检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2018年第5期35卷 663-665页

作者：高兵刘美娜谢彪王玉鹏孙琳张秋菊哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081

目的对紫癜性肾炎和过敏性紫癜两类患者中差异表达的代谢产物进行筛选。方法利用排序融合的思路,将t检验、Wilcoxon秩和检验、偏最小二乘、及随机森林等四种方法用于组间差异表达分析,对其所获得的四个变量重要性排序进行融合,获得综合... 详细信息

目的对紫癜性肾炎和过敏性紫癜两类患者中差异表达的代谢产物进行筛选。方法利用排序融合的思路,将t检验、Wilcoxon秩和检验、偏最小二乘、及随机森林等四种方法用于组间差异表达分析,对其所获得的四个变量重要性排序进行融合,获得综合的、单一的变量排序(排序融合模型);利用交叉验证获得最优模型,并进行差异变量的筛选;通过模拟实验评价排序融合模型变量筛选的能力并与least absolute shrinkage and selection operator(LASSO)进行比较。最后,将其用于紫癜性肾炎与过敏性紫癜患者间的代谢物差异分析。结果模拟实验结果显示:(1)当观测数和差异变量数较小时,排序融合模型的AUC的平均值大于LASSO;(2)当观测数和差异变量数较大时排序融合模型的AUC的平均值与LASSO相近; 3)无论参数如何设置排序融合模型所筛选的差异变量数基本均少于LASSO。实例分析结果显示:应用排序融合模型获得紫癜性肾炎和过敏性紫癜患者中存在12个差异表达的代谢产物,其AUC值达到其最大值0. 96。结论相比于LASSO,排序融合模型在筛选变量时更具可靠性和准确性,可为代谢组学数据的差异表达分析提供新的分析思路和方法。

关键词：排序融合变量筛选代谢组学 LASSO

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多分类研究中的boosting算法

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中国卫生统计 2018年第1期35卷 142-145页

作者：张圆圆侯艳李康哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081

boosting算法起源于PAC（probably approximately correct）学习模型,由Schapire在1990年首次提出,是一种基于一系列基础分类器的组合分类模型算法,基础分类器可以选择任意一种弱分类模型（如决策树）。随后,Freund和Schapire在此基础上... 详细信息

boosting算法起源于PAC（probably approximately correct）学习模型,由Schapire在1990年首次提出,是一种基于一系列基础分类器的组合分类模型算法,基础分类器可以选择任意一种弱分类模型（如决策树）。随后,Freund和Schapire在此基础上于1995年提出了著名的Adaboost算法.

关键词：分类器算法 Adaboost 类模型决策树

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单核苷酸多态性数据缺失值填补方法研究

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中国公共卫生 2014年第12期30卷 1576-1582页

作者：李昂温琪顾星博焦辛妮佟海龙袁重胜刘艳李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学研究生学院

目的通过对单核苷酸多态性（SNPs）数据展开缺失值填补影响因素与填补效果的研究,为利用SNPs数据进行基因与疾病的关联研究提供科学依据。方法以国际人类基因组单体型图计划（Hap Map计划）数据为原始数据,利用HAPGEN2软件,依据原始... 详细信息

目的通过对单核苷酸多态性（SNPs）数据展开缺失值填补影响因素与填补效果的研究,为利用SNPs数据进行基因与疾病的关联研究提供科学依据。方法以国际人类基因组单体型图计划（Hap Map计划）数据为原始数据,利用HAPGEN2软件,依据原始数据生成SNP基因型模拟数据,人为产生缺失数据并进行缺失值的填补,分析不同条件（4个水平的缺失比例、4个水平的参考数据样本量）的填补错误率。结果数据缺失比例越小、参考数据样本量越大,填补的错误率越低（样本量50、100、150和200的平均错误率分别为7.01%、5.92%、5.67%和5.26%）;2种缺失模式在缺失比例较大时（r^2=0.825）,随机缺失填补（平均5.64%）较固定缺失填补（平均9.10%）填补错误率低,而当缺失比例较小时（r^2=0.9）,固定位点缺失模式的填补错误率较低（平均4.96%）,在各种条件下IMPUTE2的填补错误率为3%~13%。结论缺失比例、参考数据样本量以及缺失模式对缺失数据填补的准确性有一定影响;对标签SNP数据进行缺失值填补,再进一步分析是一种有效的策略。

关键词：单核苷酸多态性(SNPs) 数据模拟缺失值填补标签SNP

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脂蛋白定量预测的因子分析

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中国卫生统计 2006年第4期23卷 306-308页

作者：刘艳隋虹罗志忠李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学地方病控制中心

目的用组成脂蛋白的各种载脂蛋白、甘油三酯、胆固醇含量的多少来研究脂蛋白的构成,并对脂蛋白的含量进行预测。方法采用因子分析,使用了最大似然估计算法,并通过斜交旋转,使各因子的实际意义能够得以明确的证实。结果被测定的各种载脂... 详细信息

目的用组成脂蛋白的各种载脂蛋白、甘油三酯、胆固醇含量的多少来研究脂蛋白的构成,并对脂蛋白的含量进行预测。方法采用因子分析,使用了最大似然估计算法,并通过斜交旋转,使各因子的实际意义能够得以明确的证实。结果被测定的各种载脂蛋白、甘油三酯、胆固醇的含量在很大程度上与4个因子有着密切的关系,依据其构成情况,使我们更进一步认识到它们就是VLDL、IDL、LDL、HDL,并得出了4种脂蛋白含量预测值的计算方法。结论采用因子分析可以实现对脂蛋白构成及其定量预测的研究,为解决目前脂蛋白代谢定量分析困难提供了一种新途径。

关键词：因子分析脂蛋白脂蛋白代谢定量分析

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回归校准和模拟外推对测量误差的校正效果研究

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中国卫生统计 2014年第5期31卷 741-745页

作者：陈霞张桥陈永杰李慧婷张秋菊刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学医务处

目的探讨回归校准法(RC)和模拟外推法(SIMEX)对logistic回归中测量误差的校正效果。方法通过SAS软件产生有测量误差的模拟数据,用RC和SIMEX对测量误差进行校正,对比设定的真实β值和校正后的β*值之间的差别,以评价校正效果。结果当X可... 详细信息

目的探讨回归校准法(RC)和模拟外推法(SIMEX)对logistic回归中测量误差的校正效果。方法通过SAS软件产生有测量误差的模拟数据,用RC和SIMEX对测量误差进行校正,对比设定的真实β值和校正后的β*值之间的差别,以评价校正效果。结果当X可精确测量时,在设定的σ2u条件下,RC1的校正效果较好;P-SIMEX仅当σ2u很小时校正效果较好。当X不可精确测量时,随着测量误差的增大,E-SIMEX的校正效果降低,而RC2的校正效果相对较稳定。结论无论X是否可测,在经典测量误差模型前提下,RC对logistic回归模型中测量误差的校正效果优于SIMEX,建议应用RC校正测量误差。

关键词：测量误差回归校准法模拟外推法 logistic回归回归稀释

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Rstudio和随机丛林在高维全基因组学数据分析中的应用

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中国卫生统计 2015年第6期32卷 955-958,962页

作者：顾星博李昂温琪焦辛妮刘艳哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属第一医院心内科

目的结合Rstudio和Random Jungle两款软件的优势,通过远程登录简便、快捷地实现全基因组学数据的分析。方法在服务器端搭建Rstudio Server,封装随机丛林R程序并对英国威康信托病例对照协会(WTCCC)高血压真实数据进行分析,通过Rstudio Sw... 详细信息

目的结合Rstudio和Random Jungle两款软件的优势,通过远程登录简便、快捷地实现全基因组学数据的分析。方法在服务器端搭建Rstudio Server,封装随机丛林R程序并对英国威康信托病例对照协会(WTCCC)高血压真实数据进行分析,通过Rstudio Sweave动态生成分析结果。结果在客户端即可通过网络浏览器登陆服务器端搭建好的Rstudio Server;数据量较大时,封装后的随机丛林程序在Rstudio Server中运算速度方面相对于R random Forest包优势明显。2001名高血压病例及3004名对照的22条染色体共有490032个SNP位点,根据真实标签通过10次随机丛林过程筛选出稳定排序在前20位的SNPs位点,其Cochron-Armitage检验的P值也有10个排进前11位。结论全基因组学数据的处理会消耗很多的时间和内存,普通计算机根本无法承受,Random Jungle软件的命令行运行方式又不易于数据处理、算法组合或嵌套及结果的再现、可视化,在服务器端搭建Rstudio Server并结合Random Jungle的分析策略可有效地应用于全基因组学数据分析,简化分析过程、提高分析速度和效率、方便实现分析结果的动态输出及再现。

关键词：全基因组关联分析 SNPs Rstudio 随机森林随机丛林

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医科与理科男女新生健康危险行为比较研究

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中华行为医学与脑科学杂志 2012年第1期21卷 76-78页

作者：李晶焱王琪王丽敏尹慧隋虹哈尔滨医科大学公共卫生学院健康教育学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室哈尔滨150081

目的探讨医科和理科专业大学男女新生健康危险行为的分布及特点，为制定适宜的健康教育干预措施提供依据。方法采用自编大学生健康危险行为调查问卷，对哈尔滨市某医科和理科院校1019名新生进行统一问卷调查。结果调查显示，各类健康危... 详细信息

目的探讨医科和理科专业大学男女新生健康危险行为的分布及特点，为制定适宜的健康教育干预措施提供依据。方法采用自编大学生健康危险行为调查问卷，对哈尔滨市某医科和理科院校1019名新生进行统一问卷调查。结果调查显示，各类健康危险行为发生频率，（1）在相同专业不同性别比较中，除玩电子游戏、上网、考虑过自杀、滥用药物及每天很少活动60min外，其他各项危险行为男女均存在显著差异（P〈0．01）。（2）同性别不同专业的比较发现，在尝试吸烟、现在吸烟、性行为及不吃早餐等行为中理工科男新生发生率（分别为56．4％、19．2％、12．7％和47．1％）明显高于医科男新生（分别为35．6％、5．2％、1．6％和17．3％）；而医科男生近期饮酒率高达85．3％明显高于理工科男新生的72．2％。在尝试饮酒、近期饮酒及不吃早餐等行为方面，理工科女新生发生率（分别为89．3％、50．8％和38．5％）明显高于医科女新生（分别为72．4％、36．9％和8．0％）（P〈0．01）。结论大学新生健康危险行为较为普遍，存在不同性别以及不同专业上的差异，应采取必要措施有针对性地进行干预。

关键词：健康危险行为医科理科性别大学新生

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疾病预后数据分析方法研究进展

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中国公共卫生 2017年第5期33卷 853-856页

作者：门志红刘匆提姜博刘艳哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

生存分析数据遗传因素与生存信息之间的交互作用对疾病预后的影响备受关注,Surv-MDR与CoxMDR分析方法的提出为分析影响生存时间的单核苷酸多态性(SNPs)交互作用开辟了新的道路;传统参数模型和机器学习法均可研究SNPs交互作用,将其与生... 详细信息

生存分析数据遗传因素与生存信息之间的交互作用对疾病预后的影响备受关注,Surv-MDR与CoxMDR分析方法的提出为分析影响生存时间的单核苷酸多态性(SNPs)交互作用开辟了新的道路;传统参数模型和机器学习法均可研究SNPs交互作用,将其与生存分析方法相结合对科研工作及临床预后具有重要意义。

关键词：预后生存分析单核苷酸多态性(SNPs) 交互作用

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疾病预后数据分析方法研究进展

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中国公共卫生 2016年第11期32卷 1598-1601页

作者：门志红刘匆提姜博刘艳哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

关键词：预后生存分析单核苷酸多态性(SNPs) 交互作用

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基于结直肠癌患者医生治疗质量指标评价

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中国公共卫生 2017年第6期33卷 1014-1017页

作者：张美奇苏少飞王心雨蒋皓王佳莹刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的通过单指标使用率及多指标综合得分进行医生结直肠癌治疗质量评价,为结直肠癌治疗质量的改善及医生的绩效考核提供依据。方法收集哈尔滨市四家医院内出院时间为2011年6月-2013年6月的结直肠癌患者病历信息共1 559份;利用适合使用某... 详细信息

目的通过单指标使用率及多指标综合得分进行医生结直肠癌治疗质量评价,为结直肠癌治疗质量的改善及医生的绩效考核提供依据。方法收集哈尔滨市四家医院内出院时间为2011年6月-2013年6月的结直肠癌患者病历信息共1 559份;利用适合使用某评价指标的患者数为分母,适合该指标中实际使用的患者数为分子,计算某评价指标的使用率;利用潜变量模型及贝叶斯参数估计方法,整合多维评价指标,获得医生结直肠癌治疗质量的综合得分。结果不同医生对评价指标的使用率之间存在较大的差异,术前检查生化指标、肾功能、胸部X线使用率的变异范围为3.9%~97.8%,病理报告中记录检出淋巴结数和阳性淋巴结数使用率的变异范围为95.9%~100.0%;根据潜变量模型计算的综合质量得分,医生的综合质量得分最高为xita[12]=0.405 7,即该医生的治疗质量最好;其次为xita[1]=0.3875;最低为xita[3]=-0.596 7。结论整合多维评价指标获得综合质量得分,可以多角度全面地对医生治疗质量进行综合评价;计算单指标使用率,可以在综合评价的基础上得到医生对各评价指标的使用情况。

关键词：结直肠癌治疗质量潜变量模型综合评价

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