检索结果-内蒙古大学图书馆

郑州大学学报（医学版） 2014年第3期49卷 344-348页

作者：于林凤吴静周锁兰丁勇南京医科大学生物医学工程系南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室南京210029

目的:应用ARIMA季节模型对我国丙肝发病进行预测。方法:利用2004年至2011年我国丙肝的月发病数建立ARIMA季节模型,对2012年丙肝的月发病数进行预测,并用实际数据评估模型的预测效果。同法对同期甲肝发病数据进行建模和预测。对丙肝和甲... 详细信息

目的:应用ARIMA季节模型对我国丙肝发病进行预测。方法:利用2004年至2011年我国丙肝的月发病数建立ARIMA季节模型,对2012年丙肝的月发病数进行预测,并用实际数据评估模型的预测效果。同法对同期甲肝发病数据进行建模和预测。对丙肝和甲肝2004年至2011年的月发病数按年归一化处理后计算方差。比较甲肝和丙肝的预测效果。结果:成功建立ARIMA(1,1,1)(2,1,0)12季节模型,模型的表达式为:(1+0.222L)(1+0.820L12+0.694L24)(1-L)(1-L12)lnYt=(1+0.648L)εt,参数AR(1)=-0.222(t=-2.392,P=0.020),SAR(12)=-0.820(t=-8.009,P<0.001),SAR(24)=-0.694(t=-6.124,P<0.001),MA(1)=-0.648(t=-5.889,P<0.001),残差序列是白噪声序列(P>0.05);模型拟合效果的R2为0.824,预测的平均相对误差为0.078。归一化后丙肝和甲肝发病数的平均方差分别为0.030和0.047,提示丙肝原始数据周期性动态变化较甲肝更趋一致。甲肝预测的平均相对误差为0.138,大于丙肝。结论:ARIMA(1,1,1)(2,l,0)12季节模型可用于预测我国丙肝的发病规律。样本数据的周期性动态变化趋势越一致,ARIMA季节模型的预测结果也越准确。

关键词： ARIMA季节模型丙肝发病预测

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微阵列数据扰动对错误发现率方法筛选差异表达基因的影响

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南京医科大学学报（自然科学版） 2014年第7期34卷 991-995,1002页

作者：陈婉婷刘成友吴静丁勇南京医科大学生物医学工程系江苏南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室江苏南京210029

目的:探讨微阵列数据的扰动对错误发现率(FDR)方法筛选差异表达基因的影响。方法:用计算机模拟仿真的方法,对1 991个结肠癌微阵列基因数据给予不同相对误差限的随机扰动,每个扰动进行1 000次随机模拟;用FDR的ALSU方法对无扰动数据与有... 详细信息

目的:探讨微阵列数据的扰动对错误发现率(FDR)方法筛选差异表达基因的影响。方法:用计算机模拟仿真的方法,对1 991个结肠癌微阵列基因数据给予不同相对误差限的随机扰动,每个扰动进行1 000次随机模拟;用FDR的ALSU方法对无扰动数据与有扰动数据分别筛选差异表达基因,比较两者之间的重复率;分析数据扰动对每次基因排序位次变化的影响。结果:差异表达基因的单个平均重复率与总体平均重复率都随数据扰动的增加而下降。差异表达越显著的基因,受扰动误差的影响越小;在扰动误差限≤50%时,数据扰动与差异表达基因总体平均重复率呈线性递减趋势,数据扰动误差限每增加1%,总体平均重复率约下降1.85%。扰动误差限越大,基因排序位次的波动越大。结论:数据扰动是导致差异表达基因可重复性差的原因,用计算机模拟的方法可定量探讨数据扰动对差异基因筛选的影响。

关键词：微阵列差异表达基因错误发现率数据扰动

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泊松分布信息熵的性质和数值计算

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郑州大学学报（理学版） 2014年第2期46卷 24-30页

作者：周介南丁勇南京中医药大学信息技术学院江苏南京210023 南京医科大学数学与计算机教研室江苏南京210029

泊松分布的信息熵是参数λ的无穷级数.证明了泊松分布的信息熵是参数λ的单调递增凸函数;λ误差影响的条件数小于1;在保证精度的前提下,给出了信息熵的有限项求和的近似计算递推公式,解决了无穷级数求和及阶乘溢出的数值计算问题.

关键词：泊松分布信息熵条件数近似计算

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ARIMA乘积季节模型在我国甲肝发病预测中的应用

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南京医科大学学报（自然科学版） 2014年第1期34卷 75-79页

作者：王超丁勇陆群吴静南京医科大学生物医学工程系江苏南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室江苏南京210029 南京医科大学第一临床医学院江苏南京210029

目的：应用求和自回归移动平均模型（ARIMA）乘积季节模型对我国病毒性甲型肝炎进行预测分析,为甲型肝炎的防治提供决策依据。方法：对1994~2012年我国甲型肝炎月发病数的历史疫情数据建立ARIMA乘积季节模型,应用Eviews 6.0软件进行模... 详细信息

目的：应用求和自回归移动平均模型（ARIMA）乘积季节模型对我国病毒性甲型肝炎进行预测分析,为甲型肝炎的防治提供决策依据。方法：对1994~2012年我国甲型肝炎月发病数的历史疫情数据建立ARIMA乘积季节模型,应用Eviews 6.0软件进行模型拟合,对2013年上半年甲型肝炎的月发病数进行预测,并用实际数据评估模型预测效果。结果：ARIMA（1,1,0）（2,1,2）12模型较好地拟合了既往甲肝的实际发病序列,也获得了较好的预测效果。结论：ARIMA模型能够较好地模拟我国甲型肝炎的发病趋势,预测效果良好,可为甲肝疫情的防控提供一定的科学数据。

关键词： ARIMA乘积季节模型时间序列甲肝预测

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甲型H1N1流感病毒HA基因的简单重复序列预测

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南京医科大学学报（自然科学版） 2013年第1期33卷 42-47页

作者：吴静丁勇刘成友南京医科大学数学与计算机教研室江苏南京210029 南京医科大学生物医学工程系江苏南京210029

目的:探讨应用ARIMA模型对甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因简单重复序列(simple sequencerepeats,SSRs)的相对丰度和相对密度值进行预测的可行性,为防控流感流行制定措施提供科学依据。方法:应用Eviews 6.0软件对1970～2... 详细信息

目的:探讨应用ARIMA模型对甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因简单重复序列(simple sequencerepeats,SSRs)的相对丰度和相对密度值进行预测的可行性,为防控流感流行制定措施提供科学依据。方法:应用Eviews 6.0软件对1970～2007年38条同源性相对较高的甲流H1N1流感病毒HA核苷酸序列中SSRs的相对丰度和相对密度进行拟合,建立时间序列模型,用模型对2008～2010年SSRs的相对丰度和相对密度进行预测,并用实际数据评估模型预测效果,进而预测2011年数据。结果:ARIMA模型较好地拟合了既往相对丰度和相对密度的实际序列,对2008～2010年的相对丰度和相对密度的预测也获得了较好的预测效果。结论:ARIMA模型能较好地模拟甲型H1N1流感病毒HA基因中SSRs的相对丰度和相对密度的变动趋势,可用于SSRs相对丰度和相对密度值的短期预测和动态分析。

关键词：时间序列 ARIMA模型简单重复序列甲型H1N1流感病毒预测

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对硅珠法提取石蜡包埋组织DNA质量的评估

对硅珠法提取石蜡包埋组织DNA质量的评估

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全国第九次法医学术交流会

作者：林旭王建文尹雅莎谢素梅冀强南京医科大学法医学系南京医科大学数学计算机教研室

目的运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,并评估DNA质量。方法南京医科大学第一附属医院病理科2009年至201 1年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳... 详细信息

目的运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,并评估DNA质量。方法南京医科大学第一附属医院病理科2009年至201 1年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳仪分析提取DNA片段的完整性。结果经紫外分光光度计测定胃癌组织D(260nm)/D(280nm)均值为1.84±0.02,肺癌组织为1.85±0.02,甲状腺癌组织为1.82±0.02,3组间比较P>0.05,因此硅珠法提取石蜡包埋组织DNA不会因组织差异而影响提取效果;Identifiler试剂盒PCR后毛细管电泳显示其提取效果,46例(93%)得出完整的16个基因座STR峰型。结论硅珠法可应用于多种组织的DNA提取,并保证提取DNA样品的纯度和完整度。

关键词：法医病理学石蜡包埋组织硅珠法 Identifiler试剂盒 DNA

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相对误差直线回归模型两种参数估计方法的比较

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中国卫生统计 2012年第6期29卷 905-907页

作者：刘成友丁勇南京医科大学生物医学工程系 210029 南京医科大学数学与计算机教研室 210029

最小二乘法的原理是观察值与拟合值的绝对误差平方和最小,其评价依据是针对等精度数据而言的,即观测数据具有大体相同的绝对误差,这些误差服从均值为0的正态分布。然而大量的科学研究的观测数据的误差往往是相对误差,即被观测量愈大,允... 详细信息

最小二乘法的原理是观察值与拟合值的绝对误差平方和最小,其评价依据是针对等精度数据而言的,即观测数据具有大体相同的绝对误差,这些误差服从均值为0的正态分布。然而大量的科学研究的观测数据的误差往往是相对误差,即被观测量愈大,允许的实际观测误差也愈大。例如,医学应用中,浓度测定的标准曲线,样品测定的准确度和精度是以相对误差为依据的,这样的数据用通常的最小二乘法将导致参数估计的不准确,

关键词：相对误差直线回归模型度数估计方法最小二乘法绝对误差正态分布科学研究

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Dijkstra算法在蛋白质序列比对中的研究

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计算机工程与应用 2012年第24期48卷 122-126,148页

作者：祁长红郁芸韩新焕南京医科大学生物医学工程系南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室南京210029

提出一种基于Dijkstra算法的序列比对方法,该算法主要用于求最短路径,而序列比对可以转化为在有向无环图中寻找最短路径问题。对于少量序列比对,使用该算法可以求出最优解。对于多序列比对,可将在N维空间求解最短路径问题转化为在二维... 详细信息

提出一种基于Dijkstra算法的序列比对方法,该算法主要用于求最短路径,而序列比对可以转化为在有向无环图中寻找最短路径问题。对于少量序列比对,使用该算法可以求出最优解。对于多序列比对,可将在N维空间求解最短路径问题转化为在二维空间求解最短路径。该算法可以简化问题复杂度,能求得相对最优解。

关键词：序列比对 Dijkstra算法最短路径有向无环图

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运用Identifiler试剂盒对硅珠法提取石蜡包埋组织DNA质量的评估

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南京医科大学学报（自然科学版） 2012年第4期32卷 577-581页

作者：林旭王建文尹雅莎谢素梅冀强南京医科大学法医学系江苏南京210029 南京医科大学数学计算机教研室江苏南京210029

目的:运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,Identifiler试剂盒评估DNA质量。方法:南京医科大学第一附属医院病理科2009～2011年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后313... 详细信息

目的:运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,Identifiler试剂盒评估DNA质量。方法:南京医科大学第一附属医院病理科2009～2011年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳仪分析提取DNA片段的完整性。结果:经紫外分光光度计测定胃癌组织D(260 nm)/D(280nm)均值为1.84±0.02,肺癌组织为1.85±0.02,甲状腺癌组织为1.82±0.02,3组间比较P>0.05,因此硅珠法提取石蜡包埋组织DNA不会因组织差异而影响提取效果;Identifiler试剂盒PCR后毛细管电泳显示其提取效果,46例(93%)得出完整的16个基因座STR峰型。结论:硅珠法可应用于多种组织的DNA提取,并保证提取DNA样品的纯度和完整度。

关键词：石蜡包埋组织硅珠法 Identifiler试剂盒 DNA

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中国人口数量的时间序列分析

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科技信息 2012年第32期 139-140页

作者：杨君哲吴静王娟刘潋李强南京医科大学基础医学院南京医科大学数学与计算机教研室

本文运用时间序列模型(ARIMA模型)对中国人口进行分析与预测,应用Eviews 6.0软件对1949～2007年中国人口数据进行拟合,建立ARIMA模型,运用2008～2010年的人口数据来验证模型,并对2011年的总人口数进行了预测。

关键词：时间序列 ARIMA模型人口数量预测

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