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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：刘靖尧吴佳妍李泽生黄旭日孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学国家重点实验室(长春)

通过从头算直接动力学方法,研究反应NCl+H→NCl+HCl的动力学性质,并获得体系在PMP4/6-311++G(2df,2p)/MP2/6-311+G(d,p)水平上的势能面信息,进而利用小曲率校正下的变分过渡态理论计算该反应的速率常数及其与温度的关系.

通过从头算直接动力学方法,研究反应NCl<,3>+H→NCl<,2>+HCl的动力学性质,并获得体系在PMP4/6-311++G(2df,2p)/MP2/6-311+G(d,p)水平上的势能面信息,进而利用小曲率校正下的变分过渡态理论计算该反应的速率常数及其与温度的关系.

关键词：直接动力学速率常数从头计算卤化氨反应机理

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甘露糖-6-磷酸盐异构化酶(MPI)三维结构的同源模建

甘露糖-6-磷酸盐异构化酶(MPI)三维结构的同源模建

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：孙苗李泽生孙延波肖景发吉林大学理论化学研究所吉林大学理论化学计算国家重点实验室(长春)

甘露糖-6-磷酸盐异构化酶是催化果糖-6-磷酸互相转化的异构化酶.以磷酸甘露糖异构化酶(MPI)的晶体结构为模板对甘露糖-6-磷酸盐异构化酶的三维结构进行了同源模建,并在此基础上进行分子力学和分子动力学模拟,得到优势能量构象.研究表明... 详细信息

甘露糖-6-磷酸盐异构化酶是催化果糖-6-磷酸互相转化的异构化酶.以磷酸甘露糖异构化酶(MPI)的晶体结构为模板对甘露糖-6-磷酸盐异构化酶的三维结构进行了同源模建,并在此基础上进行分子力学和分子动力学模拟,得到优势能量构象.研究表明甘露糖-6-磷酸盐异构化酶的二级结构含有13个α螺旋和18个β折叠.

关键词：异构化酶同源模建分子力学分子动力学甘露糖-6-磷酸盐结构化学三维结构

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从头算直接动力学研究反应PCl<,3>+H→PCl<,2>+HCl的速率常数

从头算直接动力学研究反应PCl<,3>+H→PCl<,2>+HCl的速率常数

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：吴佳妍刘靖尧李泽生黄旭日孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学国家重点实验室(长春)

通过双水平[G2(MP2)/MP2/6-311G(d,p)]直接动力学方法,获取反应PCl+H→PCl+HCl的势能面信息,运用内推单点能的正则变分过渡态理论计算体系的速率常数,并在计算过程中考虑小曲率隧道效应,从而拟合出该反应在298—3 000K的温度区间内的三... 详细信息

通过双水平[G2(MP2)/MP2/6-311G(d,p)]直接动力学方法,获取反应PCl<,3>+H→PCl<,2>+HCl的势能面信息,运用内推单点能的正则变分过渡态理论计算体系的速率常数,并在计算过程中考虑小曲率隧道效应,从而拟合出该反应在298—3 000K的温度区间内的三参数速率常数公式:k=1.90×10<'-19>T<'2.7>exp(-2295/T)cm<'3>·molecule<'-1>·s<'-1>.

关键词：速率常数反应机理从头计算化学动力学卤化磷氢

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分子动力学方法模拟单链聚氧化乙烯的结晶过程

分子动力学方法模拟单链聚氧化乙烯的结晶过程

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：杨永彪李泽生杨华孙家锺吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室(长春)

采用分子动力学(MD)模拟方法研究了单链聚氧化乙烯从伸直链开始的结晶过程.结果表明,结晶过程大体经历三个阶段.首先是伸直链因局部σ键的内旋转和构象态跃迁而卷曲聚集,形成较长链段平行排列的规整结构,然后通过分子链段的调整链段逐... 详细信息

采用分子动力学(MD)模拟方法研究了单链聚氧化乙烯从伸直链开始的结晶过程.结果表明,结晶过程大体经历三个阶段.首先是伸直链因局部σ键的内旋转和构象态跃迁而卷曲聚集,形成较长链段平行排列的规整结构,然后通过分子链段的调整链段逐渐排入规整结构,形成比较规整的片晶结构,最后体系的能量和有序度基本稳定,但片晶的形状还在进行动态调整.

关键词：分子动力学聚氧化乙烯结晶过程

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枯草杆菌嘧啶核苷磷酸化酶三级结构模建

枯草杆菌嘧啶核苷磷酸化酶三级结构模建

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：高雪峰黄旭日吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室(长春)

嘧啶核苷磷酸化酶(Pyrimidine nucleoside phosphorylase PYNP)在核苷合成的补救途径中有催化可逆的嘧啶核苷磷酸解作用.在比较低等的生物中(例如:枯草杆菌),PYNP可催化胸腺嘧啶核苷和尿嘧啶核苷的磷酸解反应,然而在哺乳动物和其他的比... 详细信息

嘧啶核苷磷酸化酶(Pyrimidine nucleoside phosphorylase PYNP)在核苷合成的补救途径中有催化可逆的嘧啶核苷磷酸解作用.在比较低等的生物中(例如:枯草杆菌),PYNP可催化胸腺嘧啶核苷和尿嘧啶核苷的磷酸解反应,然而在哺乳动物和其他的比较高等的生物中它只对胸腺嘧啶核苷的磷酸解起催化作用(胸腺嘧啶核苷磷酸化酶,TP).我们在Silicom Graphics工作站上利用Insight Ⅱ的Homology模块构建了枯草杆菌PYNP的三级结构模型.通过同源序列对比和使用InsightⅡ的Binding Site模块,确定了枯草杆菌PYNP的可能的活性中心和相关氨基酸.

关键词：三级结构嘧啶核苷磷酸化酶枯草杆菌结构化学

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一种c<,s>-NH<,3>-HCl-4H<,2>O的结构和非线性光学性质的研究

一种c<,s>-NH<,3>-HCl-4H<,2>O的结构和非线性光学性质的研究

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：李茹姣李志儒吴迪郝希云王炳强理论化学计算国家重点实验室吉林大学理论化学研究所(长春)

用B3LYP/d-aug-cc-PVDZ方法,得到了c-NH-HCl-4HO的优化几何构型,依据优化结构计算偶极矩μ、极化率α和一阶超极化率β,并研究了基组效应(aug-cc-PVDZ,aug-cc-PVDZ+BF,aug-cc-PVTZ,d-aug-cc-PVDZ).分析了溶剂水分子对子体系NH-HCl非线... 详细信息

用B3LYP/d-aug-cc-PVDZ方法,得到了c<,s>-NH<,3>-HCl-4H<,2>O的优化几何构型,依据优化结构计算偶极矩μ<,0>、极化率α<,0>和一阶超极化率β<,0>,并研究了基组效应(aug-cc-PVDZ,aug-cc-PVDZ+BF,aug-cc-PVTZ,d-aug-cc-PVDZ).分析了溶剂水分子对子体系NH<,3>-HCl非线性光学性质的影响.

关键词： NH-HCl-4HO 质子转移非线性光学性质偶极距从头计算分子间相互作用极化率一阶超极化率

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中子捕获疗法抗癌药剂BSH结构特性的理论研究

中子捕获疗法抗癌药剂BSH结构特性的理论研究

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：王玲张明瑜孙延波孙家钟吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室(长春)

在密度泛函B3LYP/6-31G(d)水平,对硼中子捕获疗法(BNCT)药剂BHSH(BSH)及相关化合物二聚体BSSB,自由基BS的结构特性进行量化研究.分析了它们在生物环境下相互转化的氧化还原过程(分子内电子转移),理论分析与实验事实完全吻合;重点讨论前... 详细信息

在密度泛函B3LYP/6-31G(d)水平,对硼中子捕获疗法(BNCT)药剂B<,12>H<,11>SH<'2->(BSH)及相关化合物二聚体BSSB,自由基BS的结构特性进行量化研究.分析了它们在生物环境下相互转化的氧化还原过程(分子内电子转移),理论分析与实验事实完全吻合;重点讨论前线轨道特性,探讨它们可能的作用机制.研究表明,自由基B<,12>H<,11>S<'2->最活泼,它可能会打开并键连到特定蛋白质的二硫键上,也许是通过自由基BS使B在癌细胞周围达到足够浓度起药物作用的.

关键词：中子捕获疗法密度泛函二硫键自由基前线轨道特性硼抗癌药剂结构特性

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(HF)<,n>(n=1~10)体系的偶极矩、极化率和一阶超极化率的从头计算研究

(HF)<,n>(n=1~10)体系的偶极矩、极化率和一阶超极化率的从头计算...

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：吴迪李志儒张蛮吉林大学理论化学计算国家重点实验室理论化学研究所(长春)

在MP2和B3LYP水平上,使用aug-cc-pVDZ基组对(HF)(n=1~10)折线型体系的几何结构进行了优化,得出的HF分子簇的几何参数趋近于晶体结构结果.使用MP2,B3LYP和HF方法计算了体系的静态偶极矩μ,极化率α及第一超极化率β,并且分析了分子间相... 详细信息

在MP2和B3LYP水平上,使用aug-cc-pVDZ基组对(HF)<,n>(n=1~10)折线型体系的几何结构进行了优化,得出的HF分子簇的几何参数趋近于晶体结构结果.使用MP2,B3LYP和HF方法计算了体系的静态偶极矩μ<,0>,极化率α<,0>及第一超极化率β<,0>,并且分析了分子间相互作用的效应.

关键词：从头计算非线性光学性质氢键体系偶极距极化率一阶超极化率分子间相互作用

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HNO_2异构体结构和相对稳定性的ab intio计算研究

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黑龙江大学自然科学学报 2002年第1期19卷 84-88,91页

作者：于海涛池玉娟邹晓燕白雪傅宏刚黑龙江大学化学化工学院吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室吉林长春130023

在ＭＰ２／６-３１１＋＋Ｇ（ｄ，ｐ）和ＱＣＩＳＤ（ｔ）／６-３１１＋＋Ｇ（３ｄｆ，２ｐ）（单点）水平下计算得到了包括１０个异构体和１４个过渡态的ＨＮＯ２体系势能面。在势能面上，异构体ｔｒａｎｓ-ＨＯＮＯ（Ｅ１）的能量 ... 详细信息

在ＭＰ２／６-３１１＋＋Ｇ（ｄ，ｐ）和ＱＣＩＳＤ（ｔ）／６-３１１＋＋Ｇ（３ｄｆ，２ｐ）（单点）水平下计算得到了包括１０个异构体和１４个过渡态的ＨＮＯ２体系势能面。在势能面上，异构体ｔｒａｎｓ-ＨＯＮＯ（Ｅ１）的能量是最低的，其次是ｃｉｓ-ＨＯＮＯ（Ｅ２）和ＨＮＯ（Ｏ）（Ｃ２Ｖ，Ｅ３）。能量分别比ｔｒａｎｓ-ＨＯＮＯ高２．０９和３８．１８ｋＪ／ｍｏ１．根据体系的势能面，Ｅ１和Ｅ３具有一定的稳定性，另一个比Ｅ１高３３５．２７ｋＪ／ｍｏ１的异构体Ｅ７（ｔｒａｎｓ-ＨＮＯＯ）虽然能量较高，但异构化为其它异构体的势垒较高，所以也具有一定的稳定性，它们在热化学条件下应该可以观测到。

关键词：势能面 HNO2分子异构体化稳定性 ab initio计算量子化学计算亚硝酸

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Si<,3>M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的DFT理论研究

Si<,3>M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的DFT理论研究

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中国化学第八届量子化学学术会议

作者：孙仁安吉林大学理论化学研究所刘红艳孙延波王长生辽宁师范大学化学系(大连) 理论化学计算国家重点实验室(长春) 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室(长春)

利用Gaussian-98计算程序,B3LYP方法,6-311G基组,对SiM(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的几何构型进行优化,得出它们的稳定结构.分析了C对称的最稳定的类平面菱形SiM(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的Mulliken电荷布居和重叠布居,得... 详细信息

利用Gaussian-98计算程序,B3LYP方法,6-311G<'*>基组,对Si<,3>M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的几何构型进行优化,得出它们的稳定结构.分析了C<,2V>对称的最稳定的类平面菱形Si<,3>M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇的Mulliken电荷布居和重叠布居,得出在类平面菱形的Si<,3>M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,B,Al)原子簇中,同一主族依金属原子从上到下的顺序,Si—M键长依次变长,键的强度依次减弱;同一周期从左到右Si—M键长依次变短,键的强度依次增强;Si—Si键没什么变化规律.

关键词：原子簇金属元素化学键量子化学密度泛函理论

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