检索结果-内蒙古大学图书馆

物理化学学报 2009年第3期25卷 417-422页

作者：赵勇山郑清川张红星楚慧郢孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类丝氨酸消旋酶(hSR)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的可靠性.在此基础上用分子对接程序(affinity)将多肽类抑制剂A和B分别与hSR进行对接,获得了其复合物结构的理论模型... 详细信息

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类丝氨酸消旋酶(hSR)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的可靠性.在此基础上用分子对接程序(affinity)将多肽类抑制剂A和B分别与hSR进行对接,获得了其复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了此类抑制剂与hSR的具体结合方式,明确了hSR与此类抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基,为基于人类丝氨酸消旋酶三维结构的药物设计提供重要的参考信息.

关键词：人类丝氨酸消旋酶分子动力学模拟分子对接同源模建

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系列二亚胺Os(Ⅱ)配合物[Os(L)_2(CN)_2(phen)](L=PH_3,DMSO;phen=1,10-邻二氮杂菲)及[Os(PH_3)_2(phen)Br_2]电子结构和光谱性质的理论研究

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化学学报 2009年第3期67卷 197-202页

作者：吴玉辉周欣张红星吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用自旋限制和非限制B3LYP/UB3LYP方法分别优化了系列Os(Ⅱ)二亚胺配合物[Os(L)2(CN)2(phen)][phen=1,10-邻二氮杂菲;L=PH3(1),二甲基亚砜(DMSO)(2)]及[Os(PH3)2(phen)Br2](3)的基态和激发态几何构型.通过TD-DFT方法结合PCM溶剂化模型计算了配合物1～3在二氯甲烷溶液中的吸收和发射光谱并指认了相应的跃迁性质.通过理论化学计算,揭示了π酸配体及π碱配体对配合物磷光发射性质的影响及原因.并进一步解释了配合物3易于在Os—Br键处断裂而发生反应的量子化学机理.对配合物在不同溶剂中的磷光发射性质的计算表明,溶剂对配合物的量子产率存在着影响并且配合物具有溶剂化显色效应。

关键词： Os(Ⅱ)配合物激发态密度泛函理论 TD—DFT 溶剂化效应

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IrR(CO)(PH_3)_2(mnt)配合物的基态和激发态结构及光谱性质的理论研究

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化学学报 2009年第1期67卷 33-38页

作者：吴玉辉周欣王嵩白福全张建坡张红星孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

应用MP2和CIS方法分别优化了IrR(CO)(PH3)2(mnt)[mnt=maleonitriledithiolate;R=H(1),CH3(2),Br(3)]系列配合物的基态和激发态几何结构.使用TD-DFT方法计算了配合物的吸收和发射光谱.计算结果表明:配合物1～3在430,435及439nm处的最低能吸收均为ILCT/LLCT/MLCT混合跃迁性质,它们的最低能磷光发射和吸收性质相似,发射波长则红移至760,770和800nm.配合物2与1的几何结构、光谱性质都很接近,而配合物3中,由于溴的引入使其基态和激发态几何构型及前线分子轨道成分与1和2有很大不同,进而对其光谱及跃迁性质产生了影响.

关键词： Ir配合物激发态溶剂化效应 TD—DFT

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SnCNN：一个包含SnC三重键的分子

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高等学校化学学报 2009年第7期30卷 1427-1430页

作者：张文斌石国升丁益宏孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在CCSD(T)//B3LYP方法下,研究了四原子分子[SnCN2]的势能面,发现线性异构体SnCNN具有良好的动力学稳定性.几何分析与键分析表明,该异构体包含Sn≡C三重键,并可以用过渡金属络合物配合稳定来增加其稳定性.

关键词： SnCNN 三重键势能面线性异构体

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基于平面四配位碳单元CAl2Si2夹心组装的理论研究

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高等学校化学学报 2009年第12期30卷 2464-2468页

作者：贺海鹏杨利明丁益宏吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

对含Si的ptC单元CAl2Si2进行了夹心组装的理论研究,发现当CAl2Si2与碱金属及碱土金属(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca)组装成夹心化合物时,由于CAl2Si2之间强烈的熔合作用,不能采取传统的"同夹板夹心"方式,即[(CAl2Si2)M(CAl2Si2)]q+的形... 详细信息

对含Si的ptC单元CAl2Si2进行了夹心组装的理论研究,发现当CAl2Si2与碱金属及碱土金属(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca)组装成夹心化合物时,由于CAl2Si2之间强烈的熔合作用,不能采取传统的"同夹板夹心"方式,即[(CAl2Si2)M(CAl2Si2)]q+的形式,而新的"杂夹板夹心"形式([CpM(CAl2Si2)]q+)更适合CAl2Si2的组装.计算结果表明,在组装过程中,CAl2Si2的电子和结构特征得到很好的保持.因此,平面四配位碳单元CAl2Si2可以作为"建筑单元"构建大尺寸含平面中心碳的化合物.

关键词： CAl2Si2 夹心组装理论研究

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双咔唑间连接方式不同引起的结构和性质变化的理论研究

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高等学校化学学报 2009年第12期30卷 2434-2438页

作者：王会萍白福全郑清川赵增霞张红星吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用密度泛函方法(DFT)和单激发组态相互作用(CIS)方法,在6-31G(d,p)基组水平下优化了咔唑分子和14种双咔唑结构异构体的基态和激发态结构,在此基础上,用含时密度泛函(TD-DFT)方法在相同基组水平下计算了模型分子的吸收和发射波长及电... 详细信息

利用密度泛函方法(DFT)和单激发组态相互作用(CIS)方法,在6-31G(d,p)基组水平下优化了咔唑分子和14种双咔唑结构异构体的基态和激发态结构,在此基础上,用含时密度泛函(TD-DFT)方法在相同基组水平下计算了模型分子的吸收和发射波长及电荷跃迁性质.讨论了双咔唑构型的变化带来的性质上的变化,与实验值相比得到了精确的计算结果.通过双咔唑的前线轨道能量值、电离能和亲和势及重组能的变化,全面研究了不同构型的应用,为实验上的设计和合成提供了思路.

关键词：咔唑密度泛函理论含时密度泛函理论单激发组态相互作用方法吸收发射光谱重组能

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高分子在受限稀溶液中的结构和动力学性质

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高等学校化学学报 2009年第1期30卷 191-195页

作者：何彦东尤莉艳王晓琳吕中元李泽生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130021

利用平衡态及非平衡态耗散粒子动力学模拟方法,分别研究了平衡态和流场作用下受限高分子在稀溶液中的链结构和动力学.采用没有滑移和密度涨落的边界条件模拟纳米管道环境,进而研究了高分子回转半径和扩散系数对受限强度及高分子与溶剂... 详细信息

利用平衡态及非平衡态耗散粒子动力学模拟方法,分别研究了平衡态和流场作用下受限高分子在稀溶液中的链结构和动力学.采用没有滑移和密度涨落的边界条件模拟纳米管道环境,进而研究了高分子回转半径和扩散系数对受限强度及高分子与溶剂间相互作用的依赖关系.在非平衡态模拟中,分别考虑了Poi-seuille和Couette两种流场.研究发现,在这两种流场作用下,高分子都随着溶剂与高分子排斥作用的降低而向管道中心迁移.在强流场下,在Poiseuille流场中高分子密度呈现出双峰分布,而在Couette流场中则呈现为单峰分布.

关键词：耗散粒子动力学受限高分子稀溶液 Poiseuille流场 Couette流场

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双取代铵氧化物(R2HNO)与双取代羟胺(R2NOH)的相互转换机制的理论研究--取代基的电负性和立体效应影响

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高等学校化学学报 2009年第5期30卷 1010-1013页

作者：石国升丁益宏吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在B3LYP/6-311++G(d,p)水平下,对一系列双取代铵氧化物(R2HNO)与双取代羟胺(R2NOH){R=NH2,N(CH3)2,N(CH2CH3)2,N[C(CH3)3]2,OH,OCH3,OCH2CH3,OC(CH3)3}的相互转换机制进行了理论研究.研究结果表明,双取代铵氧化物R2HNO的热力学和动力学稳定性受电负性和立体效应的综合控制.其中胺基系列热力学稳定性以空间位阻的影响为主,而烷氧基系列热力学稳定性以电负性的影响为主.而两者的动力学稳定性均以电负性影响为主.

关键词：双取代铵氧化物双取代羟胺热力学稳定性动力学稳定性

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顶盖驱动流中胶束形态变化的耗散粒子动力学研究

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高等学校化学学报 2009年第9期30卷 1784-1788页

作者：尤莉艳赵英王帅吕中元吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用耗散粒子动力学模拟方法研究了顶盖驱动方腔流条件下,线性两嵌段共聚物胶束形态的变化.结果表明弱的流场对胶束的形态影响不大,但是在中等强度流场的作用下,小胶束会融合并形成条状胶束,而在很强的流场作用下,胶束会被破坏而形成体... 详细信息

利用耗散粒子动力学模拟方法研究了顶盖驱动方腔流条件下,线性两嵌段共聚物胶束形态的变化.结果表明弱的流场对胶束的形态影响不大,但是在中等强度流场的作用下,小胶束会融合并形成条状胶束,而在很强的流场作用下,胶束会被破坏而形成体积更小的球状胶束.

关键词：顶盖驱动流嵌段共聚物胶束耗散粒子动力学

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P123(PEO20-PPO70-PEO20)嵌段共聚物水溶液物理凝胶化行为的耗散粒子动力学模拟

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高等学校化学学报 2009年第12期30卷 2455-2459页

作者：赵英谢宇吕中元孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用耗散粒子动力学（Dissipative particle dynamics, DPD）方法研究了P123（PEO20-PPO70-PEO20）嵌段共聚物水溶液常温下的物理凝胶化行为. 在体积分数（2%~10%）较低时, P123在水溶液中形成球形胶束. 当P123的水溶液体积分数升高到20... 详细信息

采用耗散粒子动力学（Dissipative particle dynamics, DPD）方法研究了P123（PEO20-PPO70-PEO20）嵌段共聚物水溶液常温下的物理凝胶化行为. 在体积分数（2%~10%）较低时, P123在水溶液中形成球形胶束. 当P123的水溶液体积分数升高到20%时, 会形成柱状胶束. 在P123的水溶液体积分数为30%和40%时, 观察到具有三维网络结构的凝胶. 这些模拟结果不仅与实验结果一致, 而且证明了耗散粒子动力学方法是一种非常适合研究物理凝胶化行为的重要方法. 另外, 在P123的水溶液体积分数为40%时, 研究了凝胶随着时间发展的形成过程.

关键词： P123(PEO20-PPO70-PEO20)嵌段共聚物物理凝胶耗散粒子动力学模拟

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