检索结果-内蒙古大学图书馆

科学通报 2023年第33期68卷 4433-4435页

作者：常展赫朱学昊高绍荣高亚威同济大学生命科学与技术学院同济大学附属东方医院再生医学研究所上海市信号转导与疾病研究重点实验室上海200092 同济大学细胞干性与命运编辑前沿科学中心上海200092

人类基因组中有超过50%的序列是转座子序列(transposon elements,TE).转座子又称跳跃基因,是一类可以在基因组中进行自我复制和粘贴的DNA元件[1].转座子主要分为DNA转座子和反转录转座子,其中反转录转座子会先转录产生RNA,再反转录成DN... 详细信息

人类基因组中有超过50%的序列是转座子序列(transposon elements,TE).转座子又称跳跃基因,是一类可以在基因组中进行自我复制和粘贴的DNA元件[1].转座子主要分为DNA转座子和反转录转座子,其中反转录转座子会先转录产生RNA,再反转录成DNA来完成转座.长散在重复序列(long interspersed nuclear elements-1,LINE-1)是哺乳动物基因组中最丰富的转座元件家族之一,在人类基因组中占比大约为17%[2].

关键词：反转录转座子人类基因组跳跃基因自我复制转座元件多能性小鼠细胞

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人类早期胚胎发育过程中组蛋白修饰的调控

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中国科学：生命科学 2024年第1期54卷 84-93页

作者：徐睿敏李翀刘晓雨高绍荣同济大学生命科学与技术学院上海市信号与疾病研究重点实验室上海市东方医院再生医学研究所上海200120 同济大学生命科学与技术学院上海市第一妇婴保健院转化医学中心上海市母胎医学与妇科肿瘤研究所上海市母胎医学重点实验室上海200092 同济大学教育部细胞干性与命运编辑前沿科学中心上海200092

哺乳动物的生命起源于两个终末分化的生殖细胞的结合(受精),随即父母源的染色质发生剧烈且精确的表观遗传重编程,并形成具有全能性的胚胎.研究早期胚胎发育是理解物种延续和进化的重要途径,也为女性生殖健康和再生医学提供了重要理论依... 详细信息

哺乳动物的生命起源于两个终末分化的生殖细胞的结合(受精),随即父母源的染色质发生剧烈且精确的表观遗传重编程,并形成具有全能性的胚胎.研究早期胚胎发育是理解物种延续和进化的重要途径,也为女性生殖健康和再生医学提供了重要理论依据.然而,由于高等哺乳动物早期胚胎的稀缺性和伦理问题,以及高通量表观修饰检测技术的限制,目前对于人类早期胚胎中的表观遗传重编程的研究还不全面.利用最近建立的超低起始量的高通量测序技术,我国科学家首次揭示了多种组蛋白修饰在人类早期胚胎发育过程中的动态变化和调控机制.本文主要对这几项最新的研究进展进行了总结,并对人类和小鼠早期胚胎中的组蛋白修饰重编程的保守性和物种特异性进行了讨论.

关键词：人类早期胚胎表观遗传重编程组蛋白修饰合子基因组激活逆转座子

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基于大模型的MHC Ⅱ抗原肽-T细胞受体结合预测

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生物医学工程学杂志 2024年第6期41卷 1243-1249页

作者：许珉瑞张斯文鲁曼曼高媛张梦欢林勇谢鹭上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海市生物医药技术研究院上海市疾病与健康基因组学重点实验室上海200237 复旦大学上海市生物医药技术研究院上海200237 同济大学生命科学与技术学院上海200092

T细胞受体(TCR)与抗原肽的特异性结合在调节和介导免疫的过程中发挥着关键作用,为肿瘤疫苗设计提供了必要的基础。近年来的研究主要集中在主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类抗原的TCR预测,针对MHCⅡ类抗原的TCR预测研究尚不充分,仍存在较... 详细信息

T细胞受体(TCR)与抗原肽的特异性结合在调节和介导免疫的过程中发挥着关键作用,为肿瘤疫苗设计提供了必要的基础。近年来的研究主要集中在主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类抗原的TCR预测,针对MHCⅡ类抗原的TCR预测研究尚不充分,仍存在较大的提升空间。本研究利用ProtT5大模型进行MHCⅡ类抗原肽和TCR结合预测研究,探究其特征提取能力。此外,对模型进行微调,并构建前馈神经网络结构进行融合从而实现预测模型。实验结果显示,本研究提出的方法较传统方法表现更佳,预测准确度达到0.96,AUC达到0.93,验证了本文提出模型的有效性。

关键词： MHCⅡ抗原肽-T细胞受体结合预测大模型 ProtT5模型免疫治疗

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心肌细胞的成熟及其转录调控

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中国细胞生物学学报 2022年第8期44卷 1473-1483页

作者：王皓存欧阳兆惠魏珂上海市东方医院再生医学研究所同济大学生命科学与技术学院细胞干性与命运编辑前沿科学中心上海市信号转导与疾病研究重点实验室上海200092

哺乳动物心肌细胞在出生后经历了一系列巨大的转变,由胚胎期的不成熟细胞转变为成熟心肌细胞。这些转变包括细胞形态、细胞周期、代谢模式、电生理等许多方面。心肌细胞的成熟过程决定了成年心肌细胞的状态和功能,包括其微弱的再生能力... 详细信息

哺乳动物心肌细胞在出生后经历了一系列巨大的转变,由胚胎期的不成熟细胞转变为成熟心肌细胞。这些转变包括细胞形态、细胞周期、代谢模式、电生理等许多方面。心肌细胞的成熟过程决定了成年心肌细胞的状态和功能,包括其微弱的再生能力。在多种先天性心脏病中,这一过程都受到了影响,诱发成年心脏疾病。因此,解析出生后心肌细胞成熟这一发育生物学重要现象的具体转变过程,以及调控这些转变的分子机制,不仅可以鉴定心肌细胞失去增殖能力的机制,也可能加深人们对先天性心脏疾病的理解,从而找到促进心脏再生或者治疗先天性心脏疾病的药物靶点。心肌细胞在出生后的成熟由出生后的多种体内外环境的改变所诱导,经过高度协同的转录程序通过基因表达的改变来实现。随着多种新工具的出现,心肌细胞成熟的分子机制研究正在进入数据和理论层出不穷的崭新时代。该综述回顾了过去几十年里来对心肌细胞成熟多方面表型变化的探索,着重总结了近年来对心肌细胞成熟的转录调控的研究成果,并对未来可能的新发现和新理论进行了探讨。

关键词：心肌细胞成熟 SRF PGC1α Hif-1α AP-1 calcineurin

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小鼠不同脑区星形胶质细胞小分子诱导转分化和基因表达差异的研究

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中国细胞生物学学报 2020年第9期42卷 1551-1559页

作者：曾鹏花秋红石昌杰张儒上海市信号转导与疾病研究重点实验室同济大学生命科学与技术学院上海200092

该文旨在比较小分子化合物诱导小鼠不同脑区星形胶质细胞向神经元转分化的特性,并利用转录组测序技术分析小鼠不同脑区星形胶质细胞的基因表达差异。以新生小鼠皮层和海马的星形胶质细胞作为起始细胞,通过小分子化合物VCR诱导其向神经... 详细信息

该文旨在比较小分子化合物诱导小鼠不同脑区星形胶质细胞向神经元转分化的特性,并利用转录组测序技术分析小鼠不同脑区星形胶质细胞的基因表达差异。以新生小鼠皮层和海马的星形胶质细胞作为起始细胞,通过小分子化合物VCR诱导其向神经元转分化,利用免疫荧光染色检测转分化过程中细胞形态的变化以及神经元的比例,通过转录组测序比较两种星形胶质细胞的基因表达差异,并对差异基因进行荧光定量PCR验证及GO富集分析。结果表明,皮层星形胶质细胞经VCR诱导转分化为神经元的能力要显著优于海马星形胶质细胞;转录组测序发现,两种星形胶质细胞有12658个基因存在差异表达,GO分析结果表明,在皮层星形胶质细胞中高表达的基因更多地参与细胞分裂的过程,推测差异显著基因GAD2、EYA2、GSX2、INSM1以及GNG3是与转分化相关的基因。该研究对星形胶质细胞向神经元转分化的机制研究具有借鉴意义。

关键词：星形胶质细胞小分子转分化转录组测序

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牙周炎增加心脏SiglecF+中性粒细胞分化加重心肌梗死后纤维化

牙周炎增加心脏SiglecF+中性粒细胞分化加重心肌梗死后纤维化

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中华口腔医学会口腔生物医学专业委员会第14次口腔生物医学学术年会中华口腔医学会口腔病理学专业委员会第18次口腔病理学术年会

作者：王雪奎徐越余灿清项耀祖孙瑶同济大学口腔医学院同济大学附属口腔医院上海牙组织修复与再生工程技术研究中心同济大学生命科学与技术学院上海市东方医院心脏病全国重点实验室北京大学公共卫生学院重大疾病流行病学教育部重点实验室(北京大学)

目的:牙周炎促进心肌梗死发生已成业界共识,但其如何影响心肌梗死尚不明确。本研究旨在探索牙周炎对心梗预后的影响及中性粒细胞在该关联中的作用,以期丰富口腔医学内涵,优化心梗的预后管理。

关键词：牙周炎 SiglecF 中性粒细胞纤维化心肌梗死后

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原始生殖细胞的命运决定

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科学 2021年第4期73卷 21-24页

作者：沈仕君同济大学生命科学与技术学院上海市信号转导与疾病研究重点实验室上海200092 同济医院转化医学研究中心

精子和卵子结合而成的受精卵是一个新生命的开始。受精卵不断分裂、分化,在经过胚胎发育、器官形成等过程后长成新个体。其中部分细胞成为原始生殖细胞,它们是新个体产生精子或卵子的源泉,这里所发生的一切将决定新个体后代的命运。

关键词：原始生殖细胞染色质开放状态同源重组

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基因组稳定性与衰老发生及其干预

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中国基础科学 2021年第5期23卷 39-47页

作者：杨佳庆陈御张伟娜甄政毅宋治伟毛志勇同济大学生命科学与技术学院上海200092 上海市第一妇婴保健院转化医学研究中心上海200092 上海市母胎医学重点实验室上海201204

基因组DNA携带着控制细胞生长、分化的重要生命信息,其结构及功能的相对稳定是物种得以生存延续的前提与保障。越来越多的研究表明,DNA损伤修复能力的下降将导致基因组不稳定性的增加,最终成为诱导衰老及其相关疾病发生的关键因素之一... 详细信息

基因组DNA携带着控制细胞生长、分化的重要生命信息,其结构及功能的相对稳定是物种得以生存延续的前提与保障。越来越多的研究表明,DNA损伤修复能力的下降将导致基因组不稳定性的增加,最终成为诱导衰老及其相关疾病发生的关键因素之一。本文在综述基因组稳定性与衰老之间关系的基础上,探讨通过靶向DNA修复来干预衰老的发展趋势及其发展前景。

关键词： DNA损伤修复基因组稳定性衰老衰老干预

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骨髓间充质干细胞的临床应用研究

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中国细胞生物学学报 2018年第S1期 2145-2155页

作者：汪健芳莫春阳许艳华徐丽婷魏含静张潇颖王斌岳锐同济大学附属东方医院再生医学研究所同济大学生命科学与技术学院上海市信号转导与疾病研究重点实验室

骨髓间充质干细胞不仅能够分化为成骨细胞、脂肪细胞和软骨细胞从而调控骨骼功能,还能够分泌造血干细胞维持因子从而营造血液微环境。近年来,以骨髓间充质干细胞为代表的间充质干细胞因其体外扩增能力和免疫调控能力而被广泛地用于临床... 详细信息

骨髓间充质干细胞不仅能够分化为成骨细胞、脂肪细胞和软骨细胞从而调控骨骼功能,还能够分泌造血干细胞维持因子从而营造血液微环境。近年来,以骨髓间充质干细胞为代表的间充质干细胞因其体外扩增能力和免疫调控能力而被广泛地用于临床实验。该文将在描述骨髓间充质干细胞基本功能的基础上着重探讨其在免疫性疾病和纤维化疾病中的临床应用。

关键词：骨髓间充质干细胞细胞治疗免疫性疾病纤维化疾病

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组蛋白甲基化修饰在小鼠早期胚胎发育中的建立与调控

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科技导报 2018年第7期36卷 26-32页

作者：刘晓雨高绍荣同济大学附属第一妇婴保健院转化医学中心上海市信号转导与疾病研究重点实验室同济大学生命科学与技术学院

组蛋白修饰作为重要的表观遗传修饰,在调控胚胎基因表达、胚胎细胞的命运决定及胚胎基因组的稳定性等方面均起了很重要的作用。微量测序技术的发展使从全基因组水平上检测植入前胚胎的组蛋白修饰成为可能。综述了近年来利用该技术对小... 详细信息

组蛋白修饰作为重要的表观遗传修饰,在调控胚胎基因表达、胚胎细胞的命运决定及胚胎基因组的稳定性等方面均起了很重要的作用。微量测序技术的发展使从全基因组水平上检测植入前胚胎的组蛋白修饰成为可能。综述了近年来利用该技术对小鼠早期胚胎发育过程中的组蛋白甲基化修饰研究的最新进展,总结了在胚胎基因激活及第一次细胞分化过程中组蛋白H3K4me3和H3K27me3修饰不同的建立和动态变化趋势,这些研究为探索胚胎发育和细胞分化的表观调控机制奠定了基础。

关键词：植入前胚胎组蛋白修饰二价基因微量测序

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