检索结果-内蒙古大学图书馆

西南大学学报（自然科学版） 2014年第11期36卷 75-82页

作者：彭睿查何周吉彭惠民张政重庆医科大学生物信息学教研室重庆400016 重庆医科大学细胞生物学及遗传学教研室重庆400016 重庆医科大学实验教学中心重庆400016

为了解循环microRNA在早期糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)发病机制中的作用,该文采用芯片筛查结合real-time PCR检测早期糖尿病肾病患者循环microRNA差异表达谱,同时应用生物信息学方法预测差异表达谱microRNA的靶基因.结果表明:... 详细信息

为了解循环microRNA在早期糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)发病机制中的作用,该文采用芯片筛查结合real-time PCR检测早期糖尿病肾病患者循环microRNA差异表达谱,同时应用生物信息学方法预测差异表达谱microRNA的靶基因.结果表明:芯片筛查出49个microRNA在DN中呈差异表达,其中信号值在两组中均大于1 000的microRNA有22个,17个上调,5个下调.选择其中差异倍数大于2的5个microRNA进行realtime PCR验证,结果与芯片结果一致,分别为let-7a,let-7d,let-7f和miR-363在DN中低表达,miR-4429在DN中高表达.同时,应用生物信息学技术预测了5个microRNA的靶基因,主要涉及细胞代谢过程调控、生长因子反应和细胞增殖等的相关基因.DN差异表达谱的建立为探寻microRNA发病中的作用以及DN的早期诊治提供了新的思路.

关键词：糖尿病肾病 microRNA 表达谱

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绝经妇女胰岛素抵抗与代谢综合征的关系及其相关因素的研究

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实用医学杂志 2010年第15期26卷 2723-2726页

作者：金婧阮祥燕华琳首都医科大学附属北京妇产医院北京市100026 首都医科大学生物信息学教研室北京市100069

目的:了解胰岛素抵抗在绝经妇女发生代谢综合征中的作用,探寻绝经妇女发生胰岛素抵抗的相关因素。方法:选取2006年7月至2007年8月来北京妇产医院体检并被确诊为自然绝经的妇女181例,年龄41～60(51.24±4.37)岁,绝经年限1～9(2.84... 详细信息

目的:了解胰岛素抵抗在绝经妇女发生代谢综合征中的作用,探寻绝经妇女发生胰岛素抵抗的相关因素。方法:选取2006年7月至2007年8月来北京妇产医院体检并被确诊为自然绝经的妇女181例,年龄41～60(51.24±4.37)岁,绝经年限1～9(2.84±1.96)年。测量181例绝经妇女的身高、体重、腰围、臀围、血压,测定研究对象的促卵泡刺激素、促黄体生成素、雌二醇(E2)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇、空腹血糖(FPG)、空腹胰岛素及全身脂肪含量(BF)。结果:(1)绝经妇女代谢综合征的患病率为33.7%。(2)HOMA-IR是绝经妇女发生代谢综合征的危险因素(OR=2.889,P<0.001),HOMA-IR预测绝经妇女发生代谢综合征的临界值为1.5185。(3)HOMA-IR与代谢综合征组分(腰围、TG、收缩压、舒张压、FPG)具有正相关关系(r=0.467、0.403、0.326、0.293、0.731,P<0.001),与HDL-C具有负相关关系(r=-0.204,P<0.01)。(4)HOMA-IR与年龄及体重指数、腰臀比、WC、BF%具有正相关关系(r=0.219、0.462、0.313、0.467、0.475,P<0.01),与绝经年限及E2水平无明显相关关系。结论:胰岛素抵抗的产生可能是绝经妇女代谢综合征发病风险增加的中心环节,体脂含量及分布是影响绝经妇女胰岛素抵抗的重要因素。

关键词：代谢综合征X 绝经胰岛素抵抗相关因素

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基因芯片的功能评价与辅助设计软件GeneHubD

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生物信息学 2004年第3期2卷 12-14页

作者：徐建震郭政李霞屠康王辰光哈尔滨医科大学生物信息学研究室

为了比较特定的基因芯片的功能偏岐 ,我们研制开发了一个简单实用的基因芯片功能评价与辅助设计软件GeneHubD。通过结合GO、KEGG、BIND、MIPS、Unists数据库的基因功能注释信息。

关键词：基因芯片基因功能软件数据库

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利用GeneHub软件多角度分析基因功能相关与表达相关的联系

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生物医学工程学杂志 2006年第6期23卷 1157-1161页

作者：王晨光郭政李霞余辉徐建震哈尔滨医科大学生物信息学研究室哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院哈尔滨150001 哈尔滨基太生物芯片开发有限责任公司哈尔滨150090

我们研制的GeneHub软件可以用来评价基因功能分类体系中各个功能单元的表达相关性的显著性,从而筛选与实验条件相关的功能单元。采用不同的相似性测度与不同的数据集,使用GeneHub研究了分别按染色体定位、蛋白质细胞位置与互作、代谢通... 详细信息

我们研制的GeneHub软件可以用来评价基因功能分类体系中各个功能单元的表达相关性的显著性,从而筛选与实验条件相关的功能单元。采用不同的相似性测度与不同的数据集,使用GeneHub研究了分别按染色体定位、蛋白质细胞位置与互作、代谢通路、信号传导通路等五个方面分类的基因的表达相关性,结果显示按照这些不同的方面分类的基因显著共表达,并且这种共表达现象往往受相关实验条件影响。为基因表达谱分析中广泛采用的假设“功能相关的基因表达相关”提供了进一步的实验证据。

关键词：基因芯片基因表达基因功能相关数据库

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互作蛋白质与复合物亚基的基因表达相关性比较分析

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生物信息学 2004年第4期2卷 1-4,29页

作者：王磊郭政李霞屠康喻辉李雪森王辰光哈尔滨医科大学生物信息学研究室哈尔滨150086

利用在多种应激条件下酵母的基因表达谱数据 ,分别计算互作蛋白质及复合物亚基编码基因的表达相关性。结果发现 ,相对于随机对照组 ,互作蛋白质的编码基因与蛋白质复合物的编码基因表达相关性均显著 (P <0 .0 1) ,即互作蛋白质及复... 详细信息

利用在多种应激条件下酵母的基因表达谱数据 ,分别计算互作蛋白质及复合物亚基编码基因的表达相关性。结果发现 ,相对于随机对照组 ,互作蛋白质的编码基因与蛋白质复合物的编码基因表达相关性均显著 (P <0 .0 1) ,即互作蛋白质及复合物亚基有共表达的倾向。通过比较 ,进一步发现蛋白质复合物亚基的基因表达相关性显著高于互作蛋白质的基因表达相关性 (P <0 .0 1) ,这与复合物亚基之间功能联系强于定义不甚确切的互作蛋白之间功能联系现象吻合。

关键词：蛋白质互作蛋白质复合物基因表达相关性

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microRNA let-7a-3基因甲基化与糖尿病肾病的关系

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基础医学与临床 2016年第4期36卷 474-479页

作者：文利彭睿孙艳武天慧彭惠民张政重庆医科大学细胞生物学及遗传学教研室重庆400016 重庆医科大学生物信息学教研室重庆400016 重庆医科大学实验教学中心重庆400016

目的探讨微RNAlet-7a-3基因启动子甲基化与糖尿病肾病的关系。方法采用生物信息学方法预测let-7a-3基因启动子区域甲基化位点,采用real-time PCR及甲基化特异性PCR检测20例糖尿病肾病(DN)患者、20例糖尿病患者(DM)以及20例正常对照(CON)... 详细信息

目的探讨微RNAlet-7a-3基因启动子甲基化与糖尿病肾病的关系。方法采用生物信息学方法预测let-7a-3基因启动子区域甲基化位点,采用real-time PCR及甲基化特异性PCR检测20例糖尿病肾病(DN)患者、20例糖尿病患者(DM)以及20例正常对照(CON)的let-7a-3表达水平及启动子区域甲基化水平。结果 let-7a-3在DN组呈低表达。同时,DN组的平均甲基化率为96.2%±6.2%,DM组的平均甲基化率为76.6%±18.9%,正常组的平均甲基化率为63.2%±28.4%。DN组的平均甲基化水平较DM组和正常组显著增高(P<0.01)。结论 let-7a-3启动子区域高甲基化可能是糖尿病肾病患者let-7a-3低表达的一个重要因素,并参与调控糖尿病肾病的发生与发展。

关键词：糖尿病肾病 let-7a-3 甲基化

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卵巢癌发生过程中microRNA作用机制的研究进展

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国际遗传学杂志 2013年第3期36卷 128-132页

作者：王乐天宁尚伟李亦学哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物信息学教研室

MicroRNA(miRNA)是一类进化上高度保守的内源性非编码RNA,具有重要的转录后调控功能,参与生物体发育、生理代谢等重要的生物学过程,并在肿瘤等复杂疾病的发生发展过程中起关键性作用。作为严重威胁女性健康的恶性肿瘤,卵巢癌的发病率逐... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类进化上高度保守的内源性非编码RNA,具有重要的转录后调控功能,参与生物体发育、生理代谢等重要的生物学过程,并在肿瘤等复杂疾病的发生发展过程中起关键性作用。作为严重威胁女性健康的恶性肿瘤,卵巢癌的发病率逐年递增。研究表明,miRNA在卵巢癌的发生发展过程中往往呈现异常表达状态,这提示miRNA可能与卵巢癌的发病机制密切相关。探索miRNA在卵巢癌中的作用方式,对于阐明卵巢癌的发病机制具有重要的意义,也将对卵巢癌的早期筛查及诊疗方法提供重要的理论依据。该文就miRNA在卵巢癌中的研究进展作一综述,从转录后调控层面阐释卵巢癌的发病机制。

关键词： MicroRNA 卵巢癌转录后调控表达抑制

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藏红花素通过下调STAT3抑制乳腺癌细胞血管内皮生长因子C的表达

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解剖学杂志 2024年第6期47卷 493-499页

作者：马晓燕王永霞邓超吴寅玮宿菲毛春梅张雅芳刘宝全哈尔滨医科大学人体解剖学教研室哈尔滨150001 哈尔滨医科大学生物信息学教研室哈尔滨150001 哈尔滨医科大学附属第四医院儿科哈尔滨150001

目的:探讨藏红花素(Crocin)对乳腺癌细胞增殖、迁移及血管内皮生长因子C(VEGF-C)表达的影响及其机制。方法:使用Crocin处理乳腺癌MDA-MB-231细胞和ZR-75-30细胞,采用MTT法检测细胞增殖,细胞划痕实验检测细胞迁移;应用信号转导和转录激活... 详细信息

目的:探讨藏红花素(Crocin)对乳腺癌细胞增殖、迁移及血管内皮生长因子C(VEGF-C)表达的影响及其机制。方法:使用Crocin处理乳腺癌MDA-MB-231细胞和ZR-75-30细胞,采用MTT法检测细胞增殖,细胞划痕实验检测细胞迁移;应用信号转导和转录激活子3(STAT3)激动剂Colivelin干预Crocin处理2种乳腺癌细胞,分为对照组、Crocin组和Crocin+Colivelin组,RT-qPCR和免疫印迹检测VEGF-C mRNA和蛋白表达,免疫印迹检测STAT3和磷酸化STAT3(p-STAT3)表达。结果:Crocin能够抑制MDA-MB-231细胞和ZR-75-30细胞的增殖,且与药物浓度及时间呈正相关。2种乳腺癌细胞48 h的IC50值分别为2376μmol/L和2654μmol/L。Crocin处理后,与对照组相比,2种乳腺癌细胞的迁移能力明显降低,VEGF-C的mRNA和蛋白表达水平明显降低,同时p-STAT3的表达水平显著降低;Crocin+Colivelin组的p-STAT3和VEGF-C表达水平恢复至接近对照组水平,且明显高于Crocin组。结论:Crocin能够抑制乳腺癌细胞的增殖和迁移,其机制涉及通过下调STAT3抑制乳腺癌细胞VEGF-C的表达。

关键词：藏红花素乳腺癌血管内皮生长因子C 信号转导和转录激活子3

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高黏滞血症患者白细胞流变特性的研究

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中国血液流变学杂志 2008年第1期18卷 1-3页

作者：赵研陈丽娜刘影张良才马波朱翔哈尔滨医科大学生物信息学系生物物理教研室黑龙江哈尔滨150086

目的通过比较伴有和不伴有高黏滞血症病人白细胞膜流动性、白细胞荧光光谱、血浆脂质过氧化和血浆中总胆固醇含量,从而探讨了在高黏滞血症情况下白细胞的改变。方法100人伴有高黏滞血症和60人不伴有高黏滞血症,用荧光偏振技术测量白细... 详细信息

目的通过比较伴有和不伴有高黏滞血症病人白细胞膜流动性、白细胞荧光光谱、血浆脂质过氧化和血浆中总胆固醇含量,从而探讨了在高黏滞血症情况下白细胞的改变。方法100人伴有高黏滞血症和60人不伴有高黏滞血症,用荧光偏振技术测量白细胞膜的流动性;用荧光分光光度计,在250nm激发下,测量白细胞的自体荧光发射光谱;用丙二醛试剂盒测血浆中丙二醛含量;用总胆固醇试剂盒测血浆中总胆固醇含量。结果伴高黏滞血症组较不伴黏滞血症组,白细胞膜流动性降低,脂质过氧化程度大,总胆固醇含量高;高黏滞血症组较不伴黏滞血症组白细胞有三个特征峰值的增加,S1波长为330nm,S2波长为561.4nm,S3波长为654.4nm。结论伴有高黏滞血症病人白细胞膜流动性变差;血浆MDA水平升高;血浆中总胆固醇增加;白细胞会出现三个强峰峰值的增加:S1波长为330nm,S2波长为561.4nm,S3波长为654.4nm。

关键词：白细胞膜流动性脂质过氧化丙二醛总胆固醇白细胞荧光光谱

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SAGE遗传分析系统的功能及应用

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中国优生与遗传杂志 2002年第1期10卷 3-5页

作者：宫滨生李霞郭政哈尔滨医科大学医用数学与生物信息学教研室 150086

SAGE是集多功能于一体的医学遗传学群体与家系资料计算机分析系统。本文概述SAGE系统的主要功能及应用环境。重点介绍了FCOR2和TDTEX两个功能模块的数学原理和使用方法。应用TDTEX模块 ,我们发现微卫星标记 85ca与小儿失神症存在连锁不... 详细信息

SAGE是集多功能于一体的医学遗传学群体与家系资料计算机分析系统。本文概述SAGE系统的主要功能及应用环境。重点介绍了FCOR2和TDTEX两个功能模块的数学原理和使用方法。应用TDTEX模块 ,我们发现微卫星标记 85ca与小儿失神症存在连锁不平衡。

关键词：家系资料相关分析连锁分析统计分析系统遗传流行病学

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