检索结果-内蒙古大学图书馆

辽宁石油化工大学学报 2009年第4期29卷 7-11页

作者：张凤华王婵李飞刘慧玲辽宁石油化工大学化学与材料科学学院辽宁抚顺113001 辽宁石油化工大学教务处辽宁抚顺113001 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130021

在密度泛函和从头算的理论下,研究了双重态[Si,O,C,P]自由基的结构和生成路径。在B3LYP/6-311G(d)水平下,计算得到13个异构体和15个过渡态。在QCISD/6-311G(d)水平下,环状结构的O-cCSiP5和两个弯曲的异构体OSiCP1和SiCPO3是动力学稳定... 详细信息

在密度泛函和从头算的理论下,研究了双重态[Si,O,C,P]自由基的结构和生成路径。在B3LYP/6-311G(d)水平下,计算得到13个异构体和15个过渡态。在QCISD/6-311G(d)水平下,环状结构的O-cCSiP5和两个弯曲的异构体OSiCP1和SiCPO3是动力学稳定的异构体。三个异构体的价键结构和异构体1和5可能的生成路径被讨论。预测的结构和生成路径对[Si,O,C,P]自由基将来的实验室制备和星际探测具有帮助作用。

关键词：结构 [Si,O,C,P]自由基生成路径

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分子动力学研究亚铁血红素激活蛋白转录激活机理

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高等学校化学学报 2008年第4期29卷 819-823页

作者：赵熹黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较... 详细信息

以3种亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP)-DNA复合物(野生型HAP1-wt,Ser63/Arg63突变HAP1-18和Ser63/Gly63突变HAP1-PC7)为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究.对3个复合物分子动力学轨迹的比较性分析显示,涉及到上游活化序列(Upstream activation sequences,UAS)识别的蛋白质-DNA相互作用分布与实验观测到的3种蛋白转录活性一致.进一步对3个复合物进行柔性分析显示,3个DNA分子具有相似的柔性,而又有所不同,特别在涉及UAS识别的N-端和Zn2Cys6结构域前部有明显的柔性差异.蛋白质柔性的差别导致不同的蛋白质-DNA相互作用.因此亚铁血红素激活蛋白的N-端和Zn2Cys6结构域前部的柔性大小能够调节亚铁血红素激活蛋白转录激活功能.

关键词：分子动力学转录激活柔性亚铁血红素激活蛋白

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C6H5N光谱性质的多组态二级微扰理论研究

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高等学校化学学报 2008年第7期29卷 1448-1451页

作者：侯春园郑清川赵增霞张红星吉林大学理论化学研究所、理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用全活化空间自洽场方法(CASSCF)在C2v对称性和6-31g(d,p)基组水平下,研究了C6H5N自由基及其阴阳离子的基态和低激发态性质.为了进一步考察动态电子相关效应,采用多组态二级微扰理论(CASPT2)获得更加精确的能量值.计算得到13A2→13A1... 详细信息

采用全活化空间自洽场方法(CASSCF)在C2v对称性和6-31g(d,p)基组水平下,研究了C6H5N自由基及其阴阳离子的基态和低激发态性质.为了进一步考察动态电子相关效应,采用多组态二级微扰理论(CASPT2)获得更加精确的能量值.计算得到13A2→13A1和13A2→13B2在4303.1和4212.2kJ/mol处的激发可分别归因于π(b1)→ny和π(a2)→ny的跃迁,而13A2→13B1和13A2→11B1在2634.9和2700.4kJ/mol处的激发具有nx→π*(a2)和π(a2)→nx的混合跃迁特征,理论波长与紫外吸收光谱得到的实验数据一致.计算得到的电离能与实验值也非常接近.

关键词：苯基氮多组态自洽场理论多组态二级微扰理论光电子能谱

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NC3O分子体系的异构化及其结构和性能的理论研究

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高等学校化学学报 2008年第12期29卷 2457-2461页

作者：赵莹孙家锺黄旭日吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用DFT,QCISD及CCSD(T)方法,对NC3O分子体系的异构化进行了系统的研究,得到了5个稳定的异构体,其中包括4个链状异构体和1个带有支链的平面结构异构体.这5个稳定异构体都具有较高的动力学和热力学稳定性.

关键词： NC3O 势能面异构体结构

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梳型嵌段共聚物微观相分离的耗散粒子动力学模拟

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高等学校化学学报 2008年第6期29卷 1200-1204页

作者：刘英涛李占伟吕中元李泽生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中... 详细信息

利用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)模拟方法研究了二维梳型嵌段共聚物的微观相分离,得到了相形貌与侧链长度及链段间相互作用的依赖关系,进一步与线型和星型嵌段共聚物微观相分离进行了对比.模拟结果揭示了本体中影响梳形嵌段共聚物微观相分离的主要因素,包括嵌段共聚物的组成、拓扑结构以及不同粒子间的排斥力.

关键词：微观相分离耗散粒子动力学模拟梳形嵌段共聚物

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NCO自由基与O和N反应的理论研究

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高等学校化学学报 2008年第4期29卷 809-811页

作者：赵晓雷姬越蒙刘靖尧李泽生吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用密度泛函和量子化学从头算方法,对NCO自由基和O,N原子反应的势能面进行了理论研究,讨论了主要的反应通道.这两种自由基反应的机理比较类似,初始都有两种进攻方式.NCO与O的主反应通道是O原子从N端无势垒加合,经过一低垒过渡态,得到... 详细信息

采用密度泛函和量子化学从头算方法,对NCO自由基和O,N原子反应的势能面进行了理论研究,讨论了主要的反应通道.这两种自由基反应的机理比较类似,初始都有两种进攻方式.NCO与O的主反应通道是O原子从N端无势垒加合,经过一低垒过渡态,得到稳定产物P1(CO+NO),而对NCO与N反应得到了一完整反应通道和无垒加合产物.

关键词： NCO 势能面反应机理自由基

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人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(ACMSD)与底物及抑制剂作用模型的理论研究

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高等学校化学学报 2008年第12期29卷 2398-2402页

作者：楚慧郢郑清川赵勇山张红星吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)... 详细信息

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)和抑制剂喹啉酸(QA)分别与hACMSD进行对接,获得了复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了底物和抑制剂的具体结合方式,明确了hACMSD与底物和抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基.

关键词： 2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶分子动力学模拟分子对接同源模建

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预测[C,O,S]体系的稳定异构体

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高等学校化学学报 2008年第8期29卷 1641-1643页

作者：周中军刘慧玲黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130021

采用DFT,QCISD及CCSD(T)方法对单重态和三重态的COS分子体系势能面进行了理论计算,在QCISD/6-311G(d)水平上得到4个过渡态连接的6个稳定构型.经动力学及热力学分析发现只有一个单重态线性的分子11(O—C—S)能够稳定存在.

关键词：密度泛函理论 COS 异构体势能面

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HCNO分子裂解机理的理论研究

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化学学报 2008年第6期66卷 597-602页

作者：于健康王嵩郑清川张浩张红星丁大军孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130061

实验提示应用248nm UV波长对HCNO分子进行直接光解,该分子可能发生裂解,得到某些产物.为了揭示HCNO分子的裂解机理,选择HCNO分子的一组相对能级作为理论研究的起始点,即1A'(0.00kJ/mol),3A'(255.01kJ/mol),3A"(282.37kJ/m... 详细信息

实验提示应用248nm UV波长对HCNO分子进行直接光解,该分子可能发生裂解,得到某些产物.为了揭示HCNO分子的裂解机理,选择HCNO分子的一组相对能级作为理论研究的起始点,即1A'(0.00kJ/mol),3A'(255.01kJ/mol),3A"(282.37kJ/mol)和1A"(341.59kJ/mol),进而找到了合理的反应路径,阐明了相应的裂解机理,得到的主要产物为H+NCO,HCN+O和NH+CO,与实验提示的结果相符合.

关键词：反应机理势能面 HCNO

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双取代铵氧化物(R_2HNO)与双取代羟胺(R_2NOH)的相互转换机制的量子化学研究

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化学学报 2008年第22期66卷 2483-2488页

作者：石国升丁益宏吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

在B3LYP/6-311++G(d,p)水平下,首次对一系列双取代铵氧化物(R2HNO)与双取代羟胺(R2NOH)[R=CH3,NH2,OH,F,CH2CH3,CH(CH3)2,C(CH3)3]同分异构体的相互转换机制进行了理论计算研究,并与已知的H3NO和H2NOH进行了比较.结果表明,相对于双取代羟胺(R2NOH),按照H所研究的7种取代基[R=CH3,NH2,OH,F,CH2CH3,CH(CH3)2,C(CH3)3],R2HNO向R2NOH转换的能垒介于27.0～56.3 kcal/mol之间,表明在气相条件下极有可能观测到双取代铵氧化物(R2HNO).

关键词： R2HNO R2NOH 同分异构体热力学稳定性动力学稳定性

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