检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2025年第1期42卷 18-25,32页

作者：刘佳璐韩鑫浩魏孝礼陈璐程丽霞陈英东王文晗张秋菊哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院消化内科

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并... 详细信息

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并计算风险评分,根据风险评分结果将患者划分为高风险组和低风险组开展生存分析。同时绘制风险评分的ROC曲线、蛋白质热图等,用以评估这些蛋白质的预测能力。然后,将风险评分与患者其他临床表型数据结合,进行多因素回归分析,建立预后模型,并绘制列线图。通过C-index指标、ROC曲线、决策曲线等评估预后模型建立的准确性。进行GO富集分析与KEGG富集分析,探索相关蛋白所参与的生物学过程。结果通过单因素Cox分析及LASSO-Cox分析筛选出15个差异蛋白质(CKIT、CHK1、CLAUDIN7、COLLAGENVI、DVL3、EGFR_pY1173、ERALPHA_pS11、NFKBP65_pS536、SYK、ETS1、MYOSINIIA_pS1943、P21、P90RSK、RAPTOR、XBP1),用于计算蛋白质风险评分。通过多因素回归分析,筛选出年龄、性别、M分期、N分期、风险评分这5种因素,构建预后模型。生存分析结果认为,蛋白质风险评分划分的高低风险组之间的总生存率有显著差异(P<0.0001)。列线图可以用来预测患者3年、5年的生存率,并认为具有较好的预测价值(C-index=0.7257)。ROC曲线显示模型在预测中表现出稳定的灵敏度和特异度(AUC=0.77和0.86)。结论胃腺癌预后相关蛋白质的预测模型可用来预测患者的临床预后,研究结果可为个性化治疗和管理提供参考。

关键词：胃腺癌预测模型预后

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基于TransUNet改进的多任务模型在直肠癌新辅助治疗中的应用

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中国卫生统计 2025年第1期42卷 2-6页

作者：尹淑文丁志鹏李岩高国闳程丽霞陈英东王文晗张秋菊周洋哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院影像中心

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,... 详细信息

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,输出为256)、ReLU激活函数、全连接层(输入为256,输出为3),实现三分类结局的预测,即疾病稳定(stable disease,SD),部分反应(partial response,PR)和完全反应(complete response,CR)。以2015—2017年哈尔滨医科大学附属肿瘤医院收治的71名直肠癌患者新辅助化疗前的3D核磁图像提取为2D图像作为研究数据,采用Dice系数和豪斯多夫距离评价分割效果,准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score评价分类效果。结果模型训练了100个轮次,分割任务在测试集上的平均Dice系数和平均豪斯多夫距离分别为0.851和10.806,分类任务从切片角度,测试集上的准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score均为0.615,从患者角度,四个指标均为0.857。结论分割任务效果良好,分类任务以切片为单位,效果一般,以患者为单位,考虑到结局为三分类,尚且可以接受。该多任务模型有潜力用于临床进行辅助诊断。

关键词：深度学习多任务学习结直肠癌新辅助治疗

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生命八要素评分与心血管代谢疾病发病风险相关性的城乡差异

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中国循环杂志 2025年第3期40卷 269-276页

作者：陈占超刘岩房绍红田伟王善杰于波哈尔滨医科大学附属第二医院心内科心肌缺血教育部重点实验室寒地心血管病全国重点实验室哈尔滨150086 佳木斯大学公共卫生学院流行病学与生物统计学系佳木斯154007 哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病学与生物统计教研室哈尔滨150086

目的:探讨中国成年人生命八要素(LE8)评分与心血管代谢疾病(CMD)发病风险相关性的城乡差异。方法:选取2009~2015年中国健康与营养调查(CHNS)队列18岁以上无CMD的成年人4719名,其中城市地区1909名,农村地区2810名。根据LE8评分的三分位... 详细信息

目的:探讨中国成年人生命八要素(LE8)评分与心血管代谢疾病(CMD)发病风险相关性的城乡差异。方法:选取2009~2015年中国健康与营养调查(CHNS)队列18岁以上无CMD的成年人4719名,其中城市地区1909名,农村地区2810名。根据LE8评分的三分位数将研究对象分为较低组(<67.5分)、中等组(67.5~77.5分)和较高组(>77.5分)。城市地区的较低组、中等组、较高组分别为780例、564例、565例,农村地区的较低组、中等组、较高组分别为838例、934例、1038例。主要结局为随访期间新诊断的糖尿病、脑卒中和(或)心肌梗死。采用Cox比例风险回归模型分析LE8与新发CMD风险相关性的城乡差异。结果:LE8评分总分农村地区略高于城市地区(72.9分vs.70.2分,P<0.01)。平均随访(5.86±0.74)年期间,新发CMD176例,其中城市地区67例,农村地区109例。多因素Cox分析显示,在完全调整模型中,相对于城市地区的较高组,农村地区的较低组(HR=1.65,95%CI:1.27~2.15,P=0.001)新发CMD风险增加最多,其次是城市地区的较低组(HR=1.49,95%CI:1.01~2.21,P=0.046)、农村地区的中等组(HR=1.42,95%CI:1.06~1.90,P=0.020)和农村地区的较高组(HR=1.16,95%CI:1.01~1.33,P=0.032)。多变量Cox回归结果显示,城市地区中,与LE8各指标≥70分人群相比,<70分的体重指数(BMI)评分(HR=2.70,95%CI:1.51~4.84,P<0.01)、血糖评分(HR=2.09,95%CI:1.24~3.51,P<0.01)、血压评分(HR=3.73,95%CI:1.69~8.24,P<0.01)增加新发CMD风险;在农村地区中,与≥70分人群相比,<70分的BMI评分(HR=3.92,95%CI:2.43~6.30,P<0.01)、非高密度脂蛋白胆固醇(non-HDL-C)评分(HR=2.96,95%CI:1.94~4.52,P<0.01)、血糖评分(HR=2.59,95%CI:1.71~3.94,P<0.01)和血压评分(HR=1.85,95%CI:1.18~2.92,P<0.01)增加新发CMD风险。<70分的BMI、血糖、non-HDL-C评分相关的CMD发病风险,在农村地区高于城市地区。结论:尽管农村地区LE8评分略高于城市地区,但较低LE8评分相关的CMD发病风险在农村地区尤其显著。加强农村地区居民心血管健康水平监测和一级预防,对降低我国CMD负担有重要意义。

关键词：心血管健康生命八要素心血管代谢疾病队列研究

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基于互联网信息分析中国高水平公共卫生学院教师特征的现况研究

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中华流行病学杂志 2025年第3期46卷 476-483页

作者：邓慧雯王胜锋许雅君涂华康靖雪妍王红妹吴息凤李颖詹思延北京大学公共卫生学院北京100191 北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系北京100191 重大疾病流行病学教育部重点实验室(北京大学) 北京100191 浙江大学公共卫生学院大数据健康科学系杭州310058 哈尔滨医科大学公共卫生学院哈尔滨150081

目的了解中国高水平公共卫生学院教师特征,分析其在年龄、地区、高校层面存在的差异。方法基于互联网收集18所高水平公共卫生学院公开的教师信息,对教师的性别、年龄、专业等进行描述性分析。结果18所高水平公共卫生学院教师规模为1642... 详细信息

目的了解中国高水平公共卫生学院教师特征,分析其在年龄、地区、高校层面存在的差异。方法基于互联网收集18所高水平公共卫生学院公开的教师信息,对教师的性别、年龄、专业等进行描述性分析。结果18所高水平公共卫生学院教师规模为1642人,51.8%为女性,92.8%为博士文化程度,32.4%有博士后经历,56.8%为校友留校任教,年龄为(45.6±9.8)岁,专业分布前三位分别是为流行病与卫生统计学(31.0%)、劳动卫生与环境卫生学(16.5%)和卫生毒理学(16.3%)。>40岁教师中,90.2%为博士文化程度,62.6%为校友留校任教,24.7%教育背景与公共卫生不相关;≤40岁教师中的比例分别为98.2%、45.8%和39.1%。专业分布上,学科排名较前的学校、发达地区的高校多以开展大数据分析研究为主。结论公共卫生教师呈现多交叉、严标准的准入特点。各分支学科层面,专业分布、地域分布以及各学校开展研究均具有自身特色。

关键词：高水平公共卫生学院信息流行病学教师队伍现况研究

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我国医疗器械审评报告中临床试验设计与统计分析要素公开情况的汇总分析

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中国医药导刊 2025年第3期27卷 308-313页

作者：李其泽丹增赤列王朵儿林小莹姜茹沈心远王玉鹏王杨中国医学科学院北京协和医学院国家心血管病中心阜外医院医学统计部北京100037 哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的:了解我国医疗器械技术审评报告中临床试验设计与统计分析要素的公开情况。方法:通过提取国家药品监督管理局官网的医疗器械公开审评报告信息,将2023全年度的公开技术审评报告作为研究对象,提取相关信息并进行汇总分析。结果:本研... 详细信息

目的:了解我国医疗器械技术审评报告中临床试验设计与统计分析要素的公开情况。方法:通过提取国家药品监督管理局官网的医疗器械公开审评报告信息,将2023全年度的公开技术审评报告作为研究对象,提取相关信息并进行汇总分析。结果:本研究共纳入了60项临床试验,涉及医疗器械分类条目中全部类型(22个)中的17个,试验设计与分析要素的报告呈现多样性。在临床评价概述中,只有样本量信息被全部明确提及,但有51.5%的临床试验未明确说明是否应用盲法设计,有41.7%的试验未明确说明主要指标结果所基于的统计分析人群。结论:国内医疗器械审评报告反映了上市前临床试验现状,但临床评价与试验设计方法学信息公开仍存在透明度不足的情况。建议规范临床试验设计与统计分析要素公开标准并建立分类机制,提升方法学要素透明度,助力临床试验科学化发展。

关键词：医疗器械公开审评报告临床试验临床研究方法学

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基于排序融合算法的玉米不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究

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哈尔滨医科大学学报 2025年第1期 23-28页

作者：杨楠温福东刘丹王玉鹏哈尔滨医科大学卫生统计学教研室

目的识别与玉米不耐受发生相关的差异表达蛋白，并探讨其蛋白组学发病机制。方法选取2015年6月～2019年4月于哈尔滨医科大学第一附属医院就诊的7例玉米不耐受患者作为病例组，按年龄、性别匹配同期该院7例健康体检成人作为对照组。采... 详细信息

目的识别与玉米不耐受发生相关的差异表达蛋白，并探讨其蛋白组学发病机制。方法选取2015年6月～2019年4月于哈尔滨医科大学第一附属医院就诊的7例玉米不耐受患者作为病例组，按年龄、性别匹配同期该院7例健康体检成人作为对照组。采集两组血清样本，使用串联质量标记(tandem mass tags, TMT)定量蛋白质组学技术分析蛋白含量，获得蛋白表达数据；利用压缩感知、随机森林、偏最小二乘法计算出所有蛋白的重要度，为平衡不同算法的影响将各算法得到的蛋白重要度分别进行标准化，并将三个标准化后的序列相加，构建一个新的序列；利用Hampel滤波法筛选出与玉米不耐受发生相关的蛋白，并进行基因本体论(Gene Ontology, GO)功能注释和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析。结果排序融合方法共筛选出31个与玉米不耐受发生相关的蛋白，导入STRING数据库构建蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络，筛选出18个差异蛋白。GO富集分析发现差异蛋白主要参与核小体组装、自然杀伤细胞分化调控等生物学通路；KEGG富集分析得到5条通路，分别为中性粒细胞外陷阱形成、酗酒、系统性红斑狼疮通路、补体与凝血级联通路、上皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)酪氨酸激酶抑制剂耐药性。结论玉米不耐受的发生与免疫调节、脂质代谢、染色体结构成分、补体调节等过程的改变密切相关。

关键词：食物不耐受蛋白质组学生物标志物变量筛选

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基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究

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中国卫生统计 2022年第3期39卷 329-334页

作者：赵敏张薇孙琳王玉鹏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白... 详细信息

目的应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。

关键词：小麦不耐受差异表达蛋白变量筛选

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多组学数据分析中关联网络融合ANF算法及应用研究

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中国卫生统计 2020年第6期37卷 822-827页

作者：徐臻旖王策侯艳李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的引入关联网络融合(affinity network fusion,ANF)方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究。方法模拟产生两组学数据,改变总体差异大小等情况比较多种多组学整合方法的效果。实例分析中目标人群选择TCGA数据库中对... 详细信息

目的引入关联网络融合(affinity network fusion,ANF)方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究。方法模拟产生两组学数据,改变总体差异大小等情况比较多种多组学整合方法的效果。实例分析中目标人群选择TCGA数据库中对铂类药物敏感并拥有mRNA和甲基化两个组学的卵巢癌患者,目标基因是TCGA数据库和ImmPort数据库中共有基因,目标甲基化位点是目标基因对应的所有甲基化位点。使用ANF、SNF、K-means、系统聚类和iCluster五种方法比较聚类效果。结果模拟实验提示存在总体差异的两亚型间差异较小时ANF方法的效果明显优于其他方法。实例分析结果表明,通过ANF方法进行多组学数据整合得到的分子分型较单组学得到的分子分型有更好的生物学意义且多组学聚类效果优于其他方法。结论ANF方法可以应用于多组学数据整合分析,具有实际应用意义。

关键词： ANF方法多组学数据整合免疫分型

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基于扩展MDR方法的生存数据的特征选择

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中国卫生统计 2022年第5期39卷 663-668页

作者：田野侯婧雯王宗辉郑睿李若锦刘艳哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的对比分析Surv-MDR、Cox-MDR、Cox UM-MDR和KM-MDR四种用于识别生存分析中SNP位点交互作用的算法,为寻找影响患者生存时间的交互SNP位点时算法的选择提供理论指导。方法使用R 4.0.5完成四种算法以及模拟实验代码的编写,并使用ggplot... 详细信息

目的对比分析Surv-MDR、Cox-MDR、Cox UM-MDR和KM-MDR四种用于识别生存分析中SNP位点交互作用的算法,为寻找影响患者生存时间的交互SNP位点时算法的选择提供理论指导。方法使用R 4.0.5完成四种算法以及模拟实验代码的编写,并使用ggplot2包绘制功效对比图;探索实际数据集上影响患者生存时间的交互SNP位点,并使用survminer包绘制相应的生存曲线。结果在不同最小等位基因频率、遗传度下四种方法的效能不同。Cox-MDR受协变量影响最大;Surv-MDR和KM-MDR功效相近且整体表现最好,且KM-MDR具有更好的稳定性;CoxUM-MDR功效强于Cox-MDR但受删失比例影响最大;在真实数据集上,Cox UM-MDR和Surv-MDR识别出了同一个有意义的一阶交互项,Cox-MDR和KM-MDR未能识别出有意义的交互项。结论当不存在协变量时,CoxUM-MDR、Surv-MDR和KM-MDR功效都明显高于Cox-MDR,不宜选用Cox-MDR;当存在协变量且删失比例不高时,Cox-MDR功效高于其他三种方法,宜选用Cox-MDR;但随着删失比例的增加,宜选用CoxUM-MDR或Surv-MDR。

关键词：单核苷酸多态性多因子降维生存分析降维

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基于lncRNA-mRNA共表达网络筛选胃癌分期相关的lncRNA

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中国卫生统计 2021年第5期38卷 665-669页

作者：丛雨欣张秋菊田伟张奇李称赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因... 详细信息

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因共表达网络分析(WGCNA)相结合的方法,构建lncRNA-mRNA共表达网络模块,结合临床信息筛选与胃癌分期相关的模块;采用Kruskal-Wallis秩和检验筛选模块内胃癌不同分期差异表达的lncRNA。结果获得286例胃癌组织和30例癌旁对照组织样本的RNA-seq数据;eQTL分析得到5118对顺式作用和1 953 109对反式作用lncRNA-mRNA;2 999个lncRNA和3 884个mRNA纳入WGCNA,产生25个共表达模块,其中与胃癌分期高度相关的模块有3个;模块midnightblue、orange内18个枢纽lncRNA中有14个lncRNA在胃癌不同分期差异表达。结论本研究筛选出14个与胃癌分期相关的lncRNA,这14个lncRNA可能通过调控mRNA的表达影响胃癌的进展,分析其对应的网络调控关系,为研究lncRNA-mRNA调控机制及探索胃癌治疗靶点提供了参考和方向。

关键词：胃癌 eQTL 加权基因共表达网络 lncRNA mRNA

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