检索结果-内蒙古大学图书馆

细胞死亡蛋白的三维结构及活性位点的理论研究

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分子科学学报 2008年第4期24卷 288-290页

作者：李建华郑清川吕绍武牡丹江大学化工系黑龙江牡丹江157000 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130023 吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室吉林长春130023

利用同源模建和分子动力学模拟方法,构建了细胞死亡蛋白(CED-10)的三维结构,并预测了其可能的活性位点,为细胞死亡蛋白家族催化机理的深入研究提供了重要的参考信息.

关键词：细胞死亡蛋白分子动力学模拟同源模建

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3,9-咔唑聚合物基态和激发态性质的理论研究

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高等学校化学学报 2007年第5期28卷 955-959页

作者：薄冬生任爱民封继康杨丽吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室

用密度泛函B3LYP方法对3,9-咔唑低聚物[(3,9-carbazole)n(n=1,2,3,4,6,8)]体系进行了全优化,计算得到电离能、电子亲合势、空穴抽取能及电子抽取能等相关能量,用ZINDO和TD-DFT方法计算得到吸收光谱;分析了各种能量的变化及光谱规律.用... 详细信息

用密度泛函B3LYP方法对3,9-咔唑低聚物[(3,9-carbazole)n(n=1,2,3,4,6,8)]体系进行了全优化,计算得到电离能、电子亲合势、空穴抽取能及电子抽取能等相关能量,用ZINDO和TD-DFT方法计算得到吸收光谱;分析了各种能量的变化及光谱规律.用外推法由低聚物分子的各种性质与聚合度n相联系得到高聚物的性质,将所得结果与2,7-咔唑(2,7-carbazole)及类似聚合物进行了比较分析.结果表明,3,9位聚合的咔唑整体共轭程度降低,光谱蓝移,其IP值和聚芴相近,可以作为空穴接受材料应用于多层电子荧光器件的空穴传输层.用CIS方法进行优化得到部分分子的S1激发态结构,用ZINDO和TD-DFT方法得到对应的发射光谱.

关键词：咔唑密度泛函吸收光谱发光性质

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剪切场作用下环形二嵌段共聚物微相形态变化的耗散粒子动力学研究

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高等学校化学学报 2007年第3期28卷 548-551页

作者：刘伟钱虎军吕中元李卓孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)方法研究了在剪切场作用下,环形二嵌段共聚物微观相分离过程中的形态变化.在层状(lamellae,LAM)体系中发生了微相的平行重取向和平行-垂直转变以及剪切导致的波动不稳定现象.对... 详细信息

采用耗散粒子动力学(Dissipative particle dynamics,DPD)方法研究了在剪切场作用下,环形二嵌段共聚物微观相分离过程中的形态变化.在层状(lamellae,LAM)体系中发生了微相的平行重取向和平行-垂直转变以及剪切导致的波动不稳定现象.对于穿孔层状(Perforated lamellae,PL)体系,强剪切导致了穿孔层状-柱状(Hexagonal cylinder,HEX)微相转变.在剪切场作用下,柱状体系中同样也有平行重取向发生.可以用相区破坏-相区重生的两步机理描述微相的平行重取向、平行-垂直转变以及PL-HEX转变现象.在球状相(Body centered cubic,BCC)体系中发现了剪切诱导相融合.

关键词：剪切环形嵌段共聚物微观相分离重取向耗散粒子动力学

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NC_2S^+离子的结构和稳定性的理论研究

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高等学校化学学报 2007年第10期28卷 1957-1961页

作者：于广涛李飞于健康黄旭日孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130021

在密度泛函和从头算理论水平下计算了单重态的NC2S+离子的结构、能量、光谱以及稳定性.在B3LYP/6-311G(d)水平下,得到8个异构体,它们由15个过渡态相连接.在CCSD(T)/6-311+G(2df)//QCISD/6-311G(d)+ZPVE水平下,得到能量最低的异构体是直... 详细信息

在密度泛函和从头算理论水平下计算了单重态的NC2S+离子的结构、能量、光谱以及稳定性.在B3LYP/6-311G(d)水平下,得到8个异构体,它们由15个过渡态相连接.在CCSD(T)/6-311+G(2df)//QCISD/6-311G(d)+ZPVE水平下,得到能量最低的异构体是直线型的具有1Σ电子态的NCCS+(1)(0.0kJ/mol),其次是直线型的异构体CNCS+(2)(54.8kJ/mol).两个低能量的异构体1和2及另外一个高能量的直线型异构体CCNS+(3)(323.8kJ/mol)都具有相当大的动力学稳定性,这三个异构体在具备一定条件的实验室和星际条件下是可以进行观测的.分析了这3个异构体的成键性质.

关键词：异构体势能面结构 NC2S^+

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聚合物链长及表面吸附强度对三维受限下嵌段共聚物微观相分离的影响

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高等学校化学学报 2007年第2期28卷 316-319页

作者：陈梨俊张志杰吕中元孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

利用动态密度泛函(Dynamic density functional theory,DDFT)方法研究了三维受限下嵌段共聚物的微观相分离,讨论了共聚物链长和表面吸附强度对微观相形成与取向的影响.体系中随机分布的等径微球提供三维限制结构,体积分数为0.6.增加微... 详细信息

利用动态密度泛函(Dynamic density functional theory,DDFT)方法研究了三维受限下嵌段共聚物的微观相分离,讨论了共聚物链长和表面吸附强度对微观相形成与取向的影响.体系中随机分布的等径微球提供三维限制结构,体积分数为0.6.增加微球的半径和体积分数,能够使其从破坏微相规整结构的纳米掺杂过渡到提供三维限制结构.调整嵌段共聚物与微球表面的相互作用对微相形成与取向有重要影响.

关键词：微观相分离三维受限动态密度泛函方法

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二氧化三氮(N_3O_2)中性分子和离子的一些重要反应过程的理论研究

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高等学校化学学报 2007年第1期28卷 132-135页

作者：张浩孙延波李泽生孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先... 详细信息

二重态的N3O2中性分子作为中间体,在N3O2阴离子的光解离反应和NO+N2O N2+NO2反应中均起重要作用.在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPE的水平上,对这两个反应进行了理论计算.结果表明,在N3O2阴离子的光解离反应中,该阴离子先在光照下解离为与其具有相同的W构型的中性分子和一个电子,这个中性分子是一个过渡态,它将打破C2v构型变成具有Cs对称性的W型中间异构体,然后再经过一个过渡态,裂解成N2O+NO两个小分子.这个裂解过程的能垒非常低(5.96 kJ/mol),因此在实验中很难检测到W型的中间异构体.在另一个重要的[N3O2]体系的反应(NO+N2O N2+NO2)中,找到了两条反应通道,其中不经过中间异构体的一步转化通道更为可行.

关键词：中性二氧化三氮(N3O2)分子光解离稳定中间体多步转化一步转化

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He_2F^-体系的分子间相互作用势能面

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高等学校化学学报 2007年第5期28卷 960-963页

作者：孙晓颖王钦李志儒吴迪孙家锺唐敖庆吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是... 详细信息

使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是0.295nm,∠HeF-He为52.5°.计算了此稳定结构的频率、相互作用能、二体相互作用能和三体相互作用能.在CCSD(T)/d-aug-cc-pVTZ水平下,相互作用能为-1.727kJ/mol.

关键词：相互作用势能面从头算方法三体相互作用能 He2F^-

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含碱金属分子簇体系的结构和NLO性质

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高等学校化学学报 2007年第6期28卷 1110-1112页

作者：孙晓颖李志儒吴迪孙家锺唐敖庆吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130021

采用MP2方法优化得到Li(HF)n(n=2～4)体系的三个环型结构.使用高水平的从头算方法MP2/6-311++G(3df,3pd)计算了它们的偶极矩μ0、极化率α0和一阶超极化率β0.得出了大的一阶超极化率的变化规律,并揭示出额外电子是引起大一阶超极化率... 详细信息

采用MP2方法优化得到Li(HF)n(n=2～4)体系的三个环型结构.使用高水平的从头算方法MP2/6-311++G(3df,3pd)计算了它们的偶极矩μ0、极化率α0和一阶超极化率β0.得出了大的一阶超极化率的变化规律,并揭示出额外电子是引起大一阶超极化率的主要原因.

关键词：从头算非线性光学(NL0)性质含碱金属的分子簇体系

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人类A_3腺苷受体拮抗剂1,2,4-三唑并[1,5-α]喹喔啉衍生物的QSAR研究

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化学学报 2007年第15期65卷 1420-1426页

作者：战金辉李吉来黄旭日左明辉孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

采用遗传算法构建了27种人类腺苷受体拮抗剂1,2,4-三唑并[1,5-α]喹喔啉衍生物与受体之间的亲和性的QSAR模型.为得到理想模型,计算了拓扑学、热力学、空间、电子拓扑状态和量子化学描述符.结合这些参数得到最终模型:ENpKi=13.407-0.027*... 详细信息

采用遗传算法构建了27种人类腺苷受体拮抗剂1,2,4-三唑并[1,5-α]喹喔啉衍生物与受体之间的亲和性的QSAR模型.为得到理想模型,计算了拓扑学、热力学、空间、电子拓扑状态和量子化学描述符.结合这些参数得到最终模型:ENpKi=13.407-0.027*FC-8-0.033*FC-8+0.845*Atype_C_28-19.493*Shadow_XYfrac.计算得到的统计学指标为:LOF=0.291,r2=0.766,ra2dj=0.723,F-test=17.974,PRESS=3.469,CV-r2=0.791.通过对模型进行分析,得到如下结论:降低C-8位亲电、亲核原子的前线电子密度的权重和分子在XY平面的投影分数,增加疏水性原子类型描述符Atpye_C_28的值,都对增加化合物分子与受体的亲和性有利.利用此模型合理的设计了两个新的化合物,并预测具有较高的结合活性.该研究为喹喔啉衍生物作为人类A3腺苷受体拮抗剂的结构改造提供理论指导,并为进一步研究受体与配体亲和性机理奠定理论基础.

关键词：遗传算法亲和性量子化学描述符 QSAR

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芴-硫芴共聚物的电子结构和光谱性质的理论研究

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化学学报 2007年第8期65卷 673-677页

作者：刘彬封继康任爱民杨丽邹陆一吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023

用DFT-B3LYP方法对低聚物(PF30T)_n[n(芴):n(硫芴)=2:1,物质的量之比,n=1～4],(PF50T)_n[n(芴):n(硫芴) =1:1,物质的量之比,n=1～4]体系全优化,得到两系列低聚物的电离能(IP_(a,v))、电子亲和势(EA_(a,v))、空穴抽取能(HEP)、电子抽取能(EEP),在此基础上用ZINDO和TD-DFT方法计算吸收光谱,分析了两个系列的HOMO-LUMO能隙随着n递增的变化趋势及硫芴含量对低聚物电子结构和光谱性质的影响,推断了高聚物的电子和光谱性质,用ab initio CIS方法优化了低聚物的S_1激发态结构并分析了其与发射光谱的关系,研究显示:2,8位引入的硫芴基团,破坏了链的共轭,而且随着硫芴含量的增加,HOMO-LUMO能隙变大,光谱蓝移:激发态结构趋于共面化。

关键词：聚合物密度泛函理论(DFT) 光谱性质芴-硫芴共聚物

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