检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2024年第11期46卷 911-919页

作者：闫旭郭影孙冬琳吴楠金焰中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081 哈尔滨医科大学医学遗传学研究室哈尔滨150081

血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子... 详细信息

血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子。抗血管生成已经成为临床常用靶向治疗肿瘤的方案之一。首个抗血管生成药物贝伐单抗已广泛应用于多种实体肿瘤治疗,但由于获得性耐药现象,疗效仅能维持1~2年。即使血管内皮细胞的基因组相对稳定,不易产生耐药性,但临床实践中仍观察到多种类型的耐药现象,这表明抗血管生成治疗的耐药问题仍然是一个具有挑战性的研究领域。本文主要综述了肿瘤抗血管生成治疗耐药机制的最新进展,并探讨了抗肿瘤血管生成治疗的新前景,以期为临床实践提供有力的理论支持和指导。

关键词：肿瘤耐药抗血管生成血管共选择血管拟态血管套叠

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

真核生物mRNA应激状态下的帽-非依赖性翻译

引用

中国生物化学与分子生物学报 2024年第1期40卷 1-9页

作者：刘子昂金焰吴楠中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081 哈尔滨医科大学医学遗传学研究室哈尔滨150081

在真核生物中,mRNA翻译过程包括起始、延伸和终止。其中,翻译的起始阶段最为重要且复杂,它决定了mRNA能否被有效翻译成蛋白质。根据翻译起始机制的不同,真核生物mRNA翻译可以分为传统的帽-依赖性翻译和替代机制帽-非依赖性翻译。当外部... 详细信息

在真核生物中,mRNA翻译过程包括起始、延伸和终止。其中,翻译的起始阶段最为重要且复杂,它决定了mRNA能否被有效翻译成蛋白质。根据翻译起始机制的不同,真核生物mRNA翻译可以分为传统的帽-依赖性翻译和替代机制帽-非依赖性翻译。当外部环境的刺激或细胞自身的改变使细胞处于应激状态时,传统的帽-依赖性翻译被抑制或下调,替代机制帽-非依赖性翻译得以启动,以保证翻译的顺利进行。真核生物在应激状态下为了维持蛋白质合成的需求,采用多种翻译起始机制来实现帽-非依赖性翻译。其中较常见的是IRES(internal ribosome entry site)、m6A修饰和CITE(cap-independent translation enhancer)所启动的翻译。这些机制允许核糖体在mRNA的特殊区域内部进行启动,而不依赖于传统的m7G帽结构。通过这些机制,真核生物可以在应激状态下仍然进行蛋白质合成,以满足细胞的需要。本文在总结传统帽-依赖性翻译研究进展基础上,着重介绍IRES、m6A和CITE所启动的帽-非依赖性翻译,为更好地探索细胞应激状态下的翻译机制提供参考,为未来的翻译研究和应用提供更多的思路。

关键词：真核生物mRNA 帽-非依赖性翻译内部核糖体进入位点 N6-甲基腺苷帽-非依赖性翻译增强子

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于生物信息学分析胃癌双微体中增强子的调控机制

引用

遗传 2025年第5期47卷 558-572页

作者：安梦婷郭冠麟吴杰孙文靖贾学渊哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150081 中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本... 详细信息

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本研究利用生物信息学方法通过分析CCLE细胞系数据库和TCGA实体瘤数据库中的基因组拷贝数变异数据,总结含双微体肿瘤样本的基因组特征,依此特征对胃癌样本进行分类。接着使用FANTOM5数据库、R包“GenomicRanges”、Bedtools工具以及MEME SUITE分析胃癌双微体上增强子及其调控的靶基因的功能。然后利用CIBERSORT包和GDSC药物数据库对TCGA中含和不含的胃癌样本进行免疫细胞浸润分析和耐药分析。研究显示,胃癌中的双微体基因组特征包括一类拷贝数超过10且长度≥50kb的基因组片段。双微体增强子的调控作用影响了耐药性和肿瘤免疫,其中增强子-转录因子-靶基因的调控回路扰动也与肿瘤免疫相关。进一步分析发现,双微体增强子调控的靶基因不仅导致了免疫相关基因表达的改变,还使得胃癌样本对常见化疗药物展现出更强的不敏感性,并且耐药相关靶基因在含双微体的胃癌样本中高表达并与不良预后密切相关。综上所述,该项研究为含有双微体的胃癌个体治疗提供了新的见解。

关键词：双微体增强子胃癌肿瘤免疫肿瘤耐药性生物信息学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

一个黏多糖贮积症Ⅱ型家系的IDS基因致病变异特征分析

引用

中华内分泌代谢杂志 2023年第4期39卷 345-352页

作者：于函菲秦倩吴杰贾学渊计薇张学龙徐丽丹董科显关荣伟王浩孙文靖中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室（哈尔滨医科大学），哈尔滨医科大学医学遗传学研究室　150081 哈尔滨医科大学附属第二医院胆道胰腺外科　150086

目的:鉴定1个黏多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis type Ⅱ，MPS Ⅱ)家系的遗传变异，并对变异位点艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶(IDS)：c.323A>C进行功能学研究。方法:收集中国北方地区1个五代83名个体的MPS Ⅱ家系，其中包括4例患者... 详细信息

目的:鉴定1个黏多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis type Ⅱ，MPS Ⅱ)家系的遗传变异，并对变异位点艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶(IDS)：c.323A>C进行功能学研究。方法:收集中国北方地区1个五代83名个体的MPS Ⅱ家系，其中包括4例患者。通过尿液黏多糖、Alder-Reilly小体检测对该病进行辅助诊断，并对核心家系成员进行IDS酶活性检测;通过对MPS Ⅱ家系患者进行全外显子组测序及生物信息学分析，筛选出该家系候选变异位点，并通过PCR-Sanger测序进一步确定变异位点。最后，针对致病基因变异位点，将野生型IDS过表达质粒(pCMV-hIDS-WT)及携带突变位点的IDS过表达质粒(pCMV-hIDS-c.323A>C)分别转染COS-7细胞，进行IDS酶活性检测。结果:先证者(Ⅳ3)及Ⅳ4经尿液黏多糖、Alder-Reilly小体及IDS酶活性检测诊断为MPS Ⅱ，Ⅳ3、Ⅳ4、Ⅲ19和Ⅲ32基因检测均携带IDS：c.323A>C错义变异，确诊为MPS Ⅱ患者;并有8名个体为IDS：c.323A>C错义变异携带者，Ⅱ2、Ⅱ4、Ⅱ8、Ⅱ12、Ⅱ14、Ⅲ5、Ⅲ7、Ⅳ14排除MPS Ⅱ诊断。COS-7细胞体外实验结果显示，该错义变异可导致IDS酶活性显著降低。结论:本研究确定了IDS：c.323A>C：p.Y108S在体内和体外均可导致IDS酶活性显著降低，判定为MPS Ⅱ的致病性变异。

关键词：黏多糖贮积症Ⅱ型艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶基因全外显子组测序 c.323A>C：p.Y108S变异

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

CRC中EMT的作用及靶向治疗研究进展

引用

生命科学 2023年第4期35卷 463-471页

作者：史莉计薇哈尔滨医科大学医学遗传学教研室中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学)

结直肠癌(colorectal cancer, CRC)是世界第三大常见的癌症。上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)在肿瘤迁移和侵袭中起着非常重要的作用。本文主要总结了EMT在CRC进展中的作用及针对EMT的靶向治疗，对EMT的特点、EM... 详细信息

结直肠癌(colorectal cancer, CRC)是世界第三大常见的癌症。上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)在肿瘤迁移和侵袭中起着非常重要的作用。本文主要总结了EMT在CRC进展中的作用及针对EMT的靶向治疗，对EMT的特点、EMT在结直肠癌转移侵袭中的作用以及EMT的临床应用进行了探讨和分析，同时对一些针对EMT的治疗靶点在CRC中的应用进行了评述，以期为深入理解CRC中EMT的作用和相关治疗研究提供新的视角。

关键词：结直肠癌上皮间质转化上皮间质转化靶向治疗

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于原发癌灶T2WI的影像组学特征预测局部进展期直肠癌新辅助治疗疗效及多种分类器效能比较

引用

磁共振成像 2023年第11期14卷 77-83页

作者：胡鸿博赵升姜昊姜慧杰蔺雪张莹哈尔滨医科大学附属第二医院放射科哈尔滨150086 哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150086

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机... 详细信息

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机器学习方法在评估直肠癌新辅助治疗疗效临床价值的效能。材料与方法回顾性分析2021年9月至2023年1月于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊经病理检查证实的LARC并行nCRT的病例共160例,按8∶2比例分为训练集及验证集。分别建立支持向量机(support vector machines,SVM)、朴素贝叶斯(naive Bayes,NB)、神经网络(neural network,NN)、卷积神经网络(convolutional neural networks,CNN)四种分类器模型,采用DeLong检验比较受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线的差异,对4种分类器诊断效能进行评估比较。结果2组患者年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05)。通过最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法得到9个与治疗效果分组相关的特征,9个特征在病理完全缓解(pathological complete response,pCR)/病理非完全缓解(non-pathological complete response,non-pCR)中有差异,但差异不具有统计学意义(P>0.05)。SVM模型在训练集的ROC曲线下面积为0.9150,评估nCRT效果最为显著。结论基于磁共振高分辨T2WI的纹理特征,通过SVM、NB、NN、CNN分类器模型可以对直肠癌nCRT疗效进行评估,其中SVM分类器模型诊断效能最佳。基于高分辨T2WI的影像组学可以评估LARC患者nCRT治疗效果。

关键词：直肠癌磁共振成像影像组学机器学习支持向量机

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于高通量测序技术对染色体外环状DNA研究的最新进展

引用

生命科学 2023年第6期35卷 824-832页

作者：郭志涛武慧慧耿淑慧陈晨孟祥宁孙文靖朱静哈尔滨医科大学医学遗传学研究室中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学)

染色体外环状DNA (extrachromosomal circular DNA, eccDNA)是一种真核生物染色体外的闭合环状DNA结构，长度和染色体起源具有较高异质性。ecc DNA这一名称目前主要指大小在数百kb以内的小分子染色体外环状DNA，包括micro DNA、小多分... 详细信息

染色体外环状DNA (extrachromosomal circular DNA, eccDNA)是一种真核生物染色体外的闭合环状DNA结构，长度和染色体起源具有较高异质性。ecc DNA这一名称目前主要指大小在数百kb以内的小分子染色体外环状DNA，包括micro DNA、小多分散环状DNA (small polydispersed circular DNA, spcDNA)以及其他未分类的小分子eccDNA等。高通量测序技术(high-throughput sequencing, HTS)是一种可以同时对百万条DNA分子进行序列测定的技术，又名新一代测序技术(next generation sequencing, NGS)，具有高通量、高灵敏度、高准确度等优势。近年来高通量测序结合生物信息学分析技术不仅在揭示eccDNA染色体起源、分子结构、发生机制和潜在功能以及循环系统中的eccDNA分子特征研究等方面发挥了重要作用，而且推动了eccDNA在甲基化等表观遗传学方面的研究。生物信息学软件的发展和eccDNA分析算法的开发也对其研究提供了重要帮助。血浆以及尿液等液体活检常用体液样本中也鉴定出eccDNA的广泛存在，并且表现出与组织、生理状态以及疾病相关的生物学特征。eccDNA可能是重要的液体活检候选标志物。本综述旨在阐述利用高通量测序技术在研究eccDNA的结构、发生机制和功能上取得的最新成果，并讨论eccDNA在液体活检等方面的潜在应用。

关键词：染色体外环状DNA microDNA 高通量测序技术液体活检

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

健康教育能力对临床医学本科生支持性沟通能力和一般自我效能感关系的中介作用研究

引用

中华医学教育探索杂志 2024年第3期23卷 347-352页

作者：尹慧李闻轩张颖陶雨春李泽慧刘玮张作明王丽敏曹德品哈尔滨医科大学健康教育学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学医学教育教研室哈尔滨150081

目的探讨影响临床医学本科生支持性沟通能力的因素,并提出提升这种能力的策略。方法采用整群抽样法,选取哈尔滨医科大学2017和2018级临床医学专业388名本科生作为研究对象,进行支持性沟通能力、一般自我效能感及健康教育能力问卷调查。... 详细信息

目的探讨影响临床医学本科生支持性沟通能力的因素,并提出提升这种能力的策略。方法采用整群抽样法,选取哈尔滨医科大学2017和2018级临床医学专业388名本科生作为研究对象,进行支持性沟通能力、一般自我效能感及健康教育能力问卷调查。应用SPSS 22.0进行描述性统计分析,并使用AMOS 22.0构建结构方程模型,验证三者之间的关系,同时进行中介效应检验。结果临床医学本科生支持性沟通能力较好,总分为(74.28±10.84),一般自我效能感得分为(27.81±5.58),健康教育能力总得分为(25.50±4.76)。一般自我效能感对支持性沟通能力和健康教育能力存在直接正向作用(β=0.75,P<0.001;β=0.31,P<0.001),健康教育能力对支持性沟通能力有直接正向作用(β=0.14,P<0.001)。健康教育能力在一般自我效能感影响支持性沟通能力中发挥显著的中介作用(标准化后中介效应值为0.042,P<0.01),中介效应占比为5.1%。结论临床医学本科生健康教育能力能够中介一般自我效能感对支持性沟通能力的作用路径。可以通过加强医学人文教育,提高一般自我效能感,同时重视培养健康教育能力,以实现对临床医学专业本科生支持性沟通能力的提升。

关键词：临床医学本科生支持性沟通能力一般自我效能感健康教育能力

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

SDAEC算法在单细胞测序数据批次校正中的应用

引用

中国卫生统计 2024年第4期41卷 501-506页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 浙江大学医学院附属妇产科医院临床研究中心

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细... 详细信息

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细胞数据具有高维度、高稀疏性及高度非线性误差特点,通过将单细胞Louvain聚类算法嵌入堆叠降噪自动编码器(stacked denoising auto encoder, SDAE)算法中,形成SDAEC算法,用于单细胞测序数据的批次效应移除。结合实际卵巢癌组织scRNA-seq数据,利用分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding, tSNE)、 k最近邻批次效应检测(k-nearest-neighbor batch-effect test, kBET)、调整兰德系数(adjusted rand index, ARI)、标准化互信息(normalized mutual information, NMI)、平均轮廓宽度(average silhouette width, ASW)评价其移除批次效应性能。结果利用SDAEC方法对scRNA-seq数据批次效应移除性能高于Combat、相互最近邻(mutual nearest neighbors, MNN)、分布匹配残差网络(maximum mean discrepancy distribution-matching residual networks, MMD-ResNet)和基于零膨胀负二项的方差提取法(zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction, ZINB-WaVE)。结论 SDAEC算法能够移除scRNA-seq数据的批次效应,提高scRNA-seq数据下游分析的有效性,具有实际应用价值。

关键词：深度堆叠降噪自编码嵌套聚类单细胞测序批次效应卵巢癌

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

单细胞RNA测序数据批次效应校正方法

引用

中国卫生统计 2023年第1期40卷 153-156页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150086 浙江大学医学院附属妇产科医院

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录... 详细信息

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录图谱分析其分子状态[1],在描绘细胞微环境,阐述相关生物学机制,识别新的治疗靶点等方面取得了前所未有的进展[2]。scRNA-seq数据通常由多批次实验数据整合而成,批次效应主要来源于实验数据的获取时间、操作人员、试剂批次、设备及检测技术平台等方面。批次效应可能是高度非线性的,它的存在使得下游分析复杂化,结果难以解释。因此,有效地移除scRNA-seq数据批次效应至关重要。

关键词：批次效应分子状态生物学机制细胞微环境数据整合细胞群校正方法整体状态

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：