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2014年第十二届全国脂质与脂蛋白学术会议

作者：徐胜媛潘晓冬孙立元江龙关啸杨士伟刘俊涛姚凤霞王绿娅首都医科大学附属北京安贞医院-北京市心肺血管疾病研究所动脉硬化研究室中国协和医科大学北京协和医院妇产科中国医学科学院基础医学研究所/中国协和医科大学基础医学院医学遗传学系

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体细胞重编程的转化医学研究

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转化医学研究（电子版） 2014年第2期4卷 38-67页

作者：李艳华林杰孙长凯杨晓寒王敏刘谟震万超刘启贵尹安春殷嘉辉张兵兵周平冯斌张方乙林永忠杜建玲吕明慧郑铁铮刘思宇洪浩孟醒夏丹丹孙阳魏盼蔡楠李红晔吴爽赵慧李彧媛高长玉李巍戴冶王君德赵辉谭小新门莉莉马辉徐军胡增春王玲王宏孙品郭慧芳宋桂荣刘辉单宝帅韩璐梁琳琅王晓晨汪丹谌桂花陈建停孙香友薛君王智琦王婧张永青蔡东风张桂平栾国明王建莉范明曹雪涛大连医科大学脑疾病研究所辽宁省脑疾病重点实验室统计分析中心现代教育技术部大连116027 大连市甘井子医院大连116033 沈阳军区总医院门诊部骨外科内分泌科医务部沈阳110015 中国医学科学院医学信息研究所信息分析与情报方法研究室北京100020 大连医科大学附属一院神经内科骨外科护理部内分泌科肿瘤科耳鼻喉科大连116027 解放军大连403医院医务处心血管内科大连116000 同济大学图书馆上海200092 大连医科大学生物技术系大连116027 大连医科大学附属二院神经内科体检中心药剂科神经外科大连116023 复旦大学2012医学实验班上海200433 解放军大连210医院神经内科大连116000 沈阳格微软件有限责任公司沈阳110034 首都医科大学三博脑科医院北京100093 浙江大学免疫学研究所杭州310027 北京军事医学科学院基础医学研究所神经生理学研究室北京100850 中国医学科学院北京100073

脑血管疾病、痴呆、糖尿病、恶性肿瘤、骨退行性病等重大临床疾患的发病率、患病率、病死率和致残率居高不下,细胞保护与细胞损伤修复药物、策略和方法的转化研发、应用与推广一直停滞不前或进展过缓应是其重要原因之一。本研究通过医... 详细信息

脑血管疾病、痴呆、糖尿病、恶性肿瘤、骨退行性病等重大临床疾患的发病率、患病率、病死率和致残率居高不下,细胞保护与细胞损伤修复药物、策略和方法的转化研发、应用与推广一直停滞不前或进展过缓应是其重要原因之一。本研究通过医学、生物学、数据库构建、程序编写、软件研制、统计分析及管理工程等多个领域专业人员的通力合作,对2012年诺贝尔生理学或医学奖两位获奖者关于"成熟细胞可以被重编程而多能化"的原始研究及其被引用的大规模复杂信息数据做整体定量对比和局部关联解析,探讨体细胞重编程研究的临床应用前景和实现策略,发现两位获奖者原创性研究及其影响在时间、学科、科学和技术等多个层面与角度上差异具有统计学意义,揭示和证明了加强与加快转化医学和转化神经科学研究的时代意义、紧迫需求、重要方向、目标与路径及我国医学科研管理体系因此所面临的重要挑战。

关键词：细胞重编程细胞保护细胞损伤修复转化医学网络药理学大(量)数据解析

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一非综合征型牙齿先天缺失家系的致病基因研究

一非综合征型牙齿先天缺失家系的致病基因研究

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第七次全国儿童口腔医学学术大会

作者：朱妹陈旭邱广蓉郭艳中国医科大学口腔医学院儿童口腔科中国医科大学口腔医学院儿童口腔科辽宁省口腔医学研究所儿童口腔医学研究室中国医科大学基础医学院医学遗传学教研室中国医科大学口腔医学院中心实验室辽宁沈阳110002

目的:研究一非综合征型牙齿先天缺失家系的可能致病基因.方法:本实验以一个非综合征型牙齿先天缺失家系3代共17名成员为研究对象,知情同意下提取静脉血DNA,应用基因芯片技术(GeneChip Human Mapping 10K 2.0 Xba Array,Affymetrix Compa...

目的:研究一非综合征型牙齿先天缺失家系的可能致病基因.方法:本实验以一个非综合征型牙齿先天缺失家系3代共17名成员为研究对象,知情同意下提取静脉血DNA,应用基因芯片技术(GeneChip Human Mapping 10K 2.0 Xba Array,Affymetrix Company)检测分析导致该家系牙齿先天缺失的可能致病基因.

关键词：

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常见染色体病的快速检测

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诊断学理论与实践 2010年第5期9卷 449-452页

作者：曹美婷贾兴元刘迁卫小静王立荣郑梅玲刘敬忠首都医科大学附属北京朝阳医院实验研究中心北京100020 山西医科大学第一临床医学院遗传研究室山西太原030001 中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学遗传室北京100005

目的:初步建立运用多重连接探针扩增(MLPA)联合变性液相高效色谱(DHPLC)技术快速诊断常见染色体非整倍体的方法。方法:应用P095试剂盒将待测DNA标本进行MLPA反应,得到的MLPA反应产物用DHPLC仪进行分离分析,并于用ABI3130XL得到的结果加... 详细信息

目的:初步建立运用多重连接探针扩增(MLPA)联合变性液相高效色谱(DHPLC)技术快速诊断常见染色体非整倍体的方法。方法:应用P095试剂盒将待测DNA标本进行MLPA反应,得到的MLPA反应产物用DHPLC仪进行分离分析,并于用ABI3130XL得到的结果加以对比。结果:检测了10份正常人DNA和16份21三体DNA、3份47,XYYDNA、3份47,XXXDNA标本,结果与用MLPA/ABI3130XL检测及染色体核型分析结果一致。结论:用1管MLPA反应结合DHPLC即可对常见染色体非整倍体作出快速、准确的诊断。

关键词：染色体非整倍体变性液相高效色谱多重连接探针扩增

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一种简单而有效的检测胃癌微小RNA表达水平的方法

一种简单而有效的检测胃癌微小RNA表达水平的方法

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中华医学会第七次全国检验医学学术会议

作者：张岱吕丹王振宁罗阳徐岩张勇刘彦山孙淼张学中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学遗传学系中国医科大学医学基因组学研究室

目的胃癌在全世界范围内是处于发病率第二位的恶性肿瘤;在中国,胃癌发病率仍高居各种恶性肿瘤之首,每年新确诊患者达400,000人,且呈上升趋势;每年因胃癌死亡人数为260,000,占所有恶性肿瘤死亡的23.24%。近年来,表观遗传学与肿瘤发生的... 详细信息

目的胃癌在全世界范围内是处于发病率第二位的恶性肿瘤;在中国,胃癌发病率仍高居各种恶性肿瘤之首,每年新确诊患者达400,000人,且呈上升趋势;每年因胃癌死亡人数为260,000,占所有恶性肿瘤死亡的23.24%。近年来,表观遗传学与肿瘤发生的相关性研究已成为肿瘤遗传学的重要内容。其中,微小RNA(miRNA)所介导的基因转录后调节被证明与肿瘤的发生密切相关。本研究旨在通过建立一种简单而有效的实验技术来检测胃癌中miRNA的表达情况,从而为胃癌的早期诊断和分子病理学提供miRNA水平的分析工具和实验依据。

关键词：胃癌组织 RNA

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应用多重连接依赖探针扩增(MLPA)技术研究胃癌基因组DNA拷贝数的改变

应用多重连接依赖探针扩增(MLPA)技术研究胃癌基因组DNA拷贝数的...

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中华医学会第七次全国检验医学学术会议

作者：张岱吕丹王振宁罗阳徐岩张勇刘彦山孙森张学中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学遗传学系中国医科大学医学基因组学研究室

目的多重连接依赖探针扩增(Multiplex Lization- Dependent Probe Amplification.简称MLPA)是一种高通量检测基因拷贝数量改变的新技术.可以在单一反应中检测45个核苷酸序列;和其他技术(如Array-CGH和FISH)相比.MLPA反应具有快速.经济.... 详细信息

目的多重连接依赖探针扩增(Multiplex Lization- Dependent Probe Amplification.简称MLPA)是一种高通量检测基因拷贝数量改变的新技术.可以在单一反应中检测45个核苷酸序列;和其他技术(如Array-CGH和FISH)相比.MLPA反应具有快速.经济.易于操作等优点.使其在临床检验中具有良好的应用前景。本研究旨在通过MLPA技术对中国胃癌病人样本进行全基因组范围的DNA拷贝数改变的分析.以进一步探明胃癌的分子遗传学机理和发现与病人临床表现高度相关的基因标记物.为胃癌的早期诊断和分子分型提供实用的临床检验技术基础。方法:将经显微切割获得的50例胃癌患者肿瘤样本(肿瘤细胞>90%)和4例正常胃组织通过TaKaRa基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA。通过MLPA的预制探针和样本基因组DNA进行杂交.经过对相邻位点片断的连接后进行多重PCR反应.对扩增产物进行毛细管电泳.使用GeneMarker软件对经ABI 3730毛细管电泳仪所获得的荧光电泳图谱进行定量分析.获得样本的基因组DNA拷贝数相对值,并利用HCluster软件对结果进行聚类分析。使用SPSS软件对基因位点的拷贝数与胃癌组织的临床病理参数进行统计学分析。结果:HCluster聚类分析显示:50例胃癌组织和4例正常胃组织被成功的分成两大类.其中50例胃组织根据其基因组DNA拷贝数的改变幅度而分成高、中、低、极低四组。对GeneMarker所计算的DNA拷贝数相对值进行定义:小于0.75为拷贝数缺失.大于1.3为拷贝数扩增.介于0.75和1.3之间为拷贝数正常。根据以上定义.在全部检测的112个基因位点中.拷贝数扩增的频率大于30%的基因位点有28个.占全部位点的25%.拷贝数缺失的频率大于30%的基因位点有26个,占全部位点的23.2%。拷贝数扩增频率最高的基因位点的前3位分别为:PTK2(8q24.3),72%;MYC(8q24.21),70%;EHF(11p13),66%。拷贝数缺失频率最高的基因位点的前3位分别为:CDKN2A(9p21.3),90%;MIF(22q11.23),86%;THBD (20p11.21).78%。在淋巴结转移阴性和阳性的两组病例之间.Mann- Whitney U test结果表明VEGF(p=0.044)和MYC(p=0.018)的拷贝数相对值具有显著性差别。结论:本研究结果证明通过MLPA技术对胃癌标本进行基因拷贝数的检测切实可行.同时具有高通量、低成本、操作简单等优点,因此可以在临床检验中推广使用;同时我们的实验结果为胃癌的基因诊断分型提供了有力的科学依据。

关键词：胃癌组织基因位点多重连接依赖探针扩增拷贝数 DNA 基因组

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应用MLPA技术研究胃癌基因组DNA拷贝数的改变

应用MLPA技术研究胃癌基因组DNA拷贝数的改变

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第八届北京生命科学领域学术年会

作者：张岱吕丹王振宁罗阳徐岩张勇刘彦山孙淼张学中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学遗传学系北京100005 中国医科大学医学基因组学研究室沈阳110001

多重连接依赖探针扩增(称MLPA)是一种高通量检测基因拷贝数量改变的新技术,可以在单一反应中检测45个核苷酸序列，本研究旨在通过MLPA技术对中国胃癌病人样本进行全基因组范围的DNA拷贝数改变的分析,以进一步探明胃癌的分子遗传学机理... 详细信息

多重连接依赖探针扩增(称MLPA)是一种高通量检测基因拷贝数量改变的新技术,可以在单一反应中检测45个核苷酸序列，本研究旨在通过MLPA技术对中国胃癌病人样本进行全基因组范围的DNA拷贝数改变的分析,以进一步探明胃癌的分子遗传学机理和发现与病人临床表现高度相关的基因标记物,为胃癌的早期诊断和基因分型提供实用的临床检验技术基础及分子生物学依据。

关键词：胃癌基因组DNA 基因拷贝数 MLPA 早期诊断分子遗传学

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胃癌的微小RNA表达谱研究

胃癌的微小RNA表达谱研究

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第八届北京生命科学领域学术年会

胃癌在全世界范围内是处于发病率第二位的恶性肿瘤;在中国,胃癌发病率仍高居各种恶性肿瘤之首,每年新确诊患者达400,000人,且呈上升趋势;每年因胃癌死亡人数为260,000,占所有恶性肿瘤死亡的23.24％.近年来,表观遗传学与肿瘤发生的相关... 详细信息

胃癌在全世界范围内是处于发病率第二位的恶性肿瘤;在中国,胃癌发病率仍高居各种恶性肿瘤之首,每年新确诊患者达400,000人,且呈上升趋势;每年因胃癌死亡人数为260,000,占所有恶性肿瘤死亡的23.24％.近年来,表观遗传学与肿瘤发生的相关性研究已成为肿瘤遗传学的重要内容。其中,微小RNA(miRNA)所介导的基因转录后调节被证明与肿瘤的发生密切相关，本研究旨在通过建立一种简单而有效的实验技术来研究胃癌中miRNA的表达谱情况,从而进一步分析miRNA在胃癌发生中的相关分子机理。

关键词：胃癌表观遗传学肿瘤发生微小RNA 表达谱

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载脂蛋白B基因单体型与中国维吾尔族自然长寿的关联研究

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中国科学（C辑） 2006年第5期36卷 424-431页

作者：姜文锡邱长春程祖亨周文郁顾明亮许群方鸣武牛文全玛依拉新疆医科大学乌鲁木齐830054 中国医学科学院基础医学研究所中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国医学科学院中国协和医科大学医学生物学研究所医学遗传学研究室昆明650118

探讨载脂蛋白B（apolipoprotein B，apoB）基因单体型与维吾尔族自然长寿之间的关系．选择新疆和田地区191名年龄90岁以上的健康维吾尔族个体为研究对象，另选53名年龄65—70岁、民族、性别、地域相匹配的正常个体为对照．采用PCR—SSP... 详细信息

探讨载脂蛋白B（apolipoprotein B，apoB）基因单体型与维吾尔族自然长寿之间的关系．选择新疆和田地区191名年龄90岁以上的健康维吾尔族个体为研究对象，另选53名年龄65—70岁、民族、性别、地域相匹配的正常个体为对照．采用PCR—SSP（sequence specific primer），PCR—RFLP（restriction fragment length polymorphism）和PCR-直接测序（PCR—sequencing）等技术对apoB基因第1外显子5＇端信号肽插入／缺失（insertion／deletion，PD）、第26外显子Xba Ⅰ限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphisms，Xba Ⅰ—RFLP）和第29外显子3＇端可变数目重复序列（vaffable number of tandemly repeat，VNTR）进行分型．经Logistic回归分析显示，长寿组apoB基因X^＋X^＋基因型频率显著高于对照组；M，L的等位基因频率和其组成的基因型频率显著增高；在单体型分析中，长寿组中由X^＋和M等位基因组成的单体型频率显著增高，而由X^-和S等位基因组成的单体型频率显著降低（均P〈0．05）．研究认为：等位基因M，L，基因型X^＋X^＋，MM，ML，LL和单体型I—X^＋-M，X^＋-M与自然长寿显著正相关，可能为长寿的保护因素，而等位基因S，基因型SS和单体型X^＋-S，D—S和D—X^＋-S则可能是影响长寿的不利因素．

关键词： apoB基因单体型等位基因基因型自然长寿维吾尔族

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中国人群中STK15基因内两种非同义SNP的连锁不平衡和单体型分析

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遗传学报 2005年第4期32卷 331-336页

作者：陈立敖雪任群王振宁鲁翀徐岩姜莉罗阳徐惠绵张学中国医科大学医学基因组学研究室卫生部细胞生物学重点实验室沈阳110001 中国医科大学医学基因组学研究室卫生部细胞生物学重点实验室沈阳110001 中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学遗传学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

STK15基因编码一种丝氨酸苏氨酸蛋白激酶,哺乳动物细胞中其过量表达将导致中心体扩增、染色体不稳定和细胞癌变.STK15基因外显子3中有3种非同义单核苷酸多态(SNP),即:91A→T(I31F)、169G→A(V57I) 和311C→T(S104L).新近研究发现,91A→... 详细信息

STK15基因编码一种丝氨酸苏氨酸蛋白激酶,哺乳动物细胞中其过量表达将导致中心体扩增、染色体不稳定和细胞癌变.STK15基因外显子3中有3种非同义单核苷酸多态(SNP),即:91A→T(I31F)、169G→A(V57I) 和311C→T(S104L).新近研究发现,91A→T与人类肿瘤遗传易感性相关.应用PCR-RFLP技术确定了91A→T(I31F)和 169G→A(V57I)两种SNP在中国人群中的基因型和单体型.采用巢式PCR方法扩增了193例正常个体的DNA样品,通过错配正向巢式内引物引入EcoRⅠ酶切位点.巢式PCR扩增产物用限制性内切酶EcoRⅠ和AccⅡ双酶切消化,其中EcoRⅠ能酶切91A,AccⅡ能切开169G,用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法鉴定双酶切结果,发现了4种可能的单体型中的3种,其单体型频率分别为:p(91A-169G)=68.65%,p(91T-169A)= 10.88%,p(91T-169G)=20.47%,p(91A-169A)=0%;它们组成的6种基因型及频率分别为: 91A-169G/91A-169G (46.11%),91A-169G/91T-169A(14.51%),91A-169G/91T-169G(30.57%),91T-169G/91T-169G(3.11%),91T-169G/91T-169A (4.15%),91T-169A/91T-169A(1.55%).等位基因及单体型数据分析结果表明,91A→T(I31F)和 169G→A(V57I)之间存在连锁不平衡.

关键词： STK15基因单核苷酸多态单体型连锁不平衡

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