极化率.提示非中心对称的超价化合物将是一类潜在的非线性光学分子.

关键词：从头算超价化合物一阶超极化率

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聚偏二氯乙烯构象分布的理论研究

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高等学校化学学报 2008年第11期29卷 2273-2276页

作者：张志杰吕中元李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论与计算化学国家重点实验室长春130023

在MP2/6-311++G**水平下,对2,2,4,4-四氯戊烷与2,2,4,4,6,6-六氯庚烷旋转异构体构象进行几何优化和能量计算.结果表明,对于2,2,4,4-四氯戊烷,采用gauche-gauche排列的旋转异构体的能量较低;2,2,4,4,6,6-六氯庚烷旋转异构体中,采用trans-... 详细信息

在MP2/6-311++G**水平下,对2,2,4,4-四氯戊烷与2,2,4,4,6,6-六氯庚烷旋转异构体构象进行几何优化和能量计算.结果表明,对于2,2,4,4-四氯戊烷,采用gauche-gauche排列的旋转异构体的能量较低;2,2,4,4,6,6-六氯庚烷旋转异构体中,采用trans-gauche-trans-gauche排列的构象能量较低.反之,完全采用trans-trans排列的旋转异构体构象能量较高,不稳定.通过比较模型分子不同旋转异构体构象的能量差值可以得到一级和二级特征的相互作用能差,进而计算统计权重参数.在此基础上,应用计算得到的模型分子的几何构型与统计权重参数,分别构建针对—CH2—和—CCl2—中心的聚偏二氯乙烯的6态旋转异构态模型.通过旋转异构态模型可以计算聚偏二氯乙烯分子中各种构象的分布.

关键词：从头算聚偏二氯乙烯构象分布

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卤代氰基卡宾自由基XCCN(X=F，Cl，Br)的理论研究

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高等学校化学学报 2009年第9期30卷 1839-1843页

作者：赵增霞侯春园张红星孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在Cs对称性和ANO-S基组下,使用全活化空间自洽场方法(CASSCF),研究了卤代氰基卡宾自由基及其阴离子的低能电子激发态性质.为了进一步考虑电子的动态相关效应,采用多组态二级微扰理论(CASPT2)获得更加精确的能量值.计算结果表明,XCCN的... 详细信息

在Cs对称性和ANO-S基组下,使用全活化空间自洽场方法(CASSCF),研究了卤代氰基卡宾自由基及其阴离子的低能电子激发态性质.为了进一步考虑电子的动态相关效应,采用多组态二级微扰理论(CASPT2)获得更加精确的能量值.计算结果表明,XCCN的基态是三重态.单重态和三重态的能隙差ΔES-T(kJ/mol):7.4(FCCN)<13.4(ClCCN)<16.6(BrCCN).计算得到,XCCN(X=F,Cl,Br)最低垂直激发能分别为408.3,385.4和345.2kJ/mol,这归因于π(a′)→nxy的电子跃迁;XCCN的电子亲和势分别为235.7,233.0和237.2kJ/mol,与HCCN相比,其电子亲和势变大.

关键词：卤代氰基卡宾多组态自洽场理论多组态二级微扰理论单重态三重态

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分子动力学模拟极端嗜热核糖结合蛋白的热力学稳定性

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化学学报 2012年第5期70卷 606-610页

作者：冯献礼赵熹于辉王乙博孙铁东黄旭日吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用分子动力学模拟方法研究极端嗜热性核糖结合蛋白(tteRBP)的嗜热机理.在常温(300 K)和最佳活性温度(375 K)时,分别对tteRBP分子进行动力学模拟,结果表明,整体分子均保持结构稳定,但分子内部的协调运动不同.在375 K时蛋白整体柔性显... 详细信息

采用分子动力学模拟方法研究极端嗜热性核糖结合蛋白(tteRBP)的嗜热机理.在常温(300 K)和最佳活性温度(375 K)时,分别对tteRBP分子进行动力学模拟,结果表明,整体分子均保持结构稳定,但分子内部的协调运动不同.在375 K时蛋白整体柔性显著提高,使分子能够局部调整构象以适应极端高温.蛋白结构变化的分析也确认了高温时构象局部微调对蛋白极端高温稳定性的关键作用.

关键词： tteRBP(Thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein) 分子动力学分子内部协调运动柔性极端嗜热

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