检索结果-内蒙古大学图书馆

哈尔滨医科大学学报 2019年第2期53卷 145-149页

作者：陈晓文陈曦李函章王世缘王吉喆向睿智哈尔滨医科大学生物信息与技术学院生物数学教研室黑龙江哈尔滨150081 东北林业大学理学院基础数学教研室黑龙江哈尔滨150040 黑龙江大学计算机学院黑龙江哈尔滨150080

目的探讨药物副作用发生相关的药物-靶蛋白子结构对。方法从DrugBank,Kinase Knowledgebase,PDSP Ki,Matador 4个药物信息数据库中获得药物-靶点互作关系对做作为参考集,利用朴素贝叶斯算法预测副作用相关的药物靶点。在Pubchem和Pfam... 详细信息

目的探讨药物副作用发生相关的药物-靶蛋白子结构对。方法从DrugBank,Kinase Knowledgebase,PDSP Ki,Matador 4个药物信息数据库中获得药物-靶点互作关系对做作为参考集,利用朴素贝叶斯算法预测副作用相关的药物靶点。在Pubchem和Pfam数据库中分别获得药物的子结构fingerprint和蛋白质靶点的子结构结构域并将其两两配对,组成药物-蛋白质子结构对,将其作为特征构建二元罗杰斯特回归模型预测药物的副作用。最后,对模型进行了特征选择优化和多倍交叉验证,应用ROC曲线下面积(AUC)进行效能评价。结果罗杰斯特回归方法成功地应用于肾衰竭,其AUC值为0.80。与支持向量的方法比较,本方法获得了更高的准确率。结论基于药物和靶点的子结构可以有效地预测药物副作用,为副作用的早期预测提供了重要的参考。

关键词：副作用朴素贝叶斯分类模型逻辑回归模型子结构支持向量机

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伤害监测系统中口腔科门急诊病例特征分析

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临床口腔医学杂志 2017年第9期33卷 556-559页

作者：李莹崔春玉祁森荣华琳郭晔首都医科大学附属北京口腔医院儿童口腔科北京100050 北京市房山区第一医院门诊办北京102400 首都医科大学附属北京口腔医院放射科北京100050 首都医科大学数学与生物信息教研室北京100069

目的:了解北京市房山区颌面部伤害病例的分布特征。方法:利用2016年全国伤害监测系统(NISS)数据,对首次在NISS监测点医院北京房山第一医院口腔科门/急诊室就诊的伤害病例进行分析,了解其人口学、伤害事件和临床特征。结果:2016年房山第... 详细信息

目的:了解北京市房山区颌面部伤害病例的分布特征。方法:利用2016年全国伤害监测系统(NISS)数据,对首次在NISS监测点医院北京房山第一医院口腔科门/急诊室就诊的伤害病例进行分析,了解其人口学、伤害事件和临床特征。结果:2016年房山第一医院NISS共收集颌面部伤害病例1085例,男719人,占66.3%,女366人,占33.7%。病因第一位是跌倒/坠落(53.9%),其次是机动车车祸(14.0%)。伤害性质首位是锐器伤/咬伤/开放伤(57.1%),其次是擦伤/挫伤(35.3%)。1~5岁年龄组在家中发生伤害占比最高;6~17岁年龄组在学习与公共场所发生伤害占比最高;18~59岁在公路/街道发生伤害占比最高;60岁以上人群在家中发生伤害占比最高。结论:可从建立安全社区等多个方面介入减少颌面部伤害的发生。

关键词：颌面部伤害监测安全社区

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医学生物信息学课程教学的探索与思考

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数理医药学杂志 2015年第6期28卷 945-947页

作者：华琳刘红首都医科大学数学与生物信息学教研室北京100069

生物信息学作为一门新兴的交叉学科,是通过综合运用数学、计算机科学、统计学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。对于医学研究的发展,生物信息学具有广阔的应用前景。因此,对于医学专业高年级学生开展生物信... 详细信息

生物信息学作为一门新兴的交叉学科,是通过综合运用数学、计算机科学、统计学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。对于医学研究的发展,生物信息学具有广阔的应用前景。因此,对于医学专业高年级学生开展生物信息学课程十分必要。本文从医用生物信息学的理论课程介绍,实践教学环节,案例分析这3个方面探讨了如何提高生物信息学课程的教学质量,使生物信息学课程教学与医学应用实践紧密结合,从而使该课程能够为医学生从事未来的医学科研活动提供帮助。

关键词：生物信息学实践案例分析

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Hermite矩阵空间上保逆的加法映射

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黑龙江科技信息 2008年第34期 30-30,306页

作者：陈晓文哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物数学教研室

考虑了复数域■上所有从Hermite矩阵空间hn(■)到全矩阵空间Mn(■)的保逆加法映射,证明了每一个保逆的加法映射f:Hn(■)→Mn(■)是f(x)=ep-1xσp或者f(x)=ep-1(xT)σp这种形式,■x∈hn(■),其中e∈{-1,1},σ是复数域■的单同态。进而刻... 详细信息

考虑了复数域■上所有从Hermite矩阵空间hn(■)到全矩阵空间Mn(■)的保逆加法映射,证明了每一个保逆的加法映射f:Hn(■)→Mn(■)是f(x)=ep-1xσp或者f(x)=ep-1(xT)σp这种形式,■x∈hn(■),其中e∈{-1,1},σ是复数域■的单同态。进而刻化了所有Hn(■)到自身的保逆加法映射。

关键词：全矩阵空间 Hermite矩阵空间加法映射保逆

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应用同胞对Haseman-Elston回归法分析影响基因表达的SNP遗传标记

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中国优生与遗传杂志 2007年第11期15卷 3-4页

作者：华琳郑卫英全海英刘红首都医科大学数学与生物信息学教研室 100069

健康人群个体间的基因表达水平变化常常和人类复杂疾病的易感性及复杂疾病性状有密切联系。应用受累同胞对连锁分析H-E方法,对Centre d’Etude du Polymorphisme Humain(CEPH)家族的4个家系54个个体1号染色体的240个SNP标记作初步的连... 详细信息

健康人群个体间的基因表达水平变化常常和人类复杂疾病的易感性及复杂疾病性状有密切联系。应用受累同胞对连锁分析H-E方法,对Centre d’Etude du Polymorphisme Humain(CEPH)家族的4个家系54个个体1号染色体的240个SNP标记作初步的连锁分析。结果显示两个SNP标记(rs2007215和rs2004576)有统计学意义,提示这两个标记可能影响基因HSPA6(chr1q23)的表达水平。

关键词： Haseman-Elston回归连锁分析 SNP

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同一代谢通路上基因表达相关性分析

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中国卫生统计 2006年第1期23卷 83-85页

作者：杜磊李霞郭政宫滨生闻凤霞哈尔滨医科大学生物信息学系 150086 包头医学院数学教研室 014010

基因芯片技术是近年来发展起来的一种可以快速、高通量的探测基因在同一时刻表达水平的新技术。可用于研究生命体系中不同部位、不同生长发育阶段的基因表达,研究比较正常和疾病状态下基因表达及其表达的差异等。人们已经发展多种方法,... 详细信息

基因芯片技术是近年来发展起来的一种可以快速、高通量的探测基因在同一时刻表达水平的新技术。可用于研究生命体系中不同部位、不同生长发育阶段的基因表达,研究比较正常和疾病状态下基因表达及其表达的差异等。人们已经发展多种方法,包括多元统计分析、机器学习方法和模式识别方法等研究分析基因表达谱数据,探测基因表达调控网络及与疾病发生发展的关系等。[第一段]

关键词：基因表达谱相关性分析代谢通路基因芯片技术多元统计分析模式识别方法疾病状态不同部位生命体系发育阶段

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利用基因表达谱对组织样品分类方法的研究

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中国卫生统计 2003年第1期20卷 2-5页

作者：张瑞杰许杰王增权郭政李霞李康哈尔滨医科大学数学与生物信息研究室 150086 哈尔滨工程大学计算机学院哈尔滨医科大学公卫学院卫生统计教研室

目的　探讨在基因表达谱数据分析中用主成分分析方法结合层次聚类法与K -均值聚类方法两种分类方法对组织样品分类的分类效果。方法　用主成分分析方法对数据降维后进行聚类分析 ,与不经主成分分析直接聚类 ,并结合筛选与组织样品分型... 详细信息

目的　探讨在基因表达谱数据分析中用主成分分析方法结合层次聚类法与K -均值聚类方法两种分类方法对组织样品分类的分类效果。方法　用主成分分析方法对数据降维后进行聚类分析 ,与不经主成分分析直接聚类 ,并结合筛选与组织样品分型相关的基因的各种筛选水平 ,评价聚类效果。结果　用约当指数进行评价两种聚类方法 :经主成分分析后用提取的主成分聚类与不用主成分的直接聚类效果不同 ;不同筛选相关基因的筛选水平对聚类效果也有影响。结论　对组织样品做聚类分析时 ,主成分分析能提高聚类质量。

关键词：组织样品分类方法基因表达谱聚类分析主成分分析差异表达基因

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向心性肥胖与全身性肥胖关系的研究