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新疆医科大学学报 2024年第5期47卷 668-674页

作者：张金佩冯学召刘梦薇何心瞳徐梦波阿来依·买提卡比力麦尔哈巴·达毛拉衡锐米娜新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆医科大学重点实验室乌鲁木齐830017 中山大学肿瘤防治中心广东510060 新疆医科大学基础医学院生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院乌鲁木齐830054

目的探讨自噬接头蛋白(Sequestosome 1,SQSTM1/p62)与磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)复合物的结合蛋白WD重复结构域磷酸肌醇互作蛋白2(WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2,WIPI2)在空间上定位的调控关系。方法使用CRISPR-Cas9技术敲除正常大鼠肾上皮细胞(Normal rat kidney,NRK)中的自噬相关基因2A(Autophagy-related gene,Atg2A)、自噬相关基因2B(Autophagy-related gene,Atg2B)和p62基因,建立Atg2A和Atg2B基因敲除的细胞系(Atg2AB double knockout,Atg2AB DKO)以及p62基因敲除细胞系(p62 knockout,p62 KO);透射电镜观察Atg2AB DKO细胞中p62体周围囊泡的定位;活细胞成像观察Atg2AB DKO细胞内p62体与自噬相关蛋白WIPI2的定位变化;光漂白实验观察相变蛋白p62与WIPI2的荧光漂白恢复;通过免疫荧光观察WT、p62 KO和Atg2AB DKO细胞中WIPI2与p62的定位关系;通过蛋白免疫印记检测WT和p62 KO细胞中WIPI2表达量的变化。结果建立了Atg2AB DKO和p62 KO细胞系;透射电镜显示Atg2AB DKO细胞中p62附近聚集了大量囊泡;在Atg2AB DKO中,通过活细胞成像观察到tdTomatop62与WIPI2-GFP高度共定位;荧光漂白实验观察到WIPI2具有流动性;通过免疫荧光观察到,与WT细胞相比,在Atg2AB DKO中WIPI2点的数量明显增多(P<0.0001);与WT细胞相比,p62 KO细胞中WIPI2点的数量和表达量无明显变化(P>0.05)。结论无膜细胞器p62能够与具有流动性的WIPI2阳性囊泡动态融合,促进自噬体的形成。

关键词：自噬体自噬接头蛋白 WD重复结构域磷酸肌醇互作蛋白2

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肝细胞癌进展过程中的关键基因ATP1B3和ENAH的筛选与鉴定:基于数据挖掘和临床验证

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南方医科大学学报 2022年第6期42卷 815-823页

作者：杨雪佳李玉杰吴登强马义丽周素芳国家生物靶向诊治国际联合研究中心//广西生物靶向诊治重点实验室//广西肿瘤靶向诊治协同创新中心//广西生物靶向诊治研究人才小高地基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西医科大学广西南宁530021

目的筛选与肝细胞癌(HCC)预后、进展和临床诊断相关标记物。方法分析来自癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合(GEO)的TCGA-LIHC、GSE84432、GSE14323和GSE63898数据集。利用GEO_(2)R和edge R包获得各疾病类型之间共同差异基因(DE... 详细信息

目的筛选与肝细胞癌(HCC)预后、进展和临床诊断相关标记物。方法分析来自癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合(GEO)的TCGA-LIHC、GSE84432、GSE14323和GSE63898数据集。利用GEO_(2)R和edge R包获得各疾病类型之间共同差异基因(DEG),并对DEG进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。将DEG在TCGALIHC中正常和癌组织进行差异表达验证分析,挑选在HCC中上调基因。利用R语言进行生存分析、受试者工作特征(ROC)曲线分析、基因与患者临床特征关系分析。再通过RT-qPCR验证15对临床HCC和癌旁组织中基因的差异表达。结果数据库挖掘共获得118个共同DEG,挑选出2个基因:ATP酶Na+/K+转运亚基Beta 3(ATP1B3)和肌动蛋白调节器(ENAH),其表达随疾病进展升高。结合TCGA-LIHC数据集生存分析发现两者高表达与HCC患者不良预后显著相关(P<0.05)。ROC曲线分析ATP1B3和ENAH的AUC值分别是0.821和0.933。ATP1B3高表达与晚期病理T分期、Stage和Grade相关(P<0.05),而ENAH高表达仅与晚期病理Grade有关(P<0.05)。RT-qPCR结果发现,ATP1B3和ENAH在临床HCC组织中表达上调(P<0.05)。结论ATPIB3和ENAH有望成为肝脏疾病恶化和肝细胞癌的不良预后标志物。

关键词：肝纤维化肝硬化肝细胞癌 ATP1B3 ENAH

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手机游戏在生物化学混合式教学中的应用

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基础医学教育 2023年第3期25卷 250-252页

作者：杨生永易发平冉隆科马艳余华荣李轶重庆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室重庆400016 重庆医科大学基础医学院生物信息学教研室重庆医科大学信息中心重庆医科大学基础医学院生理学教研室

文章探讨了通过在线上平台发布基于知识点开发的原创手机游戏,有效利用了移动设备和碎片时间,实现了课堂延展和知识点回顾。学生通过参与游戏这一过程,也实现了主动学习。全新的多维混合式教学模式,证实了手机游戏这一新颖学习形式的引... 详细信息

文章探讨了通过在线上平台发布基于知识点开发的原创手机游戏,有效利用了移动设备和碎片时间,实现了课堂延展和知识点回顾。学生通过参与游戏这一过程,也实现了主动学习。全新的多维混合式教学模式,证实了手机游戏这一新颖学习形式的引入,对知识传递效率和学习体验的提升作用。

关键词：生物化学混合式教学手机游戏

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线粒体动力学稳态与血管重塑性疾病

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生命的化学 2024年第10期44卷 1923-1932页

作者：邹沁霖冯丽娜樊世钰何超张丹丹孔鹏河北医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室河北省血管生物学重点实验室神经与血管省部共建教育部重点实验室石家庄050017

线粒体是细胞内高度动态的细胞器,通过融合和裂变不断改变其形态,实现由相互连接的网络结构向不连接的碎片状结构动态转换,这种现象被称为线粒体动力学。线粒体融合是维持正常线粒体和细胞功能所必需的,而裂变则有助于线粒体吞噬去除功... 详细信息

线粒体是细胞内高度动态的细胞器,通过融合和裂变不断改变其形态,实现由相互连接的网络结构向不连接的碎片状结构动态转换,这种现象被称为线粒体动力学。线粒体融合是维持正常线粒体和细胞功能所必需的,而裂变则有助于线粒体吞噬去除功能失调、去极化的线粒体。生理状态下,线粒体通过融合与裂变的动态改变而调节细胞内分子的传递和代谢产物的交换。线粒体融合与分裂通常处于一种动态平衡的状态,以维持其形态、功能和数量的稳定。线粒体动力学稳态对于细胞维持正常生物学活动有重要意义。近年来,研究已证实线粒体动力学失衡是动脉粥样硬化、动脉瘤、血管成形术后再狭窄等血管重塑性疾病发生发展的重要始动因素。本文综述了线粒体动力学稳态在血管重塑性疾病发生中的调控作用和影响,期待为更有效的心血管疾病治疗和预防提供新的方向。

关键词：线粒体动力学线粒体融合线粒体裂变血管重塑性疾病

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基于血栓弹力图的凝块溶解时间与ACS合并高脂血症患者再发心肌梗死的相关性研究

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临床心血管病杂志 2022年第5期38卷 378-383页

作者：曹梦霞李凤娟任璐李琴王媛杜杰山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室太原030001 山西医科大学分子影像精准诊疗省部共建协同创新中心首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所血管生物研究室

目的:探讨凝块溶解时间(CLT)与急性冠状动脉综合征(ACS)合并高脂血症患者再发心肌梗死(心梗)事件风险的关系。方法:纳入2019年1月—2020年2月于北京安贞医院住院确诊为ACS且出院前行血栓弹力图检测的患者,共计909例。收集研究对象的人... 详细信息

目的:探讨凝块溶解时间(CLT)与急性冠状动脉综合征(ACS)合并高脂血症患者再发心肌梗死(心梗)事件风险的关系。方法:纳入2019年1月—2020年2月于北京安贞医院住院确诊为ACS且出院前行血栓弹力图检测的患者,共计909例。收集研究对象的人口学特征、临床检测结果并对其进行电话随访,中位随访时间为2年。根据患者出院诊断及既往病史将其分为ACS高脂血症组(685例)和ACS非高脂血症组(224例)。通过多因素logistic回归模型分析CLT与ACS合并高脂血症患者再发心梗事件的关系,并利用受试者工作特征(ROC)曲线评价CLT对患者再发心梗事件的评估效能。使用Kaplan-Meier方法计算生存曲线。结果:ACS高脂血症组患者出院前CLT值高(P=0.007)。多因素logistic回归模型显示,调整病史、合并症及临床检验指标等后,CLT与ACS高脂血症患者再发心梗事件发生风险独立相关(OR=1.45,95%CI:1.06-2.00,P=0.020)。ROC曲线分析得到CLT评估ACS高脂血症患者再发心梗事件风险的最佳截止点为12.7 min, Kaplan-Meier生存曲线分析结果表明CLT≥12.7 min组再发心梗发生率显著高于CLT<12.7 min组(Log rank:P=0.043)。结论:CLT可评估ACS合并高脂血症患者出院后发生再发心梗事件风险。

关键词：急性冠状动脉综合征高脂血症血栓弹力图预后研究

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医学生创新训练项目的实施、成效与思考

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基础医学教育 2024年第2期26卷 169-172页

作者：卡思木江·阿西木江艾力·艾比不拉木合依提·阿地力艾力赵健锋龚素芬穆凯代斯·艾合买提新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆医科大学第一附属医院心脏外科新疆伊宁卫生学校新疆医科大学

以健康促进为中心的医学发展理念下,培养医学院校大学生的临床和科研思维能力十分重要。大学生创新训练项目以项目为载体,激发学生的创新思维和创新意识,调动学生对科研和学习的积极性和创造性,提高学生的创新能力和实践能力。文章通过... 详细信息

以健康促进为中心的医学发展理念下,培养医学院校大学生的临床和科研思维能力十分重要。大学生创新训练项目以项目为载体,激发学生的创新思维和创新意识,调动学生对科研和学习的积极性和创造性,提高学生的创新能力和实践能力。文章通过问卷调查了解医学生参与大学生创新训练项目的现状、项目的选题来源和成效,分析大学生创新训练项目存在的问题并提出有效的解决方案,为大学生后续科研和专业能力的提升提供一定的理论指导。

关键词：高等教育大学生创新训练项目教学改革专业能力科研能力

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基于TCGA分析GALNT14在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

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广西科学 2022年第6期29卷 1111-1124页

作者：韦玉琴吴帆张胜锋谭炎林臧宁晁耐霞吴群英周青鸟广西医科大学基础医学院广西南宁530021 广西医科大学广西高等学校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021

本研究拟探索N-acetylgalactosaminyltransferase 14 ( GALNT14)的表达水平对肾透明细胞癌(Kidney Renal Clear Cell Carcinoma, KIRC)的临床预后意义及其在疾病进展中的功能。从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取肾透明细胞癌的临床信息和相应的mRNA表达数据,使用R语言进行差异表达分析和配对差异表达分析,检测 GALNT14在肾透明细胞癌的表达;通过Logistic回归分析、Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析探究 GALNT14的表达量与肾透明细胞癌临床特征的相关性;从STRING数据库中获得GALNT14相互作用的蛋白质,通过Linkedomics和GeneMANIA数据库分析GALNT14的蛋白质-蛋白质相互关系;通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)探索 GALNT14在肾透明细胞癌中介导的生物信号通路。结果表明,肾透明细胞癌组织中 GALNT14的mRNA相对表达量显著高于癌旁组织;肾透明细胞癌 GALNT14的高表达与肿瘤原发灶大小、Tumor Node Metastasis (TNM)分期、患者年龄、组织分级显著相关;肾透明细胞癌患者 GALNT14的高表达与患者总生存率(Overall Survival, OS)正相关,与无病生存率(Disease Free Survival, DFS)负相关;GALNT14可作为肾透明细胞癌患者的独立预后因子;GALNT14的共调控基因与肾透明细胞癌关系密切;GALNT14的高表达与肿瘤细胞中氨基酸代谢、脂肪酸代谢和糖代谢等信号通路相关。因此, GALNT14在肾透明细胞癌中高表达且与患者预后相关,可作为该疾病的独立预后因子。

关键词：肾透明细胞癌 GALNT14 生物信息学表达分析预后因子

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负载干细胞外囊泡的缓释聚左旋乳酸微球在促肝细胞增殖中的作用

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中国热带医学 2023年第10期23卷 1030-1036页

作者：楚瑨木克西娜·木拉提高瑾李亮张雪吕国栋林仁勇毕晓娟省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室新疆乌鲁木齐830011 新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830052

目的制备一种调控释放干细胞外囊泡的微粒子递送系统,仅干预1次后长期发挥增强肝细胞增殖能力的作用。方法采用差速离心法提取干细胞外囊泡并鉴定,透射电镜观察外囊泡结构和免疫印记检测外囊泡膜标志蛋白,评价所提取外囊泡符合规范。采... 详细信息

目的制备一种调控释放干细胞外囊泡的微粒子递送系统,仅干预1次后长期发挥增强肝细胞增殖能力的作用。方法采用差速离心法提取干细胞外囊泡并鉴定,透射电镜观察外囊泡结构和免疫印记检测外囊泡膜标志蛋白,评价所提取外囊泡符合规范。采用乳液-溶剂挥发法制备“壳-核”结构聚左旋乳酸(poly-L-lactic acid,PLA)微球,在微球“核”结构位置负载干细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)得到EVs-PLA微球。通过扫描、透射电镜检测微球及外囊泡形貌,粒径分析,缓释实验检测EVs-PLA微球缓释周期,扫描电镜检测缓释至8周EVs-PLA微球形貌变化;将EVs-PLA微球与肝实质细胞共培养,鬼笔环肽/DAPI染色评价EVs-PLA微球生物相容性和细胞毒性,CCK8评价EVs-PLA微球对细胞增殖活力的影响作用,免疫印记检测EVs-PLA微球共培养后细胞中增殖标志蛋白表达量并统计数据结果。结果对比EVs-PLA干细胞外囊泡微球处理组和对照组的肝实质细胞增殖能力评价,发现EVs-PLA微球未造成细胞凋亡和细胞结构发生变异,具有生物相容性无细胞毒性;EVs-PLA微球的“壳-核”结构调控所负载的干细胞外囊泡的释放速率和释放周期,EVs-PLA微球可缓慢释放EVs,单次干预后持续发挥促进肝实质细胞增殖的生物作用。结论EVs-PLA微球可缓慢释放EVs,单次干预后持续发挥增强肝细胞增殖能力的作用,为探索外囊泡促肝细胞增殖的微递送系统提供了新的思路。

关键词：干细胞外囊泡缓释肝再生 O/W乳化生物因子载体

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脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2通过肌醇需要酶1α介导的UPR信号通路调控肝癌细胞凋亡并预测早期肝细胞癌的不良预后

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中国生物化学与分子生物学报 2023年第2期39卷 269-276页

作者：朱睿安李朝英姜颖安徽医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室合肥230032 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心国家蛋白质科学中心(北京)军事科学院军事医学研究院生命组学研究所北京102206

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)严重危害着人类健康。尽管大量研究表明,在HCC早期进行手术切除可提高患者的生存率,但其高复发率仍然阻碍着治疗进程。本研究分析蛋白质组学数据发现。脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2(prolyl 4-hydroxy... 详细信息

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)严重危害着人类健康。尽管大量研究表明,在HCC早期进行手术切除可提高患者的生存率,但其高复发率仍然阻碍着治疗进程。本研究分析蛋白质组学数据发现。脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2(prolyl 4-hydroxylase subunit α-2,P4HA2)在早期HCC组织中高表达,Kaplan-Meier曲线、Cox比例风险回归模型(cox regression model)证明,P4HA2高表达的早期肝癌患者预后较差,且P4HA2可作为患者预后的独立预测因子。通过敲低或过表达实验发现,P4HA2明显促进肿瘤细胞的增殖、迁移等恶性生物学行为。敲低P4HA2激活了由肌醇需要酶1α(inositol-requiring enzyme 1α,IRE1α)介导的促凋亡非折叠蛋白反应(unfolded protein response,UPR)。以上结果表明,P4HA2可能通过调节内质网稳态来调控肝癌细胞凋亡,P4HA2有望成为HCC潜在的治疗靶点。

关键词：肝细胞癌脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2 预后细胞凋亡

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Gstm3在何首乌苷延缓SH-SY5Y细胞衰老中的作用

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遵义医科大学学报 2022年第3期45卷 296-303页

作者：吴德静范芳陈佳瑜葛正龙遵义医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室贵州遵义563099

目的初步探讨Gstm3在何首乌苷延缓SH-SY5Y细胞衰老中的作用及可能机制。方法从针对Gstm3基因的4组含不同shRNA序列的干扰载体中筛选沉默效率最高的一组,作为Gstm3沉默组(shGstm3-P/D),同时设空白对照组(NC-P/D,未转染)及阴性对照组(shNC... 详细信息

目的初步探讨Gstm3在何首乌苷延缓SH-SY5Y细胞衰老中的作用及可能机制。方法从针对Gstm3基因的4组含不同shRNA序列的干扰载体中筛选沉默效率最高的一组,作为Gstm3沉默组(shGstm3-P/D),同时设空白对照组(NC-P/D,未转染)及阴性对照组(shNC-P/D,转染无意义的阴性对照病毒载体shRNA序列),对照组(NC组,SH-SY5Y细胞)、D-Gal处理组(D-Gal组,SH-SY5Y细胞用D-Gal处理)、何首乌苷和D-Gal共同处理组(P/D组,SH-SY5Y细胞用何首乌苷和D-Gal共同处理);采用qPCR检测SH-SY5Y细胞中Gstm3 mRNA水平,细胞端粒长短,CCK8法检测细胞活力;Western blotting检测转染后各组细胞Gstm3、Bax、Bcl-2蛋白的表达,流式细胞术检测转染后各组细胞凋亡率。结果qPCR和WB检测结果显示,与NC组和shNC组比较shGstm3-P/D组SH-SY5Y细胞中Gstm3 mRNA和蛋白的表达明显降低(P<0.01);与NC组比较,D-Gal组端粒长度明显缩短,细胞活力下降;与D-Gal组比较,P/D组端粒长度明显增加,细胞活力升高;而与P/D组比较,shGstm3-P/D组端粒长度明显缩短,细胞活力明显下降(P<0.05);与NC-P/D组和shNC-P/D组比较,shGstm3-P/D组Bcl-2蛋白水平降低、Bax蛋白水平增加(P<0.05),且细胞凋亡率分别增加11.22%和9.07%(P<0.001)。结论Gstm3通过调控细胞凋亡相关蛋白Bcl-2、Bax的表达及细胞凋亡率参与何首乌苷延缓SH-SY5Y细胞衰老。

关键词：何首乌何首乌苷 Gstm3 衰老凋亡

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